seq1: chr11_5391089_5392262
seq2: B6Ng01-183P07.b_44_1234 (reverse)
seq1 GTTTCA-CCATCTGAGGACCAG-GCCTTCAAAGACATGAGCTATGCTGGG 48
|||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||
seq2 GTTTCACCCATCTGAGGACCCGAGCCTTCAAGAACATGAGTTATGGTGGG 50
seq1 CCGT-GCCTATGCAGGTCACCACACTGAGGTGCATGGCAATAGAACC--T 95
|||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |
seq2 CCGTGGCCTATGCAGTTCACCACCCTGAGGTGCATGGC-ATAGGACCCTT 99
seq1 TCAGATCTCCAGTTA--GTCATTGCTCTGAAA--TCACT--GTCTCTAGC 139
||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2 TCAGATCTCAAGGTAAGTTCATTGCTCTGAAAATTCACTTGTTCTCTAGC 149
seq1 C--TCGG-GATAATGTCACCA--CCCCAGGAAGTCCTT-GTTCGTTGTTC 183
| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||
seq2 CCTTCGGAGATAATGTCACCAACCCCAAGGAAGTCCTTGGTTCGTTGTTC 199
seq1 CTCTC-TCTGGTGACCTCTGCTGTGCTCCGTGTGGAGCAGTGTAGTGACT 232
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCTTCTGGTGACCTCTGCTGTGCTCCGTGTGGAGCAGTGTAGTGACT 249
seq1 CGGGCCATAGATTCCCTGACTGTGCCCATTGATAGCTGCCTCTTCCCCTG 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGGGCCATAGATTCCCTGACTGTGCCCATTGATAGCTGCCTCTTCCCCTG 299
seq1 T-AAGGTCATGTTTGCGTCTTATTTTAGCTGAAATCCACGAGGTATGAAG 331
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAGGTCATG-TTGCGTCTTATTTTAGCTGAAATCCACGAGGTATGAAG 348
seq1 GTAAACATTAGCTGGGTGTGGCAGTCCACACACACCTGTGTGCACCACAG 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAAACATTAGCTGGGTGTGGCAGTCCACACACACCTGTGTGCACCACAG 398
seq1 AGGCCGAGGCCTGAGAACCTCTAGTTCAAGGCTGTAGTCTGGGCTACAGG 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGCCGAGGCCTGAGAACCTCTAGTTCAAGGCTGTAGTCTGGGCTACAGG 448
seq1 GTGAGATCCTACCTATCACAAGAAACCAAGGGCTGGGGATGTAGTTCAGT 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAGATCCTACCTATCACAAGAAACCAAGGGCTGGGGATGTAGTTCAGT 498
seq1 GGTAGACCTATTGCACACAAGGCCCTGGGTTTGATTCGATAGTACTACAA 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTAGACCTATTGCACACAAGGCCCTGGGTTTGATTCGATAGTACTACAA 548
seq1 CCATTACCAACAACCTCACCATTTGAAAGTGTGCATTTGGGGCTAGAGAG 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATTACCAACAACCTCACCATTTGAAAGTGTGCATTTGGGGCTAGAGAG 598
seq1 ATGGCTCAGTGGTTAAGAGTACTGACTGCTCTTCCAGAGGCCCTGAGTTC 631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGGCTCAGTGGTTAAGAGTACTGACTGCTCTTCCAGAGGCCCTGAGTTC 648
seq1 AATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCATGACCATCTGTAATGGGATGTGA 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCATGACCATCTGTAATGGGATGTGA 698
seq1 TGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAGAACTCATATACATATACAGGCCTC 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAGAACTCATATACATATACAGGCCTC 748
seq1 CCCCTGCCCCCTGCCCAGCACCTGGAATGCCCAACCCTGCTTTCAGCCTA 781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCTGCCCCCTGCCCAGCACCTGGAATGCCCAACCCTGCTTTCAGCCTA 798
seq1 CCTTTCCCTTCTCATGGCCTACTGGGATTTTACTATCTGATAAAGACGAC 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTTTCCCTTCTCATGGCCTACTGGGATTTTACTATCTGATAAAGACGAC 848
seq1 ACAAGAGGAGAAGAAACATTTAGGTGAGAGAGTGAGACAAAACCCCTGAA 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAAGAGGAGAAGAAACATTTAGGTGAGAGAGTGAGACAAAACCCCTGAA 898
seq1 ATCCAGGAAAACTCGCCCAGGCTGTCCAGCCCAGAAGAAGCCATTTGTAA 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCAGGAAAACTCGCCCAGGCTGTCCAGCCCAGAAGAAGCCATTTGTAA 948
seq1 AGTCAAAGCCGCCCCTCATCTTGGATGCAAGGCTCCTCCTGGCCCCGGCT 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTCAAAGCCGCCCCTCATCTTGGATGCAAGGCTCCTCCTGGCCCCGGCT 998
seq1 TGAAGGCTGCTCCCGGTGCTATTGACAGATGACGATTGCAATGTTTATTT 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAAGGCTGCTCCCGGTGCTATTGACAGATGACGATTGCAATGTTTATTT 1048
seq1 TCTTATCAACCAAGTAAAAGTCAGAGGCCAGGTTGAAAGAGAAAAATCCC 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTATCAACCAAGTAAAAGTCAGAGGCCAGGTTGAAAGAGAAAAATCCC 1098
seq1 CACAGCTGGCATTGACATAAAGACCAAACAGGAAGGAGTTTCAAATGCAG 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACAGCTGGCATTGACATAAAGACCAAACAGGAAGGAGTTTCAAATGCAG 1148
seq1 GAAAGGCCACGGTTGTCTGTTAAACAGCACCTACCTGGAATTC 1174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAAGGCCACGGTTGTCTGTTAAACAGCACCTACCTGGAATTC 1191
| seq1: chr11_5273647_5273885
seq2: B6Ng01-183P07.g_70_308
seq1 TGAGGACAGAAGTAATGTGGTCTGGCGTGTCTTTTAACTGGATTGCTATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGGACAGAAGTAATGTGGTCTGGCGTGTCTTTTAACTGGATTGCTATA 50
seq1 GCTGCTGCTGTACTTGGAAAGAATTGGTATGGGGAAGACCATAGAAAGTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTGCTGCTGTACTTGGAAAGAATTGGTATGGGGAAGACCATAGAAAGTG 100
seq1 GGACTGCATAAGGAAAGCTAGGCAGGAGGCTTGAGGAGAAGCAATAGCAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGACTGCATAAGGAAAGCTAGGCAGGAGGCTTGAGGAGAAGCAATAGCAG 150
seq1 TGTGGAATCAGGTAGTAAAGTAAAGGTGTTGGTTGAGAAGTGGTTAGTTA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGGAATCAGGTAGTAAAGTAAAGGTGTTGGTTGAGAAGTGGTTAGTTA 200
seq1 GGCTCTGAGAGTGAAAGTAGAATGGTGGGGTGGGGTGGG 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTCTGAGAGTGAAAGTAGAATGGTGGGGTGGGGTGGG 239
|