BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-019G03
Chromosome11 (Build37)
Map Location 3,670,207 - 3,671,194
singlet/doubletsinglet
Overlap geneOsbp2
Upstream geneLOC236604, Sfi1, LOC623257, Eif4enif1, Drg1, Patz1, Pik3ip1, Limk2, Rnf185, 8430429K09Rik, LOC100041573, Pla2g3, Pib5pa, Selm, Smtn, Map1lc3-5, LOC625608, Tug1, Morc2a, LOC664900
Downstream geneLOC664920, 4921536K21Rik, Dusp18, Slc35e4, Tcn2, LOC100041720, Pes1, Gal3st1, Sec14l4, Sec14l3, 1700020C11Rik, Sec14l2, LOC625729, Rnf215, 4930562D19Rik, Sf3a1, Tbc1d10a, 2410008K03Rik, LOC625760, Osm, Lif, Hormad2, Mtmr3, LOC100041006, OTTMUSG00000005065, Ascc2, 1110020P15Rik, Zmat5, Cabp7, Nf2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-019G03.b
ACCDH852485
length983
definitionDH852485|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-019G03, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccttggcttgtgacatcattctacccctgccttgcttttcccatt
ctatgtctttatatagtgtccttgtgtatgtgtgtgtactgtccatgccc
atgtttgcatgtgtatgcctgtgtatatgtgtgtgtatgtgcctgagtgt
gcctttgtagactgccctcctgtgtgtgcatatgtgttggatgcatattc
atgtatgttcttgtatagtgtccttgcatatgcatgtgaatgtatgtgtc
catgcatgtacaatgtgtgtaagtgcctatgtgtgtccctatacaatgtt
ttcatgtgtgtgcacgtgtattctgtgcctgtgtatgtgtgcatgcacac
acatgtgtgtgtttctgtcaagctgcgataggaacctgaatgactttgcc
ataaagattacatctgcagagacctatttttcccaaataaggtcacacta
acaacaagtacagggcgttaggacataatgcagaccataggactggtacc
taatgctgcacttgatacacagggtgagactcttgttcttgtgactagcc
agccaagaaagagtgatgaggtcagagcagggaggaaagtgtgctgaaga
cagctggttggatctggaggagtgcaggcaggattggccgcacttaaatc
ctgcctaggcatagagagcacagtgcactcctttgcagtgtgggctccaa
agttgacttgcagaaaggccttcccagagccaggagctagcaggggaagg
ctcttcaggaaagcagtggcaagagcagaatttgtccctgaaacacacaa
gcacagctctgaggaatcccaggcgggaaagtggccagatgcaaaaatgt
caacctcggtagggaacttaatcagggatgaaattgcatagcttgaggga
acgagtgtaaccaaagaaatgtgacaggaaagggacagggccgggctgca
ggtggagaaggaggaaggaatgaggctaatggg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_3670207_3671194
seq2: B6Ng01-019G03.b_41_1023

seq1  GAATTCCTTGGCTTGTGACATCATTCTACCCCTGCCTTGCTTTTCCCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGGCTTGTGACATCATTCTACCCCTGCCTTGCTTTTCCCATT  50

seq1  CTATGTCTTTATATAGTGTCCTTGTGTATGTGTGTGTACTGTCCATGCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTCTTTATATAGTGTCCTTGTGTATGTGTGTGTACTGTCCATGCCC  100

seq1  ATGTTTGCATGTGTATGCCTGTGTATATGTGTGTGTATGTGCCTGAGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTGCATGTGTATGCCTGTGTATATGTGTGTGTATGTGCCTGAGTGT  150

seq1  GCCTTTGTAGACTGCCCTCCTGTGTGTGCATATGTGTTGGATGCATATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGTAGACTGCCCTCCTGTGTGTGCATATGTGTTGGATGCATATTC  200

seq1  ATGTATGTTCTTGTATAGTGTCCTTGCATATGCATGTGAATGTATGTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTTCTTGTATAGTGTCCTTGCATATGCATGTGAATGTATGTGTC  250

seq1  CATGCATGTACAATGTGTGTAAGTGCCTATGTGTGTCCCTATACAATGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCATGTACAATGTGTGTAAGTGCCTATGTGTGTCCCTATACAATGTT  300

seq1  TTCATGTGTGTGCACGTGTATTCTGTGCCTGTGTATGTGTGCATGCACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTGTGTGCACGTGTATTCTGTGCCTGTGTATGTGTGCATGCACAC  350

seq1  ACATGTGTGTGTTTCTGTCAAGCTGCGATAGGAACCTGAATGACTTTGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGTGTGTTTCTGTCAAGCTGCGATAGGAACCTGAATGACTTTGCC  400

seq1  ATAAAGATTACATCTGCAGAGACCTATTTTTCCCAAATAAGGTCACACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGATTACATCTGCAGAGACCTATTTTTCCCAAATAAGGTCACACTA  450

seq1  ACAACAAGTACAGGGCGTTAGGACATAATGCAGACCATAGGACTGGTACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAGTACAGGGCGTTAGGACATAATGCAGACCATAGGACTGGTACC  500

seq1  TAATGCTGCACTTGATACACAGGGTGAGACTCTTGTTCTTGTGACTAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCTGCACTTGATACACAGGGTGAGACTCTTGTTCTTGTGACTAGCC  550

seq1  AGCCAAGAAAGAGTGATGAGGTCAGAGCAGGGAGGAAAGTGTGCTGAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGAAAGAGTGATGAGGTCAGAGCAGGGAGGAAAGTGTGCTGAAGA  600

seq1  CAGCTGGTTGGATCTGGAGGAGTGCAGGCAGGATTGGCCGCACTTAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGTTGGATCTGGAGGAGTGCAGGCAGGATTGGCCGCACTTAAATC  650

seq1  CTGCCTAGGCATAGAGAGCACAGTGCACTCCTTTGCAGTGTGGGCTCCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTAGGCATAGAGAGCACAGTGCACTCCTTTGCAGTGTGGGCTCCAA  700

seq1  AGTTGACTTGCAGAAAGGCCTTCCCAGAGCCAGGAGCTAGCAGGGGAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGACTTGCAGAAAGGCCTTCCCAGAGCCAGGAGCTAGCAGGGGAAGG  750

seq1  CTCTTCAGGAAAGCAGTGGCAAGAGCAGAATTTGTCCCTGAAACACACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCAGGAAAGCAGTGGCAAGAGCAGAATTTGTCCCTGAAACACACAA  800

seq1  GGCACAGCTCTGAGGAATCCCAGGCGGGAAAGTGGCCAGATGCAAAAATG  850
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GCACAGCTCTGAGGAATCCCAGGCGGGAAAGTGGCCAGATGCAAAAATG  849

seq1  TCAACCTCGGTAGGGAACTTAATCAGGGATGAAACTGCATAGCCTGAGGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  TCAACCTCGGTAGGGAACTTAATCAGGGATGAAATTGCATAGCTTGAGGG  899

seq1  AACGAGTGTAACCCAAAGAAAATGTGACAGGAAAAGGGACAGGGCCGGGC  950
      ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AACGAGTGTAA-CCAAAG-AAATGTGACAGG-AAAGGGACAGGGCCGGGC  946

seq1  TGCAGGTGGGAAGAGGAGGAAGGAATGAGGCTCATGGG  988
      ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGCAGGT-GGAGAAGGAGGAAGGAATGAGGCTAATGGG  983