BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128P17
Chromosome11 (Build37)
Map Location 11,887,898 - 12,093,550
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrb10
Upstream geneVwc2, Zpbp, LOC625132, EG432534, 4930415F15Rik, Ikzf1, Fignl1, Ddc
Downstream geneCobl, LOC627244
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128P17.bB6Ng01-128P17.g
ACCDH930688DH930689
length1,1151,164
definitionDH930688|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P17, 5' end.DH930689|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,092,441 - 12,093,550)(11,887,898 - 11,889,049)
sequence
gaattctgtcacttggggattatattgagggtttttttttttttgtattc
tatgagatgctatatcttgataaatactccataggtatattctttttctt
ttatattgctacacaaatatatatggtgtaagaatagtatgtcatgattt
atagaattatgttttgtctgttttgagtaaggtagatattaatgctgctg
ttatatggttgaactggtgtgtatttggaggagtgtcattttttcatcaa
taggagatactttgatcaatgcaatgctcttttttattttttaaccttta
tttttattgtttgcctatgagtgttttgtctgcatgtatctaagtaccat
gttcatgcagggcccacagaggctaggagaggatattggatcccctgtga
gcagagctacctgccgtttgtgggtattagaaactaacccaggtcttctg
caaaagcaaacaggcttttaaccagtaagccatctgaatatctgtgatat
ttgtgtcaggatattttagcaatatagataaaattaatttaaaaatttgt
ccatttctattttcaacagtgttatttaacttggatatttgttttttata
caatatgcaattagattatttccaaccaaatatatgaaatttgactattg
gtctatgcttccttgctatgtttttaagaatcccaagaccattttttttt
gttcaatactgataactagagatgactattacaggattttgtttcctctc
ctctctaccagattagccctgatgtcaccaagttacctgagattttagta
accatattgtcttatgctatgactttcccttgccaagattgatttcttaa
taactctttagcatcaatatccatcatgagaaaaaaaatgaaagagagaa
agaaatgtggaggaagtgagaccccaatcgggctacttgagccagagcta
gatttcagttgtaattatatcagggaaagactggaggacataagcttcaa
catacttactacttccaacatatttcctatttgggtcctgggtctttgca
actctaccttacaaccaactttcccaatcacgaaaacaatgctgggttcc
tgggcccacatagcc
gaattctctgaagagtaattaaaaaggacagctgtcgaatgctcagtacg
ggcaatgaatgtcaacaatgaacactctgtggagcacacacactttctag
agctgctaagtatccaacactggcgttcctgggccagaaacatccagaga
ggaatcataaagagctccttgcaaaggacagggaactcagtggcatgccg
aatgaggacgaagtcttaggcaaacattaaaacagcacatatataatttg
agaaaagtatcttcatagaaatacctcaagatggtgaaagaaacgttaaa
atatgggcagaaatatgctacttatatccatatgcttacaaaaaaagagc
agtgattaattcttggtagtcagatgtcaacaatctcttataaatcttta
aaatctgtgaacattttgaaaacacatgtactacttctgtagttagaaag
gttttgaattgtgccaaaagcacataatgttcgtttaagtctacttaata
tatagttacaagcagggcacagattccactttgactgcagtgggctcata
tcccagtagattcaacctacatgaaaaatgtctgaggtgatacgtgcact
gaacatatccaaccaacttcacgttgcacctgagacatggatcactacag
aggacttcttgtttctcttgacccagagactcagcaggaactgtggctca
tatccactacccagcatagcaagacagcaccatacaacacagcattagtc
taagaaatgatccaagtttaaaattcaaagtgtctgttgaatgcatattg
cctttacacaacgataacgtcaaaaacctattaagcagaacaatcataga
ctgggggaagatcatctacaactgatttaatagcaaccttgttacctatc
cattgttccagcatggccaaactgctacagcatggagattcttactctgt
tagtgtcaagaatattttcagaatattacagttggctgtcaatggcattt
gggtcatgcccccccacagattcaacaactataactaaaatggttaggca
gcagaaacacctcagtctgtgaagccctatgggactatgtaacaaacaca
aatcatattggttatccacatgggcagagttctcattactcacaaccagg
aaatggaacactgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_12092441_12093550
seq2: B6Ng01-128P17.b_49_1163 (reverse)

seq1  GGCTATGTGG--CCAGGAACCAGCCATTGGTTTCTGTTGAT--GAGAAGT  46
      ||||||||||  |||||||||   ||||| ||||   ||||  |  ||||
seq2  GGCTATGTGGGCCCAGGAACCCAGCATTGTTTTC--GTGATTGGGAAAGT  48

seq1  TGGATGTTAAGGTAGAGATGCAAAGAGCAAGGA-CCAAATAGGAAATTAT  95
      ||| || |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||
seq2  TGGTTG-TAAGGTAGAGTTGCAAAGACCCAGGACCCAAATAGGAAA-TAT  96

seq1  GTTGGAAGTAGTAAGTATGTTG-AGC-TATGTCCTCCAGTC-TTCCCTGA  142
      |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  GTTGGAAGTAGTAAGTATGTTGAAGCTTATGTCCTCCAGTCTTTCCCTGA  146

seq1  TATAATTAC-ACTGAATTCTAGCTCTGGCTCAAGGTAGCCCGATTGGGAT  191
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
seq2  TATAATTACAACTGAAATCTAGCTCTGGCTCAA-GTAGCCCGATTGGGGT  195

seq1  CTCACTTCCTCCACATTTCTTTCTCTCTTTCA-TTTTTTTCTCATGATGG  240
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTCACTTCCTCCACATTTCTTTCTCTCTTTCATTTTTTTTCTCATGATGG  245

seq1  ATATTGATGGCTAAAGAGTTATTAAGAAATCATTCTTGGCAAGGGAAAGT  290
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATATTGAT-GCTAAAGAGTTATTAAGAAATCAATCTTGGCAAGGGAAAGT  294

seq1  CATAGCATAAGACAATATGGTTACTAAAATCTCAGGTAACTTGGTGACAT  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCATAAGACAATATGGTTACTAAAATCTCAGGTAACTTGGTGACAT  344

seq1  CAGGGCTAATCTGGTAGAGAGGAGAGGAAACAAAATCCTGTAATAGTCAT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTAATCTGGTAGAGAGGAGAGGAAACAAAATCCTGTAATAGTCAT  394

seq1  CTCTAGTTATCAGTATTGAAC-AAAAAAAATGGTCTTGGGATTCTTAAAA  439
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTTATCAGTATTGAACAAAAAAAAATGGTCTTGGGATTCTTAAAA  444

seq1  ACATAGCAAGGAAGCATAGACCAATAGTCAAATTTCATATATTTGGTTGG  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGCAAGGAAGCATAGACCAATAGTCAAATTTCATATATTTGGTTGG  494

seq1  AAATAATCTAATTGCATATTGTATAAAAAACAAATATCCAAGTTAAATAA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATCTAATTGCATATTGTATAAAAAACAAATATCCAAGTTAAATAA  544

seq1  CACTGTTGAAAATAGAAATGGACAAATTTTTAAATTAATTTTATCTATAT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTGAAAATAGAAATGGACAAATTTTTAAATTAATTTTATCTATAT  594

seq1  TGCTAAAATATCCTGACACAAATATCACAGATATTCAGATGGCTTACTGG  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAAATATCCTGACACAAATATCACAGATATTCAGATGGCTTACTGG  644

seq1  TTAAAAGCCTGTTTGCTTTTGCAGAAGACCTGGGTTAGTTTCTAATACCC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGCCTGTTTGCTTTTGCAGAAGACCTGGGTTAGTTTCTAATACCC  694

seq1  ACAAACGGCAGGTAGCTCTGCTCACAGGGGATCCAATATCCTCTCCTAGC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACGGCAGGTAGCTCTGCTCACAGGGGATCCAATATCCTCTCCTAGC  744

seq1  CTCTGTGGGCCCTGCATGAACATGGTACTTAGATACATGCAGACAAAACA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGGGCCCTGCATGAACATGGTACTTAGATACATGCAGACAAAACA  794

seq1  CTCATAGGCAAACAATAAAAATAAAGGTTAAAAAATAAAAAAGAGCATTG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAGGCAAACAATAAAAATAAAGGTTAAAAAATAAAAAAGAGCATTG  844

seq1  CATTGATCAAAGTATCTCCTATTGATGAAAAAATGACACTCCTCCAAATA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGATCAAAGTATCTCCTATTGATGAAAAAATGACACTCCTCCAAATA  894

seq1  CACACCAGTTCAACCATATAACAGCAGCATTAATATCTACCTTACTCAAA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAGTTCAACCATATAACAGCAGCATTAATATCTACCTTACTCAAA  944

seq1  ACAGACAAAACATAATTCTATAAATCATGACATACTATTCTTACACCATA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAAAACATAATTCTATAAATCATGACATACTATTCTTACACCATA  994

seq1  TATATTTGTGTAGCAATATAAAAGAAAAAGAATATACCTATGGAGTATTT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGTGTAGCAATATAAAAGAAAAAGAATATACCTATGGAGTATTT  1044

seq1  ATCAAGATATAGCATCTCATAGAATACAAAAAAAAAAAAACCCTCAATAT  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGATATAGCATCTCATAGAATACAAAAAAAAAAAAACCCTCAATAT  1094

seq1  AATCCCCAAGTGACAGAATTC  1110
      |||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCCAAGTGACAGAATTC  1115

seq1: chr11_11887898_11889049
seq2: B6Ng01-128P17.g_70_1233

seq1  GAATTCTCTGAAGAGTAATTAAAAAGGACAGCTGTCGAATGCTCAGTACG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGAAGAGTAATTAAAAAGGACAGCTGTCGAATGCTCAGTACG  50

seq1  GGCAATGAATGTCAACAATGAACACTCTGTGGAGCACACACACTTTCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATGAATGTCAACAATGAACACTCTGTGGAGCACACACACTTTCTAG  100

seq1  AGCTGCTAAGTATCCAACACTGGCGTTCCTGGGCCAGAAACATCCAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTAAGTATCCAACACTGGCGTTCCTGGGCCAGAAACATCCAGAGA  150

seq1  GGAATCATAAAGAGCTCCTTGCAAAGGACAGGGAACTCAGTGGCATGCCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCATAAAGAGCTCCTTGCAAAGGACAGGGAACTCAGTGGCATGCCG  200

seq1  AATGAGGACGAAGTCTTAGGCAAACATTAAAACAGCACATATATAATTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGGACGAAGTCTTAGGCAAACATTAAAACAGCACATATATAATTTG  250

seq1  AGAAAAGTATCTTCATAGAAATACCTCAAGATGGTGAAAGAAACGTTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGTATCTTCATAGAAATACCTCAAGATGGTGAAAGAAACGTTAAA  300

seq1  ATATGGGCAGAAATATGCTACTTATATCCATATGCTTACAAAAAAAGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGGCAGAAATATGCTACTTATATCCATATGCTTACAAAAAAAGAGC  350

seq1  AGTGATTAATTCTTGGTAGTCAGATGTCAACAATCTCTTATAAATCTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATTAATTCTTGGTAGTCAGATGTCAACAATCTCTTATAAATCTTTA  400

seq1  AAATCTGTGAACATTTTGAAAACACATGTACTACTTCTGTAGTTAGAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTGTGAACATTTTGAAAACACATGTACTACTTCTGTAGTTAGAAAG  450

seq1  GTTTTGAATTGTGCCAAAAGCACATAATGTTCGTTTAAGTCTACTTAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGAATTGTGCCAAAAGCACATAATGTTCGTTTAAGTCTACTTAATA  500

seq1  TATAGTTACAAGCAGGGCACAGATTCCACTTTGACTGCAGTGGGCTCATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTTACAAGCAGGGCACAGATTCCACTTTGACTGCAGTGGGCTCATA  550

seq1  TCCCAGTAGATTCAACCTACATGAAAAATGTCTGAGGTGATACGTGCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGTAGATTCAACCTACATGAAAAATGTCTGAGGTGATACGTGCACT  600

seq1  GAACATATCCAACCAACTTCACGTTGCACCTGAGACATGGATCACTACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATATCCAACCAACTTCACGTTGCACCTGAGACATGGATCACTACAG  650

seq1  AGGACTTCTTGTTTCTCTTGACCCAGAGACTCAGCAGGAACTGTGGCTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTTCTTGTTTCTCTTGACCCAGAGACTCAGCAGGAACTGTGGCTCA  700

seq1  TATCCACTACCCAGCATAGCAAGACAGCACCATACAACACAGCATTAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCACTACCCAGCATAGCAAGACAGCACCATACAACACAGCATTAGTC  750

seq1  TAAGAAATGATCCAAGTTTAAAATTCAAAGTGTCTGTTGAATGCATATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAATGATCCAAGTTTAAAATTCAAAGTGTCTGTTGAATGCATATTG  800

seq1  CCTTTACACAACGATAACGTCAAAAACCTATTAAGCAGAACAATCATAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTACACAACGATAACGTCAAAAACCTATTAAGCAGAACAATCATAGA  850

seq1  CTGAGGGAAGATCATCTACAACTGA-TTAATAGCAACCTTG-TACCTATC  898
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGGGGGAAGATCATCTACAACTGATTTAATAGCAACCTTGTTACCTATC  900

seq1  CATTGTTCCCAGCAT-GCCAAACTGCTACAGCAT-GAGATTCTTACTCTG  946
      ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATTGTT-CCAGCATGGCCAAACTGCTACAGCATGGAGATTCTTACTCTG  949

seq1  TTAGTGTCAAGAATA-TTTCAGAATA-TACAGTTGGCTGTCAAT-GCATT  993
      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||
seq2  TTAGTGTCAAGAATATTTTCAGAATATTACAGTTGGCTGTCAATGGCATT  999

seq1  T-GGTCATG-CCCCCCACAGATTCAAACAACTA-AACTAAAATGGTTAGG  1040
      | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGGGTCATGCCCCCCCACAGATTC-AACAACTATAACTAAAATGGTTAGG  1048

seq1  CAGCAGAAACACCTCAGTCTGTGA--GCCTAT-GGACTATG-AACAAACA  1086
      ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||
seq2  CAGCAGAAACACCTCAGTCTGTGAAGCCCTATGGGACTATGTAACAAACA  1098

seq1  CAAAATCCATCATGGTTTATCCAC-TTGGCAGTG-TCTCATTACTCACAA  1134
      ||||   ||| || | |||||||| | ||||| | |||||||||||||||
seq2  CAAA--TCAT-ATTGGTTATCCACATGGGCAGAGTTCTCATTACTCACAA  1145

seq1  -CAGGAAATGGAGCACTGC  1152
       ||||||||||| ||||||
seq2  CCAGGAAATGGAACACTGC  1164