seq1: chr11_5429948_5431139
seq2: B6Ng01-106C04.b_46_1230 (reverse)
seq1 TTATTGTGTAGATATAAATATTTTGTTTAAATATTAAACATTAAACCTTT 50
||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| |
seq2 TTATTGTGTAGATATTAATA-TTTGTT--AATAT--AACATT--ACC--T 41
seq1 TCCTGACATCTAGA-CAGAAA-CGGAGAGAGCAGGAACAACAGCAGAGGA 98
|||||||||||||| | |||| ||||| | |||| ||||||||||||||
seq2 TCCTGACATCTAGACCCGAAACCGGAGGGGGCAG--ACAACAGCAGAGGA 89
seq1 GACAGTCCAAAGACAGACGGACTCCTA-TGCCATCTGCAGGAGGGAGG-C 146
||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |
seq2 GACAGTCCAAAGACAAACCGACTCCTATTGCCATCTGCAGAAGGGAGGCC 139
seq1 CAGCATGGGTTGCAAAACGCCAAGAAGCTACGTTTCTAAAAAGTCA-CCC 195
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2 CAGCATGGGTTGCAAAACGCCAAGAAGCTACG-TTCTAAAAAGTCACCCC 188
seq1 CCCCTCAGCATAAACCTCTTCTCTGTTCTCCCCTATACAAAGGGAGAAGC 245
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCTCAGCATAAACCTC-TCTCTGTTCTCCCCTATACAAAGGGAGAAGC 237
seq1 AAGCCAGAAACTGAAAACTCAACTGAGGAGGAGTTCAGCTGTAGAAAGAG 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGCCAGAAACTGAAAACTCAACTGAGGAGGAGTTCAGCTGTAGAAAGAG 287
seq1 CCG-CCACACTCACTGGATGGATAGCTTACTGCTCTGCAGCGCTGAAGGA 344
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCGCCCACACTCACTGGATGGATAGCTTACTGCTCTGCAGCGCTGAAGGA 337
seq1 CTTGCGAAAGCCCTCATTACACGTCCTGCCATGCTGAAGAGCTCTTCCTG 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGCGAAAGCCCTCATTACACGTCCTGCCATGCTGAAGAGCTCTTCCTG 387
seq1 AGAAATTAAAAACTTTAACCCTGGTTATTTCCAAAGAACACCTTGAGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAAATTAAAAACTTTAACCCTGGTTATTTCCAAAGAACACCTTGAGACT 437
seq1 GGTTCGGGTACTAAAGGGTAAAGATTTCCTGCTGGCAGGAGGCCATCTTC 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTTCGGGTACTAAAGGGTAAAGATTTCCTGCTGGCAGGAGGCCATCTTC 487
seq1 TGCTAACTTTTAGGCTTACTGCACAAAAGCTTAAGCACCTGACAATTAGC 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTAACTTTTAGGCTTACTGCACAAAAGCTTAAGCACCTGACAATTAGC 537
seq1 TATTTCAGTAAATCTCCAAGACACTTCTCCATTTCTTTTCAGCTAATTCA 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTTCAGTAAATCTCCAAGACACTTCTCCATTTCTTTTCAGCTAATTCA 587
seq1 CTGTTTTTGGAACCAACATTAAAAAAATTCAACTTGCAAATACAAGCACA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTTTTTGGAACCAACATTAAAAAAATTCAACTTGCAAATACAAGCACA 637
seq1 ACTTTCCCTTTTTAAACTCTAGAAGCAATCAATTGTAGGTTTAGCTGACA 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTTTCCCTTTTTAAACTCTAGAAGCAATCAATTGTAGGTTTAGCTGACA 687
seq1 CAGCATGTCCTTAGGATTCATGAAAAGACATTTCTCTCACAGGCAATATA 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCATGTCCTTAGGATTCATGAAAAGACATTTCTCTCACAGGCAATATA 737
seq1 CCTCCCAGTCTTTAAGTCAATCACTGAAGTTAACTGAGGTGTAAACATTC 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCCAGTCTTTAAGTCAATCACTGAAGTTAACTGAGGTGTAAACATTC 787
seq1 CTGACTAACTGAGCCTATCCGTCATGAAAGGAGATCAAGGGCTACTACTT 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGACTAACTGAGCCTATCCGTCATGAAAGGAGATCAAGGGCTACTACTT 837
seq1 GGGTGATCCAGCTACACCAACCTGACACCAACACAAGTTTCTTTGCTTGT 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGTGATCCAGCTACACCAACCTGACACCAACACAAGTTTCTTTGCTTGT 887
seq1 TCCATTCCTTCACAAGAGACAAGTCCTGCTCTCTTCCCTCCCGAGCCCCA 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCATTCCTTCACAAGAGACAAGTCCTGCTCTCTTCCCTCCCGAGCCCCA 937
seq1 CGTGTACAGTGACCACTACAAGTAGCTCAGCACATGACTCAGCAATTAGG 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGTGTACAGTGACCACTACAAGTAGCTCAGCACATGACTCAGCAATTAGG 987
seq1 GTGCAGTGGCGATTAGGAGCACTCCTGTACAGAATCATCTCAAGAATGAA 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGCAGTGGCGATTAGGAGCACTCCTGTACAGAATCATCTCAAGAATGAA 1037
seq1 TGGCTTCAACAATGTGACATGACCTAAGTCATCGGAACACATCCAGCATC 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGCTTCAACAATGTGACATGACCTAAGTCATCGGAACACATCCAGCATC 1087
seq1 TATAGCTGTCGTTAAAGAGACTGTAACATTTCCTGGATAAGCCTATTAAA 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATAGCTGTCGTTAAAGAGACTGTAACATTTCCTGGATAAGCCTATTAAA 1137
seq1 AAACTGCATTTCCCTTGAGATAAGCTTCCTTGGCAAAAAGTTGAATTC 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACTGCATTTCCCTTGAGATAAGCTTCCTTGGCAAAAAGTTGAATTC 1185
| seq1: chr11_5273647_5273884
seq2: B6Ng01-106C04.g_72_309
seq1 TGAGGACAGAAGTAATGTGGTCTGGCGTGTCTTTTAACTGGATTGCTATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGGACAGAAGTAATGTGGTCTGGCGTGTCTTTTAACTGGATTGCTATA 50
seq1 GCTGCTGCTGTACTTGGAAAGAATTGGTATGGGGAAGACCATAGAAAGTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTGCTGCTGTACTTGGAAAGAATTGGTATGGGGAAGACCATAGAAAGTG 100
seq1 GGACTGCATAAGGAAAGCTAGGCAGGAGGCTTGAGGAGAAGCAATAGCAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGACTGCATAAGGAAAGCTAGGCAGGAGGCTTGAGGAGAAGCAATAGCAG 150
seq1 TGTGGAATCAGGTAGTAAAGTAAAGGTGTTGGTTGAGAAGTGGTTAGTTA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGGAATCAGGTAGTAAAGTAAAGGTGTTGGTTGAGAAGTGGTTAGTTA 200
seq1 GGCTCTGAGAGTGAAAGTAGAATGGTGGGGTGGGGTGG 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTCTGAGAGTGAAAGTAGAATGGTGGGGTGGGGTGG 238
|