BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-499E10.T7 (MSMg01no499_e10.b1) | MSMg01-499E10.TJ (MSMg01no499_e10.g1) |
ACC | AG575398 | AG575399 |
length | 761 | 787 |
length of high quality (start - end) | 242 (77 - 318) | 324 (350 - 673) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_e10.b1 PHD_FILE: MSMg01no499_e10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_e10.g1 PHD_FILE: MSMg01no499_e10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:37 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (86,223,647 - 86,223,888) | (86,388,958 - 86,389,281) |
---|
sequence | ACTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGTTCGAAAATGCGCGGA
ANCNTAGCAGACTACTATTATTTCTACTAGGAGAAAATGAAAAGTAAGTT
TCTATAGAGTGTTTCAATAACGTGTGTGTCTCTCTCCCAGTTCTCTAATG
CCTGGGGTGTGCTCTGACCTATTGGGCCATCTTGCTTCTTTGTCTCTAGT
CCTGCTCATAAACTGAGTGGGGTGCACCCTTCCTGAGGGCCCTGCCCTCC
TGTGTTTGTCAGGGCATCTATTACAAAGCCTTCTGAAAACTCTGGACCCA
CAGAGTGGAGGCTTTGCATCTTTTTTGGACACAGGACCCAGGTCTCTCAC
TGTGAGTGTTTGTGAGTGGGCGTGTTTCATTCAGGCTTCTGCGTAGGCCG
CAGCCTGGCTGCTGTCTGCAGGACCCCATCCCACTGTTCTGTCCCCTAAC
TCCAGCAGGCTTTGAGATGTGGCCCTGTCCTCAACTCCTTACACAGCTAA
GTGGAGAAGAGGGCGGTAGGGATCCTCACAGGGCCCTGATGTGAGCATGC
CTAGATCTGTTTTTGCTGGCTGCAGGGTTGTTAACTCCCAGCAATTGTCC
TGTCACAGCAGGGTCAGCTGACAGTGCTCGGGGCTGCTCAGTTGTGAAAT
GTCGCTAGGGTTTGGAGCTTGGTTCCCCTGACCTCCTCTCCCCTCCTCTT
CTCTTCCCTTTCATCCCTTCCCTTCCCTTTCCTCCCCTCTCTTCCCTTTT
CTCCCCTCCCC
| GGGGAGTGAGTGGGAGGGAAGCGATGATATGGGTAGGCTGGNGGCCGCCT
GGCCTTCAAATAAAGGNGAACNANAGAAGGACTGCCAAAAAACAGGGTCC
ATCTTAGAGCTGACCATCTCACAGATACATATGAGCTGGGCCTAACATCT
TAGATGGGAAAACAAGCTGTCTCCTCCATCTTGGTTTTCTCAGGCCACCT
GTCAATATACTTTGTCTGGTGTTTGGAGCTGTGTTTGCCAAGAGGGCTAT
GAAGGAAATGGTGTCCTGTGCTATGGAAATGTGCTCATGGTAAGTCCCTA
GTGAGAACCTCAAGTGCAAAGTCACAGACAGAACACATATCTTGTTATTG
GACGTTTCAGCTCAGATAGCCTTAGACATGCTCCATCTACAGACCCTTTG
TCCAAGAGATTTTTAGATGAAGACAGCTGGTTTTCTATAGATACCTCATG
TTTGGTGGGTCCCTCATTTTCACAGGCTATAGCAGTTTTTTATCTGGCAC
TTTCTGCACACCGGCTAGTCCTGAAACTTTTATTTGCTAATTTGTCTCAA
ACTTCCCAAGTGAGCAACTGATCTCCCTCTGCTGGGCTACATGGGATAGC
TGCCTTAGTACCCCGTTGGGTCCCATGCCTCCCATGGGTAGCCAGAACAC
CCTGGGTTTACCCATCCTGAATGAGGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTACATGCATGCACATGTGCTCAAGAATATGCCTTCTG
TGTACAAGGTGTCTTTCTAGGTCCTTTATGCAGCAAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 10 10 17 17 20 22 28 25 25 28 19 21 12 12 10 20 17 21 14 17 21 12 9 8 17 19 17 6 6 6 6 7 6 6 6 9 8 7 7 6 6 6 6 9 21 21
3 0 3 0 3 27 25 25 9 9 9 7 7 7 7 7 10 10 8 8 8 10 13 13 13 15 18 25 23 36 57 57 57 57 53 53 53 50 50 50 57 50 53 50 50 50 50 59 57 57
57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 50 50 39 32 24 15 12 12 12 13 26 28 39 40 40 40 46 48 50 50 57 57 57 57 57 50 57 48 48 48 48 57 57 57 57 50 53 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 44 44 43 43 48 59 57 50 48 47 47 47 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
59 59 59 59 59 43 44 44 47 47 48 50 57 50 57 52 57 57 59 59 59 57 52 50 50 50 48 48 50 59 59 59 59 57 57 32 32 18 27 27 44 47 59 57 57 57 59 57 44 44
35 42 30 30 31 34 34 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 54 54 54 54 54 48 48 59 53 50 50 50 50 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 53 50 50 50 50 47 30 28 11 10 9 9 9 12 15 13 14 9 11 11 25 27 47 47 50 50 50 50 50 48 57 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 43 43 25 32 30 41 32 41 24 29 24 42 44 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 44 43 43 43 57 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 57 48 59 59 59
47 39 41 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 57 32 50 43 39 39 43 43 44 44 43 43 57 57 57 48 48 48 48 48 54 54 44 59 42 37 35 59
44 57 44 43 43 57 57 48 48 48 57 44 41 32 20 20 24 32 32 37 32 30 43 43 57 46 57 54 54 48 48 48 48 48 57 48 48 48 59 57 57 43 43 39 36 28 37 19 26 14
14 14 21 21 13 13 13 15 15 17 17 18 24 21 29 24 32 21 28 24 36 33 43 39 37 36 28 23 23 20 19 20 23 23 19 30 18 20 16 23 25 33 43 43 46 43 47 43 43 43
37 39 37 39 39 39 39 22 22 11 10 10 19 13 12 11 27 30 28 28 22 25 22 19 12 12 12 25 13 16 13 16 16 12 20 28 32 28 24 14 16 22 23 17 18 11 11 11 12 18
19 18 18 23 21 22 14 13 11 16 10 10 11 12 15 11 11 18 19 18 11 11 11 21 19 30 26 30 14 14 14 15 16 18 22 34 34 37 30 18 18 11 11 9 9 10 11 10 8 12
8 8 8 8 9 14 13 10 12 12 12 23 16 12 9 10 10 15 22 19 13 13 10 10 10 17 17 18 25 14 17 10 12 10 10 10 16 20 30 30 27 37 19 11 11 11 11 14 21 9
10 10 17 17 14 10 10 18 9 9 9 9 10 10 10 11 11 16 16 19 24 37 26 26 24 25 25 25 27 32 29 31 32 27 20 11 11 10 13 12 13 16 19 18 20 26 16 17 14 14
14 15 12 10 6 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 8 6 8 6 6 8 8 7 7 8 6 6 7 7 7 6 8 8 15 13 13 15 15 8 8 8 8 8 10 15 13 10 8 8 10 10 18 3 0 3 23 23 37 37 37 37 25
23 17 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 3 0 3 11 11 3 0 3 0 3 27 27 27 16 8 6 6 6 6 6 6 6 9 11 11 10 8 8 7 8 9 9 9 21 21
30 33 33 50 50 59 59 59 59 59 59 59 53 53 43 43 47 47 47 43 48 48 48 48 50 68 68 68 68 68 51 68 68 68 34 34 21 24 20 21 24 14 21 18 25 28 44 48 68 57
57 50 47 47 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 32 32 15 19 15 12 12 12 24 32 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 59 34 23 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10
16 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 42 42 32 32 32 35 39 47 44 48 48 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 54 59 59 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57
54 57 57 59 57 57 54 47 47 57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 54 54 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 59 59 54 54 54 57 54 54 57 54 46 46 37 39 35 42 47
48 46 48 48 42 42 35 28 32 32 37 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 43 43 47 48 48 43 43 41 41 41 59 43 41 41 36 34 34 37 37 35 31 26 35 31 30 24 28 28 26
29 39 41 41 41 41 34 31 39 37 37 37 30 30 30 39 37 41 34 36 20 16 16 11 11 11 29 12 14 13 25 24 28 28 28 23 19 20 28 28 47 47 47 47 43 43 43 59 47 43
43 43 43 59 43 57 57 57 57 57 59 59 27 27 11 12 12 24 24 36 43 43 37 37 39 33 32 22 20 20 20 28 30 28 23 13 8 8 6 6 6 13 12 20 14 14 17 18 19 11
11 11 10 9 10 10 11 11 12 12 11 12 10 14 16 14 14 13 10 10 10 12 12 22 12 13 10 10 10 10 15 12 10 10 10 10 10 |