BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130P08
Chromosome11 (Build37)
Map Location 4,151,986 - 4,302,838
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLif, Hormad2
Upstream geneDrg1, Patz1, Pik3ip1, Limk2, Rnf185, 8430429K09Rik, LOC100041573, Pla2g3, Pib5pa, Selm, Smtn, Map1lc3-5, LOC625608, Tug1, Morc2a, LOC664900, Osbp2, LOC664920, 4921536K21Rik, Dusp18, Slc35e4, Tcn2, LOC100041720, Pes1, Gal3st1, Sec14l4, Sec14l3, 1700020C11Rik, Sec14l2, LOC625729, Rnf215, 4930562D19Rik, Sf3a1, Tbc1d10a, 2410008K03Rik, LOC625760, Osm
Downstream geneMtmr3, LOC100041006, OTTMUSG00000005065, Ascc2, 1110020P15Rik, Zmat5, Cabp7, Nf2, Nipsnap1, Thoc5, Nefh, Ap1b1, Rasl10a, Gas2l1, Ewsr1, Rhbdd3, Emid1, Kremen1, Znrf3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130P08.bB6Ng01-130P08.g
ACCDH932140DH932141
length1,155786
definitionDH932140|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130P08, 5' end.DH932141|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130P08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,301,680 - 4,302,838)(4,151,986 - 4,152,771)
sequence
gaattcaacttgttagtcttttcaagcgacattcagcagaatgaaaagta
tttagaatacttcttaagaaacgtttgttaaggacccttcgttagacaag
ggttcagtgccctttttgggctctgtgggcactacacacacatacacaga
aaaataatttttaaatacttaaagaaaagaaattctagtctactccagag
cttacagaggcatactctgtgtccttctctaaagggacagtaacctagca
gtaaccacagggaaagaagttttgtttaattatggtggagtgtgcacata
tgagacactggcttcagtttgccttagtgctgggataggagtgaagggaa
acagaaacaaagatcaccataaatatatatatatacatacacacacatgt
atatacacatatacacatatgcatgtgaacatatgagtacctggcctttt
tctcagtcacttttggctatacttggagttatttatgatgctttcacaga
ttgggaatctattatgtttctgtagttgtttgcctcttttccatctggtg
ctatttatttgagtccctttattattatatatgccccaaatcagtatttt
ttaaaaagttaggttttgattgtgctgttcacatctattgcttctctttt
cttttactcatggtttcttttctgtttgttttctccctgaccacacattg
atcttcccacccatgtgcagacgtgcatacctatagggtcctcacagtac
cattggtgtacagatgtacacatctgtcttagtcactgtgaagacactgt
gaccaaggcaactctttgtaaaaagaaaagcatttaaatggggacttgct
tacagtttcagaggtttagtccatcttgatgggagtatggtggcttgcag
tcaggcactggaacagtagctaagagctagctacatcctgatctgtaggt
gagaagactttagacttggcatgggcttttgaaacctcaaagcccaaaga
cacttcctccaacaagccacgctacttattggtctaattcttttcaatag
tgctagtccgtgctggactagcattcaggtatatgaccctatgggaggtc
atctcattccaccaccacagtatctacaagtctctatcaatgccagactg
tattc
gaattccagcgcaccccttcactcttcttccattattcagtgttcctact
ccacaccctgatgcttcaccttcctctcactcgatgctcagcctcggttt
ccctgccccagccagacacctgctcctgccacacagttcagacacctcgg
ccttggcacatctcttccctctcacaaaacatccacagctcctccctgcc
ttctagccaggagcctccattctagacttgtcaaggtccagcacttcccg
gatctaaagctgggcctcttctcaggtcccacgcttacgtgttagtcact
gcactgtagtggctattcctcgttgtcaacttgactaaatctggaatgaa
ctacactccagaactggaagtgatcccaatgtggaggctgggagatacaa
gtttctgacctggatctcagcatggagatcttgaggtgtagtggctatga
atcccagaagattaagacagggagacctctgagttcaaggtcatctggga
gaaagcaagtcccaggtccaggcgtggtggctcacacctttaatctgggc
cacaccttctgctggagacctacgtaaggacactggaagaaggaagattt
gctctctcttctttgcctgcttgccttgcgggactgagcaactgctcgat
ccttggtcttccattcacagctgctgctgaccattgttggggagttggac
tatagactataagtcatcaacaaattcccttactatatagagactaccca
tatgttctgtgactctagaaaaccctgactaataca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_4301680_4302838
seq2: B6Ng01-130P08.b_47_1201 (reverse)

seq1  GAATACAAGTCTGTGCATTGATAGAGACTTGTAGGTACTGTGGTGGTGTG  50
      |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
seq2  GAATAC-AGTCTG-GCATTGATAGAGACTTGTAGATACTGTGGTGGTG-G  47

seq1  AATGAGAATGGCCT-CCATAGGGTCATATACTTGAATGCTTAGT-CAGCA  98
      |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||
seq2  AATGAG-ATGACCTCCCATAGGGTCATATACCTGAATGC-TAGTCCAGCA  95

seq1  CGGACTAGCACTATTTGAAAAGAATTAGACCAATAAGTAGGCGTGGCTTT  148
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  CGGACTAGCACTA-TTGAAAAGAATTAGACCAATAAGTA-GCGTGGC-TT  142

seq1  GTTGGAGGAAGTGTCTTTGGGCTTTGAGGTTTCAAAAGCCCATGCCAAGT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAGGAAGTGTCTTTGGGCTTTGAGGTTTCAAAAGCCCATGCCAAGT  192

seq1  CTAAAGTCTTCTCACCTACAGATCAGGATGTAGCTAGCTCTTAGCTACTG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGTCTTCTCACCTACAGATCAGGATGTAGCTAGCTCTTAGCTACTG  242

seq1  TTCCAGTGCCTGACTGCAAGCCACCATACTCCCATCAAGATGGACTAAAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTGCCTGACTGCAAGCCACCATACTCCCATCAAGATGGACTAAAC  292

seq1  CTCTGAAACTGTAAGCAAGTCCCCATTTAAATGC-TTTCTTTTTAC-AAG  346
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  CTCTGAAACTGTAAGCAAGTCCCCATTTAAATGCTTTTCTTTTTACAAAG  342

seq1  AGTTGCCTTGGTCACAGTGTCTTCACAGTGACTAAGACAGATGTGTACAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCTTGGTCACAGTGTCTTCACAGTGACTAAGACAGATGTGTACAT  392

seq1  CTGTACACCAATGGTACTGTGAGGACCCTATAGGTATGCACGTCTGCACA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACACCAATGGTACTGTGAGGACCCTATAGGTATGCACGTCTGCACA  442

seq1  TGGGTGGGAAGATCAATGTGTGGTCAGGGAGAAAACAAACAGAAAAGAAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGGGAAGATCAATGTGTGGTCAGGGAGAAAACAAACAGAAAAGAAA  492

seq1  CCATGAGTAAAAGAAAAGAGAAGCAATAGATGTGAACAGCACAATCAAAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGTAAAAGAAAAGAGAAGCAATAGATGTGAACAGCACAATCAAAA  542

seq1  CCTAACTTTTTAAAAAATACTGATTTGGGGCATATATAATAATAAAGGGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACTTTTTAAAAAATACTGATTTGGGGCATATATAATAATAAAGGGA  592

seq1  CTCAAATAAATAGCACCAGATGGAAAAGAGGCAAACAACTACAGAAACAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAATAAATAGCACCAGATGGAAAAGAGGCAAACAACTACAGAAACAT  642

seq1  AATAGATTCCCAATCTGTGAAAGCATCATAAATAACTCCAAGTATAGCCA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATTCCCAATCTGTGAAAGCATCATAAATAACTCCAAGTATAGCCA  692

seq1  AAAGTGACTGAGAAAAAGGCCAGGTACTCATATGTTCACATGCATATGTG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGACTGAGAAAAAGGCCAGGTACTCATATGTTCACATGCATATGTG  742

seq1  TATATGTGTATATACATGTGTGTGTATGTATATATATATATTTATGGTGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGTATATACATGTGTGTGTATGTATATATATATATTTATGGTGA  792

seq1  TCTTTGTTTCTGTTTCCCTTCACTCCTATCCCAGCACTAAGGCAAACTGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTTCTGTTTCCCTTCACTCCTATCCCAGCACTAAGGCAAACTGA  842

seq1  AGCCAGTGTCTCATATGTGCACACTCCACCATAATTAAACAAAACTTCTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTGTCTCATATGTGCACACTCCACCATAATTAAACAAAACTTCTT  892

seq1  TCCCTGTGGTTACTGCTAGGTTACTGTCCCTTTAGAGAAGGACACAGAGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTGGTTACTGCTAGGTTACTGTCCCTTTAGAGAAGGACACAGAGT  942

seq1  ATGCCTCTGTAAGCTCTGGAGTAGACTAGAATTTCTTTTCTTTAAGTATT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTCTGTAAGCTCTGGAGTAGACTAGAATTTCTTTTCTTTAAGTATT  992

seq1  TAAAAATTATTTTTCTGTGTATGTGTGTGTAGTGCCCACAGAGCCCAAAA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATTATTTTTCTGTGTATGTGTGTGTAGTGCCCACAGAGCCCAAAA  1042

seq1  AGGGCACTGAACCCTTGTCTAACGAAGGGTCCTTAACAAACGTTTCTTAA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACTGAACCCTTGTCTAACGAAGGGTCCTTAACAAACGTTTCTTAA  1092

seq1  GAAGTATTCTAAATACTTTTCATTCTGCTGAATGTCGCTTGAAAAGACTA  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTATTCTAAATACTTTTCATTCTGCTGAATGTCGCTTGAAAAGACTA  1142

seq1  ACAAGTTGAATTC  1159
      |||||||||||||
seq2  ACAAGTTGAATTC  1155

seq1: chr11_4151986_4152771
seq2: B6Ng01-130P08.g_67_852

seq1  GAATTCCAGCGCACCCCTTCACTCTTCTTCCATTATTCAGTGTTCCTACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCGCACCCCTTCACTCTTCTTCCATTATTCAGTGTTCCTACT  50

seq1  CCACACCCTGATGCTTCACCTTCCTCTCACTCGATGCTCAGCCTCGGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCCTGATGCTTCACCTTCCTCTCACTCGATGCTCAGCCTCGGTTT  100

seq1  CCCTGCCCCAGCCAGACACCTGCTCCTGCCACACAGTTCAGACACCTCGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCCCCAGCCAGACACCTGCTCCTGCCACACAGTTCAGACACCTCGG  150

seq1  CCTTGGCACATCTCTTCCCTCTCACAAAACATCCACAGCTCCTCCCTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCACATCTCTTCCCTCTCACAAAACATCCACAGCTCCTCCCTGCC  200

seq1  TTCTAGCCAGGAGCCTCCATTCTAGACTTGTCAAGGTCCAGCACTTCCCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCCAGGAGCCTCCATTCTAGACTTGTCAAGGTCCAGCACTTCCCG  250

seq1  GATCTAAAGCTGGGCCTCTTCTCAGGTCCCACGCTTACGTGTTAGTCACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAAAGCTGGGCCTCTTCTCAGGTCCCACGCTTACGTGTTAGTCACT  300

seq1  GCACTGTAGTGGCTATTCCTCGTTGTCAACTTGACTAAATCTGGAATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGTAGTGGCTATTCCTCGTTGTCAACTTGACTAAATCTGGAATGAA  350

seq1  CTACACTCCAGAACTGGAAGTGATCCCAATGTGGAGGCTGGGAGATACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACTCCAGAACTGGAAGTGATCCCAATGTGGAGGCTGGGAGATACAA  400

seq1  GTTTCTGACCTGGATCTCAGCATGGAGATCTTGAGGTGTAGTGGCTATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTGACCTGGATCTCAGCATGGAGATCTTGAGGTGTAGTGGCTATGA  450

seq1  ATCCCAGAAGATTAAGACAGGGAGACCTCTGAGTTCAAGGTCATCTGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGAAGATTAAGACAGGGAGACCTCTGAGTTCAAGGTCATCTGGGA  500

seq1  GAAAGCAAGTCCCAGGTCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTTTAATCTGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAGTCCCAGGTCCAGGCGTGGTGGCTCACACCTTTAATCTGGGC  550

seq1  CACACCTTCTGCTGGAGACCTACGTAAGGACACTGGAAGAAGGAAGATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCTTCTGCTGGAGACCTACGTAAGGACACTGGAAGAAGGAAGATTT  600

seq1  GCTCTCTCTTCTTTGCCTGCTTGCCTTGCGGGACTGAGCAACTGCTCGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTCTTCTTTGCCTGCTTGCCTTGCGGGACTGAGCAACTGCTCGAT  650

seq1  CCTTGGTCTTCCATTCACAGCTGCTGCTGACCATTGTTGGGGAGTTGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGTCTTCCATTCACAGCTGCTGCTGACCATTGTTGGGGAGTTGGAC  700

seq1  TATAGACTATAAGTCATCAACAAATTCCCTTACTATATAGAGACTACCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGACTATAAGTCATCAACAAATTCCCTTACTATATAGAGACTACCCA  750

seq1  TATGTTCTGTGACTCTAGAAAACCCTGACTAATACA  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTCTGTGACTCTAGAAAACCCTGACTAATACA  786