BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094K17
Chromosome11 (Build37)
Map Location 43,637,313 - 43,771,245
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdra1b
Upstream geneAtp10b, EG544767, Pttg1, Slu7, LOC100039392, C1qtnf2, Ccnjl, Fabp6, LOC620562, 4631424J17Rik, Ttc1
Downstream geneIl12b, Ublcp1, 3732413I11Rik, Ebf1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094K17.bB6Ng01-094K17.g
ACCDH905828DH905829
length709994
definitionDH905828|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094K17, 5' end.DH905829|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094K17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,637,313 - 43,638,021)(43,770,237 - 43,771,245)
sequence
gaattcttattttgaaaagaacacaataggaaaaaaaatctcaaacaatc
tggcatgttttcgaatggaagagtgaacagggctgtagcagtgtcaggaa
gaaccaggagaatttctaagtgttcccagggcccagaagcagagagcggg
atatgagcaaaactacagtaaaaatgatgagataacgctggttgtccaag
gatccgagttcaaatcctcactaaccatatcaaggtggctgaggcagcta
tgagccgttatcacagtgatcctatgacaagataaaagatggagagagga
aatccccagaaactggagagccagctagcctgagtacacaaccaggaaca
acaatctcaaaccaggtgaaatgtgaacacatacgtgcacgtgattaaag
aaacggtcaagtgtagatagaaactttttcttttggtggtttttcttctg
aactcattaaacagcatcgaagtccaaacaataactttattaaaacccga
tttccattctgttaatgttcttaatctggtgtctgtaattacaaatgaaa
tgtttccttaatgcagtatgtaaactcataagaggacagaaaaagttaat
aatctatttccactctgtaaaagtggtccctggaagtgagtaagctaaag
ctctaagttttgttttttgagaatgcatatgtgcatgttcgtgtgcgtgt
gtgtgtgtg
gaattccaggttccccatttggttccaaaatccaattacatccaagcaca
gagcaatttgtccccatggggcgtgtccgggtatcaacgacagatcaaac
tctgagaaggaaggagctagtggaggggaggttgtgcccttgtggtgtgt
gtgaaatcaagccatagaatcacattccacttgcatagtcagactgcaca
gtagttgtgaactgcaatttacagatgaaaacatggcatgggacggcatg
agaagagttactgggaccaagggactaagactaacagaagcagcattgac
ttgggtcagcagccccacgtgggcctcctgtgcttcttcctgctgagtgt
tgttacagcggcagactcttttcttactgagcagagtcaggtgggtgatc
tcccgtccagcttgagctttctggaattcaatacttactatccttaggtg
aaattattctaccataggagagtctcataaccccttcggttccactgaga
ataaacacttagaggtgttcaacaatagccagactcaactatctcctgcc
ttaacaaccactcctccacttgagaattcactcggtgagaaatctactct
gctaaagactgtatcatattactctcctgaagatgttgtagaagaaggct
ctatggctctggggtgcaggcaatcaaaatagatccatgcaacagatctc
aaacaatagacagacatcaggagtacagcttggtcctcaaagagattgca
gtgtggaatggagtttcaccaaagccaaggatcacaaagtagctttagta
agaccgcgatctattagttataaagtgctaaaataaataaaacaatatga
aacagagacttccaggtggttcagcaggtcaaggcccttatcagcaaggc
tgtgactttatgagttcaattccaggaccagttggtgagaggagaaccaa
ctcacagttgtcccaactccagattcccacaggactctggcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_43637313_43638021
seq2: B6Ng01-094K17.b_48_756

seq1  GAATTCTTATTTTGAAAAGAACACAATAGGAAAAAAAATCTCAAACAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATTTTGAAAAGAACACAATAGGAAAAAAAATCTCAAACAATC  50

seq1  TGGCATGTTTTCGAATGGAAGAGTGAACAGGGCTGTAGCAGTGTCAGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGTTTTCGAATGGAAGAGTGAACAGGGCTGTAGCAGTGTCAGGAA  100

seq1  GAACCAGGAGAATTTCTAAGTGTTCCCAGGGCCCAGAAGCAGAGAGCGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAGGAGAATTTCTAAGTGTTCCCAGGGCCCAGAAGCAGAGAGCGGG  150

seq1  ATATGAGCAAAACTACAGTAAAAATGATGAGATAACGCTGGTTGTCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGCAAAACTACAGTAAAAATGATGAGATAACGCTGGTTGTCCAAG  200

seq1  GATCCGAGTTCAAATCCTCACTAACCATATCAAGGTGGCTGAGGCAGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCGAGTTCAAATCCTCACTAACCATATCAAGGTGGCTGAGGCAGCTA  250

seq1  TGAGCCGTTATCACAGTGATCCTATGACAAGATAAAAGATGGAGAGAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCGTTATCACAGTGATCCTATGACAAGATAAAAGATGGAGAGAGGA  300

seq1  AATCCCCAGAAACTGGAGAGCCAGCTAGCCTGAGTACACAACCAGGAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCCAGAAACTGGAGAGCCAGCTAGCCTGAGTACACAACCAGGAACA  350

seq1  ACAATCTCAAACCAGGTGAAATGTGAACACATACGTGCACGTGATTAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTCAAACCAGGTGAAATGTGAACACATACGTGCACGTGATTAAAG  400

seq1  AAACGGTCAAGTGTAGATAGAAACTTTTTCTTTTGGTGGTTTTTCTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGGTCAAGTGTAGATAGAAACTTTTTCTTTTGGTGGTTTTTCTTCTG  450

seq1  AACTCATTAAACAGCATCGAAGTCCAAACAATAACTTTATTAAAACCCGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCATTAAACAGCATCGAAGTCCAAACAATAACTTTATTAAAACCCGA  500

seq1  TTTCCATTCTGTTAATGTTCTTAATCTGGTGTCTGTAATTACAAATGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATTCTGTTAATGTTCTTAATCTGGTGTCTGTAATTACAAATGAAA  550

seq1  TGTTTCCTTAATGCAGTATGTAAACTCATAAGAGGACAGAAAAAGTTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCTTAATGCAGTATGTAAACTCATAAGAGGACAGAAAAAGTTAAT  600

seq1  AATCTATTTCCACTCTGTAAAAGTGGTCCCTGGAAGTGAGTAAGCTAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATTTCCACTCTGTAAAAGTGGTCCCTGGAAGTGAGTAAGCTAAAG  650

seq1  CTCTAAGTTTTGTTTTTTGAGAATGCATATGTGCATGTTCGTGTGCGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAGTTTTGTTTTTTGAGAATGCATATGTGCATGTTCGTGTGCGTGT  700

seq1  GTGTGTGTG  709
      |||||||||
seq2  GTGTGTGTG  709

seq1: chr11_43770237_43771245
seq2: B6Ng01-094K17.g_70_1063 (reverse)

seq1  AAAGACAGAGTCACTGTGTGAATCTGGAAGTTGGGGACAACTTGTTGAGT  50
      |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||   |||||
seq2  AAAGCCAGAGTC-CTGTGGGAATCTGG-AGTT-GGGACAACT--GTGAGT  45

seq1  TGGTTCTCTCCTTCCACCATCTGGGTCCTGGGAATTGAACTCAATTAAAG  100
      ||||  ||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||  |||||
seq2  TGGT--TCTCCTCTCACCAACT-GGTCCT-GGAATTGAACTCA--TAAAG  89

seq1  TCACCAAGCCTTGCTGATAAGGGCCTTGACCTGCTGAACCACCTGGAAGT  150
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAC--AGCCTTGCTGATAAGGGCCTTGACCTGCTGAACCACCTGGAAGT  137

seq1  CTCCTGTTTCATATTGTTTTATTTATTTTAGCACTTTATAACTAATAGAT  200
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CT-CTGTTTCATATTGTTTTATTTATTTTAGCACTTTATAACTAATAGAT  186

seq1  CGCGGTCTTACTAAAGCCTACTTTGTGATCCTTGGCCTTGGTGAAACTCC  250
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CGCGGTCTTACTAAAG-CTACTTTGTGATCCTTGGCTTTGGTGAAACTCC  235

seq1  ATTCCACACTGCAATCTCTTTGAGGACCAAGCTGTACTCCTGATGTCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCACACTGCAATCTCTTTGAGGACCAAGCTGTACTCCTGATGTCTGT  285

seq1  CTATTGTTTGAGATCTGTTGCATGGATCTATTTTGATTGCCTGCACCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGTTTGAGATCTGTTGCATGGATCTATTTTGATTGCCTGCACCCCA  335

seq1  GAGCCATAGAGCCTTCTTCTACAACATCTTCAGGAGAGTAATATGATACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATAGAGCCTTCTTCTACAACATCTTCAGGAGAGTAATATGATACA  385

seq1  GTCTTTAGCAGAGTAGATTTCTCACCGAGTGAATTCTCAAGTGGAGGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAGCAGAGTAGATTTCTCACCGAGTGAATTCTCAAGTGGAGGAGT  435

seq1  GGTTGTTAAGGCAGGAGATAGTTGAGTCTGGCTATTGTTGAACACCTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTTAAGGCAGGAGATAGTTGAGTCTGGCTATTGTTGAACACCTCTA  485

seq1  AGTGTTTATTCTCAGTGGAACCGAAGGGGTTATGAGACTCTCCTATGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTATTCTCAGTGGAACCGAAGGGGTTATGAGACTCTCCTATGGTA  535

seq1  GAATAATTTCACCTAAGGATAGTAAGTATTGAATTCCAGAAAGCTCAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATTTCACCTAAGGATAGTAAGTATTGAATTCCAGAAAGCTCAAGC  585

seq1  TGGACGGGAGATCACCCACCTGACTCTGCTCAGTAAGAAAAGAGTCTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACGGGAGATCACCCACCTGACTCTGCTCAGTAAGAAAAGAGTCTGCC  635

seq1  GCTGTAACAACACTCAGCAGGAAGAAGCACAGGAGGCCCACGTGGGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAACAACACTCAGCAGGAAGAAGCACAGGAGGCCCACGTGGGGCTG  685

seq1  CTGACCCAAGTCAATGCTGCTTCTGTTAGTCTTAGTCCCTTGGTCCCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCAAGTCAATGCTGCTTCTGTTAGTCTTAGTCCCTTGGTCCCAGT  735

seq1  AACTCTTCTCATGCCGTCCCATGCCATGTTTTCATCTGTAAATTGCAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTCTCATGCCGTCCCATGCCATGTTTTCATCTGTAAATTGCAGTT  785

seq1  CACAACTACTGTGCAGTCTGACTATGCAAGTGGAATGTGATTCTATGGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACTACTGTGCAGTCTGACTATGCAAGTGGAATGTGATTCTATGGCT  835

seq1  TGATTTCACACACACCACAAGGGCACAACCTCCCCTCCACTAGCTCCTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTCACACACACCACAAGGGCACAACCTCCCCTCCACTAGCTCCTTC  885

seq1  CTTCTCAGAGTTTGATCTGTCGTTGATACCCGGACACGCCCCATGGGGAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCAGAGTTTGATCTGTCGTTGATACCCGGACACGCCCCATGGGGAC  935

seq1  AAATTGCTCTGTGCTTGGATGTAATTGGATTTTGGAACCAAATGGGGAAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGCTCTGTGCTTGGATGTAATTGGATTTTGGAACCAAATGGGGAAC  985

seq1  CTGGAATTC  1009
      |||||||||
seq2  CTGGAATTC  994