BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018G07
Chromosome11 (Build37)
Map Location 47,526,951 - 47,580,893
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039647
Upstream geneLOC620678, Havcr1, Timd4, Sgcd, LOC628753
Downstream geneLOC192895, Hn1l-ps2, LOC667163, LOC432554
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018G07.bB6Ng01-018G07.g
ACCDH851808DH851809
length804318
definitionDH851808|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018G07, 5' end.DH851809|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018G07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,580,091 - 47,580,893)(47,526,951 - 47,527,268)
sequence
gaattctattataatgtttagaaaacctatgattctttgattcaaggtga
cacagtcttacacttttagagttaaagctgttgttgacttgcttcaccca
aactttcacaacagggtgagtatcttctatacagtcttctcatctgctca
acctatctcagcctgcgactctgggctagtgcttggtggagttgattgta
aaaaattatccatgaaaagaacctgcaggaaggaaaactttctgggccat
aactgtcttcactcaatgttcacagagcaatcacttgatgtttcaggaca
gggacaggcgaagtaagagagaacaatgcatctgaaaagctaggataaaa
gctaagtgctggaattatgaactgagttcaggtctactactactacctta
aagatgatcacttggaaaatagaaacagtagaggccagaccatttgaata
atttatcctaaagtggataggaaccaaatgcctaatgatctctaaaagga
tgtgtgagaagaacaaagctaaaagcaaagacagataaacattttagaaa
tagatctatggaggaatcgagagcccccaagtggagctgtccagttaacc
tccatgttgagagtagatgggaggatgaaatgtggagttatgcattgcct
ctgaggaaaaagatatcagttgtgctcttctgaagttgcaatttagtggt
gaagtatactggcaatgtagatatcacatcaaaagttcatcaatgtacgt
ttgatagtagcatagtttgaaacccacatttggatttattgttgttgttg
ttgt
actatgaagatgagattggccatgaactctaagagatccatccattcctg
cctcctgaatactgggattaaaggcatgtgccatcatgcctgacttgcta
acagggttacaaaacaacaaacaaacatgagttgcttaaaaaaaacaact
tatcaaaatgaataaaatatacaaagaatctcagaggccatccaagtggt
ttttttccttgtggctcaagggccagacattatgggatttaatgggcctg
gccaatatcttacagatgttggatggttatttataatgataggatgttta
agagtgtaatgtggtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_47580091_47580893
seq2: B6Ng01-018G07.b_45_848 (reverse)

seq1  ACAACAACAACAACAATAAATCC-AATGTGGGTTTCAAACTATGCTACTA  49
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACAACAACAATAAATCCAAATGTGGGTTTCAAACTATGCTACTA  50

seq1  TCAAACGTACATTGATGAACTTTTGATGTGATATCTACATTGCCAGTATA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACGTACATTGATGAACTTTTGATGTGATATCTACATTGCCAGTATA  100

seq1  CTTCACCACTAAATTGCAACTTCAGAAGAGCACAACTGATATCTTTTTCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACCACTAAATTGCAACTTCAGAAGAGCACAACTGATATCTTTTTCC  150

seq1  TCAGAGGCAATGCATAACTCCACATTTCATCCTCCCATCTACTCTCAACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGCAATGCATAACTCCACATTTCATCCTCCCATCTACTCTCAACA  200

seq1  TGGAGGTTAACTGGACAGCTCCACTTGGGGGCTCTCGATTCCTCCATAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTTAACTGGACAGCTCCACTTGGGGGCTCTCGATTCCTCCATAGA  250

seq1  TCTATTTCTAAAATGTTTATCTGTCTTTGCTTTTAGCTTTGTTCTTCTCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTCTAAAATGTTTATCTGTCTTTGCTTTTAGCTTTGTTCTTCTCA  300

seq1  CACATCCTTTTAGAGATCATTAGGCATTTGGTTCCTATCCACTTTAGGAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCCTTTTAGAGATCATTAGGCATTTGGTTCCTATCCACTTTAGGAT  350

seq1  AAATTATTCAAATGGTCTGGCCTCTACTGTTTCTATTTTCCAAGTGATCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATTCAAATGGTCTGGCCTCTACTGTTTCTATTTTCCAAGTGATCA  400

seq1  TCTTTAAGGTAGTAGTAGTAGACCTGAACTCAGTTCATAATTCCAGCACT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGGTAGTAGTAGTAGACCTGAACTCAGTTCATAATTCCAGCACT  450

seq1  TAGCTTTTATCCTAGCTTTTCAGATGCATTGTTCTCTCTTACTTCGCCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTTATCCTAGCTTTTCAGATGCATTGTTCTCTCTTACTTCGCCTG  500

seq1  TCCCTGTCCTGAAACATCAAGTGATTGCTCTGTGAACATTGAGTGAAGAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTCCTGAAACATCAAGTGATTGCTCTGTGAACATTGAGTGAAGAC  550

seq1  AGTTATGGCCCAGAAAGTTTTCCTTCCTGCAGGTTCTTTTCATGGATAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATGGCCCAGAAAGTTTTCCTTCCTGCAGGTTCTTTTCATGGATAAT  600

seq1  TTTTTACAATCAACTCCACCAAGCACTAGCCCAGAGTCGCAGGCTGAGAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACAATCAACTCCACCAAGCACTAGCCCAGAGTCGCAGGCTGAGAT  650

seq1  AGGTTGAGCAGATGAGAAGACTGTATAGAAGATACTCACCCTGTTGTGAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGAGCAGATGAGAAGACTGTATAGAAGATACTCACCCTGTTGTGAA  700

seq1  AGTTTGGGTGAAGCAAGTCAACAACAGCTTTAACTCTAAAAGTGTAAGAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGGTGAAGCAAGTCAACAACAGCTTTAACTCTAAAAGTGTAAGAC  750

seq1  TGTGTCACCTTGAATCAAAGAATCATAGGTTTTCTAAACATTATAATAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCACCTTGAATCAAAGAATCATAGGTTTTCTAAACATTATAATAGA  800

seq1  ATTC  803
      ||||
seq2  ATTC  804

seq1: chr11_47526951_47527268
seq2: B6Ng01-018G07.g_71_388

seq1  ACTATGAAGATGAGATTGGCCATGAACTCTAAGAGATCCATCCATTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGAAGATGAGATTGGCCATGAACTCTAAGAGATCCATCCATTCCTG  50

seq1  CCTCCTGAATACTGGGATTAAAGGCATGTGCCATCATGCCTGACTTGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGAATACTGGGATTAAAGGCATGTGCCATCATGCCTGACTTGCTA  100

seq1  ACAGGGTTACAAAACAACAAACAAACATGAGTTGCTTAAAAAAAACAACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGTTACAAAACAACAAACAAACATGAGTTGCTTAAAAAAAACAACT  150

seq1  TATCAAAATGAATAAAATATACAAAGAATCTCAGAGGCCATCCAAGTGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAAATGAATAAAATATACAAAGAATCTCAGAGGCCATCCAAGTGGT  200

seq1  TTTTTTCCTTGTGGCTCAAGGGCCAGACATTATGGGATTTAATGGGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCCTTGTGGCTCAAGGGCCAGACATTATGGGATTTAATGGGCCTG  250

seq1  GCCAATATCTTACAGATGTTGGATGGTTATTTATAATGATAGGATGTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATATCTTACAGATGTTGGATGGTTATTTATAATGATAGGATGTTTA  300

seq1  AGAGTGTAATGTGGTGGG  318
      ||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTAATGTGGTGGG  318