BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-497C17.T7 (MSMg01no497_c17.b1) | MSMg01-497C17.TJ (MSMg01no497_c17.g1) |
ACC | AG573802 | AG573803 |
length | 753 | 754 |
length of high quality (start - end) | 696 (50 - 745) | 591 (78 - 668) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_c17.b1 PHD_FILE: MSMg01no497_c17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_c17.g1 PHD_FILE: MSMg01no497_c17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNAATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCAGAACTCTTCAGCTGGGGAACGGTGGTAATGAAGTGTTCCC
GTAAAACAGACTGTTGAGAAGGATTCAACTGCGTGAATTCAGAACTCTTC
AGCTGGGGAACAGGGTACCCGTAAGTATAGCTTTACAAGGTAAGTCTGGT
CTTGAACTTTCTAACGAAATTCAAGACAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGGA
AATAGCTTTACAAGGTATGTTTGGCCTTGAACTTTCTCTGGTGTTAGGAG
CCTTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGGTTAAGGCAGGGCTGAAA
ATTCTGGATGAAATTCAGGGCAATCTATCAGAAGTAAAGCGGGGAGAGAG
AGTAGGAGCGAAGAGGAAATATGGTACACAAAATAAGTATACAGGCCTTT
CCACGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTTAGGTCAGGTAAGAATACCTGG
GGAGAGATTAGAAGGAAGGAGAAGGAAAAAGAAAAGAAAAAAGATCAATT
AGCGGAGGTCTCTAGGAGAAGGAGCCTATACTCATCACTAGGTGAGCTCA
AGGAGCCAGTTCTTAGTAGTTCTGAATCAGATGAAAAGGCTATTAGGGCC
TGGAAGGCGCTCTCCCGAGCAGGTGAAGCCACTGGACAACTAACAAAGAT
CGTCCAGGGACCTCAGGAGTCCTTCTCAGATTTTGTGGCCAGAATGACAG
AGG
| NAACGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCACCGCTTGCAAAGCAGGAGA
GAGTGAAAGTGGAAAACTGATTAAAAGAAGTCACAGCGACGTTGTCCACC
CTTATATTGAGACGTAAATAACAGCAGCAAATCCCATCGCTTAGGAAAGT
CTGCGAGGGGCTTTTCCTTTGGAAACACGTTTTACCACCAACTTTGTTCT
CTTGAGACATCCTCCATTTAAAAGCATATTGGATATTGGAGATATCCTCC
ATTTAAAAGCATATTGGAACTAACCCAGCATTGCTTTTAATTAGCACAGA
AATGCTAATTAGATTTTTTTCTGTGTGATGCTCAATGCTGGCTGTCAGAG
TCCTGCATTTTTCATTCCAGTTGCAATGAAGGTACCGAGGGGGTCACCAG
ACCCACTTGCAAATTGATGAAGGCCAGTACATCCAGGCTGATTGTTATTT
TAAAACTGTAGAGATCTGTTAGAAGACACATGAGTCTAATGGCGCTCGAA
AAGAAAAAATAAATAAATAAATAAAAAGAGCGGGCTTTTTCTTTGCTCTA
GACAGGAGCATAATTTCACAAATTATTCAGTATGTGTGGCCCATGCAAAT
CAGGCTTCTTAGTGCAGAGTCAATGCAAACACACCCAAAGCTCAATTTGG
GAAGGAATCTGTTTTCATGCAACAGTCCCTTGTGAAAACAAATAGCTGCC
TTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 8 8 8 10 9 9 13 27 24 23 23 22 18 14 21 17 10 10 10 17 18 29 37 41 25 20 21 20 20 15 15 7 7 7 7 7 11 13 21 16 16 23 23 27 30
39 39 39 23 19 19 22 23 23 30 31 30 21 23 10 12 11 15 11 10 10 11 23 30 41 46 40 41 48 48 48 48 57 57 57 53 53 50 50 50 53 53 57 57 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 50 36 36 36 36 36 53 50 50 50 50 47 47 44 44 41 28 27 25 30 30 30 41 50 50 59 59 59 59 59 36 36 36 36 37 37 50 50 53 53 53 53 53 47 47 50
50 50 53 57 68 68 68 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 45 43 43 35 35 43 44 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 59 59 68 68 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59
57 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 43 43 40 43 43 43
48 48 57 43 36 33 33 33 36 43 59 48 48 46 40 41 39 37 37 32 29 29 37 39 41 41 47 47 59 59 43 43 37 36 36 39 47 47 59 41 37 36 41 41 47 47 59 47 41 41
41 37 37 41 39 34 31 35 36 47 59 46 39 39 36 36 43 37 37 37 37 37 39 41 37 31 34 32 23 23 20 32 32 47 47 43 39 31 28 32 36 39 28 31 24 18 21 24 20 28
37 36 30 30 22 19 19 25 33 37 37 37 37 37 37 30 30 30 33 33 37 31 31 37 37 40 37 35 28 25 31 31 39 31 29 32 32 29 29 37 37 37 36 40 39 41 39 39 32 34
28 25 25 34 32 35 32 30 29 37 29 27 24 21 21 17 13 21 21 28 25 26 33 37 30 22 25 16 12 11 12 12 24 28 36 32 27 25 24 22 28 20 22 19 23 25 21 23 11 15
10 10 10 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 10 11 11 9 10 8 8 12 8 8 8 11 27 36 37 37 37 37 37 37 29 31 37 35 16 21 9 9 9 12 9 11 8 8 8 9 12 22 22 24 23 18 30 34
32 30 28 28 33 33 50 47 41 23 17 8 6 6 6 7 7 12 12 12 23 13 10 10 12 15 22 34 37 37 39 41 37 50 47 47 39 39 39 41 41 44 44 39 39 39 39 39 39 39
37 37 37 37 41 41 41 37 37 37 37 37 44 39 39 37 39 37 37 37 37 37 37 39 39 39 44 37 37 37 37 37 37 48 48 50 53 53 53 53 53 57 57 59 50 50 50 50 50 37
57 53 53 50 50 47 47 50 50 50 50 42 47 39 39 30 26 24 28 30 30 41 47 50 50 50 50 53 53 47 47 47 47 47 48 48 47 50 59 59 59 59 44 41 41 39 39 39 41 37
37 39 50 41 47 47 53 53 50 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 44 44 42 35 33 32 32 32 43 43 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 44 44 50 57 57 57 57 57 47 57 57 57 54 57 59 59 59 59 59 59 57 54 54 57
57 57 59 59 59 59 57 57 57 44 43 43 59 47 54 47 59 43 47 47 59 48 54 54 57 57 57 46 48 48 48 48 57 48 54 48 59 59 59 43 43 43 47 47 46 46 43 39 39 32
37 36 32 32 36 37 39 41 41 41 39 39 39 37 20 28 20 20 18 25 34 40 43 48 48 43 37 33 28 28 37 37 37 32 37 30 24 24 19 18 18 23 32 37 37 35 28 31 32 34
34 23 19 18 24 24 37 34 31 31 35 28 28 15 18 14 28 14 15 15 14 14 12 25 15 13 13 19 19 28 30 30 39 32 37 41 36 34 32 34 35 35 35 28 32 32 32 37 31 31
31 31 28 28 28 39 31 30 22 23 11 11 11 24 25 22 22 19 26 19 18 20 28 30 31 35 32 32 34 30 25 23 18 15 18 18 22 15 22 20 22 21 24 17 29 22 24 16 18 16
18 14 14 14 |