BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-043H05
Chromosome11 (Build37)
Map Location 36,247,005 - 36,369,919
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz2
Upstream geneSlit3, Pank3, LOC666733, AI595406, Rars, Wwc1, LOC636532
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-043H05.bB6Ng01-043H05.g
ACCDH869510DH869511
length1,0351,011
definitionDH869510|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043H05, 5' end.DH869511|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043H05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,247,005 - 36,248,044)(36,368,906 - 36,369,919)
sequence
gaattcatggaagattgatctagaatgggctgttaaggggagtcagggac
cctgacagcacaactaaccttccaagctggatgaagagcaatcgcgttca
ctcaacaaaagctccttggtgccccattgaagtcgtggtcctagacagga
agaccagagatttggccaagtagagaaatgattcagtccccatgtctcct
cttcaggaaaatgaacaattcccttcttgttacagctcaaccctgcatca
tggactagctcggtatattagccacaggcaaaatgaactccacactggca
tgacgaaggcaatgtgatggcaggaacgtcctccttcggaggggtagtga
cacagcaatgaaatttcccccgtgtctagctggacagtccctacttggag
gacagaggtgacttcaccttgcaaaagccccaggcactgcttactgaaac
aacctttggcaggacctcacagttaagtcggctcatctaagcaagaagtc
agcttggggagagttagttgcctcatccaagaacaggagaagggaagaga
aacttgcctttctcaaagcttccctttgaatgttgattcctgtgactgat
tcctatgatgtatttgattgccactcctgatgacttcttcccttccaaat
cagctatcttgggtggaaggttgtggtcttgaaatggaagtaatggccag
aggacagagtggaggtcagtggagcaagctcagactggcaagcccagctt
tgatgcacacactatcaaagcaatgggaaatatgttcctgagcagaaggc
agcagggttccctttaacaataagcacacggaagacagcctcacaggaaa
agcatacaccagtcccacagcaggcacaaaacaaccagatactcagagat
cagatcagcagaggaatgaaggacgcaaatttccctgaagatggctccca
gcaattggtggaatggatgttcaccctacttgcctttccttagtgagcct
tggctacgcatgggtacactgtttctagcttggag
gaattccttacagaatgagtgatgttcccccaaagacttagctaaagagt
ggaattccacaaacctagcacagtcagtcctagtaactatttaaaagaat
aataagtcatggaaaaatacatcatggaagcagaagacattaattgatga
aaggcaagtttctttttcaattccatctatctaaaccctttaagaaatat
atcctaagccttgagtggggatgttagtatttccagacatacagagaact
cagcctccaagccgcttcctctctacatccccttatttcctgcacctcac
cttaaattaccagtgtagtttcttgtcccaaccaagtattggatcccagt
ctgggcatcttcttttgtgggaagggaatagcagaataccagttctcagc
tgaagccaaacactaggatcaccaaaccaagtactctttctaaaattatt
tttaattcaaaatatagtatcattgcccccttccctttccttcattgaac
cctcccaatgtgtcccatgttttagtcccgaggcatcatagctggggaaa
gactggttgcttcccttgaaggctttcatagcatttttctgtaccatgga
aactcatccccagggaggatgctttcaagtgagacctagctgagatcatc
taggtcctgtgtctgaagttttgggtgtctttgcaatagggacttaactt
taatctctgggaggcagctaatatatgtaatattgcatattacataggta
catattacagtatacataaatattacatagcctgtaatatttttggaaat
ctcttgcacaattctgcccaaaattgcacagggggatggtggcttccatg
tctgatgttaaggatattgttagtctatggttcttggtaagagcattgtc
agtccagagggaaaatttttgttaaactatatctatctatatatatatag
atatatatgtgcatgtatgtattacagactggaatgcactataggtgatt
taggtaaacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_36247005_36248044
seq2: B6Ng01-043H05.b_44_1078

seq1  GAATTCATGGAAGATTGATCTAGAATGGGCTGTTAAGGGGAGTCAGGGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGAAGATTGATCTAGAATGGGCTGTTAAGGGGAGTCAGGGAC  50

seq1  CCTGACAGCACAACTAACCTTCCAAGCTGGATGAAGAGCAATCGCGTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACAGCACAACTAACCTTCCAAGCTGGATGAAGAGCAATCGCGTTCA  100

seq1  CTCAACAAAAGCTCCTTGGTGCCCCATTGAAGTCGTGGTCCTAGACAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACAAAAGCTCCTTGGTGCCCCATTGAAGTCGTGGTCCTAGACAGGA  150

seq1  AGACCAGAGATTTGGCCAAGTAGAGAAATGATTCAGTCCCCATGTCTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGAGATTTGGCCAAGTAGAGAAATGATTCAGTCCCCATGTCTCCT  200

seq1  CTTCAGGAAAATGAACAATTCCCTTCTTGTTACAGCTCAACCCTGCATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGGAAAATGAACAATTCCCTTCTTGTTACAGCTCAACCCTGCATCA  250

seq1  TGGACTAGCTCGGTATATTAGCCACAGGCAAAATGAACTCCACACTGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTAGCTCGGTATATTAGCCACAGGCAAAATGAACTCCACACTGGCA  300

seq1  TGACGAAGGCAATGTGATGGCAGGAACGTCCTCCTTCGGAGGGGTAGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGAAGGCAATGTGATGGCAGGAACGTCCTCCTTCGGAGGGGTAGTGA  350

seq1  CACAGCAATGAAATTTCCCCCGTGTCTAGCTGGACAGTCCCTACTTGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAATGAAATTTCCCCCGTGTCTAGCTGGACAGTCCCTACTTGGAG  400

seq1  GACAGAGGTGACTTCACCTTGCAAAAGCCCCAGGCACTGCTTACTGAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGGTGACTTCACCTTGCAAAAGCCCCAGGCACTGCTTACTGAAAC  450

seq1  AACCTTTGGCAGGACCTCACAGTTAAGTCGGCTCATCTAAGCAAGAAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTGGCAGGACCTCACAGTTAAGTCGGCTCATCTAAGCAAGAAGTC  500

seq1  AGCTTGGGGAGAGTTAGTTGCCTCATCCAAGAACAGGAGAAGGGAAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGGGGAGAGTTAGTTGCCTCATCCAAGAACAGGAGAAGGGAAGAGA  550

seq1  AACTTGCCTTTCTCAAAGCTTCCCTTTGAATGTTGATTCCTGTGACTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGCCTTTCTCAAAGCTTCCCTTTGAATGTTGATTCCTGTGACTGAT  600

seq1  TCCTATGATGTATTTGATTGCCACTCCTGATGACTTCTTCCCTTCCAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGATGTATTTGATTGCCACTCCTGATGACTTCTTCCCTTCCAAAT  650

seq1  CAGCTATCTTGGGTGGAAGGTTGTGGTCTTGAAATGGAAGTAATGGCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATCTTGGGTGGAAGGTTGTGGTCTTGAAATGGAAGTAATGGCCAG  700

seq1  AGGACAGAGTGGAGGTCAGTGGAGCAAGCTCAGACTGGCAAGCCCAGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGAGTGGAGGTCAGTGGAGCAAGCTCAGACTGGCAAGCCCAGCTT  750

seq1  TGATGCACACACTATCAAAGCAATGGGAAATATGTTCCTGAGCAGGAGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGATGCACACACTATCAAAGCAATGGGAAATATGTTCCTGAGCAGAAGGC  800

seq1  AGCAGGGTTCCC-TTAACAATAAGCACACGGAAGACAGCCTCACAGGAAA  849
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGTTCCCTTTAACAATAAGCACACGGAAGACAGCCTCACAGGAAA  850

seq1  AGCATACACCAGTCCCACAGCAGGCACAAAACAACCAGATACTCAGAGAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATACACCAGTCCCACAGCAGGCACAAAACAACCAGATACTCAGAGAT  900

seq1  CAGATCAGCAGAGGAATGAAGGACGCAAATTTCCCTGAAGATGGCTCCCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAGCAGAGGAATGAAGGACGCAAATTTCCCTGAAGATGGCTCCCA  950

seq1  GCAATATGTTGGAATGGATGTTCCAGCCTACTTGCCTTTCCTTAAGTGAA  999
      ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
seq2  GCAAT-TGGTGGAATGGATGTT-CACCCTACTTGCCTTTCCTT-AGTG-A  996

seq1  GCCTTGGCTACGCATGGGTACAACTGTTTCTTAGCTTGGAG  1040
      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  GCCTTGGCTACGCATGGGTAC-ACTGTTTC-TAGCTTGGAG  1035

seq1: chr11_36368906_36369919
seq2: B6Ng01-043H05.g_67_1077 (reverse)

seq1  CTATTTACCTAAAATCACTTATAGTGCATATCAGTCTGTAAATACATACA  50
      || ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||
seq2  CTGTTTACCT-AAATCACCTATAGTGCATTCCAGTCTGT-AATACATACA  48

seq1  TACACATATATATCTATATATATATAGATAGATATAGTTTAAACAAAAAT  100
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGCACATATATATCTATATATATATAGATAGATATAGTTT-AACAAAAAT  97

seq1  TTTCCTTCTGGACTGACAATGCTCTTACCAAGAACCATAGACTAACAATA  150
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTCTGGACTGACAATGCTCTTACCAAGAACCATAGACTAACAATA  147

seq1  TCCTTAACATCAGACATTGGAAGCCACCATCCCCCTGTGCAATTTTGGGC  200
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAACATCAGACA-TGGAAGCCACCATCCCCCTGTGCAATTTTGGGC  196

seq1  AGAATTGTGCAAGAGATTTCC-AAAATATTACAGGCTATGTAATATTTAT  249
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGTGCAAGAGATTTCCAAAAATATTACAGGCTATGTAATATTTAT  246

seq1  GTATACTGTAATATGTACCTATGTAATATGCAATATTACATATATTAGCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACTGTAATATGTACCTATGTAATATGCAATATTACATATATTAGCT  296

seq1  GCCTCCCAGAGATTAAAGTTAAGTCCCTATTGCAAAGACACCCAAAACTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCCAGAGATTAAAGTTAAGTCCCTATTGCAAAGACACCCAAAACTT  346

seq1  CAGACACAGGACCTAGATGATCTCAGCTAGGTCTCACTTGAAAGCATCCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACACAGGACCTAGATGATCTCAGCTAGGTCTCACTTGAAAGCATCCT  396

seq1  CCCTGGGGATGAGTTTCCATGGTACAGAAAAATGCTATGAAAGCCTTCAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGGATGAGTTTCCATGGTACAGAAAAATGCTATGAAAGCCTTCAA  446

seq1  GGGAAGCAACCAGTCTTTCCCCAGCTATGATGCCTCGGGACTAAAACATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGCAACCAGTCTTTCCCCAGCTATGATGCCTCGGGACTAAAACATG  496

seq1  GGACACATTGGGAGGGTTCAATGAAGGAAAGGGAAGGGGGCAATGATACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACATTGGGAGGGTTCAATGAAGGAAAGGGAAGGGGGCAATGATACT  546

seq1  ATATTTTGAATTAAAAATAATTTTAGAAAGAGTACTTGGTTTGGTGATCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTGAATTAAAAATAATTTTAGAAAGAGTACTTGGTTTGGTGATCC  596

seq1  TAGTGTTTGGCTTCAGCTGAGAACTGGTATTCTGCTATTCCCTTCCCACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTTTGGCTTCAGCTGAGAACTGGTATTCTGCTATTCCCTTCCCACA  646

seq1  AAAGAAGATGCCCAGACTGGGATCCAATACTTGGTTGGGACAAGAAACTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGATGCCCAGACTGGGATCCAATACTTGGTTGGGACAAGAAACTA  696

seq1  CACTGGTAATTTAAGGTGAGGTGCAGGAAATAAGGGGATGTAGAGAGGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGTAATTTAAGGTGAGGTGCAGGAAATAAGGGGATGTAGAGAGGAA  746

seq1  GCGGCTTGGAGGCTGAGTTCTCTGTATGTCTGGAAATACTAACATCCCCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGCTTGGAGGCTGAGTTCTCTGTATGTCTGGAAATACTAACATCCCCA  796

seq1  CTCAAGGCTTAGGATATATTTCTTAAAGGGTTTAGATAGATGGAATTGAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGCTTAGGATATATTTCTTAAAGGGTTTAGATAGATGGAATTGAA  846

seq1  AAAGAAACTTGCCTTTCATCAATTAATGTCTTCTGCTTCCATGATGTATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAACTTGCCTTTCATCAATTAATGTCTTCTGCTTCCATGATGTATT  896

seq1  TTTCCATGACTTATTATTCTTTTAAATAGTTACTAGGACTGACTGTGCTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATGACTTATTATTCTTTTAAATAGTTACTAGGACTGACTGTGCTA  946

seq1  GGTTTGTGGAATTCCACTCTTTAGCTAAGTCTTTGGGGGAACATCACTCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGTGGAATTCCACTCTTTAGCTAAGTCTTTGGGGGAACATCACTCA  996

seq1  TTCTGTAAGGAATTC  1014
      |||||||||||||||
seq2  TTCTGTAAGGAATTC  1011