BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-505A02.T7 (MSMg01no505_a02.b1) | MSMg01-505A02.TJ (MSMg01no505_a02.g1) |
ACC | AG579748 | AG579749 |
length | 750 | 758 |
length of high quality (start - end) | 638 (50 - 687) | 555 (80 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_a02.b1 PHD_FILE: MSMg01no505_a02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_a02.g1 PHD_FILE: MSMg01no505_a02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:48 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTTTGTTTTCCTCTGTACCCCATTTTTTAATAGGGTTATTTG
ATTTTCTGGAGTCCAGCTTCTTGAGTTCCTTGTATATATTGGATATTAGT
CTCCTATCAGATTTAGGAGTGGTAAAGATCCTTTCACAATCTGTTGGTGG
CCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAATT
TTATGAGGTCCCATTTGTCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCT
GTTCTGTTCAGGAATCTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCGAGGCTTTTCCC
TGTCTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCTT
TGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGAGATAAGAATGGATCTATT
CGCATTCTTCTACATGATAACTGCCAGTTAAGCCAGCACCATTTGTTGAA
AATGCTGTCTCTTTTCCACTGGATGGTTTTAGATACTTTGTCAAAGATCA
AGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTATTTTCCAT
TGTTCTACCTGACTGTCGCTGTACCAGTACCTTGCAGTTTATATCACAAT
TGCTCTGTAGTACAGCTTGAGGTCAGGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTC
TTTTATTATTGAGAATAGTTTTTTGCTATTCTAGGTTTTTTATTATTCCG
| CCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTCTTCTGTACATAGATGGC
ATGGTTATCACAGGCTCATAGCTGCTGAGGTTTCCAACACAAGCCCTGTA
CAAGACCAAGCCAGACACACTTCCAGCTTAGACGGGGTAGACAGGCCATA
GGCCTCACCATGTACTAAAGAGCTGTCATCAGTGAATACTGCTATGGGGA
AGGAGAACCATTCATAGCTGAGACAGAATTCCCATGCTCCAGTAGAATGT
CTATACCCATGCACACACAGATAGCAGTAACTAAATTTAGTGGCTTACCA
AAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAACCAAAGTGAAAA
CAACATCAACAACAAAAAATACCCCCAAAACCAGGATATGAAGTCAGTAT
GGAGCAAATTAGAGCAACATTATGTAATTAAGGGTAGAAATGATATTAGA
CATGATCAGATCTCCTTATACATATTTATAAAATCCACAAATATATAACA
TTTTAAATTTGATTAGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTTTTATACACATGCTAAGGCACATGTGTGGAGGTCAGAGGACAACCTGA
GAGCGTGGGCTCCCTCTTCCCACCATGTATTTCCCAGAAATGAAAGTAAG
ATTCTCAGGCTTGGGCACAAATACCTTTACCTGCTGAGTAATCTTTCTAG
CCACTTTN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 8 10 15 16 20 28 32 33 33 33 33 31 37 37 37 35 29 32 37 37 41 47 30 28 30 19 19 10 12 12 15 11 10 10 11 19 22 22 26 30 24 24 28
39 48 57 36 36 36 31 33 33 59 59 59 59 31 27 12 11 11 12 20 26 37 37 40 40 47 48 48 47 47 50 50 59 53 53 53 57 53 53 50 50 57 57 57 57 57 53 68 68 68
68 68 48 48 54 54 54 48 48 57 59 42 41 41 47 47 42 46 47 47 48 57 57 68 57 57 47 44 48 44 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 43 44 32
43 43 44 48 48 57 43 43 32 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 43 43 52 52 44 43 37 37 52 50 50 52 52 52 57 57 68 68 68 59 59 57
39 39 43 59 59 68 57 57 52 52 52 57 57 68 57 57 57 52 52 57 57 59 52 52 57 57 59 59 57 52 52 57 44 44 57 57 57 57 59 45 45 62 62 62 62 52 52 62 62 68
68 68 68 68 68 68 62 62 43 41 43 43 52 62 62 62 62 43 35 35 44 44 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 43 43 43 52 62 62 62 62 62
62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 68 68 68 59 59 43 43 35 62 59 59 43 52 52 52 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 57 57 59
59 59 59 43 43 35 35 43 38 44 44 59 52 59 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 57 42 35 35 43 43 57 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 54 59 44 43
29 29 38 44 44 52 52 52 52 52 42 44 43 52 57 57 68 57 57 48 48 57 59 43 43 35 50 50 57 48 44 32 27 32 32 42 42 42 35 42 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 41 41 41 41 43 59 59 31 29 22 25 31 31 46 46 54 54 54 54 54 54 54 54 57 57 42 59 42 48 48 59 59 43 32 28 28 36 36 36 36 31 28 35
47 59 44 37 37 30 30 21 30 28 31 37 43 41 44 44 44 39 37 27 30 22 22 28 36 36 43 41 37 43 36 37 41 43 37 37 32 26 26 32 59 47 47 47 59 37 37 37 37 34
30 37 29 25 32 37 41 37 37 39 44 41 41 46 59 40 39 39 40 59 59 59 39 25 25 23 28 34 34 28 31 37 43 34 41 41 41 31 30 34 34 37 39 35 35 32 35 31 31 36
37 37 43 31 28 28 25 30 43 39 37 37 39 41 41 37 31 26 27 27 24 22 28 28 28 24 29 34 41 41 37 31 30 30 23 18 14 15 13 14 16 18 12 12 12 18 16 28 17 22
18 30 31 34 39 37 32 41 32 29 34 28 19 15 15 19 14 26 16 24 26 30 30 37 39 35 35 31 22 25 19 19 13 14 12 21 21 28 34 30 30 30 25 25 30 22 12 12 9 9
| Open.Hide. 7 7 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 19 25 32 26 30 37 37 37 37 41 50 50 50 53 50 50 50 41 41 28 28 22 18 7 7 6 6 6 8 8 8 15 15 28 24 28 23 31
37 44 53 47 47 37 37 39 41 41 41 27 22 10 6 6 6 10 15 11 19 21 31 28 33 33 33 36 36 47 47 42 42 48 48 43 43 44 43 47 48 48 53 53 53 68 53 53 50 54
54 57 57 68 68 48 48 46 47 47 47 48 50 43 41 41 32 35 48 42 43 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 48 39 39 35 35 39 39 44 47 47 48 42 42 43 44 44 59 50 43
43 43 57 43 43 37 37 37 50 50 43 43 52 59 52 52 43 43 38 38 43 43 43 35 35 43 43 43 44 44 44 33 43 43 59 59 68 57 57 57 52 52 52 57 57 39 39 43 44 44
44 43 39 39 43 39 39 42 42 42 57 57 59 52 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 39 39 39 39 39 35 44 44 68 68 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 43 43 35 35 35 44 43 35 35 44 44 52 52 62 62 44 44 35 43 43 62 62 44 62 43 43 43 43 43 62 62 62 52 43 43 39 44 44 62 62 62 62 44 62 52
52 52 62 62 43 43 43 39 39 44 44 52 45 43 43 39 39 39 43 62 62 44 44 41 41 27 27 23 39 28 35 39 44 44 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35
44 44 43 35 31 31 44 43 39 39 39 44 43 39 35 35 44 43 39 35 35 59 43 39 35 35 59 43 43 35 35 59 43 43 35 35 44 43 43 35 35 59 59 68 68 68 68 59 44 39
35 35 35 39 38 35 26 26 35 38 39 39 39 39 57 57 68 68 59 44 43 52 45 43 43 23 23 44 44 43 35 33 28 43 43 68 68 68 68 68 68 59 44 35 33 33 44 44 57 68
68 59 59 52 52 52 59 59 57 57 54 44 44 43 38 43 41 35 35 50 50 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 33
42 42 57 48 48 42 42 35 59 59 41 41 43 43 43 37 48 48 48 46 43 43 46 48 57 68 68 68 57 57 54 43 43 29 29 23 28 28 33 36 43 43 57 57 59 59 59 43 43 43
48 48 48 50 57 50 50 50 50 42 41 40 39 39 39 39 37 41 43 59 44 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59
59 59 53 47 47 47 39 43 28 28 22 22 22 34 34 37 37 32 29 27 32 32 36 37 39 37 41 41 41 25 27 19 15 15 21 28 22 23 11 11 11 25 17 17 10 10 10 12 17 8
8 8 19 23 36 35 31 32 32 37 28 24 22 24 20 20 20 19 16 14 14 21 21 24 32 36 36 37 24 20 20 24 24 21 24 17 17 27 27 37 19 11 11 11 8 8 10 12 12 19
14 15 15 28 25 23 20 26 19 30 14 11 11 9 9 14 18 19 15 27 25 22 19 8 8 9 11 12 14 25 24 32 28 28 25 22 21 14 15 11 13 11 13 16 17 22 26 26 28 24
22 20 23 28 23 17 3 0 |