BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-108F15
Chromosome11 (Build37)
Map Location 16,782,907 - 16,887,503
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEgfr, 2810442I21Rik, A630050E13Rik, Plek
Upstream geneLOC665660, Vstm2, Sec61g, Akt2-ps, LOC665689, LOC627583
Downstream gene1500041B16Rik, LOC100042644, Ppp3r1, Pno1, AI553587, C1d, LOC382486, EG665748, Etaa1, LOC327871
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-108F15.bB6Ng01-108F15.g
ACCDH915559DH915560
length1,1231,023
definitionDH915559|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108F15, 5' end.DH915560|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108F15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,886,368 - 16,887,503)(16,782,907 - 16,783,927)
sequence
gaattcagaggggttatcatcaagcagggatgtttactgaagcaggtgag
tgactgccactattccaccttgcctttcctcctttttcaaaccgtctagt
ttttttctaaatcactaatatgagcagaggatggcgatgcatgtttataa
tttcagcaaagtattttatgaaagtattgccctttcttttttaataggga
gaaataagttggccaagagacggcattaaaaagataaagatatttcatgg
taaagtacttcaaggtgaccagaaaatagaaacaggccacactctctctc
tctggtaacctttaagagcaaaaggtgccattccagactgaggacataaa
gctatggcatgaggccaactttgtaggatcagtaggctaaggtcaggtcc
tgttcgaggacatgggcacaggcacagtacaagtgtgtgtgcaggcgtgt
gggggtgttatgtgcagtttcaggtacaacgtaacttctcttcaaggagt
tcaggggaggaagtattaattcctaggggcatagttcgggtggttctgtt
ttgactgacaagcttgggtcttgggttacataagtttttctttgttgcat
gtgtttttgccataacctctgaatttaatcacattaattcaaagttatgg
atatggtgataggagatttttccctaaaagtttactttattgcatatgaa
cccaacatttgctcaagttgtgtttgtcctgtctctagttcccacatgcg
tttcaggacatatttgagcataaggcaaccacaaaaggggaattaccacg
gggctgcgaagggaggagagttctattttattgcttggaagaggatgttt
gtgcagctccaggaagatgagaatccaggttgccaaatgcatttcattga
aagaaagaggtgtgtttgtagcccaagccaagcagagtcctgagttacta
agctttccttctgcttgcctgccccaatcctttaccccatgagtaaccct
ggttcatatcagaaccacttggacaatttttaaaatgttctttatggttc
tcaagatcactctcttccactgctccatgggagttgcccaggcttactgt
agggaggttgcactttcatagaa
gaattccatcaatgatccacacacaatggaaagaaatcaccaactctcaa
aagctgcccactgacctctacattttcatccacaaacacataatgtaact
acataattaattgattagttaattaattaattaatttaaaagcttatatt
tttgaaaagtcaggaacagtcagaaaaacgtagcttgtcatgggcgtagc
gagcaagaacaatcacagaactcgtcatatactttaagaacttctgcact
gggctggagagatgccttagtggttacgagcagtgactgctcttctagaa
gaccaggtttgattatcagcacccacataacaactcacagccacctgtaa
tccagttccagggaatcttctgtcctctatgcgcaccaggtatgcaagtg
gtacacagacataattgcacatagacaacaataataaagaacatctatat
tatttggcttctgttttctcatagtaagtactataaatagaaagttattt
tcttttcaaaaagaaataaaagatgtgcaaccttttctatgccttgattc
agggaccagacaactgcatccagtgtgcccactacattgatggcccacac
tgtgtcaagacctgcccagctggcatcatgggagagaacaacactctggt
ctggaagtatgcagatgccaataatgtctgccacctatgccacgccaact
gtacctatgggtaagtttagagcagcccctataacagtatatgaaaattt
gtttcctagaaatgtctactaaattttcaggaccttaagatgttccaagt
ccatggccatggtggcagcagtggtgtgctggtgggcaggtgtcagactg
gtggtaatatcactaagcatctcgggatgtttgactcagtagtcctagtt
ctttggcactttcatgtgccagtgggaaagggtgatggattaggtttgac
tgccagggtgtaacttcttttcccagctatatgcataggattgggatagg
gatgtttgggctggggatggtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_16886368_16887503
seq2: B6Ng01-108F15.b_47_1169 (reverse)

seq1  TTCTAATGAAAGTGCAAACCTTCCCTACAGGTTAAGCCTGGGCAACTCCC  50
      |||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||
seq2  TTCT-ATGAAAGTGCAA--CCTCCCTACAG--TAAGCCTGGGCAACTCCC  45

seq1  ATGGAAGCAGTGGAAGGAGAGTTGATCTTTTGAGGAACATAAAGAACATT  100
      |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||| | ||||||||||| |
seq2  ATGG-AGCAGTGGAA-GAGAG-TGATC--TTGAGAACCATAAAGAACA-T  89

seq1  TTTAAAATTTGTTCCCAAGTGGTTCTGATATGAACCAGGGTTACTCATGG  150
      ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAATTGT--CCAAGTGGTTCTGATATGAACCAGGGTTACTCATGG  137

seq1  GGTAAAGGATTGGGGCAGGCAAGCAGAAGGAAAGCTTAGTAACTCAGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGGATTGGGGCAGGCAAGCAGAAGGAAAGCTTAGTAACTCAGGAC  187

seq1  TCTGCTTGGCTTGGGCTACAAACACACCTCTTTCTTTTCAATG-AATGCA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  TCTGCTTGGCTTGGGCTACAAACACACCTCTTTC-TTTCAATGAAATGCA  236

seq1  TTTGGCAACCTGGATTCTCATCTTCCTGGAGCTGCACAAACATCCTCTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCAACCTGGATTCTCATCTTCCTGGAGCTGCACAAACATCCTCTTC  286

seq1  CAAGCAATAAAATAGAACTCTCCTCCCTTCGCAGCCCCGTGGTAATTCCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAATAAAATAGAACTCTCCTCCCTTCGCAGCCCCGTGGTAATTCCC  336

seq1  CTTTTGTGGTTGCCTTATGCTCAAATATGTCCTGAAACGCATGTGGGAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTGGTTGCCTTATGCTCAAATATGTCCTGAAACGCATGTGGGAAC  386

seq1  TAGAGACAGGACAAACACAACTTGAGCAAATGTTGGGTTCATATGCAATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGACAGGACAAACACAACTTGAGCAAATGTTGGGTTCATATGCAATA  436

seq1  AAGTAAACTTTTAGGGAAAAATCTCCTATCACCATATCCATAACTTTGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAACTTTTAGGGAAAAATCTCCTATCACCATATCCATAACTTTGAA  486

seq1  TTAATGTGATTAAATTCAGAGGTTATGGCAAAAACACATGCAACAAAGAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTGATTAAATTCAGAGGTTATGGCAAAAACACATGCAACAAAGAA  536

seq1  AAACTTATGTAACCCAAGACCCAAGCTTGTCAGTCAAAACAGAACCACCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTATGTAACCCAAGACCCAAGCTTGTCAGTCAAAACAGAACCACCC  586

seq1  GAACTATGCCCCTAGGAATTAATACTTCCTCCCCTGAACTCCTTGAAGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTATGCCCCTAGGAATTAATACTTCCTCCCCTGAACTCCTTGAAGAG  636

seq1  AAGTTACGTTGTACCTGAAACTGCACATAACACCCCCACACGCCTGCACA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTACGTTGTACCTGAAACTGCACATAACACCCCCACACGCCTGCACA  686

seq1  CACACTTGTACTGTGCCTGTGCCCATGTCCTCGAACAGGACCTGACCTTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTTGTACTGTGCCTGTGCCCATGTCCTCGAACAGGACCTGACCTTA  736

seq1  GCCTACTGATCCTACAAAGTTGGCCTCATGCCATAGCTTTATGTCCTCAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACTGATCCTACAAAGTTGGCCTCATGCCATAGCTTTATGTCCTCAG  786

seq1  TCTGGAATGGCACCTTTTGCTCTTAAAGGTTACCAGAGAGAGAGAGTGTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAATGGCACCTTTTGCTCTTAAAGGTTACCAGAGAGAGAGAGTGTG  836

seq1  GCCTGTTTCTATTTTCTGGTCACCTTGAAGTACTTTACCATGAAATATCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTTTCTATTTTCTGGTCACCTTGAAGTACTTTACCATGAAATATCT  886

seq1  TTATCTTTTTAATGCCGTCTCTTGGCCAACTTATTTCTCCCTATTAAAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTTTTAATGCCGTCTCTTGGCCAACTTATTTCTCCCTATTAAAAA  936

seq1  AGAAAGGGCAATACTTTCATAAAATACTTTGCTGAAATTATAAACATGCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGGCAATACTTTCATAAAATACTTTGCTGAAATTATAAACATGCA  986

seq1  TCGCCATCCTCTGCTCATATTAGTGATTTAGAAAAAAACTAGACGGTTTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCCATCCTCTGCTCATATTAGTGATTTAGAAAAAAACTAGACGGTTTG  1036

seq1  AAAAAGGAGGAAAGGCAAGGTGGAATAGTGGCAGTCACTCACCTGCTTCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGAGGAAAGGCAAGGTGGAATAGTGGCAGTCACTCACCTGCTTCA  1086

seq1  GTAAACATCCCTGCTTGATGATAACCCCTCTGAATTC  1136
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACATCCCTGCTTGATGATAACCCCTCTGAATTC  1123

seq1: chr11_16782907_16783927
seq2: B6Ng01-108F15.g_68_1090

seq1  GAATTCCATCAATGATCCACACACAATGGAAAGAAATCACCAACTCTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCAATGATCCACACACAATGGAAAGAAATCACCAACTCTCAA  50

seq1  AAGCTGCCCACTGACCTCTACATTTTCATCCACAAACACATAATGTAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGCCCACTGACCTCTACATTTTCATCCACAAACACATAATGTAACT  100

seq1  ACATAATTAATTGATTAGTTAATTAATTAATTAATTTAAAAGCTTATATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAATTAATTGATTAGTTAATTAATTAATTAATTTAAAAGCTTATATT  150

seq1  TTTGAAAAGTCAGGAACAGTCAGAAAAACGTAGCTTGTCATGGGCGTAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAAGTCAGGAACAGTCAGAAAAACGTAGCTTGTCATGGGCGTAGC  200

seq1  GAGCAAGAACAATCACAGAACTCGTCATATACTTTAAGAACTTCTGCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGAACAATCACAGAACTCGTCATATACTTTAAGAACTTCTGCACT  250

seq1  GGGCTGGAGAGATGCCTTAGTGGTTACGAGCAGTGACTGCTCTTCTAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGAGAGATGCCTTAGTGGTTACGAGCAGTGACTGCTCTTCTAGAA  300

seq1  GACCAGGTTTGATTATCAGCACCCACATAACAACTCACAGCCACCTGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGGTTTGATTATCAGCACCCACATAACAACTCACAGCCACCTGTAA  350

seq1  TCCAGTTCCAGGGAATCTTCTGTCCTCTATGCGCACCAGGTATGCAAGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTTCCAGGGAATCTTCTGTCCTCTATGCGCACCAGGTATGCAAGTG  400

seq1  GTACACAGACATAATTGCACATAGACAACAATAATAAAGAACATCTATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACAGACATAATTGCACATAGACAACAATAATAAAGAACATCTATAT  450

seq1  TATTTGGCTTCTGTTTTCTCATAGTAAGTACTATAAATAGAAAGTTATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGCTTCTGTTTTCTCATAGTAAGTACTATAAATAGAAAGTTATTT  500

seq1  TCTTTTCAAAAAGAAATAAAAGATGTGCAACCTTTTCTATGCCTTGATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTCAAAAAGAAATAAAAGATGTGCAACCTTTTCTATGCCTTGATTC  550

seq1  AGGGACCAGACAACTGCATCCAGTGTGCCCACTACATTGATGGCCCACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACCAGACAACTGCATCCAGTGTGCCCACTACATTGATGGCCCACAC  600

seq1  TGTGTCAAGACCTGCCCAGCTGGCATCATGGGAGAGAACAACACTCTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAAGACCTGCCCAGCTGGCATCATGGGAGAGAACAACACTCTGGT  650

seq1  CTGGAAGTATGCAGATGCCAATAATGTCTGCCACCTATGCCACGCCAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGTATGCAGATGCCAATAATGTCTGCCACCTATGCCACGCCAACT  700

seq1  GTACCTATGGGTAAGTTTAGAGCAGCCCCTATAACAGTATATGAAAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTATGGGTAAGTTTAGAGCAGCCCCTATAACAGTATATGAAAATTT  750

seq1  GTTTCCTAGAAATGTCTACTAAATTTTCAGGACCTTAAGATGTTCCAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCTAGAAATGTCTACTAAATTTTCAGGACCTTAAGATGTTCCAAGT  800

seq1  CCATGGCCATGGTGGCAGCAGTGGTGTGCTGGTGGGCAGGTGTCAGACTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGCCATGGTGGCAGCAGTGGTGTGCTGGTGGGCAGGTGTCAGACTG  850

seq1  GTGGTAATATCACTAAGCATCTCGGGATGTTTGACTCAGTAGTCCTAGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAATATCACTAAGCATCTCGGGATGTTTGACTCAGTAGTCCTAGTT  900

seq1  CTTTGGCAC-TTCATGTGCCAGTGGGAAAGGGTGATGGA-TAGGTATGAC  948
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  CTTTGGCACTTTCATGTGCCAGTGGGAAAGGGTGATGGATTAGGTTTGAC  950

seq1  TGCCAGGTTGTAACTTC-TTTCCCAGCTATATGCATAGGATTGGGATAGG  997
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGGTGTAACTTCTTTTCCCAGCTATATGCATAGGATTGGGATAGG  1000

seq1  GATGTTGTGGGCTGGGGATGGGAA  1021
      |||||| |||||||||||||| ||
seq2  GATGTT-TGGGCTGGGGATGGTAA  1023