| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-477N14.T7 (MSMg01no477_n14.b1) | MSMg01-477N14.TJ (MSMg01no477_n14.g1) |
|---|
| ACC | AG559103 | AG559104 |
|---|
| length | 729 | 1,535 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 689 (41 - 729) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no477_n14.b1 PHD_FILE: MSMg01no477_n14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:57:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no477_n14.g1 PHD_FILE: MSMg01no477_n14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:57:24 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
ACTTCCCTGAGAGCCTGAACCTGTGAAAGCAATTAAAAGAGGGCAGGGCA
TCCAAAGTGTTGGGTGTGAGGGCTGTTCATGAACAGCTCTACCAGACTGA
GATTTAATCATAAGGGTGGGAGGCGCAGCAGCAATCACGGCTCAGAGGAG
TGGGGACGTGGTGTGGAGTCTTAGGCACTAGGATATCTCATGCTGGTTTT
CCAAAGCTTTTCTTCCATTTTTTGGCACTTCTGATAGCCTCTCAATGCTT
GCTCAAAAATTTCCATTTTTATTAAGCTATCCTGAGTAGGATTCAAAAGC
TGCCCACCAAGCCACTTGATGGGCATGCTCTGCCCTGTGCAGGAGCACTT
TGGCATGGAACATGCCAATCATTTTCTTGCTTCTTAGATTAAGTCCAGCT
GTGCATATTCCAAAAAGGGATTTCAGAATGCATTTATAGAGCTTTATTCA
ATGGCTTCATTACATTCCCTCCTGGTTTTCCCCTTTGATATTAAGCTGCT
TACAGACCTGGACTCTCGCTTTGTCCTTTCCTTCTTTCAATCAACAGTAA
AGCATTTGATTATGCTCTGTTTGAGCAGCCAAAGGGACATCCTTGCAGTT
ACGTAGTATTTCATAATCATCAGATTTCCCAACATTTATAGCCAGATCAT
TTTAGCAAACTGTTTTTCACTACCCCGGN
| CCCCCTGGCGCGCTCTNGTGCGGTCGNCGGCGCGGTGTGGGCGTAGGCGA
GGAGNTTATTCACTTCTACTAGAACAGAGTGAGAGGAGAGAGGGGCGTCG
CGTGGAGCGTTATCTCCCAACCTAAGATACGGAGCGAGGGAGTTCGCAAG
CGACGCAGAACGAGAGTATGTAGAGGCGTGATCCGGGGCGCGCGACGCAC
GAGTATAAATATACTATCTTTCTGTCTNTGGTCAACTCGCACTATCCTTA
CCTGTGTATGCAAGAGTGTATAGTGTAGTAACCTACGCTCAATATTATTA
CGCACGGGAGACGCCGCGGTCGTCGCGGCGAGTCCGCTACGTTGCCGTGA
CGCTGTGTGGTTGGGTACTGGTAGATCGAACATAACAATATACAATATAC
TCACAGACTGAATATTGTTATAGAACAGTGTGCACTCTCTTATGAGACTA
CGGGTGATAACGAGCGCGTGATATATACTAATATCTCATTCTCTTGTGCT
GTCTGCGTGTCCTTANATGTCATAACCACGGAACACGCGAGAGAGATATC
ACATAGAGAGTCGATCCCAGAAGCTAGTAGTGCGCCGACGCACACGCATT
ACTATCCTTGTAGTTATATTATATCGTCGACGGGCGCGNCCTATCTGCGC
GCGCATAGGAGATATATTAATCAACAATCGCAGAGCCATAATATCGTACG
CTGTCGCACCATATACGCATACACTCAANCGCTAGAATCGCCATATAGCC
GATAACTATTTATGTAAGGTGGGTTGATTGTGGTTAGCGCGCCGCACACG
CGGGCTGTTCTCTGATGTTTCTAACACACATACACGACTATCGTATATAT
TTATAGATACAGATATATATCTATATTATCCCCGTTATCTTGTATTGTTA
TCGCGCCGCAGAGACATATATAATGTCTATTCGGCGCTTCTTGTATCCAC
CGCCCGTCTAATCCGAGTGCACTGTGTGCGAGCTAATCATCCTCCCGTAT
TATATATGCGAGCGTGCTACTACATTCTGGCCACGACCCACGTAGTCTTA
TATAATATATACCCACCGCGCCGATTACACCACAGCACACGACGACCGAC
ACGGTGTGTAATTGTGACCGAGCACTGTGAACTATAGAGTGTCGCGCCGC
ACTTGATGCCTCACGTGAATACGTGCAGTTGACTTGCGTCGTCACTATAC
TTTNTNCAATAGAATACGAGTTCACTCACNCAANATCGACGACACGTGCT
CATATATTGTTAGCCGACAGCGAAGAACCGAGATAATGTAGTAGAGACTG
ATNTATTGATAGTATAATATATACAGTGCGTTACTCACACACACCGGCGA
TATATATGATAATTTCGTTCTAATGCTGCTGCGCAGTCGTGCGCGCGCGN
TGTATCTACTTACATACACGTATGCTGTGATTGGCACACATGACTCTATA
CTGATCGCACTGTATTAGAGCGATGTGTGATACGCTTNGTTGACGTCGTA
CGCGCAGCTNATAGTGTGACTGTGGATACTCTAAC
|
|---|
| quality values | Open.Hide.37 37 37 39 32 32 32 30 28 28 30 30 24 19 19 23 24 30 30 37 28 28 25 25 24 30 29 24 9 9 9 9 9 9 15 12 19 14 12 12 25 32 41 41 23 15 12 18 23 23
37 37 37 27 23 8 8 8 8 8 10 17 22 39 37 39 33 33 36 36 53 53 59 57 57 57 53 53 57 47 47 47 48 48 48 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 54 51 51 51 50
48 50 48 48 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 57 57 57 57 57 35
35 17 30 30 42 42 50 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 59 52 57 57 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 35 43 39 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62
62 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 57 57 57 57
57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 43 43
43 43 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59 44 44 44 41 41 44 44 59 59 47 50 50 50 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59
59 59 40 41 41 41 39 39 39 31 31 32 37 37 41 47 46 46 48 48 48 48 40 40 41 41 39 39 39 37 37 41 43 47 47 37 37 30 25 25 32 31 26 26 39 39 41 41 43 37
37 41 44 44 39 39 41 41 41 41 41 41 47 47 47 41 37 37 35 28 28 40 39 36 35 37 37 30 23 18 18 18 30 23 27 30 35 30 30 30 37 35 32 32 39 37 36 36 31 32
39 39 39 41 36 32 32 28 30 31 39 39 36 35 31 32 39 37 37 31 34 21 26 14 26 26 37 30 31 31 28 32 35 35 32 39 36 37 37 36 32 28 18 18 18 19 25 25 31 31
39 36 31 35 25 18 11 11 11 11 18 32 28 28 34 28 25 23 23 23 34 34 37 29 26 13 13 3 0 | Open.Hide. 7 7 7 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 9 3 0 3 8 8 8 10 8 10 8 3 0 3 10 10 10 6 6 6 6 6 9 10 9 10 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6
6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 8 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 10 6 6 8 6 8 8 13 10 6 6 6 6 9 11
12 11 11 10 10 9 9 8 8 8 8 8 9 14 14 13 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 17 16 11 8 8 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8
7 10 6 6 6 6 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 13 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 9 8 7 7 7 7 6 6 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 10 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
7 6 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 7 7 8 10 6 7 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 6 6 6 6 6 6
8 10 8 8 8 12 10 10 10 14 16 13 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 10 10 10 12 16 10 6 6
6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 9 10 8 6 6 6 6 8 10 11 11
9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 9 9 8 6 6 7 7 10 8 8 9 9 9 8 6 6 8 8 8 7 12 12 9 9 10 10 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 7 10 11
19 12 10 9 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 10 8 6 7 9 7 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 6 6 10 10 10 13 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 6 6 6 3 0 3 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 10 10 11 10 9 9 11 10 9 10 8 6 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 8 8 8 8 15 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 10 7 6 6 6 10 8 10 10 10
9 6 6 7 7 7 6 15 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 7 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11 12 10 10 10 10 10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 10 8 10
10 9 9 9 8 6 10 7 6 6 6 8 9 6 8 6 6 6 6 6 8 7 8 8 8 12 9 3 0 3 8 8 8 10 10 10 10 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 11 10
8 8 7 7 8 8 8 8 7 7 6 6 8 6 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 13 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 9 11 14 18 10 8 6 6 6 6 7 6 8 10 8 6 8 6 6 6 6 6 6 11 11 11 13 10 11 11 10 10 11 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 12 9 6 6 6 6 8 8 7 7 10
9 9 10 10 8 8 6 6 6 7 7 8 11 13 13 13 8 8 8 11 12 9 7 7 7 7 7 7 8 6 8 6 7 8 10 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 7 6 6 6
7 7 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 6 10 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7
6 7 6 6 6 8 8 10 8 6 6 8 8 9 9 9 6 7 6 6 8 8 6 6 6 8 6 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8
12 10 10 9 8 8 13 8 8 8 8 8 11 10 8 6 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 7 7 10 8 6 6 6 6
8 8 3 0 3 0 3 6 8 10 10 10 10 10 8 6 8 6 8 6 6 7 6 10 10 10 10 10 3 0 3 8 3 0 3 6 6 6 10 6 6 8 10 8 8 8 8 8 7 8
7 8 10 10 10 9 9 9 10 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 12 13 10 6 8 6 6
6 3 0 3 10 11 8 8 8 10 11 11 13 18 9 8 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 10 7 7 9 10 10 10 10 10 11 13 10 10 10 11 11 8 8 6 8 8 8 8
8 8 11 13 10 8 8 9 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 10 11 14 11 10 8 8 8 3 0
3 11 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 6 6 6 7 11 13 13 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8
6 8 8 8 8 8 10 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 10 9 9 9 10 15 9 8 8 8 8 8 17 9 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 10 8 8 10 12 10 10 3 0 3 9 9 8 8 8 8 11 10 8 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 |
|---|
