BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-456F19.T7 (MSMg01no456_f19.b1) | MSMg01-456F19.TJ (MSMg01no456_f19.g1) |
ACC | AG542683 | AG542684 |
length | 735 | 747 |
length of high quality (start - end) | 440 (69 - 508) | 253 (329 - 581) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no456_f19.b1 PHD_FILE: MSMg01no456_f19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:28:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no456_f19.g1 PHD_FILE: MSMg01no456_f19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:28:09 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCAGTATGACTGTTATCTATTCAGCAGCATTCAAATTTACTTC
TAGTAGTGATGGTGAAACTAATTAGGCATTACAAAGAATGGAGCTGGAAT
AGCTCAGGCTGGTCTGCACAGTGTTTACTTGGGACAATAGCCAGTCTTAC
CCAGACAAGGGAATTCACAATGGCCTAGTGAATAGGTGGGTTTACCATGA
AAGAGTTAGGGAACCACCCTGAGACAGGTTTCTTCAGTAGGCCTAAAGAA
ACAGCATAATCAGGCATTTACTAAGAACCCCTGGTGGTGGGCTTAACAAT
AGACTAGCATTATACCTGGCTCCCTTCTTAGTGGCAGCTGCCTGATCCCT
GACTTCTTTTGATGTATATATTCCTTTTGTATTGTGTCACTGTAAGTCAG
CGGATGTATCTTGCCTGGTTTCTTGTAGCTCTTCTGTATAAAAAGTATGA
TGCTCAACTTTGAAAATTATATTCATATTCTCCCCAATCTCTCCTGTTGA
TTCTGTTTGCCATTCATTCTCCCAACCCCTTGTCCACCCTGCTACCAAAG
AACTTGTTCTACACAGACAGGGTACCAAAAGTGGTCTGCGGGAGGCCCAG
GAACCTGGGAAGAAATTAAACTTTCTCTCTTCTCCTTTAAGGAAAAATTA
TTTGTTAATTTCCGGGAATATATAATTGGCTAACC
| TCCCAATGTAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGATTTTTGAGAATATAAATTAGTT
TTACATTTCAGATTCATGCCATGGTGATAAAGGGTTTACAAGACTGGAGG
GAAAAGGTTCGACTTGACTGTAAAAAGTTCTGTTTGTCACAACAAATGCA
AAGTAAGTCATTAAATTCAAGGCAAGTGAATATGATTAGTAGTATCACTC
AAGATATTTCCATTAAGGAAGAAGAAATTCTGATGCTAATGAAAAAATTC
ATATTGAAACATAAGAAGTTTGTAATATATAGATAAAATATTAAAATATT
AATAGACTTCTTAATGGTGACTTCAAAGGTTCAGCGTAGAAATATAGATT
CAAATTTTCCTGACAACAAACAGAATACTATTAACTGATATCCTAGCACA
ATCCTTAGGCAATAAATTCACCTGATTTATAAGACATTTTCTCAATTAAG
CATCTGTTAAAGCCTATTAGGAATCTAACCTAGAGGTAGGAAAACTCAGA
TTAGCGACTTTCTTCGCAACATGTAAAAAGGGGTGAAGCTATCATTTCTA
TCTTGTTTATTGAGCTATTATTGCTTAAGTCATGAATTAAAGCAACGAAT
AGATATTCTATGGATAATTTGAAACTTTATAGCACCTCTTCCAATGTTCA
TAATAGTTCTGCAACTCAATATTATCTTTCCTATACATTTCCTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 6 8 8 11 12 13 22 37 26 26 15 15 12 25 15 17 18 20 32 37 37 41 30 22 10 10 9 9 10 12 9 11 11 12 17 28 26 14 14 14 14 14 25
31 59 59 23 15 15 19 23 20 15 13 7 7 6 6 6 6 8 10 19 34 37 41 50 50 50 35 35 23 23 23 35 36 53 53 53 53 53 47 47 48 53 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 68 68 57 57 68 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 51 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 35 35 20 20 20 23 41 43 52 43 38 38 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 54 48 48 54 54 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 59 59 48 57 57
57 57 48 48 48 48 47 47 47 47 44 59 44 41 41 39 37 39 39 39 44 59 59 37 37 37 37 37 37 48 48 57 57 57 48 48 34 34 34 34 34 42 48 47 39 39 39 39 39 48
48 46 32 30 18 17 17 23 12 9 9 8 15 15 10 10 10 16 19 19 20 20 20 19 22 14 23 24 37 23 21 18 12 12 11 16 16 27 23 31 28 30 25 21 17 16 14 13 16 14
14 14 21 23 23 20 20 32 28 24 22 28 28 25 19 12 10 10 13 15 12 10 8 8 8 8 16 9 18 17 17 10 12 14 12 12 12 12 15 13 9 9 9 9 8 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 9 9 9 15 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 11 11 9 12 12 10 10 10 13 15 9 10 10 8 8 10 13 10 8 9 11 17 11 11 11 10 10 14 10 10 10
6 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 13 13 16 10 10 10 10 11 12 9 10 10 10 9
9 8 11 8 8 8 8 13 14 15 13 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 11 10 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 17 19 14 16 15 27 27 36 36 39 39 39 30 30 28 24 24 31 39 19 25 9 9 9 8 8 6 6 6 6 10 15 14 22 16 22 26 25 12
11 11 21 21 42 41 39 23 23 6 6 6 6 7 7 7 7 7 8 8 9 13 16 19 19 26 37 36 37 37 36 53 57 57 57 36 50 50 50 50 50 53 53 53 47 47 47 47 47 47
68 51 51 42 42 42 42 42 42 41 41 47 42 42 47 42 42 37 39 39 37 32 25 28 21 21 30 32 46 50 59 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59
59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 57 57 54 54 57 57 57 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 50 53 53 53 53 50 50 50 47 47 47 48 57 57 57 48 48 48 50 50 59 41 30
12 8 8 6 6 6 6 23 28 44 47 47 47 41 48 48 48 59 59 59 59 59 47 39 37 39 43 47 50 50 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50
59 57 57 57 57 57 57 57 50 48 41 41 39 34 23 18 16 13 9 10 9 9 9 12 12 11 12 12 23 22 30 30 46 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 68 68 57 57 68 57 46 46 43 43 43 44 46 48 48 57 48 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 57 48 54 57 44 59 41 41 37 44 44 57 57 57 57 57 44 44 42
37 37 37 42 47 59 59 68 59 59 57 44 43 44 44 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 54 57 44 59 43 50 44 43 41 52
52 52 57 57 43 44 38 38 38 43 43 52 59 52 52 52 57 57 54 54 54 57 57 57 54 54 54 57 54 50 44 43 29 29 36 43 59 59 68 59 57 57 57 54 54 57 57 57 43 43
43 43 42 44 42 37 37 39 44 44 47 43 47 47 57 57 44 44 28 37 28 36 32 40 43 32 32 30 40 28 44 28 28 32 41 34 23 23 23 23 31 36 39 32 32 26 30 21 21 13
27 27 12 12 22 23 12 13 14 29 32 39 27 26 12 12 12 21 22 28 36 36 37 31 28 25 25 25 28 26 16 23 11 11 11 23 21 17 15 15 30 30 35 35 35 39 32 37 31 32
23 23 18 28 28 39 40 39 37 43 34 34 20 28 20 24 26 37 30 29 25 28 23 23 23 15 10 9 8 8 10 11 11 12 10 20 20 13 12 9 8 10 10 10 10 9 9 10 10 10
10 9 9 11 11 10 8 8 15 8 8 8 9 10 12 9 11 12 23 22 23 9 9 9 10 10 8 9 8 8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 9 9 11 11 10 9 8 8 10 8 8 8 11 7 9 10 10 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |