BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007O10
Chromosome11 (Build37)
Map Location 117,852,890 - 117,994,077
singlet/doubletdoublet
Overlap genePgs1, Dnahc17
Upstream geneLOC100042036, Sec14l1, Sept9, EG667423, Tnrc6c, Tmc6, Tmc8, 6030468B19Rik, Syngr2, Tk1, Afmid, Birc5, LOC546519, Tha1, Socs3
Downstream genePscd1, Usp36, Timp2, Ddc8, Lgals3bp, Cant1, C1qtnf1, D230014K01Rik, D11Bwg0517e, Enpp7, Cbx2, Cbx8, Cbx4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007O10.bB6Ng01-007O10.g
ACCDH844335DH844336
length533313
definitionDH844335|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007O10, 5' end.DH844336|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007O10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,852,890 - 117,853,428)(117,993,765 - 117,994,077)
sequence
tcagctgattgacttttagttgtagcttggtaagttgctgttgagtttcc
ctgagtgtgacttagctggtgtgagtggggcccagctgggcacatgctgc
taagcagatggagagctgcctgggattaaaccactcagttccttccatat
ctaatcctctctgtaaatactgacttaagtcagtaaaggagacagcctga
cgggagccctcgggggcaggtatggtccatgtcatgcttagttcctgctg
tgcctcagtagccggcagctcttcagtccccagtgtcactgacttccctt
tagcttgtggtcagtgtatagctggagcggtgcttgctggggagtccagt
ggccacagtgttgagtaaccgagagcatcacttcccttcctgggctcaga
cggcagaagtcaggaagggcctctgctgccagggctgcaggaagtacaga
cttctcaggaagctatgactgttgatcttctcatcagttacctttacgtg
taaatatgtaaatgtgggggagtggagggtgga
accatcatggtgtccgttgctagcgtatacaaacagtgggcttttagaca
tcagtcctgaatctagctggccgtggcggcacatgctctcagctcccagc
aacttaggatccattgggcacaggagctggaggccagcctgcacaaacta
gcaacgcaagcacatgaagtctgaagtacataaaataagataaaataaaa
tcctccattccagtggcttgctgacctctgcccagctttgttagctcagg
gcttcatgggattttccacaggcaggatgctgctctgagggaaggtgggg
gcggtgggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_117852890_117853428
seq2: B6Ng01-007O10.b_47_585

seq1  GAATTCTCAGCTGATTGACTTTTAGTTGTAGCTTGGTAAGTTGCTGTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGCTGATTGACTTTTAGTTGTAGCTTGGTAAGTTGCTGTTGA  50

seq1  GTTTCCCTGAGTGTGACTTAGCTGGTGTGAGTGGGGCCCAGCTGGGCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCCTGAGTGTGACTTAGCTGGTGTGAGTGGGGCCCAGCTGGGCACA  100

seq1  TGCTGCTAAGCAGATGGAGAGCTGCCTGGGATTAAACCACTCAGTTCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTAAGCAGATGGAGAGCTGCCTGGGATTAAACCACTCAGTTCCTT  150

seq1  CCATATCTAATCCTCTCTGTAAATACTGACTTAAGTCAGTAAAGGAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCTAATCCTCTCTGTAAATACTGACTTAAGTCAGTAAAGGAGACA  200

seq1  GCCTGACGGGAGCCCTCGGGGGCAGGTATGGTCCATGTCATGCTTAGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACGGGAGCCCTCGGGGGCAGGTATGGTCCATGTCATGCTTAGTTC  250

seq1  CTGCTGTGCCTCAGTAGCCGGCAGCTCTTCAGTCCCCAGTGTCACTGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTGCCTCAGTAGCCGGCAGCTCTTCAGTCCCCAGTGTCACTGACT  300

seq1  TCCCTTTAGCTTGTGGTCAGTGTATAGCTGGAGCGGTGCTTGCTGGGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTAGCTTGTGGTCAGTGTATAGCTGGAGCGGTGCTTGCTGGGGAG  350

seq1  TCCAGTGGCCACAGTGTTGAGTAACCGAGAGCATCACTTCCCTTCCTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGGCCACAGTGTTGAGTAACCGAGAGCATCACTTCCCTTCCTGGG  400

seq1  CTCAGACGGCAGAAGTCAGGAAGGGCCTCTGCTGCCAGGGCTGCAGGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGACGGCAGAAGTCAGGAAGGGCCTCTGCTGCCAGGGCTGCAGGAAG  450

seq1  TACAGACTTCTCAGGAAGCTATGACTGTTGATCTTCTCATCAGTTACCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGACTTCTCAGGAAGCTATGACTGTTGATCTTCTCATCAGTTACCTT  500

seq1  TACGTGTAAATATGTAAATGTGGGGGAGTGGAGGGTGGA  539
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTGTAAATATGTAAATGTGGGGGAGTGGAGGGTGGA  539

seq1: chr11_117993765_117994077
seq2: B6Ng01-007O10.g_76_388 (reverse)

seq1  CCCCCCCCACCGCCCCCACCTTCCCTCAGAGCAGCATCCTGCCTGTGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCACCGCCCCCACCTTCCCTCAGAGCAGCATCCTGCCTGTGGAA  50

seq1  AATCCCATGAAGCCCTGAGCTAACAAAGCTGGGCAGAGGTCAGCAAGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCATGAAGCCCTGAGCTAACAAAGCTGGGCAGAGGTCAGCAAGCCA  100

seq1  CTGGAATGGAGGATTTTATTTTATCTTATTTTATGTACTTCAGACTTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAATGGAGGATTTTATTTTATCTTATTTTATGTACTTCAGACTTCAT  150

seq1  GTGCTTGCGTTGCTAGTTTGTGCAGGCTGGCCTCCAGCTCCTGTGCCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTGCGTTGCTAGTTTGTGCAGGCTGGCCTCCAGCTCCTGTGCCCAA  200

seq1  TGGATCCTAAGTTGCTGGGAGCTGAGAGCATGTGCCGCCACGGCCAGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCTAAGTTGCTGGGAGCTGAGAGCATGTGCCGCCACGGCCAGCTA  250

seq1  GATTCAGGACTGATGTCTAAAAGCCCACTGTTTGTATACGCTAGCAACGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGGACTGATGTCTAAAAGCCCACTGTTTGTATACGCTAGCAACGG  300

seq1  ACACCATGATGGT  313
      |||||||||||||
seq2  ACACCATGATGGT  313