BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134E14
Chromosome11 (Build37)
Map Location 11,738,453 - 11,916,571
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdc, Grb10
Upstream geneVwc2, Zpbp, LOC625132, EG432534, 4930415F15Rik, Ikzf1, Fignl1
Downstream geneCobl, LOC627244
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134E14.bB6Ng01-134E14.g
ACCDH934624DH934625
length9961,022
definitionDH934624|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134E14, 5' end.DH934625|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134E14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,915,574 - 11,916,571)(11,738,453 - 11,739,478)
sequence
gaattcaaagtacaataagtatcatgatttgaatttgtcctttgcatgtc
tctttgttgagaactgaatctctaagttcctatgtcagtattatatagag
ctcagaggtccttggatgggtaataaggtttagatgagtataggagactc
ccatggtagtattagtgagtttacaagaagaggctagctgcaagctggga
tatctgttgagttgtaccatgtggtgctgccaccatgttctgatgaacca
aaaaggcccttgcaagatgccaagcagatgccagggccatgcacttgaac
ttggcagcatctagaaccatgagcaaataaacttctatttataagttatc
taggctcagatattttgatatctcagcagaagatgggtaagggtggcacg
tctatgcttcttagctcatgggccctgcagtgctgggggatgggtgggta
acaaggattctgggaaataaaacagtatgtgtatctgaagagaaagggtg
gctgctgtcagcagtagaggtagaaatagatggctctcgttgcttttata
gctaaggttagttaggttggtagatagggtgaaaggcatataggaaaagt
ggagggtccatgatgtactttgatgggtgcccaatatgtgaacagaatta
atggaagaggaaagcaggatttcagagggccaatttaggttgtttgaagt
tttctatgtgttctgtgggcataaagcgccagctcagcaagggaactctc
tgtacgctgggtgtgaaatgagctgtgtttccctatcccacaggagtggt
gaaagaagtacctccaacctgtgaaaggagtgtgtttctacatcagctct
ctcaggctcctctataaaagtcttccattctcttcaagaatctcatgcct
gttatgtctggagaatattaatgcttttgtgaatgaaaccatttttttac
catcagcttttctaattgccacattactagtggggtgggagggggt
gaattctgcccacgtctggaaagatggaccacagggcccatctgtgttaa
gtttgttaagtatgcactgttttatgctctgtagctctggggagagtaga
gtcttggctaactgctttgattgttacttctcatgacagagtttcgtttg
gggttacaggatacactttgcaattttcagaagagtccacgggacattta
gaacgcattggtgactttctgtggaatattggccactgtgactgcccatc
ttactcaggtatatgagaagaacgtgagcaactcattgagccagatcgta
gaggattacaggttgacgttttaaattattgtctgactggaatgcatagc
aattttattttactcataaatatttttctatggctttatatgtacaagtc
taacctatgatgcacagctctacccaggatttgtagcaaactggaaaata
gctgtctgcctcaggagtgcttcaaaagtcaggctgcatgactggaatgt
cctcagcccctatcctgaggtactgtatttattaagttaattttcatttt
ttaaaaattatgtgtatggggacacagtctaggtacatgtatggagtgca
ggagtgcacgggacagaggcatccagtgtcctagagttgcagttatggga
gtagctgctggaaaccaaactcaggtcctctgcaacaacagtacacacgt
ttattccctgattaaagttcctggctccccgggggcatttcatttctaat
aaccattgcaactggctagaaagtagtttgctgaaataaaccgaagcaat
aagagttggggtgtccaaatcttacacagggagattcactgatgaccttg
ggtagcagtgttgctcagtggtagccaagtacacaggaggccagtaggtt
tgattcccagtgcaaaacaaaagacctcactgaacagcttactcacctca
caccattcagaagataccggaattcaagaaagataaagcactgccgcgta
agcagcgtcaatggtgcagcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_11915574_11916571
seq2: B6Ng01-134E14.b_45_1040 (reverse)

seq1  ACCCCCTCCCACCCCACTAGTAATGTGGCAATTAG-AAAGCTGATGGTAA  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACCCCCTCCCACCCCACTAGTAATGTGGCAATTAGAAAAGCTGATGGTAA  50

seq1  AAAAATTGTTTCATTCACAAAAGCATTAAATATTCTCCAGACATAAACAG  99
      |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
seq2  AAAAATGGTTTCATTCACAAAAGCATT-AATATTCTCCAGACAT-AACAG  98

seq1  GCATGAGATTCTTTGAAGAGAATGGAAGACTTTTATAGAGGAGCCTGAGA  149
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAGATTC-TTGAAGAGAATGGAAGACTTTTATAGAGGAGCCTGAGA  147

seq1  GAGCTGATGTAGAAACACACTCCTTTCACAGGTTGGAGGTACTTCTTTCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGATGTAGAAACACACTCCTTTCACAGGTTGGAGGTACTTCTTTCA  197

seq1  CCACTCCTGTGGGATAGGGAAACACAGCTCATTTCACACCCAGCGTACAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCTGTGGGATAGGGAAACACAGCTCATTTCACACCCAGCGTACAG  247

seq1  AGAGTTCCCTTGCTGAGCTGGCGCTTTATGCCCACAGAACACATAGAAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTCCCTTGCTGAGCTGGCGCTTTATGCCCACAGAACACATAGAAAA  297

seq1  CTTCAAACAACCTAAATTGGCCCTCTGAAATCCTGCTTTCCTCTTCCATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAACAACCTAAATTGGCCCTCTGAAATCCTGCTTTCCTCTTCCATT  347

seq1  AATTCTGTTCACATATTGGGCACCCATCAAAGTACATCATGGACCCTCCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGTTCACATATTGGGCACCCATCAAAGTACATCATGGACCCTCCA  397

seq1  CTTTTCCTATATGCCTTTCACCCTATCTACCAACCTAACTAACCTTAGCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCTATATGCCTTTCACCCTATCTACCAACCTAACTAACCTTAGCT  447

seq1  ATAAAAGCAACGAGAGCCATCTATTTCTACCTCTACTGCTGACAGCAGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGCAACGAGAGCCATCTATTTCTACCTCTACTGCTGACAGCAGCC  497

seq1  ACCCTTTCTCTTCAGATACACATACTGTTTTATTTCCCAGAATCCTTGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTTCTCTTCAGATACACATACTGTTTTATTTCCCAGAATCCTTGTT  547

seq1  ACCCACCCATCCCCCAGCACTGCAGGGCCCATGAGCTAAGAAGCATAGAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCCATCCCCCAGCACTGCAGGGCCCATGAGCTAAGAAGCATAGAC  597

seq1  GTGCCACCCTTACCCATCTTCTGCTGAGATATCAAAATATCTGAGCCTAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCACCCTTACCCATCTTCTGCTGAGATATCAAAATATCTGAGCCTAG  647

seq1  ATAACTTATAAATAGAAGTTTATTTGCTCATGGTTCTAGATGCTGCCAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTTATAAATAGAAGTTTATTTGCTCATGGTTCTAGATGCTGCCAAG  697

seq1  TTCAAGTGCATGGCCCTGGCATCTGCTTGGCATCTTGCAAGGGCCTTTTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTGCATGGCCCTGGCATCTGCTTGGCATCTTGCAAGGGCCTTTTT  747

seq1  GGTTCATCAGAACATGGTGGCAGCACCACATGGTACAACTCAACAGATAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCATCAGAACATGGTGGCAGCACCACATGGTACAACTCAACAGATAT  797

seq1  CCCAGCTTGCAGCTAGCCTCTTCTTGTAAACTCACTAATACTACCATGGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTTGCAGCTAGCCTCTTCTTGTAAACTCACTAATACTACCATGGG  847

seq1  AGTCTCCTATACTCATCTAAACCTTATTACCCATCCAAGGACCTCTGAGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCCTATACTCATCTAAACCTTATTACCCATCCAAGGACCTCTGAGC  897

seq1  TCTATATAATACTGACATAGGAACTTAGAGATTCAGTTCTCAACAAAGAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATATAATACTGACATAGGAACTTAGAGATTCAGTTCTCAACAAAGAG  947

seq1  ACATGCAAAGGACAAATTCAAATCATGATACTTATTGTACTTTGAATTC  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCAAAGGACAAATTCAAATCATGATACTTATTGTACTTTGAATTC  996

seq1: chr11_11738453_11739478
seq2: B6Ng01-134E14.g_69_1090

seq1  GAATTCTGCCCACGTCTGGAAAGATGGACCACAGGGCCCATCTGTGTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCCCACGTCTGGAAAGATGGACCACAGGGCCCATCTGTGTTAA  50

seq1  GTTTGTTAAGTATGCACTGTTTTATGCTCTGTAGCTCTGGGGAGAGTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTAAGTATGCACTGTTTTATGCTCTGTAGCTCTGGGGAGAGTAGA  100

seq1  GTCTTGGCTAACTGCTTTGATTGTTACTTCTCATGACAGAGTTTCGTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGGCTAACTGCTTTGATTGTTACTTCTCATGACAGAGTTTCGTTTG  150

seq1  GGGTTACAGGATACACTTTGCAATTTTCAGAAGAGTCCACGGGACATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTACAGGATACACTTTGCAATTTTCAGAAGAGTCCACGGGACATTTA  200

seq1  GAACGCATTGGTGACTTTCTGTGGAATATTGGCCACTGTGACTGCCCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGCATTGGTGACTTTCTGTGGAATATTGGCCACTGTGACTGCCCATC  250

seq1  TTACTCAGGTATATGAGAAGAACGTGAGCAACTCATTGAGCCAGATCGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCAGGTATATGAGAAGAACGTGAGCAACTCATTGAGCCAGATCGTA  300

seq1  GAGGATTACAGGTTGACGTTTTAAATTATTGTCTGACTGGAATGCATAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATTACAGGTTGACGTTTTAAATTATTGTCTGACTGGAATGCATAGC  350

seq1  AATTTTATTTTACTCATAAATATTTTTCTATGGCTTTATATGTACAAGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTATTTTACTCATAAATATTTTTCTATGGCTTTATATGTACAAGTC  400

seq1  TAACCTATGATGCACAGCTCTACCCAGGATTTGTAGCAAACTGGAAAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTATGATGCACAGCTCTACCCAGGATTTGTAGCAAACTGGAAAATA  450

seq1  GCTGTCTGCCTCAGGAGTGCTTCAAAAGTCAGGCTGCATGACTGGAATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTGCCTCAGGAGTGCTTCAAAAGTCAGGCTGCATGACTGGAATGT  500

seq1  CCTCAGCCCCTATCCTGAGGTACTGTATTTATTAAGTTAATTTTCATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGCCCCTATCCTGAGGTACTGTATTTATTAAGTTAATTTTCATTTT  550

seq1  TTAAAAATTATGTGTATGGGGACACAGTCTAGGTACATGTATGGAGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATTATGTGTATGGGGACACAGTCTAGGTACATGTATGGAGTGCA  600

seq1  GGAGTGCACGGGACAGAGGCATCCAGTGTCCTAGAGTTGCAGTTATGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGCACGGGACAGAGGCATCCAGTGTCCTAGAGTTGCAGTTATGGGA  650

seq1  GTAGCTGCTGGAAACCAAACTCAGGTCCTCTGCAACAACAGTACACACGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTGCTGGAAACCAAACTCAGGTCCTCTGCAACAACAGTACACACGT  700

seq1  TTATTCCCTGATTAAAGTTCCTGGCTCCCCGGGGGCATTTCATTTCTAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCCCTGATTAAAGTTCCTGGCTCCCCGGGGGCATTTCATTTCTAAT  750

seq1  AACCATTGCAACTGGCTAGAAAGTAGTTTGCTGAAATAAACCGAAGCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATTGCAACTGGCTAGAAAGTAGTTTGCTGAAATAAACCGAAGCAAT  800

seq1  AAGAGTTGGGGTGTCCAAATCTTACACAGGGAGATTTCACTGATGACCTT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAGAGTTGGGGTGTCCAAATCTTACACAGGGAGA-TTCACTGATGACCTT  849

seq1  GGGTAGCAGTGTTGCTCAGTGGTAGCCAAGTACACAGGAGGCCAGTAGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGCAGTGTTGCTCAGTGGTAGCCAAGTACACAGGAGGCCAGTAGGT  899

seq1  TTGATTCCCAGTGCAAAAACAAAAGACCTCACTGAACAGCTTACTCACCT  950
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTCCCAGTGC-AAAACAAAAGACCTCACTGAACAGCTTACTCACCT  948

seq1  CCACACCATTCAGAAGATACCGGAATTCAGGACAGATAAAGGCACTGCCC  1000
       |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||
seq2  -CACACCATTCAGAAGATACCGGAATTCAAGAAAGATAAA-GCACTG-CC  995

seq1  GCGTAAGCAGCGTCAAT-GTGCAGCCA  1026
      ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCGTAAGCAGCGTCAATGGTGCAGCCA  1022