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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-113J18
Chromosome	11 (Build37)
Map Location	62,361,181 - 62,362,279
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Epn2, Grap, Slc5a10, 2310040C09Rik, Prpsap2, Ulk2, Akap10, D630015H07, LOC626325, LOC100041558, Specc1, Adora2b, 2410012H22Rik, Ttc19, Ncor1, Pigl, Prr6
Downstream gene	Ubb, Trpv2, 2410006H16Rik, BC046404, BC025076, Zfp287, LOC626482, LOC100042766, Zfp286, Trim16, Fbxw10, Fam18b, Cdrt4, Tekt3, Pmp22, LOC433423, LOC100042799
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-113J18.b	B6Ng01-113J18.g
ACC	DH919360	DH919361
length	1,098	1,055
definition	DH919360\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J18, 5' end.	DH919361\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J18, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcactatgttgtttaggctgccctcaaactcttagcaacccttctg ccccagctctgcaggtgctgggattcacaggcatgagtgcctgactatac atcttttaaaatttctgacttataataaattctgtctcctaactatgtta aacaaatagctacatagaccagtgcacacaggtgcccacacagagggagg gtactacctgatatggggtgcagggaaccaaactgaagtcctctgcaaga gtagtaagggcccaattcctgagacatctctcttgccccttaatattata ttttaaatatcaccacagacctgaaaagttacagtcagagcctgggccct ggcagccctaattagttaggcgtgaccaccggtcttcaataggccaatca gacaagtaataatgaaaaagagaaaagggagatttacccaatgtggtgcc actggaacgaggaacaaataaagacatacagtgccttcccctcaagtcta tcttcaaagagccaacatgaggtttagatttaaataaaggggctgtagac acagctcaactgttaagagcatttgacgctcttgcagtgaacctgagttt ggttcccagcaccctcatcaggcagctgctcataaccacctataactaca ggtttaggggtaactacagttccagggtaactacagcttcaggggtatcc aacaccctcttctggccactgcagacacctgtgtccacatgcatgtatgc acacagagacacataattaaaaatgagaaaatgggctggtgagatggctc agcaggtaagggcactgactgctcttccaaaggccctgggttcaaatccc agcaaccacatggtggctcacaaccacccataatgagatctgacgccctc tttttggtgtgtctgaagtcagctacagtgaatttatgtataataataaa taattttttaaatgagaaaatatttaagttatagacagttgggtatgtgc ataactaagcagtgtgatggaagtgtggcctcacaagtcctcactgtcag gactccagtttcctcttcaatggtgtctgacaagttgtacgacccggg	gaattccatggcaacatagtgaaaccctgtctggggaaaaaaaaaaaatt aaagtggtcaaaggacttgaataaacacttctccgaaggagaaatacaag tgaacaataagagtgtgagtaggggggctggtgagatggctcagcaggta agagcacccgactgctcttccgaaggtccggagttcaaatcccagcaacc acatggtggctcacaaccatccgtaacgagatctgactccctcttctgga gtgtctgaagacagctacagtggacttacttaaataataaataaatctta aaaaaaaaactttaaaaaaaaaaaaaaaagatgtttaaaaagagtgtgag taggtttggggagacagcgccactggtcaccagcttaactgcacaagcaa gcaggggacctgagctcctccagcacccgagatcatgggggtttctaagg taggtacgggttgtggtggcatggcagtatgcatctgtaatcccagaacc aggaggcgagaagggggactccctgggcttcctagccaactaatcaagac aagtcagtaagctggaggtccaggaaaggcactgtctgtctcagagaaat aagatccgaagtaagcaaggacaacactcagcctgtatctctggttccca cataagatgcacacacatgtgcacactcaagaaagacagagagacagagg cagacagatgacagagagaagggctctctgagaggctcaacatcaatcac ttctcattagggagtcaaaaaccacaatgaaaagctgcttcacccttact ttgcacggctgtcatttaaaaatgcaaagaagacttggagccggcagtgg ataaagaacagtgctgtgcaaccgtgaagaccagagtttgagtttctaaa acccacacaaaagcttgcaagttcggagggccctgcatcacacgtgaaag gcaaagatggggatcctcgagcaatctgaggtaactagtcattcaacagg aggctctagagctagctgggtaaataagcctagtcagtcacgcaactcac agtga
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr11_62361181_62362279 seq2: B6Ng01-113J18.b_46_1143 seq1 GAATTCACTATGTTGTTTAGGCTGCCCTCAAACTCTTAGCAACCCTTCTG 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCACTATGTTGTTTAGGCTGCCCTCAAACTCTTAGCAACCCTTCTG 50 seq1 CCCCAGCTCTGCAGGTGCTGGGATTCACAGGCATGAGTGCCTGACTATAC 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCCAGCTCTGCAGGTGCTGGGATTCACAGGCATGAGTGCCTGACTATAC 100 seq1 ATCTTTTAAAATTTCTGACTTATAATAAATTCTGTCTCCTAACTATGTTA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCTTTTAAAATTTCTGACTTATAATAAATTCTGTCTCCTAACTATGTTA 150 seq1 AACAAATAGCTACATAGACCAGTGCACACAGGTGCCCACACAGAGGGAGG 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACAAATAGCTACATAGACCAGTGCACACAGGTGCCCACACAGAGGGAGG 200 seq1 GTACTACCTGATATGGGGTGCAGGGAACCAAACTGAAGTCCTCTGCAAGA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTACTACCTGATATGGGGTGCAGGGAACCAAACTGAAGTCCTCTGCAAGA 250 seq1 GTAGTAAGGGCCCAATTCCTGAGACATCTCTCTTGCCCCTTAATATTATA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTAGTAAGGGCCCAATTCCTGAGACATCTCTCTTGCCCCTTAATATTATA 300 seq1 TTTTAAATATCACCACAGACCTGAAAAGTTACAGTCAGAGCCTGGGCCCT 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTAAATATCACCACAGACCTGAAAAGTTACAGTCAGAGCCTGGGCCCT 350 seq1 GGCAGCCCTAATTAGTTAGGCGTGACCACCGGTCTTCAATAGGCCAATCA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCAGCCCTAATTAGTTAGGCGTGACCACCGGTCTTCAATAGGCCAATCA 400 seq1 GACAAGTAATAATGAAAAAGAGAAAAGGGAGATTTACCCAATGTGGTGCC 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACAAGTAATAATGAAAAAGAGAAAAGGGAGATTTACCCAATGTGGTGCC 450 seq1 ACTGGAACGAGGAACAAATAAAGACATACAGTGCCTTCCCCTCAAGTCTA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTGGAACGAGGAACAAATAAAGACATACAGTGCCTTCCCCTCAAGTCTA 500 seq1 TCTTCAAAGAGCCAACATGAGGTTTAGATTTAAATAAAGGGGCTGTAGAC 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTTCAAAGAGCCAACATGAGGTTTAGATTTAAATAAAGGGGCTGTAGAC 550 seq1 ACAGCTCAACTGTTAAGAGCATTTGACGCTCTTGCAGTGAACCTGAGTTT 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAGCTCAACTGTTAAGAGCATTTGACGCTCTTGCAGTGAACCTGAGTTT 600 seq1 GGTTCCCAGCACCCTCATCAGGCAGCTGCTCATAACCACCTATAACTACA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTTCCCAGCACCCTCATCAGGCAGCTGCTCATAACCACCTATAACTACA 650 seq1 GGTTTAGGGGTAACTACAGTTCCAGGGTAACTACAGCTTCAGGGGTATCC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTTTAGGGGTAACTACAGTTCCAGGGTAACTACAGCTTCAGGGGTATCC 700 seq1 AACACCCTCTTCTGGCCACTGCAGACACCTGTGTCCACATGCATGTATGC 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACACCCTCTTCTGGCCACTGCAGACACCTGTGTCCACATGCATGTATGC 750 seq1 ACACAGAGACACATAATTAAAAATGAGAAAATGGGCTGGTGAGATGGCTC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACACAGAGACACATAATTAAAAATGAGAAAATGGGCTGGTGAGATGGCTC 800 seq1 AGCAGGTAAGGGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGCCCTGGGTTCAAATCCC 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCAGGTAAGGGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGCCCTGGGTTCAAATCCC 850 seq1 AGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCATAATGAGATCTGACGCCCTC 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCATAATGAGATCTGACGCCCTC 900 seq1 -TTTTGGTGTGTCTGAAGTCAGCTACAGTGAATTTATGTATAATAATAAA 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTTGGTGTGTCTGAAGTCAGCTACAGTGAATTTATGTATAATAATAAA 950 seq1 TAATTTTTTTAAATGAGAAAATATTTAAGTATAAGACAGTTGGTTATGTG 999 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 TAA-TTTTTTAAATGAGAAAATATTTAAGTTATAGACAGTTGGGTATGTG 999 seq1 CATAACTAAGCAGTTGTGATGGAAGTGTGGCCTCCACAGTCCTCACTGTC 1049 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATAACTAAGCAG-TGTGATGGAAGTGTGGCCTCACAAGTCCTCACTGTC 1048 seq1 AGGACTCCAGTTTCTCCTTCAATGTGGTCTGACAAGTTGTCAGACCCGGG 1099 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGACTCCAGTTTCCTCTTCAATGGTGTCTGACAAGTTGTACGACCCGGG 1098

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr11_62361181_62362279
seq2: B6Ng01-113J18.b_46_1143

seq1  GAATTCACTATGTTGTTTAGGCTGCCCTCAAACTCTTAGCAACCCTTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATGTTGTTTAGGCTGCCCTCAAACTCTTAGCAACCCTTCTG  50

seq1  CCCCAGCTCTGCAGGTGCTGGGATTCACAGGCATGAGTGCCTGACTATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCTCTGCAGGTGCTGGGATTCACAGGCATGAGTGCCTGACTATAC  100

seq1  ATCTTTTAAAATTTCTGACTTATAATAAATTCTGTCTCCTAACTATGTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTAAAATTTCTGACTTATAATAAATTCTGTCTCCTAACTATGTTA  150

seq1  AACAAATAGCTACATAGACCAGTGCACACAGGTGCCCACACAGAGGGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATAGCTACATAGACCAGTGCACACAGGTGCCCACACAGAGGGAGG  200

seq1  GTACTACCTGATATGGGGTGCAGGGAACCAAACTGAAGTCCTCTGCAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTACCTGATATGGGGTGCAGGGAACCAAACTGAAGTCCTCTGCAAGA  250

seq1  GTAGTAAGGGCCCAATTCCTGAGACATCTCTCTTGCCCCTTAATATTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTAAGGGCCCAATTCCTGAGACATCTCTCTTGCCCCTTAATATTATA  300

seq1  TTTTAAATATCACCACAGACCTGAAAAGTTACAGTCAGAGCCTGGGCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAATATCACCACAGACCTGAAAAGTTACAGTCAGAGCCTGGGCCCT  350

seq1  GGCAGCCCTAATTAGTTAGGCGTGACCACCGGTCTTCAATAGGCCAATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCCCTAATTAGTTAGGCGTGACCACCGGTCTTCAATAGGCCAATCA  400

seq1  GACAAGTAATAATGAAAAAGAGAAAAGGGAGATTTACCCAATGTGGTGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGTAATAATGAAAAAGAGAAAAGGGAGATTTACCCAATGTGGTGCC  450

seq1  ACTGGAACGAGGAACAAATAAAGACATACAGTGCCTTCCCCTCAAGTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAACGAGGAACAAATAAAGACATACAGTGCCTTCCCCTCAAGTCTA  500

seq1  TCTTCAAAGAGCCAACATGAGGTTTAGATTTAAATAAAGGGGCTGTAGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAAAGAGCCAACATGAGGTTTAGATTTAAATAAAGGGGCTGTAGAC  550

seq1  ACAGCTCAACTGTTAAGAGCATTTGACGCTCTTGCAGTGAACCTGAGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTCAACTGTTAAGAGCATTTGACGCTCTTGCAGTGAACCTGAGTTT  600

seq1  GGTTCCCAGCACCCTCATCAGGCAGCTGCTCATAACCACCTATAACTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCAGCACCCTCATCAGGCAGCTGCTCATAACCACCTATAACTACA  650

seq1  GGTTTAGGGGTAACTACAGTTCCAGGGTAACTACAGCTTCAGGGGTATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAGGGGTAACTACAGTTCCAGGGTAACTACAGCTTCAGGGGTATCC  700

seq1  AACACCCTCTTCTGGCCACTGCAGACACCTGTGTCCACATGCATGTATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCCTCTTCTGGCCACTGCAGACACCTGTGTCCACATGCATGTATGC  750

seq1  ACACAGAGACACATAATTAAAAATGAGAAAATGGGCTGGTGAGATGGCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAGACACATAATTAAAAATGAGAAAATGGGCTGGTGAGATGGCTC  800

seq1  AGCAGGTAAGGGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGCCCTGGGTTCAAATCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGTAAGGGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGCCCTGGGTTCAAATCCC  850

seq1  AGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCATAATGAGATCTGACGCCCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCATAATGAGATCTGACGCCCTC  900

seq1  -TTTTGGTGTGTCTGAAGTCAGCTACAGTGAATTTATGTATAATAATAAA  949
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGGTGTGTCTGAAGTCAGCTACAGTGAATTTATGTATAATAATAAA  950

seq1  TAATTTTTTTAAATGAGAAAATATTTAAGTATAAGACAGTTGGTTATGTG  999
      ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||
seq2  TAA-TTTTTTAAATGAGAAAATATTTAAGTTATAGACAGTTGGGTATGTG  999

seq1  CATAACTAAGCAGTTGTGATGGAAGTGTGGCCTCCACAGTCCTCACTGTC  1049
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  CATAACTAAGCAG-TGTGATGGAAGTGTGGCCTCACAAGTCCTCACTGTC  1048

seq1  AGGACTCCAGTTTCTCCTTCAATGTGGTCTGACAAGTTGTCAGACCCGGG  1099
      ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||
seq2  AGGACTCCAGTTTCCTCTTCAATGGTGTCTGACAAGTTGTACGACCCGGG  1098

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