BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128L05
Chromosome11 (Build37)
Map Location 36,553,989 - 36,732,114
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz2
Upstream genePank3, LOC666733, AI595406, Rars, Wwc1, LOC636532
Downstream geneLOC100039148
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128L05.bB6Ng01-128L05.g
ACCDH930480DH930481
length1,1261,089
definitionDH930480|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128L05, 5' end.DH930481|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128L05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,553,989 - 36,555,121)(36,730,996 - 36,732,114)
sequence
gaattctccttactatcactcagacatccttcatgtttctatctcagcac
atactgtcctatttgtaggcactgcacttactctggctccatgctgacgt
cagttcaacctgtcagtccttggagtcatgtggcaaatctaaggatgttt
ctgccgtttccaaagacttctctcattcctctcaaccttgcaccagcttt
cctaataactacttgtcagttcttattcttaattatcaccattgtctggc
ttacagaaatactgcatttctcaccatattccaaacctggaagcacctct
gggtatttcttagtatcatacctgtgacagatacttctagaagttcctca
gaacttagtgtgtccacaggaagtttttcaggaagccagtagattctgtc
ctttatctataaaagggctggctcatttgaagaggaaaaggatgatggct
ttctacgtttgggagttgtacactgatatccaagggaaattttggatgga
tacaggagagactggggatgagaacattctgatggggtgtgcaaggtcat
gtgaccattgggcttgagagagaagtgttttgaactctgttttcaaggga
gatacatatacatttcttttctacactgtagagtaatggtactatggtca
tttaaaggagaggctaacaaaacacaagaactttatctgtgttcctaccc
aaaggatgctagttctgattcaaccacagcgatacccaggagagtggggt
cttagtcagcaggatgatgaacacagccaaatcaacacaacagctaacaa
taggatgtcagtgaaggataaactgcttttcctcccagagatgtggctcc
tgaatgtctatggtgtggtattttgagaaacaagaaagcctctgcggatg
actgaggaggatcagaggacatcactgacttccccagctaagtatagagc
tgataaagaacagacccagtccagcctgccatgcccacttgcttctatgt
agcaattctagaagctttcatcactggcatgtctaccaaagctagggcat
aacatgccagacaacccttaaaacctagtactggggctatgcagatgatt
gcatattcaatggctctataggcaat
gaattccttgaaaaaattttgaaattaaccatttcagaatggagaatgat
tttatgtatacatatatgtaatgtgtttcaattgcacagaaatggatgac
gtgttgaatttattaggtaacaatagcaacttggacacaggggatgtgga
gtataaaattgaagagaagataaaattgcttcttctccccttcctgtttt
aaaaatacaaatgcatgttactccctacagcatgaacaaaacgagagaag
taaacattgtaacagaatcccgtaaatattagataatagagtcaaaataa
atctagaactgtaactgactggaaggcctctgttgctcctctatcagaac
tggtcctgactagttttctactagcatctaaaggctctactttcctctga
ggaataattctttgaggcttttcatttccaagaacatagtcttctttccc
cacacacaggctcactgaccagttgaaagagttaaatctctgtccatcta
tgatatcccacagtcctcttctgtcttgtctcaaccacttcctcatgatg
aaaggtcaactcttgatacgtgagtgtgtcagcttgatgcttctgatgaa
atcaggggatggaagagcaatgagagatcagatataatcttgttgagtta
caagagtgactatggatatcttgaaaatacatatagtcaagtgaggctct
tgtatatggaaaatgtaggaatttttaaatctcccttgtatagaaattgt
agagatttaaatttatctactggtggataaggagttggtcaatttgtaaa
gaatagctttacaaagtacctactgttcaaggatttttaaagcccaagtt
tacattttgctcttgtgagtgtgtgaagaatgtgtagggtatattcagtg
tgagtgaggtcagtgtctatgtcagactttatgtctatgactatcagtaa
cacatttattaattgaaagatatttcattctcgatttcttgtcactgggg
atagcaacgcttagttagtctgtgttcattaaccaattttttttataacc
tgcagttgaggctaagtcattgagaaatctcttattatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_36553989_36555121
seq2: B6Ng01-128L05.b_48_1173

seq1  GAATTCTCCTTACTATCACTCAGACATCCTTCATGTTTCTATCTCAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTACTATCACTCAGACATCCTTCATGTTTCTATCTCAGCAC  50

seq1  ATACTGTCCTATTTGTAGGCACTGCACTTACTCTGGCTCCATGCTGACGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGTCCTATTTGTAGGCACTGCACTTACTCTGGCTCCATGCTGACGT  100

seq1  CAGTTCAACCTGTCAGTCCTTGGAGTCATGTGGCAAATCTAAGGATGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCAACCTGTCAGTCCTTGGAGTCATGTGGCAAATCTAAGGATGTTT  150

seq1  CTGCCGTTTCCAAAGACTTCTCTCATTCCTCTCAACCTTGCACCAGCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCGTTTCCAAAGACTTCTCTCATTCCTCTCAACCTTGCACCAGCTTT  200

seq1  CCTAATAACTACTTGTCAGTTCTTATTCTTAATTATCACCATTGTCTGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATAACTACTTGTCAGTTCTTATTCTTAATTATCACCATTGTCTGGC  250

seq1  TTACAGAAATACTGCATTTCTCACCATATTCCAAACCTGGAAGCACCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAAATACTGCATTTCTCACCATATTCCAAACCTGGAAGCACCTCT  300

seq1  GGGTATTTCTTAGTATCATACCTGTGACAGATACTTCTAGAAGTTCCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATTTCTTAGTATCATACCTGTGACAGATACTTCTAGAAGTTCCTCA  350

seq1  GAACTTAGTGTGTCCACAGGAAGTTTTTCAGGAAGCCAGTAGATTCTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTAGTGTGTCCACAGGAAGTTTTTCAGGAAGCCAGTAGATTCTGTC  400

seq1  CTTTATCTATAAAAGGGCTGGCTCATTTGAAGAGGAAAAGGATGATGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATCTATAAAAGGGCTGGCTCATTTGAAGAGGAAAAGGATGATGGCT  450

seq1  TTCTACGTTTGGGAGTTGTACACTGATATCCAAGGGAAATTTTGGATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACGTTTGGGAGTTGTACACTGATATCCAAGGGAAATTTTGGATGGA  500

seq1  TACAGGAGAGACTGGGGATGAGAACATTCTGATGGGGTGTGCAAGGTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGAGAGACTGGGGATGAGAACATTCTGATGGGGTGTGCAAGGTCAT  550

seq1  GTGACCATTGGGCTTGAGAGAGAAGTGTTTTGAACTCTGTTTTCAAGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCATTGGGCTTGAGAGAGAAGTGTTTTGAACTCTGTTTTCAAGGGA  600

seq1  GATACATATACATTTCTTTTCTACACTGTAGAGTAATGGTACTATGGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATATACATTTCTTTTCTACACTGTAGAGTAATGGTACTATGGTCA  650

seq1  TTTAAAGGAGAGGCTAACAAAACACAAGAACTTTATCTGTGTTCCTACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGGAGAGGCTAACAAAACACAAGAACTTTATCTGTGTTCCTACCC  700

seq1  AAAGGATGCTAGTTCTGATTCAACCACAGCGATACCCAGGAGAGTGGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGATGCTAGTTCTGATTCAACCACAGCGATACCCAGGAGAGTGGGGT  750

seq1  CTTAGTCAGCAGGATGATGAACACAGCCAAATCAACACAACAGCTAACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTCAGCAGGATGATGAACACAGCCAAATCAACACAACAGCTAACAA  800

seq1  TAGGATGTCAGTGAAGGATAAACTGCTTTTCCTCCCAGAGATGTGGCTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATGTCAGTGAAGGATAAACTGCTTTTCCTCCCAGAGATGTGGCTCC  850

seq1  TGAATGTCTATGGTGTGGTATTTTGAGAAACAAGAAAGCCTCTGCGGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGAATGTCTATGGTGTGGTATTTTGAGAAACAAGAAAGCCTCTGCGG-AT  899

seq1  GACTGAGGAGGATCAGAGGACATCACTGACTTCCCCAGCTAAGTATAAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GACTGAGGAGGATCAGAGGACATCACTGACTTCCCCAGCTAAGTAT-AGA  948

seq1  GCTGATAAAGAACAGACCCAGTCCAGCCTGCCATGCCCACTTGCTCTAAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  GCTGATAAAGAACAGACCCAGTCCAGCCTGCCATGCCCACTTGCTTCTAT  998

seq1  GTAGCCATTCTAGAAGCTTTCATCACTGGCATGTCTACCAAAGCTAGGGC  1050
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAATTCTAGAAGCTTTCATCACTGGCATGTCTACCAAAGCTAGGGC  1048

seq1  ATAACATGCCAGAACAAACACTTAAAAACCTAAGTACTGAGGCTATGCAG  1100
      |||||||||||||   ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  ATAACATGCCAGA--CAACCCTT-AAAACCT-AGTACTGGGGCTATGCAG  1094

seq1  ATGATATGCATATTCAAATGGCTC-ATAGGCAAT  1133
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  ATGAT-TGCATATTC-AATGGCTCTATAGGCAAT  1126

seq1: chr11_36730996_36732114
seq2: B6Ng01-128L05.g_66_1154 (reverse)

seq1  AATAATAAGCAATATCATCAATGACTTAGACTTCAAAACTGACAAGTTAT  50
      |||||||||  || || |||||||||||| ||    ||||| || |||||
seq2  AATAATAAGAGATTTC-TCAATGACTTAGCCT---CAACTG-CAGGTTAT  45

seq1  AAAAAAAAAATGTGTTAAATGATACAACAGACTAAACTAAAGCGTTGCTA  100
      ||||||||    || | ||||| || ||||||| |||| |||||||||||
seq2  AAAAAAAA---TTGGTTAATGA-AC-ACAGACT-AACT-AAGCGTTGCTA  88

seq1  TCCCCAGTGACAAAGAAAATCGAGAAATGAAAATATTCTTTCAATTTAAT  150
      |||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||
seq2  TCCCCAGTGACAA--GAAATCGAG-AATG-AAATA-TCTTTCAA-TTAAT  132

seq1  AAATGTGTTAACTTGATTAAGGTCATAGACATAAAAGTCTGACATAGGAC  200
      ||||||||||   ||||    ||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2  AAATGTGTTA--CTGAT---AGTCATAGACAT-AAAGTCTGACATA-GAC  175

seq1  ACCTGACCCTCACTCACACTGAATATACCCTACACATTCTTCACACACTC  250
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  A-CTGA-CCTCACTCACACTGAATATACCCTACACATTCTTCACACACT-  222

seq1  CACAAGAGCAAAATGTAAACTTGGGCTTTAAAAAATCCTTTGAACAGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  CACAAGAGCAAAATGTAAACTTGGGCTTT-AAAAATCC-TTGAACAGTAG  270

seq1  GTACTTTGTAAAGCTATTCTTTACAAATTGACCAACTCCTTATCCACCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTTGTAAAGCTATTCTTTACAAATTGACCAACTCCTTATCCACCAG  320

seq1  TAGATAAATTTAAATCTCTACAATTTCTATACAAGGGAGATTTAAAAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAATTTAAATCTCTACAATTTCTATACAAGGGAGATTTAAAAATT  370

seq1  CCTACATTTTCCATATACAAGAGCCTCACTTGACTATATGTATTTTCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATTTTCCATATACAAGAGCCTCACTTGACTATATGTATTTTCAAG  420

seq1  ATATCCATAGTCACTCTTGTAACTCAACAAGATTATATCTGATCTCTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATAGTCACTCTTGTAACTCAACAAGATTATATCTGATCTCTCAT  470

seq1  TGCTCTTCCATCCCCTGATTTCATCAGAAGCATCAAGCTGACACACTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTCCATCCCCTGATTTCATCAGAAGCATCAAGCTGACACACTCAC  520

seq1  GTATCAAGAGTTGACCTTTCATCATGAGGAAGTGGTTGAGACAAGACAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAAGAGTTGACCTTTCATCATGAGGAAGTGGTTGAGACAAGACAGA  570

seq1  AGAGGACTGTGGGATATCATAGATGGACAGAGATTTAACTCTTTCAACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGACTGTGGGATATCATAGATGGACAGAGATTTAACTCTTTCAACTG  620

seq1  GTCAGTGAGCCTGTGTGTGGGGAAAGAAGACTATGTTCTTGGAAATGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTGAGCCTGTGTGTGGGGAAAGAAGACTATGTTCTTGGAAATGAAA  670

seq1  AGCCTCAAAGAATTATTCCTCAGAGGAAAGTAGAGCCTTTAGATGCTAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCAAAGAATTATTCCTCAGAGGAAAGTAGAGCCTTTAGATGCTAGT  720

seq1  AGAAAACTAGTCAGGACCAGTTCTGATAGAGGAGCAACAGAGGCCTTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACTAGTCAGGACCAGTTCTGATAGAGGAGCAACAGAGGCCTTCCA  770

seq1  GTCAGTTACAGTTCTAGATTTATTTTGACTCTATTATCTAATATTTACGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTACAGTTCTAGATTTATTTTGACTCTATTATCTAATATTTACGG  820

seq1  GATTCTGTTACAATGTTTACTTCTCTCGTTTTGTTCATGCTGTAGGGAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGTTACAATGTTTACTTCTCTCGTTTTGTTCATGCTGTAGGGAGT  870

seq1  AACATGCATTTGTATTTTTAAAACAGGAAGGGGAGAAGAAGCAATTTTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGCATTTGTATTTTTAAAACAGGAAGGGGAGAAGAAGCAATTTTAT  920

seq1  CTTCTCTTCAATTTTATACTCCACATCCCCTGTGTCCAAGTTGCTATTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTTCAATTTTATACTCCACATCCCCTGTGTCCAAGTTGCTATTGT  970

seq1  TACCTAATAAATTCAACACGTCATCCATTTCTGTGCAATTGAAACACATT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAATAAATTCAACACGTCATCCATTTCTGTGCAATTGAAACACATT  1020

seq1  ACATATATGTATACATAAAATCATTCTCCATTCTGAAATGGTTAATTTCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATGTATACATAAAATCATTCTCCATTCTGAAATGGTTAATTTCA  1070

seq1  AAATTTTTTCAAGGAATTC  1119
      |||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTTTCAAGGAATTC  1089