seq1: chr11_3709059_3710178
seq2: B6Ng01-032D03.b_44_1140
seq1 GAATTCAATTTAAAATCAATAAAACTGTGGTAAGCACAAGCCAGGCCTTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAATTTAAAATCAATAAAACTGTGGTAAGCACAAGCCAGGCCTTG 50
seq1 TGGCAAGCATCCGTAATTCCAGAGCTTGGGAAGAAGGCAGAGGGGTCAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGCAAGCATCCGTAATTCCAGAGCTTGGGAAGAAGGCAGAGGGGTCAAA 100
seq1 GGACACAATTCTTCATGAACCCGAAGGCAGATGAGAGGGACAGTGTCACA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGACACAATTCTTCATGAACCCGAAGGCAGATGAGAGGGACAGTGTCACA 150
seq1 AGGCGGTCGGGAAGCTGTAGCCAGCAAACGCCTGAGTCTGAAAGGCAGGT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGCGGTCGGGAAGCTGTAGCCAGCAAACGCCTGAGTCTGAAAGGCAGGT 200
seq1 TTCAGGGGAGGGCAGGTGCTGCTCCAAGAAGAGACGCCATGAGTGGCAGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCAGGGGAGGGCAGGTGCTGCTCCAAGAAGAGACGCCATGAGTGGCAGC 250
seq1 CATGAGTGCCCTCAGCCTGAGCATGACAGCTTACAGGTGGGTCCATGACC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATGAGTGCCCTCAGCCTGAGCATGACAGCTTACAGGTGGGTCCATGACC 300
seq1 CCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCAT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCAT 350
seq1 GACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATAACAGGTTACAG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATAACAGGTTACAG 400
seq1 GTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGGGTCCGTGA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGGGTCCGTGA 450
seq1 CCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGC 500
seq1 ATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTAC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTAC 550
seq1 AGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGT 600
seq1 GACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCTGTGACCCCACAGGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCTGTGACCCCACAGGG 650
seq1 GCATAACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCATAACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTT 700
seq1 ACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCC 750
seq1 GTGACCCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAG 800
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGACTCCACAGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAG 800
seq1 GGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACAGGGGAATGACAGG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 GGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCACA-GGGAATGACAGG 849
seq1 TTACAGGTGGATCTGTGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGGGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTACAGGTGGATCTGTGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGGGT 899
seq1 CCGTGACCCCACAGGGGCATGACATCTTACAGGTGGGTCCGTGACCCCAC 950
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2 CCGTGACCCCACAGGGGCATGACATCTTACA-GTGGGTTCGTGACCCCAC 948
seq1 AGGGGCATGACAGGTTACAGGTGGGTCCATGACCCCACAGGGGCATGACA 1000
|||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||
seq2 AGGGGCATGACA-GTTACA-GTGGGTCCATGA-CCCACA-GGGCATGAC- 993
seq1 GCTTACAGATGGGTCCATGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGG 1050
|| ||| || ||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||
seq2 GC-TAC-GAATGGTCCATGACCCC-CA-GGGCATGA-AGC-TACA-GTGG 1036
seq1 GTCTGTGACCCCACAGGGGCATGACAGCTTACAGGTGGGTCCATGACCCC 1100
|||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||
seq2 GTCTGT-AACCCACA-GGGCATGACA-CTTACA-GTGGTTC--TGACCCC 1080
seq1 ACAGGGGCATGACAGCTTAC 1120
| |||||||| |||||||
seq2 A---GGGCATGAAAGCTTAC 1097
| seq1: chrY_385658_385743
seq2: B6Ng01-032D03.g_101_181 (reverse)
seq1 CTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATC 50
||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||
seq2 CTGTCCTAGA----ACTCTATAGACCAGGCTGACCTCAGACTCAGAGATC 46
seq1 TGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGG 86
||||||||||||||| || |||||||||||||||||
seq2 TGCCTGCCTCTGCCT-CCAAGTGCTGGGATTAAAGG 81
|