BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213L08
Chromosome11 (Build37)
Map Location 16,215,350 - 16,388,307
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC665660, Vstm2
Downstream geneSec61g, Akt2-ps, LOC665689, LOC627583, Egfr, 2810442I21Rik, A630050E13Rik, Plek, 1500041B16Rik, LOC100042644, Ppp3r1, Pno1, AI553587, C1d, LOC382486, EG665748
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213L08.bB6Ng01-213L08.g
ACCGA031156GA031157
length1,1311,009
definitionB6Ng01-213L08.b B6Ng01-213L08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,387,171 - 16,388,307)(16,215,350 - 16,216,350)
sequence
gaattctgatgtaatttaagtgtctagtgtgctcctccgcaatatcctgc
agtagcataaaaagttactggtcattaactaaatacaaactatttactat
tatacaataaacactcaaaaagcagtgtcctacacatcagcaaattacta
tttaatagaaattcatgggttgtcttggcctcaactgctgatattcctga
aggttgtgggatcatttatccacaagcattcacatgacaactagctgacc
tcttgctataggctttctcgccaagtgatctcatttatttaccatatcct
gatatacagatgacaaatttctagaataattaattaaaattacaattatg
ttatcaagtagtgatgtcgcagaatgcagcttccagtatcgtcaactgta
aagtaatccacaagaccagctcatagtgaagagaaagacttgtcttttga
tgggatgaaaaacatgatttacagaaagaaataattgatagcttctttta
ctaatatatttattactgagctcttgaataaaacatgaagaaaggtcaat
atattgacataattcttgtatttataatagttactgatacagtaaaagtt
caggagactggcaaccatataacatagaacttgcatcccatataatggca
gataaaacagacaaaatgtagaacagatgtggataaaatttggatgaata
gctaggagatttgaaatagcaagaagaagatgccagcacgcacatgcaaa
cttataaaggacatagattgtccacagcagaggattgtttcaaacaaaga
cgaattcacataaaaaggtagatactaactggtaatatctaaagctactc
ttcagcatttccagggatgccattttagaaactcagcattgatgtatttc
tccatcctttttttttttttaactttaaaaaatttattaggtattttcct
catttacatttccaatgctatcccaaaagtcccccataccctccccccca
ctccccctacccacccactcccatttcttggccctggcgtttccctgtac
tgaggcatataagtttgcacgaacattgcctcctttccactgatgcggac
taggcatctcctgatacatagtcagttagag
gaattcaacatggcattctgagaaagcatgctccttgcttcagggagaag
ggaccaaagagaccagcttgattagtattcaaattaagtggaagagactg
aagggcgaatatagggcaaattgtgcaatgtcaattactgtggcaatcag
tccctctgatgataatgtggattgcaagattatggcactagattgctttg
tctaacagctctgaagcaatgtttctcagcttgtagtaacgctgccctcc
aaaagacttttgacagtgtctgaagacaatattaatttggaaacaggaag
ttactatcagggtctagtgaatagatgccaagattacagttagtctacac
catacaacccccacatttatccaacctaaatagtcaacagcaatgaagtc
aagaaattctgccccagagaaaactaagaaatagaaattattgagtggag
atcataaatggacaccacaacctcttggcaatagattgaaaaaccgttcc
tcatcttctggagtaatgagtcttagaggactaaggattgagcatgatgt
ttaaggctacagtccgtagtgttggcaacaccaaagaatgtctaaatgtt
acagatgactctagtacaggcagagacaggaaatgacaaaatctgcaggt
gcagaattgggatcagggcttgagctcttggagaacgtctatgaaatgtg
cgttcaaaacatgttaaaattgtctacctacttgccagaggagtctatgg
cctgtagccagttataaatacagaaaaggctggagaattccaagacatgc
agaggctggctgtaatctgatgctagctagtgggtagttgccatcacttg
agttcttcctacagtggtactggtagagctataggtctattctgggtgtg
attcttcacttatagaacattatattaataataaagataacatactctat
ttcctaagaaaatgtcttttgcttaactttcttgccagtcaaatttaaat
tctatatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_16387171_16388307
seq2: B6Ng01-213L08.b_45_1175 (reverse)

seq1  CTCTAACTGCATATGTATCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCAGTGGAAA  50
      |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||
seq2  CTCTAACTGACTATGTATCAGGAGAT-GCCTAGTCCG-CATCAGTGGAAA  48

seq1  GAGAGGGCCATTGGTCGTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACAGGGGAACG  100
      | ||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  G-GAGG--CAATGTTCGTGCAAAC-TTATATGCCTCAGTACAGGGAAACG  94

seq1  CCAGGGCCAAGAAATGGGAGTGGGTGGGTA-GGGGAGTGGGGGGGAGGGT  149
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGCCAAGAAATGGGAGTGGGTGGGTAGGGGGAGTGGGGGGGAGGGT  144

seq1  ATGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAGGAAAATACCTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAGGAAAATACCTA  194

seq1  ATAAAATTTTTTTAAAGTTAAAAAAAAAAAAAGGATGGAGAAATACATCA  249
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAA--TTTTTTAAAGTTAAAAAAAAAAAAAGGATGGAGAAATACATCA  242

seq1  ATGCTGAGTTTCT-AAATGGCATCCCTGGAAATGCTGAAGAGTAGCTTTA  298
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGAGTTTCTAAAATGGCATCCCTGGAAATGCTGAAGAGTAGCTTTA  292

seq1  GATATTACCAGTTAGTATCTACCTTTTTATGTGAATTCGTCTTTGTTTGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTACCAGTTAGTATCTACCTTTTTATGTGAATTCGTCTTTGTTTGA  342

seq1  AACAATCCTCTGCTGTGGACAATCTATGTCCTTTATAAGTTTGCATGTGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCCTCTGCTGTGGACAATCTATGTCCTTTATAAGTTTGCATGTGC  392

seq1  GTGCTGGCATCTTCTTCTTGCTATTTCAAATCTCCTAGCTATTCATCCAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGCATCTTCTTCTTGCTATTTCAAATCTCCTAGCTATTCATCCAA  442

seq1  ATTTTATCCACATCTGTTCTACATTTTGTCTGTTTTATCTGCCATTATAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATCCACATCTGTTCTACATTTTGTCTGTTTTATCTGCCATTATAT  492

seq1  GGGATGCAAGTTCTATGTTATATGGTTGCCAGTCTCCTGAACTTTTACTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGCAAGTTCTATGTTATATGGTTGCCAGTCTCCTGAACTTTTACTG  542

seq1  TATCAGTAACTATTATAAATACAAGAATTATGTCAATATATTGACCTTTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGTAACTATTATAAATACAAGAATTATGTCAATATATTGACCTTTC  592

seq1  TTCATGTTTTATTCAAGAGCTCAGTAATAAATATATTAGTAAAAGAAGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTTTTATTCAAGAGCTCAGTAATAAATATATTAGTAAAAGAAGCT  642

seq1  ATCAATTATTTCTTTCTGTAAATCATGTTTTTCATCCCATCAAAAGACAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATTATTTCTTTCTGTAAATCATGTTTTTCATCCCATCAAAAGACAA  692

seq1  GTCTTTCTCTTCACTATGAGCTGGTCTTGTGGATTACTTTACAGTTGACG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTCTCTTCACTATGAGCTGGTCTTGTGGATTACTTTACAGTTGACG  742

seq1  ATACTGGAAGCTGCATTCTGCGACATCACTACTTGATAACATAATTGTAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGAAGCTGCATTCTGCGACATCACTACTTGATAACATAATTGTAA  792

seq1  TTTTAATTAATTATTCTAGAAATTTGTCATCTGTATATCAGGATATGGTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATTAATTATTCTAGAAATTTGTCATCTGTATATCAGGATATGGTA  842

seq1  AATAAATGAGATCACTTGGCGAGAAAGCCTATAGCAAGAGGTCAGCTAGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATGAGATCACTTGGCGAGAAAGCCTATAGCAAGAGGTCAGCTAGT  892

seq1  TGTCATGTGAATGCTTGTGGATAAATGATCCCACAACCTTCAGGAATATC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATGTGAATGCTTGTGGATAAATGATCCCACAACCTTCAGGAATATC  942

seq1  AGCAGTTGAGGCCAAGACAACCCATGAATTTCTATTAAATAGTAATTTGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTGAGGCCAAGACAACCCATGAATTTCTATTAAATAGTAATTTGC  992

seq1  TGATGTGTAGGACACTGCTTTTTGAGTGTTTATTGTATAATAGTAAATAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGTAGGACACTGCTTTTTGAGTGTTTATTGTATAATAGTAAATAG  1042

seq1  TTTGTATTTAGTTAATGACCAGTAACTTTTTATGCTACTGCAGGATATTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATTTAGTTAATGACCAGTAACTTTTTATGCTACTGCAGGATATTG  1092

seq1  CGGAGGAGCACACTAGACACTTAAATTACATCAGAATTC  1137
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGGAGCACACTAGACACTTAAATTACATCAGAATTC  1131

seq1: chr11_16215350_16216350
seq2: B6Ng01-213L08.g_67_1075

seq1  GAATTCAACATGGCATTCTGAGAAAGCATGCTCCTTGCTTCAGGGAGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACATGGCATTCTGAGAAAGCATGCTCCTTGCTTCAGGGAGAAG  50

seq1  GGACCAAAGAGACCAGCTTGATTAGTATTCAAATTAAGTGGAAGAGACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAAAGAGACCAGCTTGATTAGTATTCAAATTAAGTGGAAGAGACTG  100

seq1  AAGGGCGAATATAGGGCAAATTGTGCAATGTCAATTACTGTGGCAATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCGAATATAGGGCAAATTGTGCAATGTCAATTACTGTGGCAATCAG  150

seq1  TCCCTCTGATGATAATGTGGATTGCAAGATTATGGCACTAGATTGCTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTGATGATAATGTGGATTGCAAGATTATGGCACTAGATTGCTTTG  200

seq1  TCTAACAGCTCTGAAGCAATGTTTCTCAGCTTGTAGTAACGCTGCCCTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACAGCTCTGAAGCAATGTTTCTCAGCTTGTAGTAACGCTGCCCTCC  250

seq1  AAAAGACTTTTGACAGTGTCTGAAGACAATATTAATTTGGAAACAGGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACTTTTGACAGTGTCTGAAGACAATATTAATTTGGAAACAGGAAG  300

seq1  TTACTATCAGGGTCTAGTGAATAGATGCCAAGATTACAGTTAGTCTACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATCAGGGTCTAGTGAATAGATGCCAAGATTACAGTTAGTCTACAC  350

seq1  CATACAACCCCCACATTTATCCAACCTAAATAGTCAACAGCAATGAAGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAACCCCCACATTTATCCAACCTAAATAGTCAACAGCAATGAAGTC  400

seq1  AAGAAATTCTGCCCCAGAGAAAACTAAGAAATAGAAATTATTGAGTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATTCTGCCCCAGAGAAAACTAAGAAATAGAAATTATTGAGTGGAG  450

seq1  ATCATAAATGGACACCACAACCTCTTGGCAATAGATTGAAAAACCGTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAAATGGACACCACAACCTCTTGGCAATAGATTGAAAAACCGTTCC  500

seq1  TCATCTTCTGGAGTAATGAGTCTTAGAGGACTAAGGATTGAGCATGATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTCTGGAGTAATGAGTCTTAGAGGACTAAGGATTGAGCATGATGT  550

seq1  TTAAGGCTACAGTCCGTAGTGTTGGCAACACCAAAGAATGTCTAAATGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCTACAGTCCGTAGTGTTGGCAACACCAAAGAATGTCTAAATGTT  600

seq1  ACAGATGACTCTAGTACAGGCAGAGACAGGAAATGACAAAATCTGCAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGACTCTAGTACAGGCAGAGACAGGAAATGACAAAATCTGCAGGT  650

seq1  GCAGAATTGGGATCAGGGCTTGAGCTCTTGGAGAACGTCTATGAAATGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAATTGGGATCAGGGCTTGAGCTCTTGGAGAACGTCTATGAAATGTG  700

seq1  CGTTCAAAACATGTTAAAATTGTCTACCTACTTGCCAGAGGAGTCTATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCAAAACATGTTAAAATTGTCTACCTACTTGCCAGAGGAGTCTATGG  750

seq1  CCTGTAGCCAGTTATAAATACAGAAAAGGCTGGAGAATTCCAAGACATGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGCCAGTTATAAATACAGAAAAGGCTGGAGAATTCCAAGACATGC  800

seq1  AGAGGCTGGCTGTAATCTGATGCTAGCTAGTGGGTAGTTGCCATCACTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTGGCTGTAATCTGATGCTAGCTAGTGGGTAGTTGCCATCACTTG  850

seq1  AGTTCTTCCTACAGTGGTACTGGTAGAGCTATAGGTCTATTCT-GGTGTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGTTCTTCCTACAGTGGTACTGGTAGAGCTATAGGTCTATTCTGGGTGTG  900

seq1  ATCCTTCACTTATAGAACA-TATATT-ATAATAAAGATAACATACTCTA-  946
      || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTCTTCACTTATAGAACATTATATTAATAATAAAGATAACATACTCTAT  950

seq1  TTCCTAAGAAAATGTC-TTTGC-TAACTTCTTGGCCAGTC-AATTTAAA-  992
      |||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||| 
seq2  TTCCTAAGAAAATGTCTTTTGCTTAACTTTCTTGCCAGTCAAATTTAAAT  1000

seq1  TCTATATGG  1001
      |||||||||
seq2  TCTATATGG  1009