BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-053L09
Chromosome11 (Build37)
Map Location 17,285,620 - 17,353,608
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSec61g, Akt2-ps, LOC665689, LOC627583, Egfr, 2810442I21Rik, A630050E13Rik, Plek, 1500041B16Rik, LOC100042644, Ppp3r1, Pno1, AI553587, C1d, LOC382486
Downstream geneEG665748, Etaa1, LOC327871, LOC627696, LOC627716
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-053L09.bB6Ng01-053L09.g
ACCDH876680DH876681
length1,213657
definitionDH876680|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053L09, 5' end.DH876681|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053L09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(17,285,620 - 17,286,834)(17,352,952 - 17,353,608)
sequence
gaattcatttaagtgacctatctgctgacctctggagtcttctaatgagt
cttctaccttgaccttcaacagtctacaaacctgcctctccctactcaac
agctctaattagcttcctagtgcttaacccttaaagataaatgggcaaag
ttcaaaacatatttggatctaccaccatgagaggtagcttttgtagatgg
atcatttaaatatcctaactaatgtcttgttttccattctggttggcctg
taacttctcagacttctcctactctgattctggccttacccatgtgaatt
gaatgagcagtggggtaatagttaactgcatgtacgtagaagcttgaagt
acctctgtgtatttccactgccactcatatgtaatgttggagtctagctg
atgctctgtagctgttccatacttttacatgtactgacaggcacctattg
agacattatttgtgtccatgccaggacatgacattgaatcatgtcatagg
gaagttaagtttcataaagagtgctacatcccagtcccacccctttcctg
acttttgcctgggaatcctagagcctggttgcaaaatcatactacgctca
atatcagtatattagtttgcttctatgctgctgcaatgaaacactgacca
cagtaacttgggaaagagtttatttgacctaaaggttccaggccatcatc
aggggagggcaggtttggagctcaattcaggaacccatatgcaggaatgg
aagcagatgtggtgggggaatcctgaataataatgtatttgatagtaaag
gtgtaaactccagtgtgaagtgtcacagtttcggaatgacttatatctat
atagaggttcactgagctatatagactttgagtctaggtaatcctttttg
catgatgtgttacttgcaagttctttataaataattttaactagaaaaca
aaacaaaaaggttacctttgttctgcacttgggctgaaaattctccttca
gagactcacttatgctgtctatctctgctctaaggctgaaatcctctttg
gagcactgtcatgttgttgctcctcttcaggttggtctatggcattgata
actcctcattaaacaccaacgggtccccaaccttcgtgttcaggtcctcc
ttgaaacacctaacgcctcctgaatctacttaacattttgtgcgtgccca
agccttccactga
gaattctcggctcattgcccctgaatccagggaagtcggtcgagctctgt
ctttaaagctgggaggaggcagtcagtaaggacatcagcacttggacagg
aaaagccaacctccacctacttcaaatagagtaaaacactgagaaaactc
ttaagaagtggaagagcctatagtttagaggtgggagctttaactggtga
atcgggagacccacagtgttctcagctctgtcactgacaagtgtatatgg
atttggaaaaagttatttagtctctctggcccctaggttacttgcctata
aaataaggaggtgaaactgcaataaatatctcagaataagaccagaggcc
acggccttatttctgagaattaaatcaaaccgccagagggatcagtgaag
aaggggtgttctagaaactgaactaaagtacccagagaagcagtaactta
cattgaacattctacagataccaattaactgataagactaaatgattgtg
gaggggttgggatgttgcaagtccagagccaaattacagtttatcttggg
atatatatatatatatatatatatatatatatatgcataaatagtagaag
attcccacgctactctacccacctacctagtgtagccacaagtgttattt
tggaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_17285620_17286834
seq2: B6Ng01-053L09.b_44_1256

seq1  GAATTCATTTAAGTGACCTATCTGCTGACCTCTGGAGTCTTCTAATGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTAAGTGACCTATCTGCTGACCTCTGGAGTCTTCTAATGAGT  50

seq1  CTTCTACCTTGACCTTCAACAGTCTACAAACCTGCCTCTCCCTACTCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACCTTGACCTTCAACAGTCTACAAACCTGCCTCTCCCTACTCAAC  100

seq1  AGCTCTAATTAGCTTCCTAGTGCTTAACCCTTAAAGATAAATGGGCAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTAATTAGCTTCCTAGTGCTTAACCCTTAAAGATAAATGGGCAAAG  150

seq1  TTCAAAACATATTTGGATCTACCACCATGAGAGGTAGCTTTTGTAGATGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAACATATTTGGATCTACCACCATGAGAGGTAGCTTTTGTAGATGG  200

seq1  ATCATTTAAATATCCTAACTAATGTCTTGTTTTCCATTCTGGTTGGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTAAATATCCTAACTAATGTCTTGTTTTCCATTCTGGTTGGCCTG  250

seq1  TAACTTCTCAGACTTCTCCTACTCTGATTCTGGCCTTACCCATGTGAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTCTCAGACTTCTCCTACTCTGATTCTGGCCTTACCCATGTGAATT  300

seq1  GAATGAGCAGTGGGGTAATAGTTAACTGCATGTACGTAGAAGCTTGAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGCAGTGGGGTAATAGTTAACTGCATGTACGTAGAAGCTTGAAGT  350

seq1  ACCTCTGTGTATTTCCACTGCCACTCATATGTAATGTTGGAGTCTAGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGTGTATTTCCACTGCCACTCATATGTAATGTTGGAGTCTAGCTG  400

seq1  ATGCTCTGTAGCTGTTCCATACTTTTACATGTACTGACAGGCACCTATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTGTAGCTGTTCCATACTTTTACATGTACTGACAGGCACCTATTG  450

seq1  AGACATTATTTGTGTCCATGCCAGGACATGACATTGAATCATGTCATAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTATTTGTGTCCATGCCAGGACATGACATTGAATCATGTCATAGG  500

seq1  GAAGTTAAGTTTCATAAAGAGTGCTACATCCCAGTCCCACCCCTTTCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTAAGTTTCATAAAGAGTGCTACATCCCAGTCCCACCCCTTTCCTG  550

seq1  ACTTTTGCCTGGGAATCCTAGAGCCTGGTTGCAAAATCATACTACGCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTGCCTGGGAATCCTAGAGCCTGGTTGCAAAATCATACTACGCTCA  600

seq1  ATATCAGTATATTAGTTTGCTTCTATGCTGCTGCAATGAAACACTGACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAGTATATTAGTTTGCTTCTATGCTGCTGCAATGAAACACTGACCA  650

seq1  CAGTAACTTGGGAAAGAGTTTATTTGACCTAAAGGTTCCAGGCCATCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACTTGGGAAAGAGTTTATTTGACCTAAAGGTTCCAGGCCATCATC  700

seq1  AGGGGAGGGCAGGTTTGGAGCTCAATTCAGGAACCCATATGCAGGAATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGGCAGGTTTGGAGCTCAATTCAGGAACCCATATGCAGGAATGG  750

seq1  AAGCAGATGTGGTGGGGGAATCCTGAATAATAATGTATTTGATAGTAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGATGTGGTGGGGGAATCCTGAATAATAATGTATTTGATAGTAAAG  800

seq1  GTGTAAACTCCAGTGTGAAGTGTCACAGTTTCGGAATGACTTATATCTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAAACTCCAGTGTGAAGTGTCACAGTTTCGGAATGACTTATATCTAT  850

seq1  ATAGAGGTTCACTGAGCTATATAGACTTTGAGTCTAGGTAAT-CTTTTTG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATAGAGGTTCACTGAGCTATATAGACTTTGAGTCTAGGTAATCCTTTTTG  900

seq1  CATGATGTGTTACTTGCAAGTTCTTTATAAATAAATTTTAACTAGAAAAC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CATGATGTGTTACTTGCAAGTTCTTTATAAAT-AATTTTAACTAGAAAAC  949

seq1  AAAACAAAAAGGTTACCTTTGTTTCTGCCACTTGGGCTG-AGATTCT-CT  997
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||
seq2  AAAACAAAAAGGTTACCTTTG-TTCTG-CACTTGGGCTGAAAATTCTCCT  997

seq1  TCAGAGACTCACTTATGCTGTCTATCTCTGCTTCTAGGGCCTGAATTCTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||| |||
seq2  TCAGAGACTCACTTATGCTGTCTATCTCTGC-TCTAAGGCTGAAATCCTC  1046

seq1  TTTGGAGCACCTGTCATGTTGTTGCTCC-CTTCCTGTATGTTCATGGCAT  1096
      ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||  ||  |||||||
seq2  TTTGGAGCA-CTGTCATGTTGTTGCTCCTCTTCAGGTTGGTCTATGGCAT  1095

seq1  TGATAACTCTTCTAATAAACACCA--CGGTCCCCAGCTGTCTGTTTCAGT  1144
      ||||||||| || | |||||||||   |||||||| |  ||   ||||| 
seq2  TGATAACTCCTC-ATTAAACACCAACGGGTCCCCAACCTTCGTGTTCAG-  1143

seq1  GTCCT-CTTGAACCACCTACCG-CTCCAGAATCCTAACATAAACATTTGT  1192
      ||||| |||||| |||||| || |||| |||||   || |||   |||||
seq2  GTCCTCCTTGAAACACCTAACGCCTCCTGAATC--TACTTAACATTTTGT  1191

seq1  GGCTGGCCAAGCCTTCCAACTGA  1215
      |  || ||||||||||| |||||
seq2  GCGTGCCCAAGCCTTCC-ACTGA  1213

seq1: chr11_17352952_17353608
seq2: B6Ng01-053L09.g_69_725 (reverse)

seq1  ATTTCC-AAATAACACTTGTGGCTACACTAGGTAGGTGGGTTAGAGTAGC  49
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ATTTCCAAAATAACACTTGTGGCTACACTAGGTAGGTGGG-TAGAGTAGC  49

seq1  GTGGGAATCTTCTACTATTTATGCATATATATATATATATATATATATAT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAATCTTCTACTATTTATGCATATATATATATATATATATATATAT  99

seq1  ATATATATCCCAAGATAAACTGTAATTTGGCTCTGGACTTGCAACATCCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATCCCAAGATAAACTGTAATTTGGCTCTGGACTTGCAACATCCC  149

seq1  AACCCCTCCACAATCATTTAGTCTTATCAGTTAATTGGTATCTGTAGAAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCTCCACAATCATTTAGTCTTATCAGTTAATTGGTATCTGTAGAAT  199

seq1  GTTCAATGTAAGTTACTGCTTCTCTGGGTACTTTAGTTCAGTTTCTAGAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAATGTAAGTTACTGCTTCTCTGGGTACTTTAGTTCAGTTTCTAGAA  249

seq1  CACCCCTTCTTCACTGATCCCTCTGGCGGTTTGATTTAATTCTCAGAAAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCTTCTTCACTGATCCCTCTGGCGGTTTGATTTAATTCTCAGAAAT  299

seq1  AAGGCCGTGGCCTCTGGTCTTATTCTGAGATATTTATTGCAGTTTCACCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCGTGGCCTCTGGTCTTATTCTGAGATATTTATTGCAGTTTCACCT  349

seq1  CCTTATTTTATAGGCAAGTAACCTAGGGGCCAGAGAGACTAAATAACTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTTTATAGGCAAGTAACCTAGGGGCCAGAGAGACTAAATAACTTT  399

seq1  TTCCAAATCCATATACACTTGTCAGTGACAGAGCTGAGAACACTGTGGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAATCCATATACACTTGTCAGTGACAGAGCTGAGAACACTGTGGGT  449

seq1  CTCCCGATTCACCAGTTAAAGCTCCCACCTCTAAACTATAGGCTCTTCCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCGATTCACCAGTTAAAGCTCCCACCTCTAAACTATAGGCTCTTCCA  499

seq1  CTTCTTAAGAGTTTTCTCAGTGTTTTACTCTATTTGAAGTAGGTGGAGGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTAAGAGTTTTCTCAGTGTTTTACTCTATTTGAAGTAGGTGGAGGT  549

seq1  TGGCTTTTCCTGTCCAAGTGCTGATGTCCTTACTGACTGCCTCCTCCCAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTTCCTGTCCAAGTGCTGATGTCCTTACTGACTGCCTCCTCCCAG  599

seq1  CTTTAAAGACAGAGCTCGACCGACTTCCCTGGATTCAGGGGCAATGAGCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAAGACAGAGCTCGACCGACTTCCCTGGATTCAGGGGCAATGAGCC  649

seq1  GAGAATTC  657
      ||||||||
seq2  GAGAATTC  657