BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119D10
Chromosome11 (Build37)
Map Location 66,553,896 - 66,676,806
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMap2k4, Zkscan6, Dnahc9, Gm879, LOC668323
Downstream geneA530088H08Rik, 9130409J20Rik, A730055C05Rik, 2310004I24Rik, Sco1, Myh3, Myh2, Myh1, Myh4, Myh8, Myh13, Gas7, Rcvrn, Glp2r, LOC544792, Dhrs7c, LOC100041899, Usp43
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119D10.bB6Ng01-119D10.g
ACCDH923487DH923488
length1,133994
definitionDH923487|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119D10, 5' end.DH923488|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119D10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,553,896 - 66,555,029)(66,676,191 - 66,676,806)
sequence
gaattcaataatggatgtggaagtctaaagagttccataaatgaaggtta
ttgtcataagaatacaaagtgaatctgctaggatgtgagttagtttttgg
gaggatgctcagaatcctaagtggctatattaagtcagggttctccagaa
aaatggaactgaaagaatgaaacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacagaatttgttaaatcggattgtgttggaataccaa
cagcatttgtcccatacctgaaaggataagaactgggtagctgcttggtc
cttgaacctcagtgcctcggcacctggaggggccctgcagtgtctgcctt
accctggagaggcagaaaacctggtagttgttcagtttctggggttagac
acctcagcagtcacaagtctagtgtaaaagctgggagcttcctggggagc
aggtggtccttagccagtgatggaagccttggaaggctagttctgatatt
aggaaaggggtcagtagcagcagcaatagactaaatcaactcagggcaag
agggaaggccaggtaagcaaagggtgagtgacccttttcttccagaaggt
gcctctcatacttcccataccaattaaagtaatcaggacagctcatcgga
tgagaggctccatactctggtgattcaaatctgtgccaaattgatattga
aacaggttaatcagcacagtggtccagaatccagggctgtgaccaaatcc
agagctcctaaggccagataagtgagacaaccaaagatgagtggcagata
tagctattgatgatatgaagcaagcatagcaaggaggagggaggggtatg
ggtccatcccttcttatccacaagctaatgcagattgaaagggtagattt
tagacaccatcacacttatctggaagatacatctttaacgtatagttctt
ttatttttgcccattcattttgtaatgtccctcttcattttggtctgtga
catgctcctgtttatattcacctgtcctttaggacattagatgccaccct
tgcattttgtagagatatgactaagcaagatgctgacctgcctttataag
cagtcaatgaccttgacctttatcctgatgtta
gaattctgtgttacaagggtggtcaagacatgtcccgaccctcaggtagc
tgacagtgcagcagaggagatagagcaatgtcagatgacagaattgtagt
atgctaaatgctcagacaagcagggaaactcaggatcccttgggagatca
aggcaaagatgatgaatccatttgggggaagatgtgggaatatttctctc
atccataggttgaaaacttaatcttcagtgctctaagaggtatagccttt
aggaaagattaggtcaagagagtagtgccctcataaaagatgtctagaca
tagtagagtaaagaagggactgcttctatgtgaagaccatgaggcatcat
gtctgtaagaagaggacccttgccagactctatctctgttggcaccttga
ccttagatgttccagtatctagaacactgaactaaatatgacaaaataga
aggtattatttaatcaggccaatgaagatggggaagacaattcagggctg
aggcgtgactcaggtatcgttagggtccaggagttaccccacaaaccaca
caaaaaccaatctcagtcagacagggatcgtttattgaatgcacacctta
agactgatcaattagggttgtagatcagactcaggaactgaaagctatga
ccccacatatttctcaggaccatcttataaaggcaaaacccacaaaaccc
acgatgagcaaaacccacaaaactcacatacaggtgtaggaagtgctttc
tggtggtcagccctgactcaagctactttagacaacagttcacattgacc
tttaatttgatgggtcctaagtaaagcttatggctgtacaacttctaaga
gtcctacacacagccattcatagcatacagagcataacagtggtcggtca
gtaagacgtgttgtgtgagtcaagttattattctgtgtcatgactggcag
gcatatacagcaacatatgaaatagtgcagcatagacaaatgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_66553896_66555029
seq2: B6Ng01-119D10.b_48_1180

seq1  GAATTCAATAATGGATGTGGAAGTCTAAAGAGTTCCATAAATGAAGGTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATAATGGATGTGGAAGTCTAAAGAGTTCCATAAATGAAGGTTA  50

seq1  TTGTCATAAGAATACAAAGTGAATCTGCTAGGATGTGAGTTAGTTTTTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATAAGAATACAAAGTGAATCTGCTAGGATGTGAGTTAGTTTTTGG  100

seq1  GAGGATGCTCAGAATCCTAAGTGGCTATATTAAGTCAGGGTTCTCCAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATGCTCAGAATCCTAAGTGGCTATATTAAGTCAGGGTTCTCCAGAA  150

seq1  AAATGGAACTGAAAGAATGAAACACACACACACACACACACACACACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAACTGAAAGAATGAAACACACACACACACACACACACACACACA  200

seq1  CACACACACACACACAGAATTTGTTAAATCGGATTGTGTTGGAATACCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACAGAATTTGTTAAATCGGATTGTGTTGGAATACCAA  250

seq1  CAGCATTTGTCCCATACCTGAAAGGATAAGAACTGGGTAGCTGCTTGGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTTGTCCCATACCTGAAAGGATAAGAACTGGGTAGCTGCTTGGTC  300

seq1  CTTGAACCTCAGTGCCTCGGCACCTGGAGGGGCCCTGCAGTGTCTGCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACCTCAGTGCCTCGGCACCTGGAGGGGCCCTGCAGTGTCTGCCTT  350

seq1  ACCCTGGAGAGGCAGAAAACCTGGTAGTTGTTCAGTTTCTGGGGTTAGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGAGAGGCAGAAAACCTGGTAGTTGTTCAGTTTCTGGGGTTAGAC  400

seq1  ACCTCAGCAGTCACAAGTCTAGTGTAAAAGCTGGGAGCTTCCTGGGGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCAGCAGTCACAAGTCTAGTGTAAAAGCTGGGAGCTTCCTGGGGAGC  450

seq1  AGGTGGTCCTTAGCCAGTGATGGAAGCCTTGGAAGGCTAGTTCTGATATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGTCCTTAGCCAGTGATGGAAGCCTTGGAAGGCTAGTTCTGATATT  500

seq1  AGGAAAGGGGTCAGTAGCAGCAGCAATAGACTAAATCAACTCAGGGCAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGGGGTCAGTAGCAGCAGCAATAGACTAAATCAACTCAGGGCAAG  550

seq1  AGGGAAGGCCAGGTAAGCAAAGGGTGAGTGACCCTTTTCTTCCAGAAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGGCCAGGTAAGCAAAGGGTGAGTGACCCTTTTCTTCCAGAAGGT  600

seq1  GCCTCTCATACTTCCCATACCAATTAAAGTAATCAGGACAGCTCATCGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCATACTTCCCATACCAATTAAAGTAATCAGGACAGCTCATCGGA  650

seq1  TGAGAGGCTCCATACTCTGGTGATTCAAATCTGTGCCAAATTGATATTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGCTCCATACTCTGGTGATTCAAATCTGTGCCAAATTGATATTGA  700

seq1  AACAGGTTAATCAGCACAGTGGTCCAGAATCCAGGGCTGTGACCAAATCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTTAATCAGCACAGTGGTCCAGAATCCAGGGCTGTGACCAAATCC  750

seq1  AGAGCTCCTAAGGCCAGATAAGTGAGACAACCAAAGATGAGTGGCAGATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCCTAAGGCCAGATAAGTGAGACAACCAAAGATGAGTGGCAGATA  800

seq1  TAGCTATTGATGATATGAAGCAAGCATAGCAAGGAGGAGGGAGGGGTATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATTGATGATATGAAGCAAGCATAGCAAGGAGGAGGGAGGGGTATG  850

seq1  GGTCCATCCCTTCTTATCCACAAGCTAATGCAGATTGAAAGGGTAGATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGTCCATCCCTTCTTATCCACAAGCTAATGCAGATTGAAAGGGTAGA-TT  899

seq1  TTAGACACCATCACACTTATCTGGAAGATACATCTTTAACGTATAAGTTC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTAGACACCATCACACTTATCTGGAAGATACATCTTTAACGTAT-AGTTC  948

seq1  CTTTACTTCTGCACATTCA-TTTGTAATGTCCCTC-TCAATTTGGTCTGT  998
       |||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||
seq2  TTTTATTTTTGCCCATTCATTTTGTAATGTCCCTCTTCATTTTGGTCTGT  998

seq1  GACATGCT-CTGTTTATATTCA-CTGTCCTTTAGGACATTAGATGCCACC  1046
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCTCCTGTTTATATTCACCTGTCCTTTAGGACATTAGATGCCACC  1048

seq1  CTTGCATTCTGTAGAGATATGACTAAGCAAAGATGCTGACACTGCCCTTC  1096
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| 
seq2  CTTGCATTTTGTAGAGATATGACTAAGC-AAGATGCTGAC-CTG-CCTTT  1095

seq1  ATAAGCAGTCAATGACCCTAGACC-TTATCCTGATGTTA  1134
      ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  ATAAGCAGTCAATGA-CCTTGACCTTTATCCTGATGTTA  1133

seq1: chr11_66676191_66676806
seq2: B6Ng01-119D10.g_70_685 (reverse)

seq1  CCTAATTGATCAGTCTTAAGGTGTGCATTCAATAAACGATCCCTGTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATTGATCAGTCTTAAGGTGTGCATTCAATAAACGATCCCTGTCTGA  50

seq1  CTGAGATTGGTTTTTGTGTGGTTTGTGGGGTAACTCCTGGACCCTAACGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATTGGTTTTTGTGTGGTTTGTGGGGTAACTCCTGGACCCTAACGA  100

seq1  TACCTGAGTCACGCCTCAGCCCTGAATTGTCTTCCCCATCTTCATTGGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGAGTCACGCCTCAGCCCTGAATTGTCTTCCCCATCTTCATTGGCC  150

seq1  TGATTAAATAATACCTTCTATTTTGTCATATTTAGTTCAGTGTTCTAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTAAATAATACCTTCTATTTTGTCATATTTAGTTCAGTGTTCTAGAT  200

seq1  ACTGGAACATCTAAGGTCAAGGTGCCAACAGAGATAGAGTCTGGCAAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAACATCTAAGGTCAAGGTGCCAACAGAGATAGAGTCTGGCAAGGG  250

seq1  TCCTCTTCTTACAGACATGATGCCTCATGGTCTTCACATAGAAGCAGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTTCTTACAGACATGATGCCTCATGGTCTTCACATAGAAGCAGTCC  300

seq1  CTTCTTTACTCTACTATGTCTAGACATCTTTTATGAGGGCACTACTCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTACTCTACTATGTCTAGACATCTTTTATGAGGGCACTACTCTCT  350

seq1  TGACCTAATCTTTCCTAAAGGCTATACCTCTTAGAGCACTGAAGATTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTAATCTTTCCTAAAGGCTATACCTCTTAGAGCACTGAAGATTAAG  400

seq1  TTTTCAACCTATGGATGAGAGAAATATTCCCACATCTTCCCCCAAATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAACCTATGGATGAGAGAAATATTCCCACATCTTCCCCCAAATGGA  450

seq1  TTCATCATCTTTGCCTTGATCTCCCAAGGGATCCTGAGTTTCCCTGCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCATCTTTGCCTTGATCTCCCAAGGGATCCTGAGTTTCCCTGCTTG  500

seq1  TCTGAGCATTTAGCATACTACAATTCTGTCATCTGACATTGCTCTATCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGCATTTAGCATACTACAATTCTGTCATCTGACATTGCTCTATCTC  550

seq1  CTCTGCTGCACTGTCAGCTACCTGAGGGTCGGGACATGTCTTGACCACCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTGCACTGTCAGCTACCTGAGGGTCGGGACATGTCTTGACCACCC  600

seq1  TTGTAACACAGAATTC  616
      ||||||||||||||||
seq2  TTGTAACACAGAATTC  616