BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-199C18
Chromosome11 (Build37)
Map Location 57,425,584 - 57,587,542
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalnt10
Upstream geneGria1, LOC667878, 1810073G14Rik, Mfap3
Downstream geneSap30l, Hand1, LOC624605, Larp1, LOC676527, LOC667947, Cnot8, Gemin5, Mrpl22, Irgb10, Igtp, LOC263305, LOC100041816, EG668249, 4930438A08Rik, Zfp692, Zfp672, 1700047K16Rik, Sh3bp5l, 2210415F13Rik, LOC624814, 1810065E05Rik, OTTMUSG00000005737, 4930504O13Rik, Olfr30, Olfr333-ps1, Olfr332, Olfr331, Olfr330, Olfr329, Olfr328, Olfr327-ps1, Olfr325, Olfr324, 2210407C18Rik, Olfr323, Trim58, Olfr216, OTTMUSG00000005755, Olfr320, LOC668058, Olfr319, Olfr318, Olfr317, Olfr316
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-199C18.bB6Ng01-199C18.g
ACCGA020575GA020576
length1,1621,163
definitionB6Ng01-199C18.b B6Ng01-199C18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,425,584 - 57,426,705)(57,586,392 - 57,587,542)
sequence
gaattctctatcatcgacttcataagctcgaatggtaggtcaggtagatg
gctacgactgatgagggttattatatgaactttgttcctgatgcttacac
agcatttcccagcccagggatggttttctcagtgacactcttggagagga
ccaatgctcagaccccggatatcagaaatgtgtgctatagtaagctgcta
agttcatgatggacttgttaaagggtgatttttaaaaagtggggctcgcc
gggcatggtggcacatgcctttaatcccagcacttgggaggcagaggcag
gcagatttctgagttcgaggccagcctggtctacagagtgagttacagga
cagccagagctacacagagaaaccctgcctcgaaaaaccaaaaaaaaaaa
aaaaaaatagtggggctggcaatgtgactctgtggtagactgcatgtgta
gcttgtacaagactctagttttcaacatacataccacacacacacataaa
tatatgcacacatatacatagcacacacatatgcatagatacacagacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaccata
cacaccacacacagcaatagaaaggaaacacattgatgagcgccttgtca
aactcctaaagcccttgacatctaaaacagactatgatacacacaggcag
tcaaagatatttgtcgagttaattaacgcagcacagtaaatggcatcaaa
atcttttgactcagacattttgatcctctttcctttttcttctctcagtc
acaggctgacggccctggcactcacagccctctgctctctggaggccacg
agggatgctttctgttatgatgattgactgtggtactgctcaaatgaact
ctgtggttaaaatagcaggtcactggattgttaaattgttactgctatcc
gaatccagccatttccctttcaccctgatgagtgctgtcagctaagcacc
ctcaaggcagagcaaagcaccccagcctcacaactctgtggaatcactga
taaagaatgccaaagaatggcttggtaatggcctttgaagtgaacacctg
acccttgggttacacagcctgcattgagtctctctttcacagaactgaga
cctctccaggtc
cagcttccttcctcattctccagtgtggcttcattagcaagtcttttgta
aataaactgaaccggaggactaaaacaaaaacaacacccccatcatttat
tctgccgcgactgtctgatgagggacattagatgcgttttttgaaatgta
tggaataacatgaaatccccgtgggctcagagatcccttggtgaatgacg
ccctgtctgctggtctcctcctccgcagctctggagaacaagttactgcg
gggcggggaagcagctctggcgaccacacagttggcccgggccacccatg
tccagctacaaatttcatgcagcgccgtccttgccaggcaatccttcagg
tgctggggatgtagccatgagtgagccacagacagatcctagatctactg
cagtggagtacctagcaacacttcgctatgcagatgggcctgctgctggg
gacaaacctggaacaatgcgtcatgaggtgtctggtggatggattggcgg
cttcactacactgatggaatgcagcctttgccaagctagattacaagggc
cggggagactgagccaacagacaagacctctgtgctatggctcacaaaac
ctgcatccatggcagacactgtcgcttctcagtctatacatagagcagcc
tcaggatgcacagccactcaacaggctatagaatgtcgattttggagctg
gcaagcttggggtcaggccctgtccctgtcactgcagaccgtgcagtttg
aagtgagtgtaacatgagcatgaccctcacaggtctgactcgtgtgaaag
ggctgctgtggcatccctggtttaccctatgagggttggagctgtgcagt
tacagagcatctgtctgtcccagtggactgggtgccgaatcttttgttaa
gtactctgggcattatccctttgataccaaacactagttgtgtttgggaa
ggctgtccttctcaaaggggagagcatcaaagacttggcggttcatagaa
gacacagactgcctttctcttatcacacgagaagtgtttgcacaaaattc
ctagaagagcttgttgtagtcccaaggttctgaactacatcgcttgatct
gttagacaatgcgaactctgaataccttgaatacgatatgttttttagaa
ctcctataattct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_57425584_57426705
seq2: B6Ng01-199C18.b_46_1207

seq1  GAATTCTCTATCATCGACTTCATAAGCTCGAATGGTAGGTCAGGTAGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATCATCGACTTCATAAGCTCGAATGGTAGGTCAGGTAGATG  50

seq1  GCTACGACTGATGAGGGTTATTATATGAACTTTGTTCCTGATGCTTACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACGACTGATGAGGGTTATTATATGAACTTTGTTCCTGATGCTTACAC  100

seq1  AGCATTTCCCAGCCCAGGGATGGTTTTCTCAGTGACACTCTTGGAGAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTCCCAGCCCAGGGATGGTTTTCTCAGTGACACTCTTGGAGAGGA  150

seq1  CCAATGCTCAGACCCCGGATATCAGAAATGTGTGCTATAGTAAGCTGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTCAGACCCCGGATATCAGAAATGTGTGCTATAGTAAGCTGCTA  200

seq1  AGTTCATGATGGACTTGTTAAAGGGTGATTTTTAAAAAGTGGGGCTCGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATGATGGACTTGTTAAAGGGTGATTTTTAAAAAGTGGGGCTCGCC  250

seq1  GGGCATGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAG  300

seq1  GCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTACAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTACAGGA  350

seq1  CAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGCCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGAGCTACACAGAGAAACCCTGCCTCGAAAAACCAAAAAAAAAAA  400

seq1  AAAAAAATAGTGGGGCTGGCAATGTGACTCTGTGGTAGACTGCATGTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATAGTGGGGCTGGCAATGTGACTCTGTGGTAGACTGCATGTGTA  450

seq1  GCTTGTACAAGACTCTAGTTTTCAACATACATACCACACACACACATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTACAAGACTCTAGTTTTCAACATACATACCACACACACACATAAA  500

seq1  TATATGCACACATATACATAGCACACACATATGCATAGATACACAGACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCACACATATACATAGCACACACATATGCATAGATACACAGACAC  550

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCATA  600

seq1  CACACCACACACAGCAATAGAAAGGAAACACATTGATGAGCGCCTTGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCACACACAGCAATAGAAAGGAAACACATTGATGAGCGCCTTGTCA  650

seq1  AACTCCT-AAGCCCTTGACATCTAAAACAGACTATGATACACACAGGCAG  699
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTAAAGCCCTTGACATCTAAAACAGACTATGATACACACAGGCAG  700

seq1  TCAAAGATATTTGTCGAGTTAATTAACGCAGCACAGT-AATGGCATC-AA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  TCAAAGATATTTGTCGAGTTAATTAACGCAGCACAGTAAATGGCATCAAA  750

seq1  ATCTTTTGACTCAGACATTTTGATCCTCTTTCCTTTTCTTTCTCTCAGTC  797
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  ATCTTTTGACTCAGACATTTTGATCCTCTTTCCTTTTTCTTCTCTCAGTC  800

seq1  ACAGGCTGACGGCCCTGGCACTCACAGCCCTCTGCTCTCTGGAGGCCACG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCTGACGGCCCTGGCACTCACAGCCCTCTGCTCTCTGGAGGCCACG  850

seq1  AGGGATGCTTTCTGTTATGATGA-TGACTGTGGTACTGCTCAAATGAACT  896
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGCTTTCTGTTATGATGATTGACTGTGGTACTGCTCAAATGAACT  900

seq1  CTGTGGTT-AAATAGCAGGTCACTGG-TTG-TAAATTGTTACTGCTAT-C  942
      |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
seq2  CTGTGGTTAAAATAGCAGGTCACTGGATTGTTAAATTGTTACTGCTATCC  950

seq1  GA--TCAGCCATT--CCCTTCA-CCTGATGAGTGCTGTCAGC-AAGCACC  986
      ||   ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAATCCAGCCATTTCCCTTTCACCCTGATGAGTGCTGTCAGCTAAGCACC  1000

seq1  --CCAGGCAGAGCAAGCAACCCCAG-CTCACA--TCTGTG--ATCACTG-  1028
        | |||||||||||   ||||||| ||||||  ||||||  ||||||| 
seq2  CTCAAGGCAGAGCAAAGCACCCCAGCCTCACAACTCTGTGGAATCACTGA  1050

seq1  TAGAG-ATG-CAGAG-ATGGCTGGG--ATGGCCTTTG-AGTG-ACA-CTG  1070
      || || ||| || || |||||| ||  |||||||||| |||| ||| |||
seq2  TAAAGAATGCCAAAGAATGGCTTGGTAATGGCCTTTGAAGTGAACACCTG  1100

seq1  ACCCTTGGTT---ACAGCCTGCA-TGAG-GTCTCTTTCACAG-ACTGA--  1112
      |||||||| |   |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||  
seq2  ACCCTTGGGTTACACAGCCTGCATTGAGTCTCTCTTTCACAGAACTGAGA  1150

seq1  -CTCT-CAGGTC  1122
       |||| ||||||
seq2  CCTCTCCAGGTC  1162

seq1: chr11_57586392_57587542
seq2: B6Ng01-199C18.g_77_1239 (reverse)

seq1  AGAAT--TAAGAGTCCTAAAAAACATTATCGTTATCAAGTTATCAAGATG  48
      |||||  || |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||  ||| |
seq2  AGAATTATAGGAGTTCTAAAAAACA-TATCGTATTCAAGGTATTCAGA-G  48

seq1  TCGGCATTGTCT-ACAGGACCAGCCGTGTAGTTCAG-ACCTTGGGACTAC  96
      |  ||||||||| ||||  | |||  |||||||||| |||||||||||||
seq2  TTCGCATTGTCTAACAGATCAAGCGATGTAGTTCAGAACCTTGGGACTAC  98

seq1  AAACAAGCTC-TCTA-GAATTCTGTGCAAACACTTCTCCGGTGTGAT-AG  143
       ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||
seq2  -AACAAGCTCTTCTAGGAATTTTGTGCAAACACTTCTC--GTGTGATAAG  145

seq1  AG-AGGGCAGTCTGTGTC-TCTATGAACCGCCAAGTCTTTGATGCTCTCC  191
      || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGCAGTCTGTGTCTTCTATGAACCGCCAAGTCTTTGATGCTCTCC  195

seq1  CCTTTGAG-AGGACAGCC-TCCCAAACACAACTAGTG-TTGGTATC-AAG  237
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  CCTTTGAGAAGGACAGCCTTCCCAAACACAACTAGTGTTTGGTATCAAAG  245

seq1  GGATAATGCCCAGAGTACTTAACAAAAGATTCGGCA-CCAGTCCACTGGG  286
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGATAATGCCCAGAGTACTTAACAAAAGATTCGGCACCCAGTCCACTGGG  295

seq1  ACAGACAGATGCTCTGTAACTGCACAGCTCCAACCCTCATAGGGT-AACC  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACAGACAGATGCTCTGTAACTGCACAGCTCCAACCCTCATAGGGTAAACC  345

seq1  A-GGATGCCACAGCAGCCC-TTCACACGAGTCAGACCTGTGAGGGTCATG  383
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGCCACAGCAGCCCTTTCACACGAGTCAGACCTGTGAGGGTCATG  395

seq1  CTCATGTTACACTCACTTCAAACTGCACGGTCTGCAGTGACAGGGACAGG  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGTTACACTCACTTCAAACTGCACGGTCTGCAGTGACAGGGACAGG  445

seq1  GCCTGACCCCAAGCTTGCCAGCTCCAAAATCGACATTCTATAGCCTGTTG  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGACCCCAAGCTTGCCAGCTCCAAAATCGACATTCTATAGCCTGTTG  495

seq1  AGTGGCTGTGCATCCTGAGGCTGCTCTATGTATAGACTGAGAAGCGACAG  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCTGTGCATCCTGAGGCTGCTCTATGTATAGACTGAGAAGCGACAG  545

seq1  TGTCTGCCATGGATGCAGGTTTTGTGAGCCATAGCACAGAGGTCTTGTCT  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCCATGGATGCAGGTTTTGTGAGCCATAGCACAGAGGTCTTGTCT  595

seq1  GTTGGCTCAGTCTCCCCGGCCCTTGTAATCTAGCTTGGCAAAGGCTGCAT  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCTCAGTCTCCCCGGCCCTTGTAATCTAGCTTGGCAAAGGCTGCAT  645

seq1  TCCATCAGTGTAGTGAAGCCGCCAATCCATCCACCAGACACCTCATGACG  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCAGTGTAGTGAAGCCGCCAATCCATCCACCAGACACCTCATGACG  695

seq1  CATTGTTCCAGGTTTGTCCCCAGCAGCAGGCCCATCTGCATAGCGAAGTG  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTCCAGGTTTGTCCCCAGCAGCAGGCCCATCTGCATAGCGAAGTG  745

seq1  TTGCTAGGTACTCCACTGCAGTAGATCTAGGATCTGTCTGTGGCTCACTC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAGGTACTCCACTGCAGTAGATCTAGGATCTGTCTGTGGCTCACTC  795

seq1  ATGGCTACATCCCCAGCACCTGAAGGATTGCCTGGCAAGGACGGCGCTGC  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTACATCCCCAGCACCTGAAGGATTGCCTGGCAAGGACGGCGCTGC  845

seq1  ATGAAATTTGTAGCTGGACATGGGTGGCCCGGGCCAACTGTGTGGTCGCC  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATTTGTAGCTGGACATGGGTGGCCCGGGCCAACTGTGTGGTCGCC  895

seq1  AGAGCTGCTTCCCCGCCCCGCAGTAACTTGTTCTCCAGAGCTGCGGAGGA  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGCTTCCCCGCCCCGCAGTAACTTGTTCTCCAGAGCTGCGGAGGA  945

seq1  GGAGACCAGCAGACAGGGCGTCATTCACCAAGGGATCTCTGAGCCCACGG  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACCAGCAGACAGGGCGTCATTCACCAAGGGATCTCTGAGCCCACGG  995

seq1  GGATTTCATGTTATTCCATACATTTCAAAAAACGCATCTAATGTCCCTCA  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCATGTTATTCCATACATTTCAAAAAACGCATCTAATGTCCCTCA  1045

seq1  TCAGACAGTCGCGGCAGAATAAATGATGGGGGTGTTGTTTTTGTTTTAGT  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACAGTCGCGGCAGAATAAATGATGGGGGTGTTGTTTTTGTTTTAGT  1095

seq1  CCTCCGGTTCAGTTTATTTACAAAAGACTTGCTAATGAAGCCACACTGGA  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCGGTTCAGTTTATTTACAAAAGACTTGCTAATGAAGCCACACTGGA  1145

seq1  GAATGAGGAAGGAAGCTG  1151
      ||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGGAAGGAAGCTG  1163