BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-107K16
Chromosome11 (Build37)
Map Location 16,940,655 - 17,119,192
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1500041B16Rik, LOC100042644, Ppp3r1, Pno1, AI553587
Upstream geneLOC665660, Vstm2, Sec61g, Akt2-ps, LOC665689, LOC627583, Egfr, 2810442I21Rik, A630050E13Rik, Plek
Downstream geneC1d, LOC382486, EG665748, Etaa1, LOC327871, LOC627696
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-107K16.bB6Ng01-107K16.g
ACCDH915068DH915069
length6811,118
definitionDH915068|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107K16, 5' end.DH915069|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107K16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,940,655 - 16,941,335)(17,118,064 - 17,119,192)
sequence
gaattcaatattacctttaagaataagaggatatatgaactttttacaaa
accaacattatcacactgatgaaaggggacagaaatcccatgatcatccc
aaaagatgcagaagtggcctgtgataaaattgagcattccttcatggaga
gagtgggattgaaaggagcagatcccagcacaataaaggctatatatgac
aaacatatagcaaacatacaaacaaaacaaatacaaaaacttgaaacatt
actattaagatcaagaattagacaatgatgtccattctctctattcttgt
tcaatataagccttgaagatttatttgacgtaataagacagtggaatgaa
aagaaagaaaaacaaataaaaagggtatctacatttatagatagtatgat
tatatatttatatatgaaatatatgagatcctagaaactctaccaaaaaa
ctcctagagaaaataaagactttcaacaatgtgtcaggatacaaagttat
ataacaatcagtaaccttatataccagtaacaaaaaacatacagagggaa
atggcgaaacaatcccactgacaaccacccccattcccaaccccatcccc
tttcccacccagtgggagaggctatgcctagccacgcagagacttgatgg
gccagcatgttgtgtgtgtgtgtgggggggg
gaattctcttttagaagactaataagcccatcaaagggagtgcttatcca
ttgcagtactatttaataatctcaccatatatgaagatttccaccaaaat
ctccagtagctaagaatctctgctgcagagatgcggcaccaaatgttcca
catttaatgggcttggccttttcaatctggacagaaaggagagaaggatt
ctttacttatggaaacagttatttataatcacaatgttgacagcttagct
gtagggggttataaatacattatacataaaagcaattaaaacattttcta
taaaaattatacttcctttagtcaattttgtatgattttaaaagtatatc
actgtccaaagaaaggtagtttttgttttgagacagggtcttactatgta
gccttggctctgagctcctagatcactgtctaggtgcgggtagagttgat
ttatttttacttaatgtgtataggtgttttgccttcatggaggtgcatgc
agtacccacaaaagctagaaaaggctatgggcacccctggaactggtagt
tgccatgtgtgtgctgggagtccaagccaggctcactgtagagcagtcag
tgacctcagagctagctctccagtttcggagacaaggtttctcacttggt
tgctcaaatcagacatgattcaaactggtctaaaactgaaagaccatgtg
attacaggagagggaagaagaggggaaatgctgccatcttgaaccccatg
tagtggctcactcctgtagccccagcactccagatatggaagcagaaatg
cagttgtgagttccaggtcaggcaaggctacacagtgaattttaggtcac
actaggctacaaagacatcttttatcttcccactcacaatcccaaagctc
tcccatctctgctagtgccagttggtactgtgctaacctctcaaatacaa
gggatacatcgttttgtgaaggctacaggaacaaacatgttcatgagctc
ttgtagtctagctacagaatccgggtggtgtcagtgctttctgaatgagg
gctaagaagcccattagccttcgactattctttgggacagcgtagccaac
gccacaaaactctctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_16940655_16941335
seq2: B6Ng01-107K16.b_45_725

seq1  GAATTCAATATTACCTTTAAGAATAAGAGGATATATGAACTTTTTACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATATTACCTTTAAGAATAAGAGGATATATGAACTTTTTACAAA  50

seq1  ACCAACATTATCACACTGATGAAAGGGGACAGAAATCCCATGATCATCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAACATTATCACACTGATGAAAGGGGACAGAAATCCCATGATCATCCC  100

seq1  AAAAGATGCAGAAGTGGCCTGTGATAAAATTGAGCATTCCTTCATGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGATGCAGAAGTGGCCTGTGATAAAATTGAGCATTCCTTCATGGAGA  150

seq1  GAGTGGGATTGAAAGGAGCAGATCCCAGCACAATAAAGGCTATATATGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGGATTGAAAGGAGCAGATCCCAGCACAATAAAGGCTATATATGAC  200

seq1  AAACATATAGCAAACATACAAACAAAACAAATACAAAAACTTGAAACATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATATAGCAAACATACAAACAAAACAAATACAAAAACTTGAAACATT  250

seq1  ACTATTAAGATCAAGAATTAGACAATGATGTCCATTCTCTCTATTCTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTAAGATCAAGAATTAGACAATGATGTCCATTCTCTCTATTCTTGT  300

seq1  TCAATATAAGCCTTGAAGATTTATTTGACGTAATAAGACAGTGGAATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATAAGCCTTGAAGATTTATTTGACGTAATAAGACAGTGGAATGAA  350

seq1  AAGAAAGAAAAACAAATAAAAAGGGTATCTACATTTATAGATAGTATGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGAAAAACAAATAAAAAGGGTATCTACATTTATAGATAGTATGAT  400

seq1  TATATATTTATATATGAAATATATGAGATCCTAGAAACTCTACCAAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATTTATATATGAAATATATGAGATCCTAGAAACTCTACCAAAAAA  450

seq1  CTCCTAGAGAAAATAAAGACTTTCAACAATGTGTCAGGATACAAAGTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAGAGAAAATAAAGACTTTCAACAATGTGTCAGGATACAAAGTTAT  500

seq1  ATAACAATCAGTAACCTTATATACCAGTAACAAAAAACATACAGAGGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAATCAGTAACCTTATATACCAGTAACAAAAAACATACAGAGGGAA  550

seq1  ATGGCGAAACAATCCCACTGACAACCACCCCCATTCCCAACCCCATCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCGAAACAATCCCACTGACAACCACCCCCATTCCCAACCCCATCCCC  600

seq1  TTTCCCACCCAGTGGGAGAGGCTATGCCTAGCCACGCAGAGACTTGATGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCACCCAGTGGGAGAGGCTATGCCTAGCCACGCAGAGACTTGATGG  650

seq1  GCCAGCATGTTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGG  681
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCATGTTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGG  681

seq1: chr11_17118064_17119192
seq2: B6Ng01-107K16.g_68_1185 (reverse)

seq1  GAGAG-GAGTATTGTGGCGTTGGCTTCGCTGTCCCAAGAATTAGTGCTGA  49
      ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||   ||
seq2  GAGAGAGAGTTTTGTGGCGTTGGCTACGCTGTCCCAAAGAATAGT--CGA  48

seq1  AGGGCTAATGGGGGCTTCCTTATGCCCTCATTCAGAGAGCACTGAACACC  99
      | |||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  A-GGCTAAT--GGGCTT-CTTA-GCCCTCATTCAGAAAGCACTG-ACACC  92

seq1  AACCGGATTCTGTAGCTAGGACTACAAGAGGCTCATGGACATGTTTGTTC  149
      | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  ACCCGGATTCTGTAGCTA-GACTACAAGA-GCTCATGAACATGTTTGTTC  140

seq1  CTGTAGCCTTCACAAAACGATGTATCCCTTGTATTTGAGAGGTTAGCACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGCCTTCACAAAACGATGTATCCCTTGTATTTGAGAGGTTAGCACA  190

seq1  GTACCAACCTGGCACTAGCAGAGATGGGAGAGCTTTTGGGATTGTGAGTG  249
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTACCAA-CTGGCACTAGCAGAGATGGGAGAGC-TTTGGGATTGTGAGTG  238

seq1  GGAAGATTAAAGATGTCTTTGTAGCCTAGTGTGACCTAAAATTCACTGTG  299
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATAAAAGATGTCTTTGTAGCCTAGTGTGACCTAAAATTCACTGTG  288

seq1  TAGCCTTGCCTGACCTGGAACTCACAACTGCATTTCTGCTTCCATATCTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTTGCCTGACCTGGAACTCACAACTGCATTTCTGCTTCCATATCTG  338

seq1  GAGTGCTGGGGCTACAGGAGTGAGCCACTACATGGGGTTCAAGATGGCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCTGGGGCTACAGGAGTGAGCCACTACATGGGGTTCAAGATGGCAG  388

seq1  CATTTCCCCTCTTCTTCCCTCTCCTGTAATCACATGGTCTTTCAGTTTTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCCCCTCTTCTTCCCTCTCCTGTAATCACATGGTCTTTCAGTTTTA  438

seq1  GACCAGTTTGAATCATGTCTGATTTGAGCAACCAAGTGAGAAACCTTGTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTTTGAATCATGTCTGATTTGAGCAACCAAGTGAGAAACCTTGTC  488

seq1  TCCGAAACTGGAGAGCTAGCTCTGAGGTCACTGACTGCTCTACAGTGAGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAAACTGGAGAGCTAGCTCTGAGGTCACTGACTGCTCTACAGTGAGC  538

seq1  CTGGCTTGGACTCCCAGCACACACATGGCAACTACCAGTTCCAGGGGTGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTGGACTCCCAGCACACACATGGCAACTACCAGTTCCAGGGGTGC  588

seq1  CCATAGCCTTTTCTAGCTTTTGTGGGTACTGCATGCACCTCCATGAAGGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGCCTTTTCTAGCTTTTGTGGGTACTGCATGCACCTCCATGAAGGC  638

seq1  AAAACACCTATACACATTAAGTAAAAATAAATCAACTCTACCCGCACCTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACCTATACACATTAAGTAAAAATAAATCAACTCTACCCGCACCTA  688

seq1  GACAGTGATCTAGGAGCTCAGAGCCAAGGCTACATAGTAAGACCCTGTCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTGATCTAGGAGCTCAGAGCCAAGGCTACATAGTAAGACCCTGTCT  738

seq1  CAAAACAAAAACTACCTTTCTTTGGACAGTGATATACTTTTAAAATCATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAAAAACTACCTTTCTTTGGACAGTGATATACTTTTAAAATCATA  788

seq1  CAAAATTGACTAAAGGAAGTATAATTTTTATAGAAAATGTTTTAATTGCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTGACTAAAGGAAGTATAATTTTTATAGAAAATGTTTTAATTGCT  838

seq1  TTTATGTATAATGTATTTATAACCCCCTACAGCTAAGCTGTCAACATTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTATAATGTATTTATAACCCCCTACAGCTAAGCTGTCAACATTGT  888

seq1  GATTATAAATAACTGTTTCCATAAGTAAAGAATCCTTCTCTCCTTTCTGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATAAATAACTGTTTCCATAAGTAAAGAATCCTTCTCTCCTTTCTGT  938

seq1  CCAGATTGAAAAGGCCAAGCCCATTAAATGTGGAACATTTGGTGCCGCAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTGAAAAGGCCAAGCCCATTAAATGTGGAACATTTGGTGCCGCAT  988

seq1  CTCTGCAGCAGAGATTCTTAGCTACTGGAGATTTTGGTGGAAATCTTCAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCAGCAGAGATTCTTAGCTACTGGAGATTTTGGTGGAAATCTTCAT  1038

seq1  ATATGGTGAGATTATTAAATAGTACTGCAATGGATAAGCACTCCCTTTGA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGTGAGATTATTAAATAGTACTGCAATGGATAAGCACTCCCTTTGA  1088

seq1  TGGGCTTATTAGTCTTCTAAAAGAGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTTATTAGTCTTCTAAAAGAGAATTC  1118