BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150C13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 14,429,523 - 14,583,513
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700046C09Rik, 1700054H16Rik
Upstream geneLOC432535
Downstream geneLOC100042542, LOC100041673, LOC432537
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150C13.bB6Ng01-150C13.g
ACCDH946311DH946312
length1,188972
definitionDH946311|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150C13, 5' end.DH946312|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150C13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,582,337 - 14,583,513)(14,429,523 - 14,430,426)
sequence
gaattctataactcaaaggaaataatgattttctctttacatgctggatc
tccagtatttgttaaagtagtaaagaactattaaacatagcccttgagag
tagtgcttggctttattttcatagctaatcatcaatatttataatagttc
aatagatgacagttcttggtgccttcctctcaatagctaatgattgtact
gggttcttctagttgtacagagattggcaataagacttatataagatagt
tttcttttcctataagtaaggtctagaaaggatggaatatattcaacact
ggaatacattgagtgggagaaacagaaaagagacaaagaatggaagatat
tctggcatagtggctcagagtagtaattccagtacttagcatactgaggc
aggaggatcactgaaaacaataggtttactatctgccactaataaactta
ctgagaaagaaattattatcccagctcaaaaagcaaacaaaacaaacaaa
caaaaagaacatgatgcatgatggaaagaaaatacatccacaatgaaaac
cttaaaacactgataaaagaaattggccacaccaacattggtgcagtcac
atccttagtacacaaaatacacagagaagtgatttctgttctattaatca
tcaaatctgtactccatttgggacttcttatactatagcgctcatgctta
ttattagttaggcagttgattcaggctctcttgaattaataagtgttttt
aaagaagatatgctgtgcttcaataacctctttacattgaattttaatca
tttttcccttctccattataccacctgtacacaattcatacctattccaa
taaagactgtttctgcagacaagtttgtcttagcttaaacattatcatga
taaaatacataaatgcaaacacatgcatgcattatctcacattccagcac
acatgtacatatagcattcatgcataagcatgcaaacagacacacaagaa
taaacatacgccacaaatgttatagacaagcatgtaccacagaaataaaa
tatgtataatcacatggtacatcacatgttgcagaaatgagtattgaagc
aaatacacaaggcaattcttttatatctttcttatagagatagtcagtgg
ttcctttaaattatttagacagattgtattatcagcta
gaattcttcacatccagatacctctctaccagtgaagatgaaagttcccc
caaccatcaggaggagatagaatgaatgttggtcctttcaagttatacat
agaatagaaataacttattaataggtgcaatagaattcctgtgagaaatt
gggctggcgagctaaagaagggggagcctaaagcactgaaagattaaggc
ccatttcttccaccaatttaaataaaatctatctcaggagacaaaagggt
gagtggaggaatggagaggatgaggtcaggtctctttcttgagaaaagga
ccaataagaccctctcacaattaagtacacgtatgttctagaatcttaat
ttgtttatattttaagtatcatatacagaaacagcatttcggttttttta
tatcatttttactagatattttcttcatttacatttcaaatgctatccca
aaagtcccctatgacctccccctgccctgctcctatacccacttgctccc
atttcttggccctggaattcccctgtactggggcatataaagtttgctag
aacaaggggtctctcttcctaataatggccaactaggccattttctgcta
catatgcagatagagacacaagttatggggggtactggttagtttatatt
gttgttccacctatagggttgcagacccctttagctccttgggtactttc
tctagctcctccattgggggccctgtgttccatcctatagatgactgtga
gcatccacttttgtatttgccaggcactggcaaagcctcacaggagagag
ctatatcagggtcctttcagcaaaaccttgctggcatatgcaatagtgtg
tgtttggtggctgattatgggatggaccccccaggtggggcagtctttgg
atggtccatccttcatctagctccaaatttgtctctgcaactccttccat
agatattttatccctattctag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_14582337_14583513
seq2: B6Ng01-150C13.b_44_1231 (reverse)

seq1  TAGCTGATAATACAATCTG-CTACATAATTTTTAAAGAACCACTGACTAT  49
      ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||
seq2  TAGCTGATAATACAATCTGTCTAAATAA-TTTAAAGGAACCACTGACTAT  49

seq1  -TCTATA--GAAGATAT-AAAGAATTTGCTTGTGTATGTGCT--CATACT  93
       ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||   |||||
seq2  CTCTATAAGAAAGATATAAAAGAATTGCCTTGTGTATTTGCTTCAATACT  99

seq1  CATATCTGC-ACATGTTGATGTA-CATGTGATTATACATA-TTTATTTCT  140
      ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||
seq2  CATTTCTGCAACATG-TGATGTACCATGTGATTATACATATTTTATTTCT  148

seq1  GT-GTACATGCTTGTCTAT-ACATTTGT-GCGTATGTTTATTCTTGTGTG  187
      || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACATGCTTGTCTATAACATTTGTGGCGTATGTTTATTCTTGTGTG  198

seq1  TCTGTTTGCATGCTTATGCATGAATGCTATATGTACATGTGTGCTGGAAT  237
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTGCATGCTTATGCATGAATGCTATATGTACATGTGTGCTGGAAT  248

seq1  GTGAGATAATGCATGCATGTGTTTGCATTTATGTATTTTATCATGATAAT  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATAATGCATGCATGTGTTTGCATTTATGTATTTTATCATGATAAT  298

seq1  GTTTAAGCTAAGACAAACTTGTCTGCAGAAACAGTCTTTATTGGAATAGG  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAGCTAAGACAAACTTGTCTGCAGAAACAGTCTTTATTGGAATAGG  348

seq1  TATGAATTGTGTACAGGTGGTATAATGGAGAAGGGAAAAATGATTAAAAT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATTGTGTACAGGTGGTATAATGGAGAAGGGAAAAATGATTAAAAT  398

seq1  TCAATGTAAAGAGGTTATTGAAGCACAGCATATCTTCTTTAAAAACACTT  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTAAAGAGGTTATTGAAGCACAGCATATCTTCTTTAAAAACACTT  448

seq1  ATTAATTCAAGAGAGCCTGAATCAACTGCCTAACTAATAATAAGCATGAG  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTCAAGAGAGCCTGAATCAACTGCCTAACTAATAATAAGCATGAG  498

seq1  CGCTATAGTATAAGAAGTCCCAAATGGAGTACAGATTTGATGATTAATAG  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTATAGTATAAGAAGTCCCAAATGGAGTACAGATTTGATGATTAATAG  548

seq1  AACAGAAATCACTTCTCTGTGTATTTTGTGTACTAAGGATGTGACTGCAC  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAATCACTTCTCTGTGTATTTTGTGTACTAAGGATGTGACTGCAC  598

seq1  CAATGTTGGTGTGGCCAATTTCTTTTATCAGTGTTTTAAGGTTTTCATTG  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTTGGTGTGGCCAATTTCTTTTATCAGTGTTTTAAGGTTTTCATTG  648

seq1  TGGATGTATTTTCTTTCCATCATGCATCATGTTCTTTTTGTTTGTTTGTT  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTATTTTCTTTCCATCATGCATCATGTTCTTTTTGTTTGTTTGTT  698

seq1  TTGTTTGCTTTTTGAGCTGGGATAATAATTTCTTTCTCAGTAAGTTTATT  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTGCTTTTTGAGCTGGGATAATAATTTCTTTCTCAGTAAGTTTATT  748

seq1  AGTGGCAGATAGTAAACCTATTGTTTTCAGTGATCCTCCTGCCTCAGTAT  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCAGATAGTAAACCTATTGTTTTCAGTGATCCTCCTGCCTCAGTAT  798

seq1  GCTAAGTACTGGAATTACTACTCTGAGCCACTATGCCAGAATATCTTCCA  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGTACTGGAATTACTACTCTGAGCCACTATGCCAGAATATCTTCCA  848

seq1  TTCTTTGTCTCTTTTCTGTTTCTCCCACTCAATGTATTCCAGTGTTGAAT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGTCTCTTTTCTGTTTCTCCCACTCAATGTATTCCAGTGTTGAAT  898

seq1  ATATTCCATCCTTTCTAGACCTTACTTATAGGAAAAGAAAACTATCTTAT  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCATCCTTTCTAGACCTTACTTATAGGAAAAGAAAACTATCTTAT  948

seq1  ATAAGTCTTATTGCCAATCTCTGTACAACTAGAAGAACCCAGTACAATCA  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTCTTATTGCCAATCTCTGTACAACTAGAAGAACCCAGTACAATCA  998

seq1  TTAGCTATTGAGAGGAAGGCACCAAGAACTGTCATCTATTGAACTATTAT  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTATTGAGAGGAAGGCACCAAGAACTGTCATCTATTGAACTATTAT  1048

seq1  AAATATTGATGATTAGCTATGAAAATAAAGCCAAGCACTACTCTCAAGGG  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATTGATGATTAGCTATGAAAATAAAGCCAAGCACTACTCTCAAGGG  1098

seq1  CTATGTTTAATAGTTCTTTACTACTTTAACAAATACTGGAGATCCAGCAT  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTTAATAGTTCTTTACTACTTTAACAAATACTGGAGATCCAGCAT  1148

seq1  GTAAAGAGAAAATCATTATTTCCTTTGAGTTATAGAATTC  1177
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGAGAAAATCATTATTTCCTTTGAGTTATAGAATTC  1188

seq1: chr11_14429523_14430426
seq2: B6Ng01-150C13.g_69_972

seq1  GAATTCTTCACATCCAGATACCTCTCTACCAGTGAAGATGAAAGTTCCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCACATCCAGATACCTCTCTACCAGTGAAGATGAAAGTTCCCC  50

seq1  CAACCATCAGGAGGAGATAGAATGAATGTTGGTCCTTTCAAGTTATACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATCAGGAGGAGATAGAATGAATGTTGGTCCTTTCAAGTTATACAT  100

seq1  AGAATAGAAATAACTTATTAATAGGTGCAATAGAATTCCTGTGAGAAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGAAATAACTTATTAATAGGTGCAATAGAATTCCTGTGAGAAATT  150

seq1  GGGCTGGCGAGCTAAAGAAGGGGGAGCCTAAAGCACTGAAAGATTAAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGCGAGCTAAAGAAGGGGGAGCCTAAAGCACTGAAAGATTAAGGC  200

seq1  CCATTTCTTCCACCAATTTAAATAAAATCTATCTCAGGAGACAAAAGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTCTTCCACCAATTTAAATAAAATCTATCTCAGGAGACAAAAGGGT  250

seq1  GAGTGGAGGAATGGAGAGGATGAGGTCAGGTCTCTTTCTTGAGAAAAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGAGGAATGGAGAGGATGAGGTCAGGTCTCTTTCTTGAGAAAAGGA  300

seq1  CCAATAAGACCCTCTCACAATTAAGTACACGTATGTTCTAGAATCTTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATAAGACCCTCTCACAATTAAGTACACGTATGTTCTAGAATCTTAAT  350

seq1  TTGTTTATATTTTAAGTATCATATACAGAAACAGCATTTCGGTTTTTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTATATTTTAAGTATCATATACAGAAACAGCATTTCGGTTTTTTTA  400

seq1  TATCATTTTTACTAGATATTTTCTTCATTTACATTTCAAATGCTATCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTTTTACTAGATATTTTCTTCATTTACATTTCAAATGCTATCCCA  450

seq1  AAAGTCCCCTATGACCTCCCCCTGCCCTGCTCCTATACCCACTTGCTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCCCTATGACCTCCCCCTGCCCTGCTCCTATACCCACTTGCTCCC  500

seq1  ATTTCTTGGCCCTGGAATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTTGGCCCTGGAATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCTAG  550

seq1  AACAAGGGGTCTCTCTTCCTAATAATGGCCAACTAGGCCATTTTCTGCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGGGGTCTCTCTTCCTAATAATGGCCAACTAGGCCATTTTCTGCTA  600

seq1  CATATGCAGATAGAGACACAAGTTATGGGGGGTACTGGTTAGTTTATATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCAGATAGAGACACAAGTTATGGGGGGTACTGGTTAGTTTATATT  650

seq1  GTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTC  700

seq1  TCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGTTCCATCCTATAGATGACTGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGTTCCATCCTATAGATGACTGTGA  750

seq1  GCATCCACTTTTGTATTTGCCAGGCACTGGCAAAGCCTCACAGGAGAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCACTTTTGTATTTGCCAGGCACTGGCAAAGCCTCACAGGAGAGAG  800

seq1  CTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAAACCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATCAGGGTCCTTTCAGCAAAACCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTG  850

seq1  TGTTTGGTGGCTGATTATGGGATGGACCCCCCAGGTGGGGCAGTCTTTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGTGGCTGATTATGGGATGGACCCCCCAGGTGGGGCAGTCTTTGG  900

seq1  ATGG  904
      ||||
seq2  ATGG  904