BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073N02
Chromosome6 (Build37)11 (Build37)
Map Location 82,516,739 - 82,517,934107,120,161 - 107,120,616
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC232143, 1700009C05Rik, AW146020, Mrpl19, Tmem166, EG622198, Tacr1
Downstream genePole4, LOC100043412, Hk2, EG622318, Sema4f, D6Mm5e, Dok1, Loxl3, Htra2, Aup1, Dqx1, Tlx2, Pcgf1, Lbx2, A230058J24Rik, Mrpl53, Gcs1, Wbp1, Znhit4, Rtkn, Wdr54, 1700003E16Rik, Dctn1, C330016K18Rik, Mthfd2, Mobk1b, Bola3, D230004J03Rik, Dguok, Actg2, Stambp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073N02.bB6Ng01-073N02.g
ACCDH890834DH890835
length1,175697
definitionDH890834|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073N02, 5' end.DH890835|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073N02, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,516,739 - 82,517,934)(107,120,161 - 107,120,616)
sequence
gaattcaggacaggaactcaaacagggcaggaacccagaatcagaggcca
tggaggggtgctgcttactggactgctcagcctgctttttaataaaaccc
aggaccaccagtccagaggtggcaccactcacaatggactgggccttgcc
cattgatcactaattgagaaatggccctacagctggatctcatggaggca
tttcctcctttctctcagatgactgtagcttgtgtcaggttgacacacaa
aaccaaccaggccacattaacctggaagctgtttcccatgggaacctggg
ctcttttcacgaatgttgtagcctgatgcttagcacacatcttgctgtac
catgggcctaagactgaaagggtgagggccgggtgtcctctgactaaaag
gaactccctatttttggtcacaatgacctttgcagttatttctagagtgt
cgaaatgccagttttgcccttctgttagtgaacaagtaatgatctgtaag
gggaacatttatacaggtttggtaagtgtttgttgccagggtgagttcta
ggacatgtcacaattatccttgttgtcattgtgcagccaagttctgaagt
acagctttgatgttattcttgttgtgagcaccattatctgaagagggatg
atgctggggaccattgaggtttatcgtcttttttatttacttgtaaaaag
gaaatgtgccctactccaactgcatttgtcttggttattttttattgttt
tctcttcttcattgtccacataagcaacatagttgtgatatatagacctt
ccccttgcttggacacgaatctaagtttagtgtaggtggaaagctataaa
taactgaaatggtcataaaactggatggagtgttgggatgatacaaaaat
gaaacacctgtggtggttttaataaggatatcccgtgtgggctcacatgc
ttgaacactggttcccaggttggtgatgctgtctgagctgtggagtctga
acaacttgagctgctggagaagcccactggggtggctttagggttacaac
ctcacctcacttcctgtcactttgtttgcctcatgtttttggctgaagac
tggatcttccgctgcctaagtgcatatttccctgccatatgattcctctg
gacctaagccaaattaacgctctct
gaattctttgacactacaggagaaacagtagcatggaatccaagactaat
gggacacaggtagtgtgagggggaaaagagaacaatggggccagggctca
ctgggaagcaggatgagggagcagaacagaggagaaaatgcaaaggggat
aactgacactaagactgcttaaaaatgccacatggaaacttggtatttta
taagatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgctcccat
tgttcaggacccacatgaagaccaaactgtacttctattacctatgtggg
gaggcctaggtccagcctgtttatgcttcttggtttggtggctcagactc
taagagccccaagggtccaggttagttgacactgttggtcttcctgtgga
gttcctatccccttgcaggctgcaattcttccctctattcttccataaga
gtccccaagctccatccactgtctggctgtgggtgtctgcatctatctga
gtcagctactgggtggagccttttcagaggacagccatgctaggttcctg
tctgcaagcagaacttagtatcattaatagtgtcagggatcggtgcccac
ccatgggatgggtctcaccacccccatttttaaaaagtgacgtttctgtg
ttgtgtctatgtgagaggatgtgcgagtgtgtgagtgctgctgaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_82516739_82517934
seq2: B6Ng01-073N02.b_44_1218 (reverse)

seq1  AGAGAGCGTTTATTTTGGCTTAAGGCTCCAGAGGGAAAAACCCATCATGG  50
      |||||||| ||| |||||||||  | ||||||||     |  ||| ||||
seq2  AGAGAGCG-TTAATTTGGCTTA--GGTCCAGAGG-----AATCAT-ATGG  41

seq1  CAGGGAAATTATGGCAC-TAGGCAGCTGAAAGATCAAGTCTTCAGCCACA  99
      |||||||| ||| |||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |
seq2  CAGGGAAA-TAT-GCACTTAGGCAGC-GGAAGATCCAGTCTTCAGCCAAA  88

seq1  AACATGAAGCAAACATAGTGACCAGGAAGTGAGGTGAGGTTGTAAACCCT  149
      ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AACATGAGGCAAACAAAGTGA-CAGGAAGTGAGGTGAGGTTGT-AACCCT  136

seq1  AAAAGCCCACCCCAGTGTGCTTCCTCCAGCCAGCCTCAAGTTGTTCAAGA  199
      |||   ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||
seq2  AAA--GCCACCCCAGTGGGCTT-CTCCAG-CAG-CTCAAGTTGTTC-AGA  180

seq1  CTCCACAGCCTCAGACAGCATCACCAACCTGGGAACCAGTGTTCAAGCAT  249
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACAG-CTCAGACAGCATCACCAACCTGGGAACCAGTGTTCAAGCAT  229

seq1  GTGAGCCCACACGGGATATTCCTTATTAAAACCACCACAGGTGTTTCATT  299
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCCCACACGGGATA-TCCTTATTAAAACCACCACAGGTGTTTCATT  278

seq1  TTTGTATCATCCCAACACTCCATCCAGTTTTATGACCATTTCAGTTATTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATCATCCCAACACTCCATCCAGTTTTATGACCATTTCAGTTATTT  328

seq1  ATAGCTTTCCACCTACACTAAACTTAGATTCGTGTCCAAGCAAGGGGAAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTTCCACCTACACTAAACTTAGATTCGTGTCCAAGCAAGGGGAAG  378

seq1  GTCTATATATCACAACTATGTTGCTTATGTGGACAATGAAGAAGAGAAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATATATCACAACTATGTTGCTTATGTGGACAATGAAGAAGAGAAAA  428

seq1  CAATAAAAAATAACCAAGACAAATGCAGTTGGAGTAGGGCACATTTCCTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAAAAATAACCAAGACAAATGCAGTTGGAGTAGGGCACATTTCCTT  478

seq1  TTTACAAGTAAATAAAAAAGACGATAAACCTCAATGGTCCCCAGCATCAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAGTAAATAAAAAAGACGATAAACCTCAATGGTCCCCAGCATCAT  528

seq1  CCCTCTTCAGATAATGGTGCTCACAACAAGAATAACATCAAAGCTGTACT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTCAGATAATGGTGCTCACAACAAGAATAACATCAAAGCTGTACT  578

seq1  TCAGAACTTGGCTGCACAATGACAACAAGGATAATTGTGACATGTCCTAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACTTGGCTGCACAATGACAACAAGGATAATTGTGACATGTCCTAG  628

seq1  AACTCACCCTGGCAACAAACACTTACCAAACCTGTATAAATGTTCCCCTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCACCCTGGCAACAAACACTTACCAAACCTGTATAAATGTTCCCCTT  678

seq1  ACAGATCATTACTTGTTCACTAACAGAAGGGCAAAACTGGCATTTCGACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATCATTACTTGTTCACTAACAGAAGGGCAAAACTGGCATTTCGACA  728

seq1  CTCTAGAAATAACTGCAAAGGTCATTGTGACCAAAAATAGGGAGTTCCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGAAATAACTGCAAAGGTCATTGTGACCAAAAATAGGGAGTTCCTT  778

seq1  TTAGTCAGAGGACACCCGGCCCTCACCCTTTCAGTCTTAGGCCCATGGTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCAGAGGACACCCGGCCCTCACCCTTTCAGTCTTAGGCCCATGGTA  828

seq1  CAGCAAGATGTGTGCTAAGCATCAGGCTACAACATTCGTGAAAAGAGCCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGATGTGTGCTAAGCATCAGGCTACAACATTCGTGAAAAGAGCCC  878

seq1  AGGTTCCCATGGGAAACAGCTTCCAGGTTAATGTGGCCTGGTTGGTTTTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCCCATGGGAAACAGCTTCCAGGTTAATGTGGCCTGGTTGGTTTTG  928

seq1  TGTGTCAACCTGACACAAGCTACAGTCATCTGAGAGAAAGGAGGAAATGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAACCTGACACAAGCTACAGTCATCTGAGAGAAAGGAGGAAATGC  978

seq1  CTCCATGAGATCCAGCTGTAGGGCCATTTCTCAATTAGTGATCAATGGGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGAGATCCAGCTGTAGGGCCATTTCTCAATTAGTGATCAATGGGC  1028

seq1  AAGGCCCAGTCCATTGTGAGTGGTGCCACCTCTGGACTGGTGGTCCTGGG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCCAGTCCATTGTGAGTGGTGCCACCTCTGGACTGGTGGTCCTGGG  1078

seq1  TTTTATTAAAAAGCAGGCTGAGCAGTCCAGTAAGCAGCACCCCTCCATGG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTAAAAAGCAGGCTGAGCAGTCCAGTAAGCAGCACCCCTCCATGG  1128

seq1  CCTCTGATTCTGGGTTCCTGCCCTGTTTGAGTTCCTGTCCTGAATTC  1196
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGATTCTGGGTTCCTGCCCTGTTTGAGTTCCTGTCCTGAATTC  1175

seq1: chr11_107120161_107120616
seq2: B6Ng01-073N02.g_306_763

seq1  TCTGCTCCCATTGTTCAGGACCCACATGAAGACCAAACTGTACTTCTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCCCATTGTTCAGGACCCACATGAAGACCAAACTGTACTTCTATT  50

seq1  ACCTATGTGGGGAGGCCTAGGTCCAGCCTGTTTATGCTTCTTGGTTTGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATGTGGGGAGGCCTAGGTCCAGCCTGTTTATGCTTCTTGGTTTGGT  100

seq1  GGCTCAGACTCTAAGAGCCCCAAGGGTCCAGGTTAGTTGACACTGTTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGACTCTAAGAGCCCCAAGGGTCCAGGTTAGTTGACACTGTTGGT  150

seq1  CTTCCTGTGGAGTTCCTATCCCCTTGCAGGCTGCAATTCTTCCCTCTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGTGGAGTTCCTATCCCCTTGCAGGCTGCAATTCTTCCCTCTATT  200

seq1  CTTCCATAAGAGTCCCCAAGCTCCATCCACTGTCTGGCTGTGGGTGTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATAAGAGTCCCCAAGCTCCATCCACTGTCTGGCTGTGGGTGTCTG  250

seq1  CATCTATCTGAGTCAGCTACTGGGTGGAGCC-TTTCAGAGGACAGCCATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CATCTATCTGAGTCAGCTACTGGGTGGAGCCTTTTCAGAGGACAGCCATG  300

seq1  CTAGGTTCCTGTCTGCAAGCAGAACTTAGTATCATTAATAGTGTCAGGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTTCCTGTCTGCAAGCAGAACTTAGTATCATTAATAGTGTCAGGGA  350

seq1  TCGGTGCCCACCCATGGGATGGGTCTCACCACCCCCA-TTTTAAAAAGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCGGTGCCCACCCATGGGATGGGTCTCACCACCCCCATTTTTAAAAAGTG  400

seq1  ACGTTTCTGTGTTGTGTCTATGTGAGAGGATGTGCGAGTGTGTGAGTGCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTTCTGTGTTGTGTCTATGTGAGAGGATGTGCGAGTGTGTGAGTGCT  450

seq1  GCTGAGGT  456
      ||||||||
seq2  GCTGAGGT  458