BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-535D23.T7 (MSMg01no535_d23.b1) | MSMg01-535D23.TJ (MSMg01no535_d23.g1) |
ACC | AG602741 | AG602742 |
length | 754 | 757 |
length of high quality (start - end) | 665 (50 - 714) | 575 (87 - 661) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no535_d23.b1 PHD_FILE: MSMg01no535_d23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:13:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no535_d23.g1 PHD_FILE: MSMg01no535_d23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:13:00 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNAATCTATAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTTTTTATATTTTCTTTTTTTTCCCCATTTTTTATTAGGTAT
TTAGCTCATTTACATTTCCAATGCTATACCAAAAGTCCCCCATATCCACC
CACCCCCACTCCCCTGCCCACCCACTCCCCCTTTTTGGCCCTGGTGTTCC
CCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCA
GTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATATATATGCAGCTAGAGTCAAGA
GCTCCGGGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCA
GATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCC
TGTGATCCATCCATGACCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAG
GCCCCGGTATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCAATAA
AATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTATGGG
GTGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTACATGGTCCATCCTTTCATCTCAG
CTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCTTCCATGGGTGAGAAATTCTGGCGG
AATCACCATGCCAGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGATAAAAA
CTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGACAAGTAGACCAATGGAATAGAATT
GAAA
| NCTTTTTTCACTATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTAATACTTTACTT
CCTAATCTAAGGTAGACATCCATCATCCATCAATTTCTTATTATATTAAA
GAGTGTTGTCGTCTTGTTTCAAGAATATTGTTCCATTATCTATGAGTCTT
ATCTAGTGATATCAAAGTGTATATTAAATTAATATATAAGCACTTAATCC
ATTTAGATACATACAGTTTCTAGTTGTAGAACTACTATCTTTCATGTTGT
ATATCTTGACAGCAATATATAATGTTTATTTTTAGTTTTTAGTATGTCTT
TTTATTTCTTTCTAGATTTAACAAAATGTCTAAATTATGTAGGTGATTTT
CATTTGCCCTAATGCATACTTTTCAGCTATAGATTGTGTTTTCAAAGGGT
TTCTTCTGGCTGGTTGTTGTGTTTTTCAGTGCTGATGATCAGCTTCGTGA
GATTTAGTATCTCCATGGATAGAAATGTCCCTACTTGTCTAGGCATGCAG
TCAGATTGAGTGCACTAATAAGAAAGAAGTGAAAAGTTTCCCCCTTGGTG
TCATTTAACCCAAGGCGAACCCAGACTTGAATTCGCTAATTCATAATCAC
TGTCTACTGTCTTTCCACTTTGTGAGTCTGAATCTGTGCCTTTGTAAAGG
ATGTGATCTCTGTCTCTCTGTCTGCTGAGNTACTCTGTGTGTCTCTGCAT
CTGTCAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 10 17 19 27 30 25 23 16 25 18 13 10 10 10 21 21 34 26 24 31 31 31 21 27 11 11 11 13 17 11 11 18 15 18 22 29 29 36
48 57 57 36 36 36 37 43 50 59 59 57 57 57 57 57 44 44 43 43 43 43 43 46 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 51 51 48 47 47 51 51 51 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 68 68
68 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68
68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57
57 57 57 57 28 28 11 11 9 28 28 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 57 52 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 54 57 57 59 57 57 50 59 59 50 57 47 57 57 59 59 57 57 54 59 59 43 44 42 35 35 42 44 48 57 57 44 44 28 36 36 44 43 43 35 35 35 42 36 32 44 44
57 57 44 44 30 39 39 47 44 46 36 36 23 28 28 30 30 34 34 43 43 43 43 47 47 57 48 48 48 40 43 43 43 39 43 39 48 48 48 48 48 48 48 48 48 47 34 34 28 30
31 30 25 29 29 29 32 41 41 47 47 41 41 41 41 39 47 37 32 24 24 31 37 37 30 30 30 34 31 30 28 26 30 34 27 25 12 12 11 23 16 18 18 30 26 34 34 41 41 34
30 22 28 35 35 35 39 39 41 41 29 32 19 19 9 11 11 23 23 32 28 37 37 34 34 39 39 39 34 23 18 11 11 11 13 14 28 22 27 27 28 21 21 13 13 14 27 27 39 36
28 28 28 32 33 31 25 25 30 30 26 24 22 22 24 21 28 21 30 16 23 12 21 13 10 9 9 9 9 12 15 11 11 9 11 11 13 14 26 24 22 22 12 15 9 9 11 11 11 11
11 10 10 10 | Open.Hide. 0 3 7 7 9 9 8 8 9 9 9 9 9 18 10 10 10 10 10 13 22 31 32 37 41 37 30 37 37 37 37 37 37 37 37 35 31 37 32 28 22 21 11 10 10 11 12 10 9 9
14 14 25 27 37 32 31 32 37 30 30 30 33 37 39 46 47 47 44 43 34 20 16 25 21 25 28 34 36 39 31 31 36 36 36 36 57 53 50 50 57 53 50 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 52 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 43 50 57 57 43 43 50 59 57
57 54 57 50 50 47 57 57 57 59 57 57 59 48 48 48 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 46
59 43 43 46 48 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 43 43 57 57 59 59 59 48 48 48 48 41 41 41 41 41 41 41 32 32 41 41 44 41 41 40 46 34 41 23 28 28
30 30 37 37 41 37 37 32 25 25 28 28 23 28 19 30 24 29 24 22 19 19 17 17 22 30 34 43 37 37 34 32 26 23 23 23 27 25 26 25 28 31 31 31 31 25 31 31 35 28
32 20 20 20 32 32 34 28 16 14 14 17 27 26 24 17 17 17 28 21 32 23 20 18 21 13 13 19 28 23 28 18 23 18 30 20 23 20 19 19 24 22 11 11 11 11 12 17 16 15
11 13 13 13 13 21 21 25 28 28 32 24 24 18 22 22 28 19 19 10 14 15 19 11 18 13 14 11 3 0 3 10 10 12 13 17 9 9 9 9 9 11 11 12 12 26 26 20 20 20
21 21 12 12 12 19 15 |