BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051M04
Chromosome11 (Build37)
Map Location 55,603,523 - 55,710,026
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041463, Lyrm7, Hint1, Gpx3, Tnip1, LOC667826, Anxa6, Ccdc69, Gm2a, LOC667832, Slc36a3, Slc36a2, Slc36a1, Fat2, Sparc, Atox1, G3bp, Glra1
Downstream geneNmur2, LOC100040816, LOC624168
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051M04.bB6Ng01-051M04.g
ACCDH875307DH875308
length842733
definitionDH875307|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051M04, 5' end.DH875308|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051M04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(55,603,523 - 55,604,364)(55,709,295 - 55,710,026)
sequence
gaattcaccgactcatagcagaactttgggacccttgaaggtggtctcaa
agactcagaaacccactctcagctcagatgcattttcttagcttctctga
gggcaagctggatgcattggctccacatgctgcacgccatgagttctatg
atttggattttagaaaagagataaatagaggcttgaggaagtgaaataat
tcatggggaatgatgaactttagaagggacagagccccagattgtaggac
ttcactttcatctgccttcctctgctttgttatctatctccccatggtgg
attgcctttcatcatgacaaaggtgccagctctggggacagtgccctgaa
ccacttttgtgctcagtgtcctgagattatatggggtctacaggggttca
ctaacttgagagggaaggattcagtatagcgctggtgagatggctcagta
ggtagtggttggggcacactcgtgaggacccgagtcttgagacccagtac
taatatgaagagtcaggtgtggtagtatgtgcctgcaatcccaacactgt
ggagctagagaaaaatctctggagcttgctggctagccagcctaaccaaa
ttggcgaattccaggttcagtgaggaaccctgtctcaaaaaagtaagata
gagaggagctggaaagatggttctgctgataagagcactggctgctttct
caggggattccgagttcagttctcagtacccacaaacactgacaacttca
gcttcagattatctgatgccctcttgtggcttctataagtactctctctc
tctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctc
gaattcaaaccttaggtaggaaagaggcttacatacatacatgcatttgt
ttatttgctgatcaggttatgcccagcacatccttctgtggtaccctcaa
ggaatatgtaaagatccagattctgacctccagatgccacaggtcacaag
cagagatgaatgtgtacatacagtaaaatgtgaggtcagtaattgttttt
ccttaccctccacatccagtttgccagtaagtctggtagagtaaatgatg
atgatgatgatagtaataataataattaataaaacatgtatcgtggatgc
tatggaggtgggtcacttagttaaagtgtcttcttatcaagcttgaggac
ctgagtttggatatccaaagcccaagtgaaaaatctgggtgtgttgatgc
atgtctggacttccgcactatgtgatggaaggcagaaacaggaggaaccc
taggagctgagagcctgctgctctggcctatatggtgaacttctgagcca
atgacagctgttccctcaaacaaaaggtagaagatgcctgaggactggca
tctgagattgtcctctaacctccacacatatgcttatacttgtagacaca
caggagaacacacatatgaacaccaaatatgcccaccaaagagagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagaaagaagaagaagaagaag
aagaagaaagaagaagaagaaggaggaggagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_55603523_55604364
seq2: B6Ng01-051M04.b_46_887

seq1  GAATTCACCGACTCATAGCAGAACTTTGGGACCCTTGAAGGTGGTCTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCGACTCATAGCAGAACTTTGGGACCCTTGAAGGTGGTCTCAA  50

seq1  AGACTCAGAAACCCACTCTCAGCTCAGATGCATTTTCTTAGCTTCTCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCAGAAACCCACTCTCAGCTCAGATGCATTTTCTTAGCTTCTCTGA  100

seq1  GGGCAAGCTGGATGCATTGGCTCCACATGCTGCACGCCATGAGTTCTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGCTGGATGCATTGGCTCCACATGCTGCACGCCATGAGTTCTATG  150

seq1  ATTTGGATTTTAGAAAAGAGATAAATAGAGGCTTGAGGAAGTGAAATAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGATTTTAGAAAAGAGATAAATAGAGGCTTGAGGAAGTGAAATAAT  200

seq1  TCATGGGGAATGATGAACTTTAGAAGGGACAGAGCCCCAGATTGTAGGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGGGAATGATGAACTTTAGAAGGGACAGAGCCCCAGATTGTAGGAC  250

seq1  TTCACTTTCATCTGCCTTCCTCTGCTTTGTTATCTATCTCCCCATGGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTTTCATCTGCCTTCCTCTGCTTTGTTATCTATCTCCCCATGGTGG  300

seq1  ATTGCCTTTCATCATGACAAAGGTGCCAGCTCTGGGGACAGTGCCCTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCTTTCATCATGACAAAGGTGCCAGCTCTGGGGACAGTGCCCTGAA  350

seq1  CCACTTTTGTGCTCAGTGTCCTGAGATTATATGGGGTCTACAGGGGTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTTGTGCTCAGTGTCCTGAGATTATATGGGGTCTACAGGGGTTCA  400

seq1  CTAACTTGAGAGGGAAGGATTCAGTATAGCGCTGGTGAGATGGCTCAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTTGAGAGGGAAGGATTCAGTATAGCGCTGGTGAGATGGCTCAGTA  450

seq1  GGTAGTGGTTGGGGCACACTCGTGAGGACCCGAGTCTTGAGACCCAGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTGGTTGGGGCACACTCGTGAGGACCCGAGTCTTGAGACCCAGTAC  500

seq1  TAATATGAAGAGTCAGGTGTGGTAGTATGTGCCTGCAATCCCAACACTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGAAGAGTCAGGTGTGGTAGTATGTGCCTGCAATCCCAACACTGT  550

seq1  GGAGCTAGAGAAAAATCTCTGGAGCTTGCTGGCTAGCCAGCCTAACCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTAGAGAAAAATCTCTGGAGCTTGCTGGCTAGCCAGCCTAACCAAA  600

seq1  TTGGCGAATTCCAGGTTCAGTGAGGAACCCTGTCTCAAAAAAGTAAGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCGAATTCCAGGTTCAGTGAGGAACCCTGTCTCAAAAAAGTAAGATA  650

seq1  GAGAGGAGCTGGAAAGATGGTTCTGCTGATAAGAGCACTGGCTGCTTTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAGCTGGAAAGATGGTTCTGCTGATAAGAGCACTGGCTGCTTTCT  700

seq1  CAGGGGATTCCGAGTTCAGTTCTCAGTACCCACAAACACTGACAACTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGATTCCGAGTTCAGTTCTCAGTACCCACAAACACTGACAACTTCA  750

seq1  GCTTCAGATTATCTGATGCCCTCTTGTGGCTTCTATAAGTACTCTCTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGATTATCTGATGCCCTCTTGTGGCTTCTATAAGTACTCTCTCTC  800

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  842

seq1: chr11_55709295_55710026
seq2: B6Ng01-051M04.g_66_798 (reverse)

seq1  TCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTC-TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT  49
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT  50

seq1  TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGGTG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGGTG  100

seq1  GGCATATTTGGTGTTCATATGTGTGTTCTCCTGTGTGTCTACAAGTATAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATATTTGGTGTTCATATGTGTGTTCTCCTGTGTGTCTACAAGTATAA  150

seq1  GCATATGTGTGGAGGTTAGAGGACAATCTCAGATGCCAGTCCTCAGGCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGTGTGGAGGTTAGAGGACAATCTCAGATGCCAGTCCTCAGGCAT  200

seq1  CTTCTACCTTTTGTTTGAGGGAACAGCTGTCATTGGCTCAGAAGTTCACC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACCTTTTGTTTGAGGGAACAGCTGTCATTGGCTCAGAAGTTCACC  250

seq1  ATATAGGCCAGAGCAGCAGGCTCTCAGCTCCTAGGGTTCCTCCTGTTTCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGGCCAGAGCAGCAGGCTCTCAGCTCCTAGGGTTCCTCCTGTTTCT  300

seq1  GCCTTCCATCACATAGTGCGGAAGTCCAGACATGCATCAACACACCCAGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCATCACATAGTGCGGAAGTCCAGACATGCATCAACACACCCAGA  350

seq1  TTTTTCACTTGGGCTTTGGATATCCAAACTCAGGTCCTCAAGCTTGATAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCACTTGGGCTTTGGATATCCAAACTCAGGTCCTCAAGCTTGATAA  400

seq1  GAAGACACTTTAACTAAGTGACCCACCTCCATAGCATCCACGATACATGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACACTTTAACTAAGTGACCCACCTCCATAGCATCCACGATACATGT  450

seq1  TTTATTAATTATTATTATTACTATCATCATCATCATCATTTACTCTACCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAATTATTATTATTACTATCATCATCATCATCATTTACTCTACCA  500

seq1  GACTTACTGGCAAACTGGATGTGGAGGGTAAGGAAAAACAATTACTGACC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTACTGGCAAACTGGATGTGGAGGGTAAGGAAAAACAATTACTGACC  550

seq1  TCACATTTTACTGTATGTACACATTCATCTCTGCTTGTGACCTGTGGCAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTTTACTGTATGTACACATTCATCTCTGCTTGTGACCTGTGGCAT  600

seq1  CTGGAGGTCAGAATCTGGATCTTTACATATTCCTTGAGGGTACCACAGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGTCAGAATCTGGATCTTTACATATTCCTTGAGGGTACCACAGAA  650

seq1  GGATGTGCTGGGCATAACCTGATCAGCAAATAAACAAATGCATGTATGTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGCTGGGCATAACCTGATCAGCAAATAAACAAATGCATGTATGTA  700

seq1  TGTAAGCCTCTTTCCTACCTAAGGTTTGAATTC  732
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGCCTCTTTCCTACCTAAGGTTTGAATTC  733