BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-102P23
Chromosome11 (Build37)
Map Location 63,350,559 - 63,480,588
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePrr6, Ubb, Trpv2, 2410006H16Rik, BC046404, BC025076, Zfp287, LOC626482, LOC100042766, Zfp286, Trim16, Fbxw10, Fam18b, Cdrt4, Tekt3, Pmp22, LOC433423, LOC100042799
Downstream geneLOC100041690, LOC654442, LOC668297, Hs3st3b1, Cox10, 2810001G20Rik, EG544785, Hs3st3a1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-102P23.bB6Ng01-102P23.g
ACCDH911725DH911726
length1,0031,011
definitionDH911725|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102P23, 5' end.DH911726|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102P23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,479,856 - 63,480,588)(63,350,559 - 63,351,566)
sequence
gaattccatgtagagatggaggcttggagcagtctactcacaaacctttg
gaaaggcggggcagaggcctgggattgagtcttacttgaagccaccagaa
ggaacccatgttactgatgcccttgacctcagaatctatatgactcccag
aaccacaagacagcaacatcctgtcttaattccttggcctttcagtaacg
caaccttactaaacatggaggggtgggcagaaaagtgtgatggcttgcat
aggaaatgccccataggtttgtgtatttcaatacttggtccctggatgct
agcactattgggggaatttatggaccctttggaccttgggcttgtctggc
acttgtagacagaggattgcaggaatgggaccggagagttatagctcagc
cttcctgaaccaagctctctgctttctaatcctgtaaggtgtaagcaagc
aatctccacagtgctcgctgccacagtccaagtctgctacagctgccatg
tcctgcctggcccactctgatggtcaggaccctctcctgtccatctttct
tcccttaagttgcattttgccaggtgatttgtaacaaatgccagaggctg
ccactgttcaccacattcctttctagggaaaagatggggctcaacatggt
gaacagtcagttccctgggtgatggacagctggcaccatcttacttcctg
caatttgctgtacttgaaatacaaggaaagcccatgataacaggaagtaa
taggtccactgtgtcttcccaccatgcagaaccctcccctgctacatcac
cctgcaacttagaacttcctttcaagtgtgtccgtactcgaaagcaaaac
cccagcatgaacaacattagtagacatggcttttctggctgcaggatagg
ggaagtctagcttgttcaatctctgcagacaaggaagcagagggttagac
tggaaacagtcagagcatggttttcaggcatgcctctagtgcctgtatca
gcc
gaattcaggagtgtcataggtaggcagtctgactgagggattctggtgaa
atcttaaagtgcactcatctgtggttctgattggaatgagaatatctact
tccacatggcctccttctaagaccaatgggttgtctgagctacttactgc
aggagctgtcaaccctgttcactccataaggctgcttgaacttctcaaga
catggtgtctgatatatcccagagccataaccagaataacaagacaaagc
tttgatgtcctttgtgactgaacctcagacatctcattccagtatttctg
taacatctcattagtcacacaggggacatccacagaggacaaaatgtaca
agcaccatgggtctgttgacttatctgtgctaaaccagacttgaaaggga
taatctgaggtcttttctgactccagaattttatggtgatagttttacag
atatccaggttctaacaggatttaattatgccacgaccgccatgagctaa
gggcatgagaagacaggtaggagtagggtgtgactcttggccccttcagc
tcagatcacagcaggtgttgctaggctcacactgaagtgacacagagtct
cactgtaggcatggggttgaggggtgctctggccttcatgatggactttg
caagaatgagatcattcaaggttgtctgctcagttactactgggatgcct
ccaagccacatacatgccagtgttaatagtggaaaatggtacaaggggcg
gcctgacaatgtggcattgtcctgcaggattcatgattggcttttaacaa
gtgaccttttatcagaaatttgttttgcctacggctggtggatatgtccc
aacacaactttgctgggacatttgggaacacctgctttcggatggctttt
ctgtcatgtctccaagatttctgtgcacttctttccagcattgattggca
ctatcctggcagaatcctgccagtggaatgttgttttagggaagtgttgg
gggggagggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_63479856_63480588
seq2: B6Ng01-102P23.b_50_782 (reverse)

seq1  GGGCTTTCCTTGTATTTCAAGTACAGCAAATTGCAGGAAGTAAGATGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTTCCTTGTATTTCAAGTACAGCAAATTGCAGGAAGTAAGATGGTG  50

seq1  CCAGCTGTCCATCACCCAGGGAACTGACTGTTCACCATGTTGAGCCCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGTCCATCACCCAGGGAACTGACTGTTCACCATGTTGAGCCCCAT  100

seq1  CTTTTCCCTAGAAAGGAATGTGGTGAACAGTGGCAGCCTCTGGCATTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCCTAGAAAGGAATGTGGTGAACAGTGGCAGCCTCTGGCATTTGT  150

seq1  TACAAATCACCTGGCAAAATGCAACTTAAGGGAAGAAAGATGGACAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAATCACCTGGCAAAATGCAACTTAAGGGAAGAAAGATGGACAGGAG  200

seq1  AGGGTCCTGACCATCAGAGTGGGCCAGGCAGGACATGGCAGCTGTAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCCTGACCATCAGAGTGGGCCAGGCAGGACATGGCAGCTGTAGCAG  250

seq1  ACTTGGACTGTGGCAGCGAGCACTGTGGAGATTGCTTGCTTACACCTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGACTGTGGCAGCGAGCACTGTGGAGATTGCTTGCTTACACCTTAC  300

seq1  AGGATTAGAAAGCAGAGAGCTTGGTTCAGGAAGGCTGAGCTATAACTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTAGAAAGCAGAGAGCTTGGTTCAGGAAGGCTGAGCTATAACTCTC  350

seq1  CGGTCCCATTCCTGCAATCCTCTGTCTACAAGTGCCAGACAAGCCCAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTCCCATTCCTGCAATCCTCTGTCTACAAGTGCCAGACAAGCCCAAGG  400

seq1  TCCAAAGGGTCCATAAATTCCCCCAATAGTGCTAGCATCCAGGGACCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGGGTCCATAAATTCCCCCAATAGTGCTAGCATCCAGGGACCAAG  450

seq1  TATTGAAATACACAAACCTATGGGGCATTTCCTATGCAAGCCATCACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAAATACACAAACCTATGGGGCATTTCCTATGCAAGCCATCACACT  500

seq1  TTTCTGCCCACCCCTCCATGTTTAGTAAGGTTGCGTTACTGAAAGGCCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGCCCACCCCTCCATGTTTAGTAAGGTTGCGTTACTGAAAGGCCAA  550

seq1  GGAATTAAGACAGGATGTTGCTGTCTTGTGGTTCTGGGAGTCATATAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTAAGACAGGATGTTGCTGTCTTGTGGTTCTGGGAGTCATATAGAT  600

seq1  TCTGAGGTCAAGGGCATCAGTAACATGGGTTCCTTCTGGTGGCTTCAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGTCAAGGGCATCAGTAACATGGGTTCCTTCTGGTGGCTTCAAGT  650

seq1  AAGACTCAATCCCAGGCCTCTGCCCCGCCTTTCCAAAGGTTTGTGAGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTCAATCCCAGGCCTCTGCCCCGCCTTTCCAAAGGTTTGTGAGTAG  700

seq1  ACTGCTCCAAGCCTCCATCTCTACATGGAATTC  733
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTCCAAGCCTCCATCTCTACATGGAATTC  733

seq1: chr11_63350559_63351566
seq2: B6Ng01-102P23.g_70_1080

seq1  GAATTCAGGAGTGTCATAGGTAGGCAGTCTGACTGAGGGATTCTGGTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAGTGTCATAGGTAGGCAGTCTGACTGAGGGATTCTGGTGAA  50

seq1  ATCTTAAAGTGCACTCATCTGTGGTTCTGATTGGAATGAGAATATCTACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAAAGTGCACTCATCTGTGGTTCTGATTGGAATGAGAATATCTACT  100

seq1  TCCACATGGCCTCCTTCTAAGACCAATGGGTTGTCTGAGCTACTTACTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACATGGCCTCCTTCTAAGACCAATGGGTTGTCTGAGCTACTTACTGC  150

seq1  AGGAGCTGTCAACCCTGTTCACTCCATAAGGCTGCTTGAACTTCTCAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCTGTCAACCCTGTTCACTCCATAAGGCTGCTTGAACTTCTCAAGA  200

seq1  CATGGTGTCTGATATATCCCAGAGCCATAACCAGAATAACAAGACAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGTCTGATATATCCCAGAGCCATAACCAGAATAACAAGACAAAGC  250

seq1  TTTGATGTCCTTTGTGACTGAACCTCAGACATCTCATTCCAGTATTTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGTCCTTTGTGACTGAACCTCAGACATCTCATTCCAGTATTTCTG  300

seq1  TAACATCTCATTAGTCACACAGGGGACATCCACAGAGGACAAAATGTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTCATTAGTCACACAGGGGACATCCACAGAGGACAAAATGTACA  350

seq1  AGCACCATGGGTCTGTTGACTTATCTGTGCTAAACCAGACTTGAAAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCATGGGTCTGTTGACTTATCTGTGCTAAACCAGACTTGAAAGGGA  400

seq1  TAATCTGAGGTCTTTTCTGACTCCAGAATTTTATGGTGATAGTTTTACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTGAGGTCTTTTCTGACTCCAGAATTTTATGGTGATAGTTTTACAG  450

seq1  ATATCCAGGTTCTAACAGGATTTAATTATGCCACGACCGCCATGAGCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCAGGTTCTAACAGGATTTAATTATGCCACGACCGCCATGAGCTAA  500

seq1  GGGCATGAGAAGACAGGTAGGAGTAGGGTGTGACTCTTGGCCCCTTCAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGAGAAGACAGGTAGGAGTAGGGTGTGACTCTTGGCCCCTTCAGC  550

seq1  TCAGATCACAGCAGGTGTTGCTAGGCTCACACTGAAGTGACACAGAGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCACAGCAGGTGTTGCTAGGCTCACACTGAAGTGACACAGAGTCT  600

seq1  CACTGTAGGCATGGGGTTGAGGGGTGCTCTGGCCTTCATGATGGACTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTAGGCATGGGGTTGAGGGGTGCTCTGGCCTTCATGATGGACTTTG  650

seq1  CAAGAATGAGATCATTCAAGGTTGTCTGCTCAGTTACTACTGGGATGCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATGAGATCATTCAAGGTTGTCTGCTCAGTTACTACTGGGATGCCT  700

seq1  CCAAGCCACATACATGCCAGTGTTAATAGTGGAAAATGGTACAAGGGGCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCCACATACATGCCAGTGTTAATAGTGGAAAATGGTACAAGGGGCG  750

seq1  GCCTGACAATGTGGCATTGTCCTGCAGGATTCATGATTGGCTTTTAACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACAATGTGGCATTGTCCTGCAGGATTCATGATTGGCTTTTAACAA  800

seq1  GTGACCTTTTATCAG-AATTTGTTTTGCCTACGGCTGGTGGATATGTCCC  849
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCTTTTATCAGAAATTTGTTTTGCCTACGGCTGGTGGATATGTCCC  850

seq1  AACACAACTTTGCTGGGACATTTGGGAACACCTGCTTTCGGATGGCTTTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAACTTTGCTGGGACATTTGGGAACACCTGCTTTCGGATGGCTTTT  900

seq1  CTGTCATGTCTCCAAGATTTCTGTGCACTTCTTTCCAGCATTGATTGGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCATGTCTCCAAGATTTCTGTGCACTTCTTTCCAGCATTGATTGGCA  950

seq1  CTATCCTGGCAGAATCCTGCCAGTGGAATGTTGTTTTAGGGAAGTGTT--  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  CTATCCTGGCAGAATCCTGCCAGTGGAATGTTGTTTTAGGGAAGTGTTGG  1000

seq1  GGGGGAGGGAT  1008
      |||||||||||
seq2  GGGGGAGGGAT  1011