BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-195F15
Chromosome11 (Build37)
Map Location 63,779,918 - 63,846,020
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCox10
Upstream geneCdrt4, Tekt3, Pmp22, LOC433423, LOC100042799, LOC100041690, LOC654442, LOC668297, Hs3st3b1
Downstream gene2810001G20Rik, EG544785, Hs3st3a1, LOC626959, Elac2, AU040829
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-195F15.bB6Ng01-195F15.g
ACCGA017799GA017800
length1,1171,092
definitionB6Ng01-195F15.b B6Ng01-195F15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,844,912 - 63,846,020)(63,779,918 - 63,781,008)
sequence
gaattcttactttctaaacatggtgtaggttagtatgataaaaagaattc
aggttggcttttagtaattcattgatgaaaaaaggtgtgccattggtggt
gtgctagaaaacatctcagttgcctgtagcgagtgacattaaagtcacac
catctacctggcaagtatgctgggtaaagttatctagtgaaattagaggt
tatatgggaaataccttaaaaagtacttttaagttatgctatctaaggat
tactgtggggtcacacaaagctatttctaggatagtttagttgccgtttt
aaattaaggtccctttcaattgatatttatacgcacacacactaagttag
ggtaggatttagcttattctggttttcagcctgttatgttctgaggtcac
attactcttggcttaattacattttgtgttatgacatatctgaatgcctc
tctgcctgtgcacccctgtggctggagagctggcttcagttatttcacaa
gtagacactcagggaatagctggacagcatgagaagtggtcagcagagga
agtgcattccagttaaggaagcataacttcaactcatcaagactgccatg
ttaaaatgaaattacttatttcagaaagtctctaactcctgcctgtccta
gaactcactatgtagaccaagttggccttgaactcaaagagatcctcctg
cctctgcttcccaggtgctagaattaaaggtgagtgcaaatctttgtagt
cttctctaaaaggttaacattgggatgattataaagcattttgaagatta
ttctttactaactggaatgccaaaatgattttagcggtaacactatgcgg
tgcacgcatgctcagtgggagtgtatccaaagctccgtgtaatgtcccag
caactgttctcagaacctttgaaactggatgatagatggtcaggaagcca
ggtgtttggtttttgccgtctagcacagccattgtctacagctcagcttc
agcccatccttcaaaccttgcccagataccttcttcccaagttgctgtcc
cttgagctgtcattgctcagcccaaaaactcgggggttactgatgacttc
tgaatccttctcaagcc

gaattctccatgtagcccagggtggcctcaaacttaaagcaatcctcctg
ccgtagcctcctgagtgccaggattactactagcacatgacactaggacc
agcttcttttaaagaagcttcctcattttcttagacctacctgggagaaa
caccagctttcccccctttaatcacagcagtgatctagggaacagctgtg
catctgtgggagtgggtcttcaggacagtgactttctgaggctctgctgc
tcagcggtggctaccccagagcacaagaatgcccttacttattatgtgtg
tgagagagaaacgcatccacagtgcttgtgtgaagagcagagagaatgct
ggcccgaccacagacctgctctcagcgctgtcttcctagtgacacttggt
gagatttttcagttctcttcaaaactatttattattcctacaagaaacag
atgtggggtgggggctccctcatttctacctctgcccaagtccagaaatg
ctcttctgtcactattgacaaaggaagctcagcaattcagccacatagta
ccttcccagaagggtggggactgtaaataggagcactagccctcggcaag
tactcttgccacgataattcctttggggatgcctggtgggtacctgctac
ccttactgaagcccatccactggcattcagcatccacacaaagtcttagt
aaggataaaaaccccactgtggtgaaagctggggttgggtttggcccaac
aggctcctctctaaatgtgggccatgaagctcgcctgctccatggctggc
cacagttgtgatgtcaggattggacagctgaggaagctggtggaagcgga
gctgtcccagagctccagggtcacagaccttaaagcttgttttttttgag
gactaccatgtgtgggtcagccctcagtgtcatagacttctatggaagag
atcagacaaagggtagcagaagtggactattttattcaaccatacaggag
aagacagcaccatgaccagtcctctggaagaatagacacagtgggcattt
ccaggtagatagagtctttgcaggacttagaatactgaggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_63844912_63846020
seq2: B6Ng01-195F15.b_45_1161 (reverse)

seq1  GGCTTGAGAAG--ATCAGAAGTCATCAGTAACCCCCGAGTTTTTGGCCTG  48
      |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGCTTGAGAAGGATTCAGAAGTCATCAGTAACCCCCGAGTTTTTGGGCTG  50

seq1  AGCAAATGACAGCTCAAGGGACAGCACCT--GGGAGAAGGTATCTGGGC-  95
      ||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| 
seq2  AGC-AATGACAGCTCAAGGGACAGCAACTTGGGAAGAAGGTATCTGGGCA  99

seq1  AGGTTTG-AGGATGGGCTGAGGCTGAGCTGTAGAC-ATGGCTGTGCTAGA  143
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGGTTTGAAGGATGGGCTGAAGCTGAGCTGTAGACAATGGCTGTGCTAGA  149

seq1  CGGC-AAAACCAAACACCTGGCTTCCTGACCATCTATCATCCAGTTTCAA  192
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAAAAACCAAACACCTGGCTTCCTGACCATCTATCATCCAGTTTCAA  199

seq1  AGGTTCTGAGAACAGTTGCTGGGACATTACACGGAGCTTTGGATACACTC  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTGAGAACAGTTGCTGGGACATTACACGGAGCTTTGGATACACTC  249

seq1  CCACTGAGCATGCGTGCACCGCATAGTGTTACCGCT-AAATCATTTTGGC  291
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCACTGAGCATGCGTGCACCGCATAGTGTTACCGCTAAAATCATTTTGGC  299

seq1  ATTCCAGTTAGTAAAGAATAATCTTCAAAATGCTTTATAATCATCCCAAT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAGTTAGTAAAGAATAATCTTCAAAATGCTTTATAATCATCCCAAT  349

seq1  GTTAACCTTTTAGAGAAGACTACAAAGATTTGCACTCACCTTTAATTCTA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACCTTTTAGAGAAGACTACAAAGATTTGCACTCACCTTTAATTCTA  399

seq1  GCACCTGGGAAGCAGAGGCAGGAGGATCTCTTTGAGTTCAAGGCCAACTT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTGGGAAGCAGAGGCAGGAGGATCTCTTTGAGTTCAAGGCCAACTT  449

seq1  GGTCTACATAGTGAGTTCTAGGACAGGCAGGAGTTAGAGACTTTCTGAAA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTACATAGTGAGTTCTAGGACAGGCAGGAGTTAGAGACTTTCTGAAA  499

seq1  TAAGTAATTTCATTTTAACATGGCAGTCTTGATGAGTTGAAGTTATGCTT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAATTTCATTTTAACATGGCAGTCTTGATGAGTTGAAGTTATGCTT  549

seq1  CCTTAACTGGAATGCACTTCCTCTGCTGACCACTTCTCATGCTGTCCAGC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACTGGAATGCACTTCCTCTGCTGACCACTTCTCATGCTGTCCAGC  599

seq1  TATTCCCTGAGTGTCTACTTGTGAAATAACTGAAGCCAGCTCTCCAGCCA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCCTGAGTGTCTACTTGTGAAATAACTGAAGCCAGCTCTCCAGCCA  649

seq1  CAGGGGTGCACAGGCAGAGAGGCATTCAGATATGTCATAACACAAAATGT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGTGCACAGGCAGAGAGGCATTCAGATATGTCATAACACAAAATGT  699

seq1  AATTAAGCCAAGAGTAATGTGACCTCAGAACATAACAGGCTGAAAACCAG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAGCCAAGAGTAATGTGACCTCAGAACATAACAGGCTGAAAACCAG  749

seq1  AATAAGCTAAATCCTACCCTAACTTAGTGTGTGTGCGTATAAATATCAAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGCTAAATCCTACCCTAACTTAGTGTGTGTGCGTATAAATATCAAT  799

seq1  TGAAAGGGACCTTAATTTAAAACGGCAACTAAACTATCCTAGAAATAGCT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGGGACCTTAATTTAAAACGGCAACTAAACTATCCTAGAAATAGCT  849

seq1  TTGTGTGACCCCACAGTAATCCTTAGATAGCATAACTTAAAAGTACTTTT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGACCCCACAGTAATCCTTAGATAGCATAACTTAAAAGTACTTTT  899

seq1  TAAGGTATTTCCCATATAACCTCTAATTTCACTAGATAACTTTACCCAGC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTATTTCCCATATAACCTCTAATTTCACTAGATAACTTTACCCAGC  949

seq1  ATACTTGCCAGGTAGATGGTGTGACTTTAATGTCACTCGCTACAGGCAAC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGCCAGGTAGATGGTGTGACTTTAATGTCACTCGCTACAGGCAAC  999

seq1  TGAGATGTTTTCTAGCACACCACCAATGGCACACCTTTTTTCATCAATGA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGTTTTCTAGCACACCACCAATGGCACACCTTTTTTCATCAATGA  1049

seq1  ATTACTAAAAGCCAACCTGAATTCTTTTTATCATACTAACCTACACCATG  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTAAAAGCCAACCTGAATTCTTTTTATCATACTAACCTACACCATG  1099

seq1  TTTAGAAAGTAAGAATTC  1109
      ||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAAGTAAGAATTC  1117


seq1: chr11_63779918_63781008
seq2: B6Ng01-195F15.g_64_1155

seq1  GAATTCTCCATGTAGCCCAGGGTGGCCTCAAACTTAAAGCAATCCTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATGTAGCCCAGGGTGGCCTCAAACTTAAAGCAATCCTCCTG  50

seq1  CCGTAGCCTCCTGAGTGCCAGGATTACTACTAGCACATGACACTAGGACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTAGCCTCCTGAGTGCCAGGATTACTACTAGCACATGACACTAGGACC  100

seq1  AGCTTCTTTTAAAGAAGCTTCCTCATTTTCTTAGACCTACCTGGGAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTTTTAAAGAAGCTTCCTCATTTTCTTAGACCTACCTGGGAGAAA  150

seq1  CACCAGCTTTCCCCCCTTTAATCACAGCAGTGATCTAGGGAACAGCTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGCTTTCCCCCCTTTAATCACAGCAGTGATCTAGGGAACAGCTGTG  200

seq1  CATCTGTGGGAGTGGGTCTTCAGGACAGTGACTTTCTGAGGCTCTGCTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTGGGAGTGGGTCTTCAGGACAGTGACTTTCTGAGGCTCTGCTGC  250

seq1  TCAGCGGTGGCTACCCCAGAGCACAAGAATGCCCTTACTTATTATGTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCGGTGGCTACCCCAGAGCACAAGAATGCCCTTACTTATTATGTGTG  300

seq1  TGAGAGAGAAACGCATCCACAGTGCTTGTGTGAAGAGCAGAGAGAATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAGAAACGCATCCACAGTGCTTGTGTGAAGAGCAGAGAGAATGCT  350

seq1  GGCCCGACCACAGACCTGCTCTCAGCGCTGTCTTCCTAGTGACACTTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCGACCACAGACCTGCTCTCAGCGCTGTCTTCCTAGTGACACTTGGT  400

seq1  GAGATTTTTCAGTTCTCTTCAAAACTATTTATTATTCCTACAAGAAACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTTTTCAGTTCTCTTCAAAACTATTTATTATTCCTACAAGAAACAG  450

seq1  ATGTGGGGTGGGGGCTCCCTCATTTCTACCTCTGCCCAAGTCCAGAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGGGTGGGGGCTCCCTCATTTCTACCTCTGCCCAAGTCCAGAAATG  500

seq1  CTCTTCTGTCACTATTGACAAAGGAAGCTCAGCAATTCAGCCACATAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTGTCACTATTGACAAAGGAAGCTCAGCAATTCAGCCACATAGTA  550

seq1  CCTTCCCAGAAGGGTGGGGACTGTAAATAGGAGCACTAGCCCTCGGCAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCAGAAGGGTGGGGACTGTAAATAGGAGCACTAGCCCTCGGCAAG  600

seq1  TACTCTTGCCACGATAATTCCTTTGGGGATGCCTGGTGGGTACCTGCTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTTGCCACGATAATTCCTTTGGGGATGCCTGGTGGGTACCTGCTAC  650

seq1  CCTTACTGAAGCCCATCCACTGGCATTCAGCATCCACACAAAGTCTTAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACTGAAGCCCATCCACTGGCATTCAGCATCCACACAAAGTCTTAGT  700

seq1  AAGGATAAAAACCCCACTGTGGTGAAAGCTGGGGTTGGGTTTGGCCCAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATAAAAACCCCACTGTGGTGAAAGCTGGGGTTGGGTTTGGCCCAAC  750

seq1  AGGCTCCTCTCTAAATGTGGGCCATGAAGCTCGCCTGCTCCATGGCTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCTCTCTAAATGTGGGCCATGAAGCTCGCCTGCTCCATGGCTGGC  800

seq1  CACAGTTGTGATGTCAGGATTGGACAGCTGAGGAAGCTGGTGGAAGCGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTGTGATGTCAGGATTGGACAGCTGAGGAAGCTGGTGGAAGCGGA  850

seq1  GCTGTCCCAGAGCTCCAGGGTCACAGACCTTAAAGCT--GTTTTTTTGAG  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
seq2  GCTGTCCCAGAGCTCCAGGGTCACAGACCTTAAAGCTTGTTTTTTTTGAG  900

seq1  GACTAACATGTGT-GGTCAG-CCTCAGTGCAATAGACTTCTATGG-AGAG  945
      ||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||
seq2  GACTACCATGTGTGGGTCAGCCCTCAGTGTCATAGACTTCTATGGAAGAG  950

seq1  A-CAGACAAAGGGAAGCAGGAAGTGGACTAATTTA-TCAACCATACAGGA  993
      | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  ATCAGACAAAGGGTAGCA-GAAGTGGACTATTTTATTCAACCATACAGGA  999

seq1  G-AGACAAGGCCACATGACAAGTCCTCTGGA--GATAGGAACACCAGTGG  1040
      | |||||  ||  |||||| |||||||||||   ||||  ||| ||||||
seq2  GAAGACA--GCACCATGACCAGTCCTCTGGAAGAATAG--ACA-CAGTGG  1044

seq1  GCATTCCCAGAGT--ATAGAGTTCTTTGCGAGGGACTTAGGAATACTGAG  1088
      ||||| |||| ||  |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||
seq2  GCATTTCCAG-GTAGATAGAG-TCTTTGC--AGGACTTA-GAATACTGAG  1089

seq1  GAG  1091
      |||
seq2  GAG  1092


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |