| Query= MSMg01no527_o12.g1 MSMg01no527_o12.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no527_o12.g1 PHD_FILE: MSMg01no527_o12.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 21:03:20 2005
(647 letters)
>mm_chr10_71974816_71975863
Length = 1048
Score = 975 bits (504), Expect = 0.0
Identities = 531/546 (97%), Gaps = 11/546 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 103 accagctggataggcaagttcgaggctcatgcaaagaccctacttcattataaagtggaa 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1046 accagctggataggcaagttcgaggctcatgcaaagaccctacttcattataaagtggaa 987
Query: 163 agtgattacggaagatgcctaatgtaagcatcagtcctctgagcctatacgcatgcatac 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 986 agtgattacggaagatgcctaatgtaagcatcagtcctctgagcctatacgcatgcatac 927
Query: 223 atatgcacacagatccatatacacatcatccccatatatatatatatatatatatatata 282
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 926 atatgcacacagatccatatacacatcatcccc----------atatatatatatatata 877
Query: 283 tatatatatatatatatatatatatatacaactacagccaaaaacaaccaaacaaaaatc 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 tatatatatatatatatatatatatatacaactacagccaaaaacaaccaaacaaaaatc 817
Query: 343 ttccaacaaacctcaataaatctcacctttcatatcttctaaactcaagtcaaggtcagt 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 ttccaacaaacctcaataaatctcacctttcatatcttctaaactcaagtcaaggtcagt 757
Query: 403 ctgctaaagggaatattttcatgaaaagaagactgcaaattttcacttg-tgagaaaatt 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 756 ctgctaaagggaatattttcatgaaaagaagactgcaaattttcacttgtttagaaaatt 697
Query: 462 gcaggtattttgttcatcctttgagacgtggttttctaaagctttaggaaaagcaccatc 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 696 gcaggtattttgttcatcctttgagacgtggttttctaaagctttaggaaaagcatcatc 637
Query: 522 agtgaataaaatttgttgcaggacaagttaaattggactttggaaagcaggatgctcctc 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 agtgaataaaatttgttgcaggacaagttaaattggactttggaaagcaggatgctcctc 577
Query: 582 tcgtttcgagagttgcccaagatttttctctgcctcatgccaagctctttagatggccat 641
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 ttgtttcgagagttgcccaagattttcctctgcctcatgccaagctctttagatggccat 517
Query: 642 tctgaa 647
||||||
Sbjct: 516 tctgaa 511
Score = 87.7 bits (45), Expect = 3e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 257 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 301
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Score = 87.7 bits (45), Expect = 3e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 259 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 303
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Score = 87.7 bits (45), Expect = 3e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 261 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 305
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Score = 87.7 bits (45), Expect = 3e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 263 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Score = 87.7 bits (45), Expect = 3e-21
Identities = 45/45 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 265 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 309
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Score = 85.8 bits (44), Expect = 1e-20
Identities = 44/44 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 267 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 892
Score = 85.8 bits (44), Expect = 1e-20
Identities = 44/44 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 256 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 893
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 118
Number of extensions: 46
Number of successful extensions: 46
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 24
Number of HSP's successfully gapped: 12
Length of query: 647
Length of database: 1048
Length adjustment: 10
Effective length of query: 637
Effective length of database: 1038
Effective search space: 661206
Effective search space used: 661206
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
|
