BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067E23
Chromosome11 (Build37)
Map Location 71,754,951 - 71,909,448
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAipl1, 6720460F02Rik, Pitpnm3
Upstream geneNup88, Rpain, C1qbp, Dhx33, Derl2, Mis12, 6330403K07Rik, LOC382536, Nlrp1a, Nlrp1b, Nlrp1c, LOC100043249, 9230020A06Rik, Wscd1
Downstream gene4933427D14Rik, Txnl5, Med31, 4930563E22Rik, Slc13a5, Fbxo39, LOC628100, Tekt1, D130058I21Rik, Ggt6, Mybbp1a, 9830002I17Rik, LOC432577, Ube2g1, Ankfy1, Cyb5d2, Zzef1, LOC627119, Atp2a3, P2rx1, LOC100043309, Camkk1, 1200014J11Rik, Itgae
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067E23.bB6Ng01-067E23.g
ACCDH886238DH886239
length8211,028
definitionDH886238|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067E23, 5' end.DH886239|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067E23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,754,951 - 71,755,770)(71,908,420 - 71,909,448)
sequence
gaattccagtctcctcctggttgcctttggatcaagatgtagaaccctca
gctctttctcagaaccctgtctgcctgaaggctgctatgcttcctgccat
gatgataatggactgaacctcagagaccataagccaaccctaattaaatg
ttttcttttataagagttaccttggtcctgtgtctgctcacagcaataaa
accataactaagataagagtccaagtacaggatgccttgacatctgctga
gggcatggagcagatctctcaaggcgtccacaccttggttcatcccagaa
agacctcagactttagaagcctgatttaaggagctaagtttcaagccaac
tgctttggcaactgcagaaaatgaatccatcatcatggtaacccttggtg
gaagtgaaactcaggcctggggcttctcctttccaaacaaaatgttctcc
accacttctcatccaatggtgctccaggctctttctgtcagtcacaccag
tctgggagcacactccaccccttctgcacaccatgcacattgtcccaagt
ctaataaacagccatgggcctcaagtagtggtcctcacccagaaacaact
catctcccatttttctctccgtggcaatcagtctgcagccctcatcatgc
caatagtaatggaagcttctcatgggaagtactctaactgtcctcctacc
ttttaggggctccatgtgggaattcatgcttcttctatggtcttcttctt
ctgatgttgctgctactgcttcctcctcctcctcctcctccacccttctc
ctcctccacctccttttcttc
gaattctaggcaagcctgggctatacagtgagaccctcttatcaaaaacc
aaggggttgatcaggttggagggacacaaggtaggagaggtgataagaat
aatcagaatgcatggtatagatctgtaaaatagcaaagaacaaaattgat
aatctccatccttaacattcccttctccaaatctaggcacatcctgtgca
ctggcatctcaaggccatgggcctcctggcttccccagcagtgagagtct
cagacccttgggctacttcttcgttagataatcctgctgatgagcattgt
gccccagctcaaagctttacttcctctgtggtcaggaaatcagcactggg
accagaagctcatacaggctctgggcgtgaaacttctgtcaagtggcata
agccaaaatggcctcccttatctggtaggcgtataagaaatgtcagtgca
cttttactgtagtctgagctgtggtttgggctttactgtccccagttcta
aattgtgttatctcctattttgtagtttgtgagtgaaatctgatagctca
tgtgccccaggctgaggctttgctgcatattgtcctgcattgaaacacct
caaaggcctcccgagatgggtgcttgcccttcctccgtcccatctggctg
tcctgtcccacctctccccttcctccaacaggagcctggccacaggcaga
gcaggggactgatgctcccatctgctgtgtttctctagactggcagtgtc
acagtgtactctgagtgtaactccgagtgagcaagctattacccatcctg
tccacggaaagcaagcgctcccttctgagaggactcttgtcagtcctgga
taggggcagcagtacatgctccggcaggagtatcactctactccccagtc
cataatgcaaagtggctggcgagtctaacagtggagggcttgggggatgg
taggcttccagtatgtgtgttctagccagggagtgagggtcccaagctca
ttgagagtcactgctcttgctcacaatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_71754951_71755770
seq2: B6Ng01-067E23.b_50_870

seq1  GAATTCCAGTCTCCTCCTGGTTGCCTTTGGATCAAGATGTAGAACCCTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTCTCCTCCTGGTTGCCTTTGGATCAAGATGTAGAACCCTCA  50

seq1  GCTCTTTCTCAGAACCCTGTCTGCCTGAAGGCTGCTATGCTTCCTGCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTCTCAGAACCCTGTCTGCCTGAAGGCTGCTATGCTTCCTGCCAT  100

seq1  GATGATAATGGACTGAACCTCAGAGACCATAAGCCAACCCTAATTAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATAATGGACTGAACCTCAGAGACCATAAGCCAACCCTAATTAAATG  150

seq1  TTTTCTTTTATAAGAGTTACCTTGGTCCTGTGTCTGCTCACAGCAATAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTTATAAGAGTTACCTTGGTCCTGTGTCTGCTCACAGCAATAAA  200

seq1  ACCATAACTAAGATAAGAGTCCAAGTACAGGATGCCTTGACATCTGCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAACTAAGATAAGAGTCCAAGTACAGGATGCCTTGACATCTGCTGA  250

seq1  GGGCATGGAGCAGATCTCTCAAGGCGTCCACACCTTGGTTCATCCCAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGGAGCAGATCTCTCAAGGCGTCCACACCTTGGTTCATCCCAGAA  300

seq1  AGACCTCAGACTTTAGAAGCCTGATTTAAGGAGCTAAGTTTCAAGCCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTCAGACTTTAGAAGCCTGATTTAAGGAGCTAAGTTTCAAGCCAAC  350

seq1  TGCTTTGGCAACTGCAGAAAATGAATCCATCATCATGGTAACCCTTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGGCAACTGCAGAAAATGAATCCATCATCATGGTAACCCTTGGTG  400

seq1  GAAGTGAAACTCAGGCCTGGGGCTTCTCCTTTCCAAACAAAATGTTCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGAAACTCAGGCCTGGGGCTTCTCCTTTCCAAACAAAATGTTCTCC  450

seq1  ACCACTTCTCATCCAATGGTGCTCCAGGCTCTTTCTGTCAGTCACACCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTTCTCATCCAATGGTGCTCCAGGCTCTTTCTGTCAGTCACACCAG  500

seq1  TCTGGGAGCACACTCCACCCCTTCTGCACACCATGCACATTGTCCCAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGAGCACACTCCACCCCTTCTGCACACCATGCACATTGTCCCAAGT  550

seq1  CTAATAAACAGCCATGGGCCTCAAGTAGTGGTCCTCACCCAGAAACAACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAACAGCCATGGGCCTCAAGTAGTGGTCCTCACCCAGAAACAACT  600

seq1  CATCTCCCATTTTTCTCTCCGTGGCAATCAGTCTGCAGCCCTCATCATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCCATTTTTCTCTCCGTGGCAATCAGTCTGCAGCCCTCATCATGC  650

seq1  CAATAGTAATGGAAGCTTCTCATGGGAAGTACTCTAACTGTCCTCCTACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGTAATGGAAGCTTCTCATGGGAAGTACTCTAACTGTCCTCCTACC  700

seq1  TTTTAGGGGCTCCATGTGGGAATTCATGCTTCTTCTATGGTCTTCTTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGGGCTCCATGTGGGAATTCATGCTTCTTCTATGGTCTTCTTCTT  750

seq1  CTGATGTTGCTGCTACTGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-TCCTTCTC  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  CTGATGTTGCTGCTACTGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCCTTCTC  800

seq1  CTCCTCCTCCTCCTCTTCTTC  820
      ||||||| |||||| ||||||
seq2  CTCCTCCACCTCCTTTTCTTC  821

seq1: chr11_71908420_71909448
seq2: B6Ng01-067E23.g_68_1095 (reverse)

seq1  CATTGTGAGC-AGAGCAGTGACTCTCAGTG-GCCTGGGACCCTCCACTCC  48
      |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||
seq2  CATTGTGAGCAAGAGCAGTGACTCTCAATGAGCTTGGGACCCT-CACTCC  49

seq1  CTGGCTTAGAACACACATACTGGAAGCCTACCATCCCCCAAGCCCTCCAC  98
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGC-TAGAACACACATACTGGAAGCCTACCATCCCCCAAGCCCTCCAC  98

seq1  TGTTAGACTCCGCCAGCCACTTTGCATAATGGACTGGGGAGTGGAGTGAT  148
      ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  TGTTAGACT-CGCCAGCCACTTTGCATTATGGACTGGGGAGTAGAGTGAT  147

seq1  ACTCCTGCCGGAGCATGTACCTGCTGCCCCTATCCAGGACTGACAAGAGT  198
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTGCCGGAGCATGTA-CTGCTGCCCCTATCCAGGACTGACAAGAGT  196

seq1  CCTCTCAGAAGGGAGCGCTTGC-TTCCGTGGACAGGATGGGTAATAGCTT  247
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCAGAAGGGAGCGCTTGCTTTCCGTGGACAGGATGGGTAATAGCTT  246

seq1  GCTCACTCGGAGTTACACTCAGAGTACACTGTGACACTGCCAGTCTAGAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACTCGGAGTTACACTCAGAGTACACTGTGACACTGCCAGTCTAGAG  296

seq1  AAACACAGCAGATGGGAGCATCAGTCCCCTGCTCTGCCTGTGGCCAGGCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAGCAGATGGGAGCATCAGTCCCCTGCTCTGCCTGTGGCCAGGCT  346

seq1  CCTGTTGGAGGAAGGGGAGAGGTGGGACAGGACAGCCAGATGGGACGGAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTGGAGGAAGGGGAGAGGTGGGACAGGACAGCCAGATGGGACGGAG  396

seq1  GAAGGGCAAGCACCCATCTCGGGAGGCCTTTGAGGTGTTTCAATGCAGGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGCAAGCACCCATCTCGGGAGGCCTTTGAGGTGTTTCAATGCAGGA  446

seq1  CAATATGCAGCAAAGCCTCAGCCTGGGGCACATGAGCTATCAGATTTCAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATGCAGCAAAGCCTCAGCCTGGGGCACATGAGCTATCAGATTTCAC  496

seq1  TCACAAACTACAAAATAGGAGATAACACAATTTAGAACTGGGGACAGTAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAAACTACAAAATAGGAGATAACACAATTTAGAACTGGGGACAGTAA  546

seq1  AGCCCAAACCACAGCTCAGACTACAGTAAAAGTGCACTGACATTTCTTAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAAACCACAGCTCAGACTACAGTAAAAGTGCACTGACATTTCTTAT  596

seq1  ACGCCTACCAGATAAGGGAGGCCATTTTGGCTTATGCCACTTGACAGAAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTACCAGATAAGGGAGGCCATTTTGGCTTATGCCACTTGACAGAAG  646

seq1  TTTCACGCCCAGAGCCTGTATGAGCTTCTGGTCCCAGTGCTGATTTCCTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACGCCCAGAGCCTGTATGAGCTTCTGGTCCCAGTGCTGATTTCCTG  696

seq1  ACCACAGAGGAAGTAAAGCTTTGAGCTGGGGCACAATGCTCATCAGCAGG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAGAGGAAGTAAAGCTTTGAGCTGGGGCACAATGCTCATCAGCAGG  746

seq1  ATTATCTAACGAAGAAGTAGCCCAAGGGTCTGAGACTCTCACTGCTGGGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTAACGAAGAAGTAGCCCAAGGGTCTGAGACTCTCACTGCTGGGG  796

seq1  AAGCCAGGAGGCCCATGGCCTTGAGATGCCAGTGCACAGGATGTGCCTAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGGAGGCCCATGGCCTTGAGATGCCAGTGCACAGGATGTGCCTAG  846

seq1  ATTTGGAGAAGGGAATGTTAAGGATGGAGATTATCAATTTTGTTCTTTGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGAGAAGGGAATGTTAAGGATGGAGATTATCAATTTTGTTCTTTGC  896

seq1  TATTTTACAGATCTATACCATGCATTCTGATTATTCTTATCACCTCTCCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTACAGATCTATACCATGCATTCTGATTATTCTTATCACCTCTCCT  946

seq1  ACCTTGTGTCCCTCCAACCTGATCAACCCCTTGGTTTTTGATAAGAGGGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTGTCCCTCCAACCTGATCAACCCCTTGGTTTTTGATAAGAGGGT  996

seq1  CTCACTGTATAGCCCAGGCTTGCCTAGAATTC  1029
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGTATAGCCCAGGCTTGCCTAGAATTC  1028