BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134F11
Chromosome11 (Build37)
Map Location 3,124,772 - 3,165,087
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEif4enif1, Drg1
Upstream geneLOC236604, Sfi1, LOC623257
Downstream genePatz1, Pik3ip1, Limk2, Rnf185, 8430429K09Rik, LOC100041573, Pla2g3, Pib5pa, Selm, Smtn, Map1lc3-5, LOC625608, Tug1, Morc2a, LOC664900, Osbp2, LOC664920, 4921536K21Rik, Dusp18, Slc35e4, Tcn2, LOC100041720, Pes1, Gal3st1, Sec14l4, Sec14l3, 1700020C11Rik, Sec14l2, LOC625729, Rnf215, 4930562D19Rik, Sf3a1, Tbc1d10a, 2410008K03Rik, LOC625760, Osm, Lif
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134F11.bB6Ng01-134F11.g
ACCDH934663DH934664
length1,1241,000
definitionDH934663|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134F11, 5' end.DH934664|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134F11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,124,772 - 3,125,906)(3,164,074 - 3,165,087)
sequence
gaattctttaaccttgataaggtgccatgcttggcttcggtgagtgtaac
aacacatttgcaaacatggatggaggggttagaggatgactcagtacata
aaagccttgctgtgcaagtacgaagactgaatgaaatgtagatctctaga
actcaagtaaatgttggggcagcatggtggtcctcctggaatcccagctc
ccggaacaagtgaggtaactgaactagctctgttggtgagctgtcggctc
aaatgagaggccctgactcaggttataaaggagagagtgaataaaaaatg
cctaccatcagcctcttgacctctgcttacacacagcatatgcacccaaa
cacatgtgtgtgtacccccacacagcaatgtccgtatatacctgccacac
actacatgcatgcatactcatatgtacaaaataaaaataaacctgtacag
aatctggatgtggaggtatgcacttataatcttagcacttgggatgccaa
gacgagaggagtttgagtctgagattagctggagctacatggtcatttca
aggcctgcctgcctgcctgcctgcatagtaaaacccatctcaaaaaaact
tttgttaaatgaaaaaaggatggaccagctaattatggttaaatttgacc
tagtgtttctctttttctccagggatgggtatcttttatttgttttgaaa
cagggtttcactgtgtagccttagatagcctggaactcagaaattaaaag
cctctcaatcaccacttcccaatacatatgtatacttttttaatttaaaa
aaaacaccctctacgaagaacaactaagcatctcatctcccagctcttcc
gtcagcagatagcgaaaaagacatagcaaaagatatcccgacttaaaaac
cagagctgtgtccatttcctgtgcaggaaagagcttctgctctcagaggc
ccttcttgctctatgttgaaatgacaaacttgccgtttgatgtgtggtgt
gcatgcttagtctcacacttgggaggcagtagcagacaatttctgtggag
tttgagtcagcctgatctacgaataagtgcagtcagcaagactacacaga
agaatcaatgtatcaagagagaga
gaattcaatgccaacctggtttacataataagttgtagtacagttaggac
cacataaagagaccctgtgttaagaaaaattaaaatggttacactgacat
tagaaagccaaaacatattctcagcttctgggagcattcaggacttttcc
cctggaacgctgcagagtttatggctgtgattcttccctgatagatggct
cggactcagaagaacaaagccacagctcatcaccttggcctgcttaaggc
tcgccttgctaaacttcgaagagaactcatcactcctaaaggtggcggcg
gcggggggccaggagaaggtttgtagttccatgtaatatgtgtgaatata
taatatgtgtgtgtaaaataatacaaatatctaatgtgtgtatgtgtgtt
atatattcatatgcccatagacaattttttttttgtttgtgtacttctta
tcctggaacttaactataaagtctaggctagcagtgaactccacagagtc
catttgctccccaagtgctgggcttaaaagtgcacaccactgtgtctggc
ttccaagaatgcatttctgtgtgtttatgtgcataggaagaccagtcctt
ttttttttttttaaattgagatagggtcttacttatcctgaaactcatca
gttcaactagactggcgatccatcagtctctggagacctgcctataatgc
agcaatgggatcacgggtgtgtgctgctgctacagggctttttttacctg
tgggtgttgggaatccacaattaggtcctcatgttgtgtggcaggcacac
tgattactgagccatctcctagcccaatttttgttttgttttgtctttga
gacagtgtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcactctttaga
caggctagctccactagatctgcctgcctctgctcctaagtgctgggata
aaggcgtgcgccaccacataggttaattaatgttgagttagggtgtggtg

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_3124772_3125906
seq2: B6Ng01-134F11.b_48_1171

seq1  GAATTCTTTAACCTTGATAAGGTGCCATGCTTGGCTTCGGTGAGTGTAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAACCTTGATAAGGTGCCATGCTTGGCTTCGGTGAGTGTAAC  50

seq1  AACACATTTGCAAACATGGATGGAGGGGTTAGAGGATGACTCAGTACATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATTTGCAAACATGGATGGAGGGGTTAGAGGATGACTCAGTACATA  100

seq1  AAAGCCTTGCTGTGCAAGTACGAAGACTGAATGAAATGTAGATCTCTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCTTGCTGTGCAAGTACGAAGACTGAATGAAATGTAGATCTCTAGA  150

seq1  ACTCAAGTAAATGTTGGGGCAGCATGGTGGTCCTCCTGGAATCCCAGCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAGTAAATGTTGGGGCAGCATGGTGGTCCTCCTGGAATCCCAGCTC  200

seq1  CCGGAACAAGTGAGGTAACTGAACTAGCTCTGTTGGTGAGCTGTCGGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGAACAAGTGAGGTAACTGAACTAGCTCTGTTGGTGAGCTGTCGGCTC  250

seq1  AAATGAGAGGCCCTGACTCAGGTTATAAAGGAGAGAGTGAATAAAAAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGAGGCCCTGACTCAGGTTATAAAGGAGAGAGTGAATAAAAAATG  300

seq1  CCTACCATCAGCCTCTTGACCTCTGCTTACACACAGCATATGCACCCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCATCAGCCTCTTGACCTCTGCTTACACACAGCATATGCACCCAAA  350

seq1  CACATGTGTGTGTACCCCCACACAGCAATGTCCGTATATACCTGCCACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGTGTGTACCCCCACACAGCAATGTCCGTATATACCTGCCACAC  400

seq1  ACTACATGCATGCATACTCATATGTACAAAATAAAAATAAACCTGTACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACATGCATGCATACTCATATGTACAAAATAAAAATAAACCTGTACAG  450

seq1  AATCTGGATGTGGAGGTATGCACTTATAATCTTAGCACTTGGGATGCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGGATGTGGAGGTATGCACTTATAATCTTAGCACTTGGGATGCCAA  500

seq1  GACGAGAGGAGTTTGAGTCTGAGATTAGCTGGAGCTACATGGTCATTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGAGAGGAGTTTGAGTCTGAGATTAGCTGGAGCTACATGGTCATTTCA  550

seq1  AGGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCATAGTAAAACCCATCTCAAAAAAACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCATAGTAAAACCCATCTCAAAAAAACT  600

seq1  TTTGTTAAATGAAAAAAGGATGGACCAGCTAATTATGGTTAAATTTGACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTAAATGAAAAAAGGATGGACCAGCTAATTATGGTTAAATTTGACC  650

seq1  TAGTGTTTCTCTTTTTCTCCAGGGATGGGTATCTTTTATTTGTTTTGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTTTCTCTTTTTCTCCAGGGATGGGTATCTTTTATTTGTTTTGAAA  700

seq1  CAGGGTTTCACTGTGTAGCCTTAGATAGCCTGGAACTCAGAAATTAAAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTTCACTGTGTAGCCTTAGATAGCCTGGAACTCAGAAATTAAAAG  750

seq1  CCTCTCAATCACCACTTCCCAATACATATGTATACTTTTTTAATTTAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCAATCACCACTTCCCAATACATATGTATACTTTTTTAATTTAAAA  800

seq1  AAAACACCCTCTACGAAGAACAACTAAGCATCTCATCTCCCAGCTCTTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACCCTCTACGAAGAACAACTAAGCATCTCATCTCCCAGCTCTTCC  850

seq1  GTCAGCAGATAGCGAAAAAGACATAGCAAAAGATATCCCGACTTAAAAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCAGATAGCGAAAAAGACATAGCAAAAGATATCCCGACTTAAAAAC  900

seq1  CAGAGCTGTGTCCATTTCCTGTGCAGGAAAGAGCTTCTGCTCTCAGAGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTGTGTCCATTTCCTGTGCAGGAAAGAGCTTCTGCTCTCAGAGGC  950

seq1  CCTTCTTGCTCCTATGTTGAAAATGAACAAACTTGCCGTTTGATGTGTGG  1000
      |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTGCT-CTATGTTG-AAATG-ACAAACTTGCCGTTTGATGTGTGG  997

seq1  TGGTGCATGCCTTTAGTCTCAACACTTGGGAGGCAGTAGCAGACATATTT  1050
      | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  T-GTGCATGC--TTAGTCTC-ACACTTGGGAGGCAGTAGCAGACA-ATTT  1042

seq1  CTGT-GAGTTTGAGGTCAGCCTGATCTACAGAATAAGTTGCAGGTCAGCC  1099
      |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |
seq2  CTGTGGAGTTTGA-GTCAGCCTGATCTAC-GAATAAG-TGCA-GTCAG-C  1087

seq1  AAGACTACACAG-AGAAACCATGTATCAAAAGAGAGA  1135
      |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||
seq2  AAGACTACACAGAAGAATCAATGTATCAAGAGAGAGA  1124

seq1: chr11_3164074_3165087
seq2: B6Ng01-134F11.g_65_1064 (reverse)

seq1  CACCACCACCCAACTCAAAACATTAATTACACCTAATGTGGTGGCGCACG  50
      ||||||  || |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  CACCACACCCTAACTC--AACATTAATTA-ACCT-ATGTGGTGGCGCACG  46

seq1  CCTTTAATCCCAGCACTTAGGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTGAGTTGGAG  100
      ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| 
seq2  CCTTT-ATCCCAGCACTTAGGA-GCAGAGGCAGGCAGATCT-AG-TGGA-  91

seq1  GCTAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAG  150
      |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCT-GTCTAAAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAG  140

seq1  AAACACTGTCTCAAAAGACAAAAACAAAAACAAAAAATTGGGCTAGGAGA  200
      |||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGTCTC-AAAGAC-AAAACAAAA--CAAAAATTGGGCTAGGAGA  186

seq1  TGGCTCAGTAATCAGTGTGCCTGCCACACAACATGAGGACCTAATTGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCAGTAATCAGTGTGCCTGCCACACAACATGAGGACCTAATTGTGG  236

seq1  ATTCCCAACACCCACAGGTAAAAAAAGCCCTGTAGCAGCAGCACACACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCAACACCCACAGGTAAAAAAAGCCCTGTAGCAGCAGCACACACCC  286

seq1  GTGATCCCATTGCTGCATTATAGGCAGGTCTCCAGAGACTGATGGATCGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCCCATTGCTGCATTATAGGCAGGTCTCCAGAGACTGATGGATCGC  336

seq1  CAGTCTAGTTGAACTGATGAGTTTCAGGATAAGTAAGACCCTATCTCAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAGTTGAACTGATGAGTTTCAGGATAAGTAAGACCCTATCTCAAT  386

seq1  TTAAAAAAAAAAAAAAGGACTGGTCTTCCTATGCACATAAACACACAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAAAAAAAAAAGGACTGGTCTTCCTATGCACATAAACACACAGAA  436

seq1  ATGCATTCTTGGAAGCCAGACACAGTGGTGTGCACTTTTAAGCCCAGCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATTCTTGGAAGCCAGACACAGTGGTGTGCACTTTTAAGCCCAGCAC  486

seq1  TTGGGGAGCAAATGGACTCTGTGGAGTTCACTGCTAGCCTAGACTTTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAGCAAATGGACTCTGTGGAGTTCACTGCTAGCCTAGACTTTATA  536

seq1  GTTAAGTTCCAGGATAAGAAGTACACAAACAAAAAAAAAATTGTCTATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGTTCCAGGATAAGAAGTACACAAACAAAAAAAAAATTGTCTATGG  586

seq1  GCATATGAATATATAACACACATACACACATTAGATATTTGTATTATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGAATATATAACACACATACACACATTAGATATTTGTATTATTTT  636

seq1  ACACACACATATTATATATTCACACATATTACATGGAACTACAAACCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACATATTATATATTCACACATATTACATGGAACTACAAACCTTC  686

seq1  TCCTGGCCCCCCGCCGCCGCCACCTTTAGGAGTGATGAGTTCTCTTCGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCCCCCCGCCGCCGCCACCTTTAGGAGTGATGAGTTCTCTTCGAA  736

seq1  GTTTAGCAAGGCGAGCCTTAAGCAGGCCAAGGTGATGAGCTGTGGCTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGCAAGGCGAGCCTTAAGCAGGCCAAGGTGATGAGCTGTGGCTTTG  786

seq1  TTCTTCTGAGTCCGAGCCATCTATCAGGGAAGAATCACAGCCATAAACTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTGAGTCCGAGCCATCTATCAGGGAAGAATCACAGCCATAAACTC  836

seq1  TGCAGCGTTCCAGGGGAAAAGTCCTGAATGCTCCCAGAAGCTGAGAATAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCGTTCCAGGGGAAAAGTCCTGAATGCTCCCAGAAGCTGAGAATAT  886

seq1  GTTTTGGCTTTCTAATGTCAGTGTAACCATTTTAATTTTTCTTAACACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGGCTTTCTAATGTCAGTGTAACCATTTTAATTTTTCTTAACACAG  936

seq1  GGTCTCTTTATGTGGTCCTAACTGTACTACAACTTATTATGTAAACCAGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCTTTATGTGGTCCTAACTGTACTACAACTTATTATGTAAACCAGG  986

seq1  TTGGCATTGAATTC  1014
      ||||||||||||||
seq2  TTGGCATTGAATTC  1000