BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114I09
Chromosome11 (Build37)
Map Location 75,466,582 - 75,629,172
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo1c, Crk, Ywhae, Doc2b
Upstream gene1300001I01Rik, Pafah1b1, Mett10d, Mnt, Rutbc1, Tsr1, Srr, LOC100042478, Smg6, LOC100043429, LOC627835, Hic1, LOC668604, Ovca2, Dph1, Rtn4rl1, Rpa1, Smyd4, Serpinf1, LOC100043447, Serpinf2, Wdr81, LOC100042498, 2010305C02Rik, Prpf8, Rilp, Scarf1, Slc43a2, Pitpna, LOC654359, Pps
Downstream geneRph3al, 1700016K19Rik, 1500005K14Rik, Vps53, LOC668634, 2310047D13Rik, Gemin4, Dbil5, Glod4, Rnmtl1, Nxn, Timm22, Abr, LOC100043483, A830053O21Rik, Tusc5, Gosr1, Cpd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114I09.bB6Ng01-114I09.g
ACCDH920023DH920024
length1,068723
definitionDH920023|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114I09, 5' end.DH920024|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114I09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,466,582 - 75,467,662)(75,628,451 - 75,629,172)
sequence
gaattctgtcagaccaaagattcatggttctgaagccagagtgagcatcc
cctcccaagtcactccccccgaagcctctaaaagtccctaatggggtagt
cggggcccagacctaaaatggatttgataatctaaattaagcgaggcatg
atagggtactttttgtaatctcagcactagggaggctgaggcaagaggct
gctgagttccaggtcagcccgagttccacagtgagacaagagtctgccct
gtgcccagcgctgacctgcctggcaggcagtactgtgctttccctgttag
cctcagtgaaagtcgccccagagcagttcctccagcctttccaccagagg
tcaggctccaaaacactgggtaagggccactggatgaaccagttctgctg
tcagccccgctccccatagtcccagtacacatccgggtaggaagagcccc
agcggtgcttttagggattaagtcttgggtcactcactggcttaaggtgt
actctagcctgaagccaaccttaagcccagggccatgctgtggggtcctc
gagtgttccccagttgccacccctaaacatcagtggtcacactacacagg
tttctgtcctaggtcactgaggaaaactgtgcagtcctgttaactgttgg
gagggatcagagcagcactaccttagttgtttcaaagcggtcctgggttt
cagttccattcctcgtacaagtctagaaatcttgaacgaacaaggcttct
cacctacctactctcagttcccccttctaaaataggataacaacataact
catggtggtacgtccggcactgacgggagtgacataagctaagaacacag
gaagcgcctggcatggcggtgtccctcacacccttggttcctcacttcac
ttcccctctctggactcacgctcctgtccagagaggtggagcagctagaa
gtagatgccgggactgtgctgctcagcccggaggcgcgctacacgccctc
cttccgatgcgggcggtgctgcggggcgccagcgggcatcctatgaatcg
gctgcgccgctcggatgg
gaattcaaaaaaatccaaaagtagccccaagaaagagctggtcttgaaga
aagctccatgggcattaaagacttagtcccttggcctcagtgagccaagt
ctccaaagtctccaaagcagccccgaccggagcaggagtaacagctctgg
cctgattgcactgaaactgcccaccaatccagctggcctctctctgagct
gggacaaagctgaggggttccccatagtgctgtggaaggtgtggggccag
cctcaggcctcatctacccctcccttcactcctcttgataatgagtagcc
ctggctgatttcacaggtgaggattaatctgtttacttcacatatgagct
agccaaccctaaacataattgcagatctgaatgcaaattcattcagcaga
cacatagtcaaaccagttactcaaacgtgctgtagctgctccttccccac
gagtgctctacagccaagtggcctgtgaccttgagtttcctgttaaatga
aggaaaccctagccctgcgtaagtgggtctttggagtatcccaccctcaa
gctagagggaggatgctatctgatcccctcaggggcaagaatggaggaaa
atcccttcagccaagtcctgcctcaatcgccatagatctttgtgctgagt
tgggacccactctggagggaaatcaaccagactttgtgtggagtgtatgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_75466582_75467662
seq2: B6Ng01-114I09.b_47_1114

seq1  GAATTCTGTCAGACCAAAGATTCATGGTTCTGAAGCCAGAGTGAGCATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCAGACCAAAGATTCATGGTTCTGAAGCCAGAGTGAGCATCC  50

seq1  CCTCCCAAGTCACTCCCCCCGAAGCCTCTAAAAGTCCCTAATGGGGTAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAAGTCACTCCCCCCGAAGCCTCTAAAAGTCCCTAATGGGGTAGT  100

seq1  CGGGGCCCAGACCTAAAATGGATTTGATAATCTAAATTAAGCGAGGCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGCCCAGACCTAAAATGGATTTGATAATCTAAATTAAGCGAGGCATG  150

seq1  ATAGGGTACTTTTTGTAATCTCAGCACTAGGGAGGCTGAGGCAAGAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGTACTTTTTGTAATCTCAGCACTAGGGAGGCTGAGGCAAGAGGCT  200

seq1  GCTGAGTTCCAGGTCAGCCCGAGTTCCACAGTGAGACAAGAGTCTGCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTTCCAGGTCAGCCCGAGTTCCACAGTGAGACAAGAGTCTGCCCT  250

seq1  GTGCCCAGCGCTGACCTGCCTGGCAGGCAGTACTGTGCTTTCCCTGTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCAGCGCTGACCTGCCTGGCAGGCAGTACTGTGCTTTCCCTGTTAG  300

seq1  CCTCAGTGAAAGTCGCCCCAGAGCAGTTCCTCCAGCCTTTCCACCAGAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGTGAAAGTCGCCCCAGAGCAGTTCCTCCAGCCTTTCCACCAGAGG  350

seq1  TCAGGCTCCAAAACACTGGGTAAGGGCCACTGGATGAACCAGTTCTGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCTCCAAAACACTGGGTAAGGGCCACTGGATGAACCAGTTCTGCTG  400

seq1  TCAGCCCCGCTCCCCATAGTCCCAGTACACATCCGGGTAGGAAGAGCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCCCGCTCCCCATAGTCCCAGTACACATCCGGGTAGGAAGAGCCCC  450

seq1  AGCGGTGCTTTTAGGGATTAAGTCTTGGGTCACTCACTGGCTTAAGGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGTGCTTTTAGGGATTAAGTCTTGGGTCACTCACTGGCTTAAGGTGT  500

seq1  ACTCTAGCCTGAAGCCAACCTTAAGCCCAGGGCCATGCTGTGGGGTCCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAGCCTGAAGCCAACCTTAAGCCCAGGGCCATGCTGTGGGGTCCTC  550

seq1  GAGTGTTCCCCAGTTGCCACCCCTAAACATCAGTGGTCACACTACACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTTCCCCAGTTGCCACCCCTAAACATCAGTGGTCACACTACACAGG  600

seq1  TTTCTGTCCTAGGTCACTGAGGAAAACTGTGCAGTCCTGTTAACTGTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTCCTAGGTCACTGAGGAAAACTGTGCAGTCCTGTTAACTGTTGG  650

seq1  GAGGGATCAGAGCAGCACTACCTTAGTTGTTTCAAAGCGGTCCTGGGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGATCAGAGCAGCACTACCTTAGTTGTTTCAAAGCGGTCCTGGGTTT  700

seq1  CAGTTCCATTCCTCGTACAAGTCTAGAAATCTTGAACGAACAAGGCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCCATTCCTCGTACAAGTCTAGAAATCTTGAACGAACAAGGCTTCT  750

seq1  CACCTACCTACTCTCAGTTCCCCCTTCTAAAATAGGATAACAACATAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTACCTACTCTCAGTTCCCCCTTCTAAAATAGGATAACAACATAACT  800

seq1  CATGGTGGTACGTCCGGCACTGACGGGAGTGACATAAGCTAAGAACACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGGTACGTCCGGCACTGACGGGAGTGACATAAGCTAAGAACACAG  850

seq1  GAAGCGCCTGGCATGGCGGTGTCCCTCACACCCTTGGTTCCTCACTTCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCGCCTGGCATGGCGGTGTCCCTCACACCCTTGGTTCCTCACTTCAC  900

seq1  TTCCCCTCTCTGGACTCACGCTCCTGTCCAGAGAGGTGGAGCAGGCTAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTCCCCTCTCTGGACTCACGCTCCTGTCCAGAGAGGTGGAGCA-GCTAGA  949

seq1  AGTAGATGCCGGGACTGTGGCTGGCCTCAGGCCCGGAGGGCGGCGGCTAC  1000
      |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||   |||||
seq2  AGTAGATGCCGGGACTGT-GCTG--CTCA-GCCCGGA-GGCG--CGCTAC  992

seq1  ACGCCCTCCTTCCGATGCGGGGCGGTGGCTGCGGGGGCGCCAGCGGGCAT  1050
      |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  ACGCCCTCCTTCCGATGC-GGGCGGT-GCTGC-GGGGCGCCAGCGGGCAT  1039

seq1  CCTAGGAATGCGGCTGCGCCGCTCGGGATGG  1081
      |||| |||| |||||||||||||| ||||||
seq2  CCTATGAAT-CGGCTGCGCCGCTC-GGATGG  1068

seq1: chr11_75628451_75629172
seq2: B6Ng01-114I09.g_69_790 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACATACACTCCACACAAAGTCTGGTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACATACACTCCACACAAAGTCTGGTTGA  50

seq1  TTTCCCTCCAGAGTGGGTCCCAACTCAGCACAAAGATCTATGGCGATTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTCCAGAGTGGGTCCCAACTCAGCACAAAGATCTATGGCGATTGA  100

seq1  GGCAGGACTTGGCTGAAGGGATTTTCCTCCATTCTTGCCCCTGAGGGGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGACTTGGCTGAAGGGATTTTCCTCCATTCTTGCCCCTGAGGGGAT  150

seq1  CAGATAGCATCCTCCCTCTAGCTTGAGGGTGGGATACTCCAAAGACCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAGCATCCTCCCTCTAGCTTGAGGGTGGGATACTCCAAAGACCCAC  200

seq1  TTACGCAGGGCTAGGGTTTCCTTCATTTAACAGGAAACTCAAGGTCACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGCAGGGCTAGGGTTTCCTTCATTTAACAGGAAACTCAAGGTCACAG  250

seq1  GCCACTTGGCTGTAGAGCACTCGTGGGGAAGGAGCAGCTACAGCACGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTTGGCTGTAGAGCACTCGTGGGGAAGGAGCAGCTACAGCACGTTT  300

seq1  GAGTAACTGGTTTGACTATGTGTCTGCTGAATGAATTTGCATTCAGATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAACTGGTTTGACTATGTGTCTGCTGAATGAATTTGCATTCAGATCT  350

seq1  GCAATTATGTTTAGGGTTGGCTAGCTCATATGTGAAGTAAACAGATTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTATGTTTAGGGTTGGCTAGCTCATATGTGAAGTAAACAGATTAAT  400

seq1  CCTCACCTGTGAAATCAGCCAGGGCTACTCATTATCAAGAGGAGTGAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACCTGTGAAATCAGCCAGGGCTACTCATTATCAAGAGGAGTGAAGG  450

seq1  GAGGGGTAGATGAGGCCTGAGGCTGGCCCCACACCTTCCACAGCACTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGTAGATGAGGCCTGAGGCTGGCCCCACACCTTCCACAGCACTATG  500

seq1  GGGAACCCCTCAGCTTTGTCCCAGCTCAGAGAGAGGCCAGCTGGATTGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACCCCTCAGCTTTGTCCCAGCTCAGAGAGAGGCCAGCTGGATTGGT  550

seq1  GGGCAGTTTCAGTGCAATCAGGCCAGAGCTGTTACTCCTGCTCCGGTCGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGTTTCAGTGCAATCAGGCCAGAGCTGTTACTCCTGCTCCGGTCGG  600

seq1  GGCTGCTTTGGAGACTTTGGAGACTTGGCTCACTGAGGCCAAGGGACTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCTTTGGAGACTTTGGAGACTTGGCTCACTGAGGCCAAGGGACTAA  650

seq1  GTCTTTAATGCCCATGGAGCTTTCTTCAAGACCAGCTCTTTCTTGGGGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAATGCCCATGGAGCTTTCTTCAAGACCAGCTCTTTCTTGGGGCT  700

seq1  ACTTTTGGATTTTTTTGAATTC  722
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTGGATTTTTTTGAATTC  722