BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115G04
Chromosome11 (Build37)
Map Location 12,429,383 - 12,537,832
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneIkzf1, Fignl1, Ddc, Grb10, Cobl
Downstream geneLOC627244
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115G04.bB6Ng01-115G04.g
ACCDH920665DH920666
length1,2431,113
definitionDH920665|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115G04, 5' end.DH920666|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115G04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,429,383 - 12,430,643)(12,536,708 - 12,537,832)
sequence
gaattctcaggagtaatgtagtgccatattggcctcaaatactttttgaa
ctcagatacttatgcaaaaaaaaacctgaaatataattattttcctcatc
ttttatattgatgcaacaagaaaagttgttctgcatctaatagtaatctt
tgattcctaatgacatcacaggatacaattaatcatgtaagagtagaaat
atgcaataccattctgcctctaactgcatctaatggcaatctctgatcct
cacctatgtgagaggatatgatcagttatgtaagaatagaagtctttagt
accattcatgtctgttgggatgtgtttacttttgttgttgtagatcatcc
taatttgctttctgttgctgggataaatgtcataacctaaaccaacttga
aaatgtttttatttcaggttaccagttagagttactccttgagggaaggc
agagtatgagctcaaaactggaagctgaggcaggaactgaagcggagatc
acagaggaactgttttgctttctctgatttgctcagctacccttcttata
cagcccaggtccacctgcccatagatgatcctgcccatactgggatgggc
tcttctacatcaacaagaaattaagaaaatgccctacagatgtattcaca
agcctggctgatggaaaccaccctttcactgaagttctttcctctcaagt
tgtaaagtttgtatcaagttgataaaaactatggcagaaattggctgtgg
ggcttcagatacgctatttacttgctaagctaagctaaacacgtgctgac
atagaccctagttcctgtccaaaaaatcctgaatcacacaaagttggatt
taatgactggatcccagaaaatgtcacgttgacagatattattcaatact
actgcagacatacgccttcagcaatgtgtaggggctcagaaattaaggga
aatgactcttccttcacatatctatttagagaaagatacgggaaagagag
atggagagagagagaaataagacttccatactcaagagaccattagatca
tatcagctagctctatcatggggcttacttgagataaatacaaagtaaag
gcattcaagagacccagcattctttagatgtgattgtattaggatattga
tacttgcatgacatatatgcttttaaaggtaatttggccttaaacagata
ctttggtaggtgtttttagatacgaatacctggtgctagggaa
gaattcactcactgcactccctcccaaagtctataactcttcagaagttt
cacctttgaattcctacctttgctacgggttttttaatgagtcaatctaa
aggtgatggggtgtttacaaaatatgaggtagccatatgaataacaatat
ccaagtccagtccagcctgcctttaactctctgctggcacagaaatcaga
ataaagataatacaaagacaatctttaatagagagtaggggaaggttgga
ggggagaaataaggaaggaatcgaaaagggagtcaagaaaagagagagac
agagacagacagagatgtctcagtaaggtaactactaggaagaggcagga
gtcaagctcatccatgcagtcactctgaaaatatccttgtatatgcccag
gtgtctgagtatagcactgtagaaggctccagttatatacacagtctcta
catccttacatgcttacacgttctgtgtatatattatcatacaaccatac
atgcaaatcacacaaaaattatttcacaagcacatattcttaccccaaca
cacattcccaattaacatatacaccctggaatgcatataactcctcacat
atgctcataccctcacagatgattatcttggtatcatgatatgggtaata
aggagctctactttcacagtaaagaactataagcttttgccccaaaattt
atcctgtctacaagaaatgcagagaaagaggatggagcagaaaccaatgg
aatggccatccaataactagcccaacttgagactcatcccataggcaagc
accaaaccctgacactattcataatactgttatgcttgcagacaagagtc
tagcatagttgtcctataagattctctatccagcagctgactcagacaga
tgcacacacccacagcacacagcagatagagtttgtgaactctatgcaga
atagggggacatattggtggatgaaggaccccactcggaccagaacagat
ttcatcttgtaccagacctccattgtaataactgggccctatcctcaggt
aaattctattactggaaaaaggcgaactgtacagagaacaccctacacac
agtccaagcagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_12429383_12430643
seq2: B6Ng01-115G04.b_48_1290

seq1  GAATTCTCAGGAGTAATGTAGTGCCATATTGGCCTCAAATACTTTTTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGAGTAATGTAGTGCCATATTGGCCTCAAATACTTTTTGAA  50

seq1  CTCAGATACTTATGCAAAAAAAAACCTGAAATATAATTATTTTCCTCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATACTTATGCAAAAAAAAACCTGAAATATAATTATTTTCCTCATC  100

seq1  TTTTATATTGATGCAACAAGAAAAGTTGTTCTGCATCTAATAGTAATCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATATTGATGCAACAAGAAAAGTTGTTCTGCATCTAATAGTAATCTT  150

seq1  TGATTCCTAATGACATCACAGGATACAATTAATCATGTAAGAGTAGAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCTAATGACATCACAGGATACAATTAATCATGTAAGAGTAGAAAT  200

seq1  ATGCAATACCATTCTGCCTCTAACTGCATCTAATGGCAATCTCTGATCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATACCATTCTGCCTCTAACTGCATCTAATGGCAATCTCTGATCCT  250

seq1  CACCTATGTGAGAGGATATGATCAGTTATGTAAGAATAGAAGTCTTTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTATGTGAGAGGATATGATCAGTTATGTAAGAATAGAAGTCTTTAGT  300

seq1  ACCATTCATGTCTGTTGGGATGTGTTTACTTTTGTTGTTGTAGATCATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTCATGTCTGTTGGGATGTGTTTACTTTTGTTGTTGTAGATCATCC  350

seq1  TAATTTGCTTTCTGTTGCTGGGATAAATGTCATAACCTAAACCAACTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTGCTTTCTGTTGCTGGGATAAATGTCATAACCTAAACCAACTTGA  400

seq1  AAATGTTTTTATTTCAGGTTACCAGTTAGAGTTACTCCTTGAGGGAAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTTTTATTTCAGGTTACCAGTTAGAGTTACTCCTTGAGGGAAGGC  450

seq1  AGAGTATGAGCTCAAAACTGGAAGCTGAGGCAGGAACTGAAGCGGAGATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTATGAGCTCAAAACTGGAAGCTGAGGCAGGAACTGAAGCGGAGATC  500

seq1  ACAGAGGAACTGTTTTGCTTTCTCTGATTTGCTCAGCTACCCTTCTTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGAACTGTTTTGCTTTCTCTGATTTGCTCAGCTACCCTTCTTATA  550

seq1  CAGCCCAGGTCCACCTGCCCATAGATGATCCTGCCCATACTGGGATGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAGGTCCACCTGCCCATAGATGATCCTGCCCATACTGGGATGGGC  600

seq1  TCTTCTACATCAACAAGAAATTAAGAAAATGCCCTACAGATGTATTCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTACATCAACAAGAAATTAAGAAAATGCCCTACAGATGTATTCACA  650

seq1  AGCCTGGCTGATGGAAACCACCCTTTCACTGAAGTTCTTTCCTCTCAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGCTGATGGAAACCACCCTTTCACTGAAGTTCTTTCCTCTCAAGT  700

seq1  TGTAAAGTTTGTATCAAGTTGATAAAAACTATGGCAGAAATTGGCTGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGTTTGTATCAAGTTGATAAAAACTATGGCAGAAATTGGCTGTGG  750

seq1  GGCTTCAGATACGCTATTTACTTGCTAAGCTAAGCTAAACACGTGCTGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGATACGCTATTTACTTGCTAAGCTAAGCTAAACACGTGCTGAC  800

seq1  ATAGACCCTAGTTCCTGTCCAAAAAATCCTGAATCACACAAAGTTGGATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACCCTAGTTCCTGTCCAAAAAATCCTGAATCACACAAAGTTGGATT  850

seq1  TAATGACTGGATCCCAGAAAATGTCAGGTTGACAGATATTATTCAATACT  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACTGGATCCCAGAAAATGTCACGTTGACAGATATTATTCAATACT  900

seq1  ACTGCAGACATACGCCTTCAGCAATGTGTAGGGGCTCAGAAATTAGGGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACTGCAGACATACGCCTTCAGCAATGTGTAGGGGCTCAGAAATTAAGGGA  950

seq1  AATGACTCTTCCTTCAACATATCTATTTAGAGAAAGATACGGGAAAGAGA  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACTCTTCCTTC-ACATATCTATTTAGAGAAAGATACGGGAAAGAGA  999

seq1  GATGGAGAGAGAGAGAAATAAAGACTTCCATACTCAAAGAGACCATTAGG  1050
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  GATGGAGAGAGAGAGAAAT-AAGACTTCCATACTC-AAGAGACCATTAG-  1046

seq1  AATCATTATCAGCTAGCTCTATCATGGGGCTTACTTGAGGAATAAATACA  1100
       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| 
seq2  -ATCA-TATCAGCTAGCTCTATCATGGGGCTTACTTGAG--ATAAATAC-  1091

seq1  AAAGTAAAGGCATTCAGAGACACCAAGCATCCTCTAGATGTTGGATAGTA  1150
      |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||  ||| |||
seq2  AAAGTAAAGGCATTCA-AGAGACCCAGCATTCTTTAGATGT--GATTGTA  1138

seq1  TTAGGGATAATTGATAACTTTGGAATGAC-TATATGCTTTTTAAAAGTAA  1199
      ||| |||| |||||| ||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||| 
seq2  TTA-GGAT-ATTGAT-ACTT--GCATGACATATATGC-TTTTAAAGGTA-  1181

seq1  TATTTGTCCTTTAAAAG--AGTATGGTAAAGTGTTTTTAAGATCAGTA-A  1246
       ||||| |||| || ||  | | |||| | |||||||| ||||  | | |
seq2  -ATTTGGCCTTAAACAGATACTTTGGT-AGGTGTTTTT-AGATACGAATA  1228

seq1  CCTGGTGCTAGGGAA  1261
      |||||||||||||||
seq2  CCTGGTGCTAGGGAA  1243

seq1: chr11_12536708_12537832
seq2: B6Ng01-115G04.g_68_1180 (reverse)

seq1  TCCTGCTTGTGACTTGTGTGTAGGGTGTTTCCTTCCTGTAACAGTTTGCT  50
      ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||| || 
seq2  TCCTGCTTG-GAC-TGTGTGTAGGGTGTT--CT--CTGT-ACAGTTCGC-  42

seq1  CTTTTTCCAGTAATTAGAATTTAACCTGAGGATAGGGCCCAGTATATACA  100
      ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||
seq2  CTTTTTCCAGTAA-TAGAATTT-ACCTGAGGATAGGGCCCAGTTATTACA  90

seq1  ATGGAGGTCTGGTTACAAGATGGAATCTG-TCTGGT-CGAGTTGGGGTCC  148
      |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||
seq2  ATGGAGGTCTGG-TACAAGATGAAATCTGTTCTGGTCCGAG-TGGGGTCC  138

seq1  TTCATCCA-CAATATGTCCCCCTATTCTTGCATAAGAGTTCACAAACTCT  197
      |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  TTCATCCACCAATATGTCCCCCTATTC-TGCAT-AGAGTTCACAAACTCT  186

seq1  ATCTGCTGTGTGGCTGTGGGTGTGTGCATCTGTCTGAGTCAGCTGCTGGA  247
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTGTGT-GCTGTGGGTGTGTGCATCTGTCTGAGTCAGCTGCTGGA  235

seq1  TAGAGAATCTTATAGGACAACTATGCTAGACTCTTGTCTGCAAGCATAAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAATCTTATAGGACAACTATGCTAGACTCTTGTCTGCAAGCATAAC  285

seq1  AGTATTATGAATAGTGTCAGGGTTTGGTGCTTGCCTATGGGATGAGTCTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTATGAATAGTGTCAGGGTTTGGTGCTTGCCTATGGGATGAGTCTC  335

seq1  AAGTTGGGCTAGTTATTGGATGGCCATTCCATTGGTTTCTGCTCCATCCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGGGCTAGTTATTGGATGGCCATTCCATTGGTTTCTGCTCCATCCT  385

seq1  CTTTCTCTGCATTTCTTGTAGACAGGATAAATTTTGGGGCAAAAGCTTAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTGCATTTCTTGTAGACAGGATAAATTTTGGGGCAAAAGCTTAT  435

seq1  AGTTCTTTACTGTGAAAGTAGAGCTCCTTATTACCCATATCATGATACCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTTTACTGTGAAAGTAGAGCTCCTTATTACCCATATCATGATACCA  485

seq1  AGATAATCATCTGTGAGGGTATGAGCATATGTGAGGAGTTATATGCATTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAATCATCTGTGAGGGTATGAGCATATGTGAGGAGTTATATGCATTC  535

seq1  CAGGGTGTATATGTTAATTGGGAATGTGTGTTGGGGTAAGAATATGTGCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTGTATATGTTAATTGGGAATGTGTGTTGGGGTAAGAATATGTGCT  585

seq1  TGTGAAATAATTTTTGTGTGATTTGCATGTATGGTTGTATGATAATATAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAATAATTTTTGTGTGATTTGCATGTATGGTTGTATGATAATATAT  635

seq1  ACACAGAACGTGTAAGCATGTAAGGATGTAGAGACTGTGTATATAACTGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAACGTGTAAGCATGTAAGGATGTAGAGACTGTGTATATAACTGG  685

seq1  AGCCTTCTACAGTGCTATACTCAGACACCTGGGCATATACAAGGATATTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCTACAGTGCTATACTCAGACACCTGGGCATATACAAGGATATTT  735

seq1  TCAGAGTGACTGCATGGATGAGCTTGACTCCTGCCTCTTCCTAGTAGTTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTGACTGCATGGATGAGCTTGACTCCTGCCTCTTCCTAGTAGTTA  785

seq1  CCTTACTGAGACATCTCTGTCTGTCTCTGTCTCTCTCTTTTCTTGACTCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACTGAGACATCTCTGTCTGTCTCTGTCTCTCTCTTTTCTTGACTCC  835

seq1  CTTTTCGATTCCTTCCTTATTTCTCCCCTCCAACCTTCCCCTACTCTCTA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCGATTCCTTCCTTATTTCTCCCCTCCAACCTTCCCCTACTCTCTA  885

seq1  TTAAAGATTGTCTTTGTATTATCTTTATTCTGATTTCTGTGCCAGCAGAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGATTGTCTTTGTATTATCTTTATTCTGATTTCTGTGCCAGCAGAG  935

seq1  AGTTAAAGGCAGGCTGGACTGGACTTGGATATTGTTATTCATATGGCTAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAAGGCAGGCTGGACTGGACTTGGATATTGTTATTCATATGGCTAC  985

seq1  CTCATATTTTGTAAACACCCCATCACCTTTAGATTGACTCATTAAAAAAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATATTTTGTAAACACCCCATCACCTTTAGATTGACTCATTAAAAAAC  1035

seq1  CCGTAGCAAAGGTAGGAATTCAAAGGTGAAACTTCTGAAGAGTTATAGAC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTAGCAAAGGTAGGAATTCAAAGGTGAAACTTCTGAAGAGTTATAGAC  1085

seq1  TTTGGGAGGGAGTGCAGTGAGTGAATTC  1125
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGAGGGAGTGCAGTGAGTGAATTC  1113