seq1: chr11_6603971_6604264
seq2: B6Ng01-202G21.b_48_341 (reverse)
seq1 CCCCCCCCCCCGCAAAGGCTGGGATCCTGTGCACCATGCACTCTGATGGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCCCCCCCCGCAAAGGCTGGGATCCTGTGCACCATGCACTCTGATGGA 50
seq1 GACACACCAGCAAGCAGTGCAAAAACTCAGCGCATCTATTATATGCAGCA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACACACCAGCAAGCAGTGCAAAAACTCAGCGCATCTATTATATGCAGCA 100
seq1 TAGTGAGGAGGTGGGCTAGCTGATCTCTGTAGGGGAGAAGTCTCAGGCTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTGAGGAGGTGGGCTAGCTGATCTCTGTAGGGGAGAAGTCTCAGGCTG 150
seq1 CAGTCACTTCCTGGAGGAGGAAGTCCCTGAGCCTGACCTAGGGAAGGCCT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGTCACTTCCTGGAGGAGGAAGTCCCTGAGCCTGACCTAGGGAAGGCCT 200
seq1 CGCCATTCCCATAGATCCTCGACATAGCTGTGCCTTCGTCAACTATACAC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGCCATTCCCATAGATCCTCGACATAGCTGTGCCTTCGTCAACTATACAC 250
seq1 ATTCACTCGGGACTTTGTCCTCTTCCCATCCCTACTCAGCACAG 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTCACTCGGGACTTTGTCCTCTTCCCATCCCTACTCAGCACAG 294
| seq1: chr11_6486587_6487697
seq2: B6Ng01-202G21.g_67_1181
seq1 GAATTCACTCTGAGGTCCAGGGTAGCCTTGAACTTACAACAGTTCTGCCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCACTCTGAGGTCCAGGGTAGCCTTGAACTTACAACAGTTCTGCCT 50
seq1 CAGCTTTCTGAGTAATGGAATTACACAAGTGAGCTTTTTAAAAGTGGAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCTTTCTGAGTAATGGAATTACACAAGTGAGCTTTTTAAAAGTGGAAA 100
seq1 AGGCTTGTTTGGCTCTTGGCTAATGAGGTTCCAGACCAAGAGACCGTTGC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGCTTGTTTGGCTCTTGGCTAATGAGGTTCCAGACCAAGAGACCGTTGC 150
seq1 TTCTAGGCTCGGTGCAGGTAGGAATTGTATGGCAGAGCATAGCTGCTTGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTAGGCTCGGTGCAGGTAGGAATTGTATGGCAGAGCATAGCTGCTTGC 200
seq1 TTCACAGCCAGAAAGCCCAAAAATAGGAACAGGGTTGGGCCCCATGGTTT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCACAGCCAGAAAGCCCAAAAATAGGAACAGGGTTGGGCCCCATGGTTT 250
seq1 CTTTTGATAGCATGCCCCTGTGACCAAAGCACTTCCTAATTTTTTTCTCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTTGATAGCATGCCCCTGTGACCAAAGCACTTCCTAATTTTTTTCTCA 300
seq1 CTTCCTGGTAGCACCACCTGGAGGCCAAGTCTTTGTCACTTACTTAGCAT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCCTGGTAGCACCACCTGGAGGCCAAGTCTTTGTCACTTACTTAGCAT 350
seq1 CCAAGTCAGAGTGTTTTGTTTTTTTTCTCAGGGTTGAGTGAGTCTGTCTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAAGTCAGAGTGTTTTGTTTTTTTTCTCAGGGTTGAGTGAGTCTGTCTG 400
seq1 TTTGATGCTAGGCATTGAATTAGGTTAAGCAGTACGAAATTGTCACTATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGATGCTAGGCATTGAATTAGGTTAAGCAGTACGAAATTGTCACTATT 450
seq1 TTAATCTGTAAAAATGTCAGTTTAACATGACTCAAACTAGTACAAAGTAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAATCTGTAAAAATGTCAGTTTAACATGACTCAAACTAGTACAAAGTAT 500
seq1 CTGACATGAACTACCTCAGTTAGCAACTATAATATACCTAAGAGGCGTCC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGACATGAACTACCTCAGTTAGCAACTATAATATACCTAAGAGGCGTCC 550
seq1 ATGAGTCTCCGCTCACAAGTGGGTGAAGGTAGGTGGTCTTGAACTGGTTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGAGTCTCCGCTCACAAGTGGGTGAAGGTAGGTGGTCTTGAACTGGTTC 600
seq1 CTTCCTGCTTCAGACCCCTGTCCAGCATCACCAAGGTGAGCCTCTGGCTC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCCTGCTTCAGACCCCTGTCCAGCATCACCAAGGTGAGCCTCTGGCTC 650
seq1 TTGACTCTCAGAGAAGAGAGGGAGGAGCCTGGCTCCTGATCAGGTTCCTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGACTCTCAGAGAAGAGAGGGAGGAGCCTGGCTCCTGATCAGGTTCCTG 700
seq1 TGGGTATTTTAAGCTGATAT-GGAGAAGCGTTCCCTATAGTTCTCATGCT 749
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGGTATTTTAAGCTGATATGGGAGAAGCGTTCCCTATAGTTCTCATGCT 750
seq1 GCAGGGATGTTTCTCTGCTTGAATCAGTACAATAAATTGTTAAGGAAGAG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCAGGGATGTTTCTCTGCTTGAATCAGTACAATAAATTGTTAAGGAAGAG 800
seq1 AAAATAGAAATTTCCCTCCATATAAGGAACATTCCAAAACCATGAGACAC 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAATAGAAATTTCCCTCCATATAAGGAACATTCCAAAACCATGAGACAC 850
seq1 AGTGCAGAGAGTCTGCTCCTCTCAGCAGCAGAGAATGCATCTCTGTCCCA 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGCAGAGAGTCTGCTCCTCTCAGCAGCAGAGAATGCATCTCTGTCCCA 900
seq1 GGGCGGCCTCGCTGTGGCAGGAGTGTGTGTGTATCCA-CCCTGATCCGGG 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 GGGCGGCCTCGCTGTGGCAGGAGTGTGTGTGTATCCACCCCTGATCCGGG 950
seq1 CTTCTGGGCACAAGGGCTGGTTTGGGTTTT-GGCTTGTAGTTTCCTCACC 997
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2 CTTCTGGGCACAAGGGCTGGTTTGGGTTTTGGGCTTGTAGTTTCCTCACC 1000
seq1 CAGAGCCAGGCAGATGCATTGGTAAC-GCTCGCTGGGCACCTCCTTGCAT 1046
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
seq2 CAGAGCCA-GCAGATGCATTGGTAACGGCTCGCT-GGCACCTCCTTGCAT 1048
seq1 GAGGCAGGC-ACCTGTGTATCTCTTCTGTCCAGAGGGTTCTA-GTGTTTG 1094
||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||
seq2 GAGGCAGGCAACCTGTGCATCTCTCCGTTCAGGAGGGTTCTAGGTGTTTG 1098
seq1 AGGCAGTCAAGTGTGGA 1111
|| ||||||||||||||
seq2 AGCCAGTCAAGTGTGGA 1115
|