seq1: chr11_8673147_8673594
seq2: B6Ng01-210I05.b_105_242 (reverse)
seq1 ACAAAATAAAGCAAACAAACAGCTACGGAGAAGTTATTCAAAAAGGATGG 50
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seq2 ACAAAATAAAGCAAACAAAC-----CAAAAAA---ATTTAAAAAGAAAAA 42
seq1 ATGCTGCTGAGATTTGGATCAGAGTCCCAAAGGCCAAAGGCCTC--TGGC 98
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seq2 AT------------------AAAAAACCAAAG--CAAAAAACTCAATGGC 72
seq1 ACGGAGAGGTATTGGGACCTTTAGGAACGGGGTCTCGTTGATGAAGGGAA 148
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seq2 TC--------AATGAAACATTAAACAA-----ACAAACAAACAAACAAAA 109
seq1 GGCC-ATCAGGCAATCATTGAAGGGTTTACTGCACACTGTCCTCCTTTCT 197
|| | || || || | || ||||
seq2 AACCAAACACACACACACACA------CAC-ACACA-------------- 138
seq1 CTCTTTGCTTCCTGCTGCCACAATGAGCAGCTCATTTCATCCACGTACTG 247
seq2 -------------------------------------------------- 138
seq1 CACCATGTTGTCCTGCCTCTCCACAGGCTGAAAGCACTTGCTCTTGCAGA 297
seq2 -------------------------------------------------- 138
seq1 GGATCCGGTTTCCTTTCTCAGCCTCCATGTCACGTGGCTTACAAACCACC 347
seq2 -------------------------------------------------- 138
seq1 AATAGCTCTAGGGGATCCTGCACCTTTCTTGCTTCTGTGGGTAGCTGAAT 397
seq2 -------------------------------------------------- 138
seq1 GCACGCGCGCGCGCACGCACACACACAAACACACACACACACACACACAC 447
seq2 -------------------------------------------------- 138
seq1 A 448
seq2 - 138
| seq1: chr12_96023274_96024437
seq2: B6Ng01-210I05.g_67_1233
seq1 GAATTCTTTCAATCTGGAAACAGATTATGACAGTCTTAAATAATCCTGCA 50
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seq2 GAATTCTTTCAATCTGGAAACAGATTATGACAGTCTTAAATAATCCTGCA 50
seq1 TGCTGAAAGACTGAACGCTTTCTTTGTAAAAGCAGTGAGAAAACAAGATA 100
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seq2 TGCTGAAAGACTGAACGCTTTCTTTGTAAAAGCAGTGAGAAAACAAGATA 100
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seq2 TATATTTGCTCTCCTTTTGTTTGAAGCTATGTTGGAAATTGAGCTGCTAA 150
seq1 GCAGAGATGAAAGCGCTACATAATGGAAACAAGTCAACACGTGTCTCACC 200
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seq2 GCAGAGATGAAAGCGCTACATAATGGAAACAAGTCAACACGTGTCTCACC 200
seq1 ACAGAACACATAATGCTGTGTACAGAAAACCTAGGGAATTTACAGAACAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAGAACACATAATGCTGTGTACAGAAAACCTAGGGAATTTACAGAACAG 250
seq1 GATTATCCACATCAATCACTCCAGCACATGCATATCAGATGAGTTTAATA 300
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seq2 GATTATCCACATCAATCACTCCAGCACATGCATATCAGATGAGTTTAATA 300
seq1 TGCAAAGTCTATTTTATTTCTCTACACCAACAACCATAGTGCAAATGTAA 350
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seq2 TGCAAAGTCTATTTTATTTCTCTACACCAACAACCATAGTGCAAATGTAA 350
seq1 GTATAACCACTCTTTTCCCAATATCATCAAAATAATAAAAGTGCTTAAGC 400
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seq2 GTATAACCACTCTTTTCCCAATATCATCAAAATAATAAAAGTGCTTAAGC 400
seq1 ATATAATTAACAGAAAATTATGAACTGTCAAACATCGAAATATGCCAAGT 450
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seq2 ATATAATTAACAGAAAATTATGAACTGTCAAACATCGAAATATGCCAAGT 450
seq1 GTCAATAAAAGTCTCCCCTAAGGAAATCCCAAATAAATAAATAAGTAGGT 500
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seq2 GTCAATAAAAGTCTCCCCTAAGGAAATCCCAAATAAATAAATAAGTAGGT 500
seq1 GTTCTGTATTCATTACTTATAAAAATTAGTATTGTTAAAAATAGCAGAAA 550
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seq2 GTTCTGTATTCATTACTTATAAAAATTAGTATTGTTAAAAATAGCAGAAA 550
seq1 ACCTCAATACAGACTCAAAAGTAATATTTTCCAGGACATGTGTTGCCATT 600
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seq2 ACCTCAATACAGACTCAAAAGTAATATTTTCCAGGACATGTGTTGCCATT 600
seq1 TTTACCAAAATAAAAATCAAGACTAAAACTTAACAATATGTCAAGAAACC 650
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seq2 TTTACCAAAATAAAAATCAAGACTAAAACTTAACAATATGTCAAGAAACC 650
seq1 GAGATTCACAAGTGCAGTTTTATGCAACTGAATATGTAGACGAGAAAGAG 700
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seq2 GAGATTCACAAGTGCAGTTTTATGCAACTGAATATGTAGACGAGAAAGAG 700
seq1 TAGGCCATTACCTCATAGAGTAAGAAACAATTTAATATGAATAAATTACT 750
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seq2 TAGGCCATTACCTCATAGAGTAAGAAACAATTTAATATGAATAAATTACT 750
seq1 TTTTTAAATTATGAGTTAAATTTTTTATATTGTAAATATAAACACATGAA 800
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seq2 TTTTTAAATTATGAGTTAAATTTTTTATATTGTAAATATAAACACATGAA 800
seq1 TAACTGATCTTAAGCAATGATTATTTTAAGATGTGAAAATCAGATTCAGC 850
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seq2 TAACTGATCTTAAGCAATGATTATTTTAAGATGTGAAAATCAGATTCAGC 850
seq1 AAAGAAAGAAACCAAAAATCTACTTTATCATATTTAAAAAAATATTTGAG 900
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seq2 AAAGAAAGAAACCAAAAATCTACTTTATCATATTTAAAAAAATATTTGAG 900
seq1 TTTCATTTGATGAAATTAAAATGTAAAGTAAACCAT-GGACGAATGTGTT 949
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seq2 TTTCATTTGATGAAATTAAAATGTAAAGTAAACCATGGGACGAATGTGTT 950
seq1 TGTAAACCATGAGCATGCT--AAAAAAAATAAACTTTTGAAAAATATGTC 997
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seq2 TGTAAACCATGAGCATGCTAAAAAAAAAATAAACTTTTGAAAAATATGTC 1000
seq1 AAATAACTAAAAAATATTTAAAAATACAAAAAAACATGCCATTCAAAAAC 1047
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seq2 AAATAACT-AAAAATATTTAAAAATACAAAAAAACATGCCATTCAAAAAC 1049
seq1 TAG-ACATTGATTTGAATA--GATGTCTTCCAAGGAAGTTA-TGTAGATG 1093
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seq2 TAGAACATTGA-TTGAATAAGAATGTCT--CA--GGAGTTATTGTAGATG 1094
seq1 ATAATAAGCAGCAGC-GGAGATGCCAG--AAACCATTTGTCACTGGGGAA 1140
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seq2 AT-ATTAGCAGCAGCGGGAGAATGCAGAAAAACCATTGGTCACTGGGG-A 1142
seq1 AGCAAAT-CAAACCACATTTGGGAA 1164
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seq2 GGCAAATCCAAACCACATTGGGGAA 1167
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