BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114K10
Chromosome11 (Build37)
Map Location 45,208,285 - 45,362,104
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneIl12b, Ublcp1, 3732413I11Rik, Ebf1, LOC382510
Downstream geneLOC633082, Clint1, Lsm11, Thg1l, Sox30, LOC667037, LOC100039624, Adam19, 9530066K23Rik, Cyfip2, C030019I05Rik, LOC100038833, LOC100039577, Itk, OTTMUSG00000005491, Crsp9, LOC100039730, Havcr2, LOC210535, LOC675689
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114K10.bB6Ng01-114K10.g
ACCDH920121DH920122
length1,124673
definitionDH920121|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114K10, 5' end.DH920122|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114K10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(45,208,285 - 45,209,416)(45,361,432 - 45,362,104)
sequence
gaattcatttgatgttaacacattaacactctgtgccaagttttccaaat
ttcaacttcttctcacacacacacacaaaaaaataaaaatagcagtataa
ggattatctctttcaaggccatgattttgaaatgacacaaatgattctat
actttaaaaaaaatgtgctcaaaagctaccattcatcatgaaggaacccc
atactcaaatgttaacaagccccattgctacagtatattgctaaagttca
gtcacataaggtgagtgttgaatgaaacttaagtaaaataaagcatcaag
taggcagaggccagcctgggctaatacctgtaaaagggcactttaagaga
gtaatctagtattccactattatcccaaagactggaaagtaagcaagatt
caaggggcccagtgctactcatgaatgaacaacatggtgagaatacagtc
attgctagataccaaacctactgcctgcagaaatattctgtctctgccac
aagatgtgaatatgatgaaaatgtcctctgtatttctatctgaactcaca
ttccaaaggcctgtgaatgaatacccagttgtctgaatttggatcatgaa
cccaccttgtagccctcagtgactggggagaatggattatgtactctgtc
agcttcctgtgggagaagtagtgcatcagttgtccatccctacctgggga
ggggggtaagagtgggcataggtgccaagcatcacccccatgctaaatat
acccaggagaggacttcacacacagctgactgtcctactgttctgaagcg
cactggaaagagtatagctgtctctaagtgggcctatcacgactaagaca
taaaggagcgtgttaggctatagaagaaaggacaaggaaagatcaacgtg
ggacagagacttactgtaagaacgcatgggctcttctggaaaacttccac
tatttcctgctgttaagacatgcagtggtgtcaattctggagctattgct
ttatccactatataacctttcatctcattacattgatcagattgatagta
gataacatgctgcagaattgctcttactctatgatcaatctaaatctaaa
gtctcagcagcagtacatctctaa
gaattcacagtcaaaggcagttgtacttcttgtgacggctgaaggggtta
ttttctttccagaatcagaaatcaaggcccaactgtctcagtgtgacacc
aagggtttgcaggggaaacaaggaaaacaaagccgaactacaaaccctaa
gctggagctttagacatggctaaaaagtgcatcaagcccttgtgacatac
taaatcctaaggatcttttcagaagttcgaggttacccttggctactagt
gagtatgtggtcatccagggctaatgagagcctttctcataagaccaagc
aaacattcagaatccattgcaagcaaaaccaaccatcccaacataaacca
aaaccaaaaccaaaacaaaacacaacccactgcacagttaagggaaaggc
aagttacttaatgaactcatggctatagattatggaggagatggccaggg
ttcacagccaggtgcactgctgccttctctgttgtcttctctgctttcat
ttattgtgtgatgttaagttcagatggacagggcagggagagaatggctt
gcttagaaagcacagcaagtgacaggatcgcaggaacccatttctgtcac
caataaaaggcagttagttgatagagcagttcttttgttgagttatgagg
aggatgatggtgttgttgaagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_45208285_45209416
seq2: B6Ng01-114K10.b_50_1173

seq1  GAATTCATTTGATGTTAACACATTAACACTCTGTGCCAAGTTTTCCAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTGATGTTAACACATTAACACTCTGTGCCAAGTTTTCCAAAT  50

seq1  TTCAACTTCTTCTCACACACACACACAAAAAAATAAAAATAGCAGTATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTTCTTCTCACACACACACACAAAAAAATAAAAATAGCAGTATAA  100

seq1  GGATTATCTCTTTCAAGGCCATGATTTTGAAATGACACAAATGATTCTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTATCTCTTTCAAGGCCATGATTTTGAAATGACACAAATGATTCTAT  150

seq1  ACTTTAAAAAAAATGTGCTCAAAAGCTACCATTCATCATGAAGGAACCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAAAAAAAATGTGCTCAAAAGCTACCATTCATCATGAAGGAACCCC  200

seq1  ATACTCAAATGTTAACAAGCCCCATTGCTACAGTATATTGCTAAAGTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCAAATGTTAACAAGCCCCATTGCTACAGTATATTGCTAAAGTTCA  250

seq1  GTCACATAAGGTGAGTGTTGAATGAAACTTAAGTAAAATAAAGCATCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATAAGGTGAGTGTTGAATGAAACTTAAGTAAAATAAAGCATCAAG  300

seq1  TAGGCAGAGGCCAGCCTGGGCTAATACCTGTAAAAGGGCACTTTAAGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCAGAGGCCAGCCTGGGCTAATACCTGTAAAAGGGCACTTTAAGAGA  350

seq1  GTAATCTAGTATTCCACTATTATCCCAAAGACTGGAAAGTAAGCAAGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCTAGTATTCCACTATTATCCCAAAGACTGGAAAGTAAGCAAGATT  400

seq1  CAAGGGGCCCAGTGCTACTCATGAATGAACAACATGGTGAGAATACAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGGCCCAGTGCTACTCATGAATGAACAACATGGTGAGAATACAGTC  450

seq1  ATTGCTAGATACCAAACCTACTGCCTGCAGAAATATTCTGTCTCTGCCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTAGATACCAAACCTACTGCCTGCAGAAATATTCTGTCTCTGCCAC  500

seq1  AAGATGTGAATATGATGAAAATGTCCTCTGTATTTCTATCTGAACTCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTGAATATGATGAAAATGTCCTCTGTATTTCTATCTGAACTCACA  550

seq1  TTCCAAAGGCCTGTGAATGAATACCCAGTTGTCTGAATTTGGATCATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAAGGCCTGTGAATGAATACCCAGTTGTCTGAATTTGGATCATGAA  600

seq1  CCCACCTTGTAGCCCTCAGTGACTGGGGAGAATGGATTATGTACTCTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCTTGTAGCCCTCAGTGACTGGGGAGAATGGATTATGTACTCTGTC  650

seq1  AGCTTCCTGTGGGAGAAGTAGTGCATCAGTTGTCCATCCCTACCTGGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTGTGGGAGAAGTAGTGCATCAGTTGTCCATCCCTACCTGGGGA  700

seq1  GGGGGGTAAGAGTGGGCATAGGTGCCAAGCATCACCCCCATGCTAAATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGTAAGAGTGGGCATAGGTGCCAAGCATCACCCCCATGCTAAATAT  750

seq1  ACCCAGGAGAGGACTTCACACACAGCTGACTGTCCTACTGTTCTGAAGCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGAGAGGACTTCACACACAGCTGACTGTCCTACTGTTCTGAAGCG  800

seq1  CACTGGAAAGAGTATAGCTGTCTCTAAGTGGGCCTATCAGGACTAAGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACTGGAAAGAGTATAGCTGTCTCTAAGTGGGCCTATCACGACTAAGACA  850

seq1  T-AAGGAGCGTGTTAGGCTATAGAAGAAAGGACAAGGAAAGATCCACGTG  899
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TAAAGGAGCGTGTTAGGCTATAGAAGAAAGGACAAGGAAAGATCAACGTG  900

seq1  GGACAGAGACTTACTGTAAGAACGCATGGGCTCTTCCTGGAAAACTTCCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGACAGAGACTTACTGTAAGAACGCATGGGCTCTT-CTGGAAAACTTCCA  949

seq1  CTACTTTCCTGCTGTTAGAACAAGGCAGTGGTGTCAATTCTGGAGCTTAT  999
      ||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTA-TTTCCTGCTGTTAAGAC-ATGCAGTGGTGTCAATTCTGGAGC-TAT  996

seq1  TGCTTTATCCACTAATATAAACCTGTCATCTCATTACAATTGATCAGATT  1049
      ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
seq2  TGCTTTATCCACT-ATAT-AACCTTTCATCTCATTAC-ATTGATCAGATT  1043

seq1  GAATAGTAGATAACATGCTGGCAG-ATTGCTCTTACTCTAGGATCAATCT  1098
      | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  G-ATAGTAGATAACATGCT-GCAGAATTGCTCTTACTCTATGATCAATCT  1091

seq1  AACCTAAAAGTCTCCAGCAGCAGGGACTCTCTAA  1132
      ||    ||||||| |||||||||    |||||||
seq2  AAATCTAAAGTCT-CAGCAGCAGTACATCTCTAA  1124

seq1: chr11_45361432_45362104
seq2: B6Ng01-114K10.g_68_740 (reverse)

seq1  ATCTTCAACAACACCATCATCCTCCTCATAACTCAACAAAAGAACTGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCAACAACACCATCATCCTCCTCATAACTCAACAAAAGAACTGCTC  50

seq1  TATCAACTAACTGCCTTTTATTGGTGACAGAAATGGGTTCCTGCGATCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAACTAACTGCCTTTTATTGGTGACAGAAATGGGTTCCTGCGATCCT  100

seq1  GTCACTTGCTGTGCTTTCTAAGCAAGCCATTCTCTCCCTGCCCTGTCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTGCTGTGCTTTCTAAGCAAGCCATTCTCTCCCTGCCCTGTCCAT  150

seq1  CTGAACTTAACATCACACAATAAATGAAAGCAGAGAAGACAACAGAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTTAACATCACACAATAAATGAAAGCAGAGAAGACAACAGAGAAG  200

seq1  GCAGCAGTGCACCTGGCTGTGAACCCTGGCCATCTCCTCCATAATCTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGTGCACCTGGCTGTGAACCCTGGCCATCTCCTCCATAATCTATA  250

seq1  GCCATGAGTTCATTAAGTAACTTGCCTTTCCCTTAACTGTGCAGTGGGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGAGTTCATTAAGTAACTTGCCTTTCCCTTAACTGTGCAGTGGGTT  300

seq1  GTGTTTTGTTTTGGTTTTGGTTTTGGTTTATGTTGGGATGGTTGGTTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTGTTTTGGTTTTGGTTTTGGTTTATGTTGGGATGGTTGGTTTTG  350

seq1  CTTGCAATGGATTCTGAATGTTTGCTTGGTCTTATGAGAAAGGCTCTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAATGGATTCTGAATGTTTGCTTGGTCTTATGAGAAAGGCTCTCAT  400

seq1  TAGCCCTGGATGACCACATACTCACTAGTAGCCAAGGGTAACCTCGAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCTGGATGACCACATACTCACTAGTAGCCAAGGGTAACCTCGAACT  450

seq1  TCTGAAAAGATCCTTAGGATTTAGTATGTCACAAGGGCTTGATGCACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAAAGATCCTTAGGATTTAGTATGTCACAAGGGCTTGATGCACTTT  500

seq1  TTAGCCATGTCTAAAGCTCCAGCTTAGGGTTTGTAGTTCGGCTTTGTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCCATGTCTAAAGCTCCAGCTTAGGGTTTGTAGTTCGGCTTTGTTTT  550

seq1  CCTTGTTTCCCCTGCAAACCCTTGGTGTCACACTGAGACAGTTGGGCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTTTCCCCTGCAAACCCTTGGTGTCACACTGAGACAGTTGGGCCTT  600

seq1  GATTTCTGATTCTGGAAAGAAAATAACCCCTTCAGCCGTCACAAGAAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTGATTCTGGAAAGAAAATAACCCCTTCAGCCGTCACAAGAAGTA  650

seq1  CAACTGCCTTTGACTGTGAATTC  673
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGCCTTTGACTGTGAATTC  673