BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-525L18.T7 (MSMg01no525_l18.b1) | MSMg01-525L18.TJ (MSMg01no525_l18.g1) |
ACC | AG595498 | AG595499 |
length | 753 | 766 |
length of high quality (start - end) | 614 (37 - 650) | 583 (68 - 650) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no525_l18.b1 PHD_FILE: MSMg01no525_l18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:00:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no525_l18.g1 PHD_FILE: MSMg01no525_l18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:00:27 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCCCTT
ACTGCTTTTAATATTCTTCCATAGTTTTGTGCATTTGGTGTTTTGATTAT
TATGTGTTGGGAGTAATTTCTTCTCTGGTCCAATCTATTTGGAGTTCTGT
AGGCTTCTTGTATGTTCATGGGCATCTCTTTCTTTAGGTTGGGGAAGTTT
TCTGCTTTAATTTTGTTGAAGATATTTACTGGCCCTTTAAGTTGGGAATC
TTCACTCTCTTCTATACCTTTTATCCTTAGGCTTGGTCTTCTTATTGTGT
CCTGGATTTCCTGGATGTTTTGGGTTAGGAGCTTTATGCATTTTACATTT
TCTTTGATTGTTGTGTCAATGTGTTCTATGGTATCTTCTGCACGTAAGAT
ATTCTCTTCTATCTCTTGAATTTTGCTTGTTATAGTTGCACCTATGGCTC
CTGACTTCTTTCCTAGGTTTTCTCTTTTCAGAGTTGTCTCCTTTTGTGAT
ATGTTTATTGTTTCTTCTTCCATTTTCGTATCCTGGATGTTTTTGTTCAA
TTGTTTGAACAATTTGATGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAAGGGAGTTGTT
TATGTCCTTCTTATAGTCCTCCATCATCATCATGAGAAGTGACTTCAGAT
TCATACCTTGCTTTTCTGGTGTTATGGTGCATCCAGGACTTGCTATGGTG
GGAGAGTTGGGTTCTGATGATGGCCAATAACCTTGGTTTCTCTTGCTTCT
GTN
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXATTTTTTGTGTTTGGAAAAAAAAGCCTCACATC
TATCTCAAAAGTTTGTGTTTGAAGTATGAGTGTTTTCTTAATACAATGAT
TGATAGATGGCAAAATGTAGCTTTAAAATTCTAATGTATTTTTTACCTAT
TAAAGGATTTTTCTTTCTAAAAATTGATTATGATTAGGTAGTAGTAGTTA
GTGATATCTATTTACTATGCTCCTAAACTGGTTTATTTCACTGATCAGTG
ATATAAGGAGAGGTATCCAACTGATCCGTACTATGAGTTCAGTGATGTGT
AGAGTAAGTTGTAGACAGTAGAGCTCTGTTTACTTAGTGACTATCCTGTG
CTTCTCCCATTAGGTGTCGTTGGAGACTGGAAACATTATTTGACTGTGGA
TCAGAGTGAAAGATTTGACAAGATATTTCACAGAAACATGAAAAACATCC
CCTTAAAATTCATCTGGGACATAAATGAGGAGTAGAATATTAATCACCAC
GTGAATAAACCATATGAAAATGTACTAGCCAGAGGTTGTACTTTAATATT
AAAATTAATATATTTGTCTCATTTAACTATTAGTTATAAAACATAATTCA
CAGACAAAATGATTACCTTGTGCCTAGATTGTTTTCCATGACATAAATTT
CAAATGGAGCTACTAGCATTGGTTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
GTTTTAAGGAAAGCCT
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 16 12 19 23 21 20 20 23 32 39 48 48 50 33 33 33 33 33 22 19 8 8 8 7 9 11 22 20 27 33 30 30 31 31 41 39 39 23 21 17 28 29 29 47 42 50 50
28 28 13 13 14 15 21 21 31 36 47 43 48 53 53 53 53 42 42 32 32 32 42 44 68 68 51 51 43 43 43 51 51 68 68 68 68 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 68 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 46 37 37 37 43 43 47 47 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48
54 57 57 57 57 59 59 59 59 35 35 35 59 59 59 59 48 48 43 43 43 57 57 50 59 59 48 47 47 46 47 47 43 43 36 34 35 39 41 41 46 46 46 46 46 34 34 28 28 28
31 27 35 36 36 39 39 40 41 48 48 48 48 57 57 57 39 34 32 33 34 34 39 43 43 48 43 43 36 36 36 32 32 35 30 28 34 25 26 29 29 21 24 22 14 14 14 24 24 31
38 39 39 37 35 31 36 41 39 39 39 39 31 26 19 29 29 30 35 29 33 25 33 28 39 43 43 43 43 40 40 39 34 34 28 23 22 20 23 28 33 34 37 29 30 26 28 17 17 26
24 18 18 19 25 22 23 20 19 20 22 23 28 30 20 20 13 16 11 12 10 10 10 17 18 21 15 14 14 15 15 18 21 15 18 15 12 10 10 10 14 14 24 15 15 8 7 6 7 10
9 11 14 9 9 9 9 11 18 11 8 8 8 10 13 10 9 9 9 9 11 12 11 11 13 8 8 10 8 9 11 11 11 11 14 10 12 11 12 8 8 8 10 10 8 10 11 13 15 13
13 3 0 | Open.Hide.10 10 10 10 10 10 9 11 26 39 39 39 39 41 42 50 50 50 50 47 26 27 12 8 6 6 6 8 8 12 8 16 16 28 23 34 34 37 37 41 32 33 33 33 33 33 50 50 53 59
33 33 13 15 26 23 34 28 40 40 59 42 42 37 37 40 42 42 42 51 68 68 51 51 51 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 51
68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 59 59 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57
50 50 37 38 43 50 59 59 59 59 50 50 37 43 43 57 50 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 48 54 59 59 59 54 54 54 59 57 59 57 57 54 54 54 54 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 59 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 48 43 43 48 59 59 59 48 57 43 44 43 48 57 48 48 47 43 40 39 39 37 37 35
39 39 40 41 39 39 44 37 37 41 41 41 41 47 46 47 48 48 53 39 39 30 35 31 27 30 28 23 28 24 21 25 14 16 14 24 24 31 31 35 39 39 42 41 41 40 39 37 37 37
37 28 30 18 16 16 27 24 28 28 28 32 39 33 37 28 28 17 23 15 20 19 30 34 32 32 41 41 35 27 27 32 28 22 18 30 28 29 25 34 17 25 25 30 25 25 19 14 10 11
11 11 10 13 9 10 10 19 26 13 11 8 8 8 13 12 16 12 14 12 9 9 13 9 9 9 12 9 11 11 13 13 15 24 22 22 14 14 13 24 15 8 8 8 8 8 12 11 11 8
8 6 6 6 6 6 7 10 11 16 13 14 16 18 11 11 10 13 11 21 17 19 15 15 15 14 12 10 10 12 22 27 43 59 37 37 30 30 30 30 37 37 41 41 19 9 9 9 9 9
10 14 15 16 16 15 10 10 14 14 9 8 12 9 9 9 |