seq1: chr11_6540312_6541070
seq2: B6Ng01-186E19.b_45_803 (reverse)
seq1 TCCCTCCCTCCCTTTCTAAAGATTTATTTATTTATTATACATAAGTACAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCCTCCCTCCCTTTCTAAAGATTTATTTATTTATTATACATAAGTACAC 50
seq1 TGTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTACAGA 100
seq1 TGGTTGTGACCCACCATATGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCGG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTTGTGACCCACCATATGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTCGG 150
seq1 AAGAGCACTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTTTCA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAGCACTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTTTCA 200
seq1 GCTCTTTCTTGGTTGTTTCCATGGATCTCCTTCCCAGCTGTGCTCAAGGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTCTTTCTTGGTTGTTTCCATGGATCTCCTTCCCAGCTGTGCTCAAGGC 250
seq1 TGATAGTGAGATTCTGCTGCTACCCCCTGCTTCTTGAAGTGGTTTGGCCC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGATAGTGAGATTCTGCTGCTACCCCCTGCTTCTTGAAGTGGTTTGGCCC 300
seq1 CTCTTGGTTCATGCCTAGGTCCTCAGCCTCTTGAAACTCTAGGCCACAGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTTGGTTCATGCCTAGGTCCTCAGCCTCTTGAAACTCTAGGCCACAGG 350
seq1 GAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAGGCCCTTGCTTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAGGCCCTTGCTTG 400
seq1 AGCCCCTTCTCCTCGTTCCTCATCTGCCTGTGAACACCTTTGGATGTGTA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCCCCTTCTCCTCGTTCCTCATCTGCCTGTGAACACCTTTGGATGTGTA 450
seq1 TCCTGTGTGTGATGGGTAGCTGTGACCTGAGTCTCTGTTGTGTAACCCCT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCTGTGTGTGATGGGTAGCTGTGACCTGAGTCTCTGTTGTGTAACCCCT 500
seq1 TTCCTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAAGAGTTTCTCTGTGTA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCTTTTTTGTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAAGAGTTTCTCTGTGTA 550
seq1 GCCCTGGCTGTCCCGGAACTCATTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCCTGGCTGTCCCGGAACTCATTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTC 600
seq1 AGAGATCCGTCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGATCCGTCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGC 650
seq1 CACCACTGTCCAGCTGTATAACCCCTTTCCACTCAAGGGGTCTTCATGTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACCACTGTCCAGCTGTATAACCCCTTTCCACTCAAGGGGTCTTCATGTT 700
seq1 CTGCACCCAGTGGCAGGGCTCTGGACTCCTCCCGCCCTGTTTTAGCAGTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGCACCCAGTGGCAGGGCTCTGGACTCCTCCCGCCCTGTTTTAGCAGTG 750
seq1 AAAGAATTC 759
|||||||||
seq2 AAAGAATTC 759
| seq1: chr11_6395041_6395266
seq2: B6Ng01-186E19.g_69_294
seq1 ATAAAACTATAAAGAACTGGGCATGGTGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAAAACTATAAAGAACTGGGCATGGTGGCGCATGCCTTTAATCCCAGCG 50
seq1 GGCGGATTTCTGTGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCTAGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCGGATTTCTGTGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCTAGG 100
seq1 ACAGCCTGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAAACCAAAACCAAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGCCTGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAAACCAAAACCAAA 150
seq1 CCAGAAGAACAAAACAAAAAACTATAAAGAGAGAAGGAATATGTTTGTGG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGAAGAACAAAACAAAAAACTATAAAGAGAGAAGGAATATGTTTGTGG 200
seq1 AGGTGTAGTCAGGTATGTGGGAAGGG 226
||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTGTAGTCAGGTATGTGGGAAGGG 226
|