BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-472J09.T7 (MSMg01no472_j09.b1) | MSMg01-472J09.TJ (MSMg01no472_j09.g1) |
ACC | AG555084 | AG555085 |
length | 750 | 760 |
length of high quality (start - end) | 508 (67 - 574) | 520 (81 - 600) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no472_j09.b1 PHD_FILE: MSMg01no472_j09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no472_j09.g1 PHD_FILE: MSMg01no472_j09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:16 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTTGATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXTACCCAGGGCTATACATAGAAACCCTGTCTTGAA
AAACAAAAAACAAAACAAAAAAAATTTAAAGAGAATTGACCATAATGGCT
AATTAGGGGTGCAATTTGACTGCATTAGTAATGTATCGTTTCTGAATGTG
ACTATGAAAATGTGTCTGTAAGAGACTGGCATTTATAGTAGCAGGCTAAG
TAATGAAGATCCAGCACTGCCCAATATAACATGTGGGTATCATCCAATGC
ATTAAAGGCTTAATAGAACATTTTGGCAGAGTAAATATTCTCATATATTC
TCTCTTTCTCCCTAAGGATCTATCTATCGATCGATTGATCTCTATCTAGC
TACCTACCTACCTATCTATTTTCACCAGCCCTCCCTTCCTCTATTTCTTC
CTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTCCTTCCCTCCTTCCCT
ACCTTTCTCCCTTCCTCCTTTGCTCTACTGTAGCTGGAAAGTTTTATGCT
GTTGCAAGACTCTTGGACGCTGGGTTTGTGTTTTCTCCAGCATGGGCTGT
AGAACTTGAGCAAAAGCCCTTGGGCTCCTTCAGGTGCTTGGGGATCTCAC
CTTTCCACTTCAGAAATCACTCTGCCACAACTGTTCTTCCCTCTCCCTTC
CCCTATAATTTAAATTATACTCCATAGTAATATTTTGTATTTTGTTTTTG
| NNNCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTAACTAATTAAGAATAAA
ATAAAACAGAATAAAATAATTCATTTATTTTGGACCTTTGAATCCCTACA
AAGTTAATTAAGAAATTTAGTGCCAAACAAGAAAATAAGTTTCACCAGTT
ACTGAGTTTTTCCTAAATTTTTGTGTGGTTTTATTTCATTTCATTTTGTT
CCTAAAATCTCTGGATGCCTCACAGAGCTCATCCTTCATCCCCAACAAAT
CCTCTGGCTTGCTACCCAGTCCTTTTATCTTTAAAGAAAAAATGCCCCCT
TGCTGCTTGTTCTCATAGGAGGCAGCAGAGCTGGGATTCAAGCAGGAGCC
CTGTCCTGAGTCCTCATGTTGTGTTGACTGGTCGCCTCTGGATGGCAGTG
ACAACTATATCTTTCTGTGATGTGTGAAAGAGACATTTCTGGTCAGAGAA
AAATAGACCTGACCATGCTCTGACAGGTGTCCCTCCTGACTGCTCTGTAN
GATGAAGACTTTCCTCTCTCTAAAAAATGTATAGAAAGGATTATGACCAG
NCATTGTCCCTTGTCACAGAAATTCTGTCCTGCTACCTTGTCATTTTGGA
CACCTTGTAGGAAGCTTTACAGGGCAATGACTGGGGTGAAGGGACCGTGA
CACCCACGAAGGACTAAAAATTAATTGGGTTAGCCCGGAACTTAAACCCC
AAAAATAAGT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 7 10 8 10 13 13 10 9 9 11 14 18 23 21 22 22 29 30 31 30 25 19 9 9 10 25 22 41 26 19 17 13 12 7 9 9 11 8 7 7 7 9 11 13 13 21 20
24 28 41 48 48 31 31 31 31 37 30 23 23 10 8 8 7 7 7 9 18 21 15 21 24 37 37 41 33 36 36 36 36 36 57 42 43 43 47 47 47 57 57 57 57 57 53 53 68 68
54 42 42 41 41 41 42 59 50 48 48 48 48 51 50 50 50 50 50 68 68 50 68 50 51 51 51 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 47 47 43 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 51 50 68 57 57 57 57 52 59 59 68 68 68 68 43 43 52 52 52 57 59 59 57 59 59 59 59 68 57 57 52 52 52 57 57
68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 54 57 57 57 57 57 54 52 57 59 68 68 57 57 57 57 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 59 59
57 57 57 57 57 57 43 46 44 57 57 57 54 59 59 59 48 57 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 54 48 42 42 30 30 30 43 43 59 68 59 59 59 59 48 48 48 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 43 31 23 18 17 11 11 9 9 11 11 11 15 12 24 33 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59
57 57 54 57 57 57 57 57 54 54 54 59 48 57 54 54 48 59 54 54 48 59 48 48 48 57 48 48 48 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 42 42 42 41 47 41
41 32 32 41 59 44 47 47 41 41 41 43 41 37 37 43 59 47 47 47 47 35 35 35 37 37 36 23 23 12 12 17 22 22 36 36 37 37 37 37 30 25 21 34 30 37 37 32 28 28
25 22 14 19 10 10 10 18 18 28 28 31 32 32 22 20 25 25 28 28 30 19 15 24 27 26 22 22 22 22 18 14 19 15 28 21 17 12 11 11 11 22 23 22 34 35 15 13 6 6
6 6 8 8 9 10 9 10 9 8 8 6 7 6 6 6 6 14 10 6 6 6 7 7 10 9 9 6 6 6 7 10 7 10 10 10 8 8 10 10 12 12 11 8 8 9 9 9 10 10
12 12 11 8 8 10 8 8 7 9 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 9 8 11 10 10 9 9 10 15 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 25 9 9 9 9 11 11 13 11 11 11
12 10 8 8 7 7 9 9 9 9 9 11 9 9 9 8 8 7 8 8 8 9 9 11 15 11 10 9 9 9 9 9 9 18 13 8 8 8 6 6 8 8 6 7 8 10 10 10 10 9
| Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 17 16 37 35 39 28 34 34 34 35 37 37 32 32 37 23 23 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 16 30 25 27 26
33 37 48 33 36 33 33 33 33 42 25 25 9 9 9 7 8 8 11 11 23 20 24 17 16 21 29 30 33 36 36 36 36 57 53 53 53 53 53 53 57 59 59 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 68 50 47 47 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 47 47 47 50 57 68 68 57 57 57 59 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 59 54 52 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 52 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 44 44 35 35 35 59 59 59 59 59 57 59 57 57 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 48 47 43 59 59 48 57 48 59 59 59 59 59 47 30 27 9 8 8 8 8 10 15 15 17 28 28 41 41 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 57 59 59 57
57 48 59 59 59 59 48 57 48 59 59 46 46 43 39 44 44 50 54 54 54 54 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 54 54
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 57 57 57 57 57 54 59 59 59 59 68 68 68 57 57 52 50 43 43 50 57 59 59 59 59 57 57 57 57 52 43 43 50 59 68 68 68 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59
54 68 54 54 54 54 54 57 57 54 54 54 54 54 48 57 54 54 54 59 57 57 57 57 48 48 48 43 43 32 32 39 47 46 48 48 48 48 48 46 46 46 46 46 37 37 23 22 3 0
3 20 20 28 36 34 40 40 37 37 47 39 48 48 46 41 41 41 37 43 34 31 31 41 37 37 37 37 30 30 31 34 34 37 30 27 24 37 37 27 30 31 30 25 30 24 18 13 19 3
0 3 18 14 25 28 28 18 14 14 14 15 9 10 8 13 8 9 9 13 22 32 29 29 24 24 13 13 13 19 26 22 22 24 18 12 9 8 8 8 12 12 28 28 30 21 18 12 11 11
11 15 17 21 15 10 8 8 8 8 8 9 12 12 12 10 15 9 9 9 9 10 19 15 8 8 8 9 11 11 12 16 12 14 8 8 8 8 10 12 20 20 20 14 13 12 9 13 11 12
10 11 11 15 8 8 8 8 8 7 6 9 8 10 15 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 15 13 10 9 10 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 11 11 12 11 11
11 11 16 16 11 11 9 9 9 9 |