BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-241H13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 38,207,884 - 38,208,975
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039148, LOC276941
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-241H13.bB6Ng01-241H13.g
ACCGA051375GA051376
length1,082852
definitionB6Ng01-241H13.b B6Ng01-241H13.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcctagggcttacttttcagaaacaaacagctaagtttcagtccaa
gtaagtgaacatatctcaaaaataaaatttaggggttggagagacagctc
agtggttaagagcactagatgctcttccaaaggtcctgagttcaattccc
agcaaccacatggtggctcacaactgtctctaaagggatctaatgcactg
ttatggtgtgtctgaagacagcaacagagacaatatactcacatacataa
aaaataaaaataaaaataattttaaaataatttttaaaaatttgaaacag
agagaaatagcttgagagagggaaaagtagtttgtacacatatatagaca
tttatataaatacacacacacacatctttcttacaaatgaagttacatga
caaagggtgataacagctcccatagagccaatgtctatgtaataattgtg
gtaaatggtggtgtccttacaaaatatacgaagaaaattaccctagggag
tagcacattacagagacagcagcctcatcctcatcaatacagaattattc
tcaaaagcgcaaatatggaaataagtaaactaataacagatgaatgaaaa
tatagatgtattaattatgcagaattttaaaaacttgaaatcacaaaata
catgaaagagtggttatctgggacaggttgctcagaagaacaggaaacta
ttgatcacagaatacaagttcagttttccagaatagaagtactagagaca
catgatgccaagctatatttcctccaagcctaggatgtgctctgagaact
agctctcatgggaatggaagttgttatgcaagcttcccagggaagcaagc
aaacaatagtcgtactagcctaatacctatgaaacaaaatgaccagagag
gcaaaataatcctaacaatgcaatagcaacatttacatctttggtatatc
ctattgttatctaattgtgtttaaggtatgctcaataaaaatgatgctta
tgtagactgtcagtctactctgtaactggtacttcaaagcatactgcagt
catggatgtagaaaaacataatgctgtgactt
gaattcttttcccagttcaggttgtcagcctgaagtgcacttcaagtttg
tatttgcttttccctttaactctcagtgcacagaacagaatgagagcttg
cataaaacaaggacaataagaagaatacacaaatgttttggatgatgaac
aatggtgtgtaataactgttttaatagcactaaagactaaagtggaaaga
gaaaggctataatttatgctaataaacataactagaggactattgtaata
aaagttgaggatctgtactacttaaaggcaaatgatcgttttgaaacaca
tgtgcttcatttgtcttgcctactagcaaacaaacaaacaaacaaacaaa
cagacagataaagaaagctagaagatggtaacactttgtaagagtctact
atgaggcaaggttaaagagtgctccccatgctcctggagagatgtctcag
cagttaagagcaagaattaagagctttggcacaggatttgagtttggttc
ctaacacccatatcagcagactcacaactgactgtaactctagctccaga
ggatttaacacccccttttggcttctgtaggtactgtacttgtatgcaca
ttactctatacacacacttacaaacacatatacatatataatttaaatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
atatatatatatgtatatatatatatatatatatatagtgttatgtgtgt
gtgtgtgtatatgtacgttcatatatatatactatataatatatatatca
atatatgtatatatgtgtatagataagagatatatacgtatatatagatg
ac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_38207884_38208975
seq2: B6Ng01-241H13.b_44_1125

seq1  GAATTCCTAGGGCTTACTTTTCAGAAACAAACAGCTAAGTTTCAGTCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAGGGCTTACTTTTCAGAAACAAACAGCTAAGTTTCAGTCCAA  50

seq1  GTAAGTGAACATATCTCAAAAATAAAATTTAGGGGTTGGAGAGACAGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTGAACATATCTCAAAAATAAAATTTAGGGGTTGGAGAGACAGCTC  100

seq1  AGTGGTTAAGAGCACTAGATGCTCTTCCAAAGGTCCTGAGTTCAATTCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTTAAGAGCACTAGATGCTCTTCCAAAGGTCCTGAGTTCAATTCCC  150

seq1  AGCAACCACATGGTGGCTCACAACTGTCTCTAAAGGGATCTAATGCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACCACATGGTGGCTCACAACTGTCTCTAAAGGGATCTAATGCACTG  200

seq1  TTATGGTGTGTCTGAAGACAGCAACAGAGACAATATACTCACATACATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGTGTGTCTGAAGACAGCAACAGAGACAATATACTCACATACATAA  250

seq1  AAAATAAAAATAAAAATAATTTTAAAATAATTTTTAAAAATTTGAAACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAATAAAAATAATTTTAAAATAATTTTTAAAAATTTGAAACAG  300

seq1  AGAGAAATAGCTTGAGAGAGGGAAAAGTAGTTTGTACACATATATAGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAATAGCTTGAGAGAGGGAAAAGTAGTTTGTACACATATATAGACA  350

seq1  TTTATATAAATACACACACACACATCTTTCTTACAAATGAAGTTACATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATAAATACACACACACACATCTTTCTTACAAATGAAGTTACATGA  400

seq1  CAAAGGGTGATAACAGCTCCCATAGAGCCAATGTCTATGTAATAATTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGGTGATAACAGCTCCCATAGAGCCAATGTCTATGTAATAATTGTG  450

seq1  GTAAATGGTGGTGTCCTTACAAAATATACGAAGAAAATTACCCTAGGGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATGGTGGTGTCCTTACAAAATATACGAAGAAAATTACCCTAGGGAG  500

seq1  TAGCACATTACAGAGACAGCAGCCTCATCCTCATCAATACAGAATTATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACATTACAGAGACAGCAGCCTCATCCTCATCAATACAGAATTATTC  550

seq1  TCAAAAGCGCAAATATGGAAATAAGTAAACTAATAACAGATGAATGAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGCGCAAATATGGAAATAAGTAAACTAATAACAGATGAATGAAAA  600

seq1  TATAGATGTATTAATTATGCAGAATTTTAAAAACTTGAAATCACAAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATGTATTAATTATGCAGAATTTTAAAAACTTGAAATCACAAAATA  650

seq1  CATGAAAGAGTGGTTATCTGGGACAGGTTGCTCAGAAGAACAGGAAACTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAAGAGTGGTTATCTGGGACAGGTTGCTCAGAAGAACAGGAAACTA  700

seq1  TTGATCACAGAATACAAGGTTCAGTTTTCCAGAATAGAAGTACTAGAGAC  750
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCACAGAATACAA-GTTCAGTTTTCCAGAATAGAAGTACTAGAGAC  749

seq1  ACATGATGCCAAGCTATATTTCCTCCAAGCCTAGGATGTGCTCTGAGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGATGCCAAGCTATATTTCCTCCAAGCCTAGGATGTGCTCTGAGAAC  799

seq1  TAGCTCTCATGGGAATGGAAGTTGTTATGCAAGCTTCCCAGGGAAGCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCTCATGGGAATGGAAGTTGTTATGCAAGCTTCCCAGGGAAGCAAG  849

seq1  CAAACAATAGTCGTACTAGCCTAATACCTATGAAACAAAATGACCAGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAATAGTCGTACTAGCCTAATACCTATGAAACAAAATGACCAGAGA  899

seq1  GGCAAAATAATCCTAACAATGCAATAGCAACATTTACATCTTTGGTATAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAATAATCCTAACAATGCAATAGCAACATTTACATCTTTGGTATAT  949

seq1  CCTATTGTTATCTAATTGTGTTTAAGGTATGCTCAATAAAAATGAATGCT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCTATTGTTATCTAATTGTGTTTAAGGTATGCTCAATAAAAATG-ATGCT  998

seq1  TATGTAGAACTGTCAGTCTACTCTGTAAACCTGGTACTTTAAAGCCATAA  1050
      ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |
seq2  TATGTAG-ACTGTCAGTCTACTCTGTAA--CTGGTACTTCAAAG-CAT-A  1043

seq1  CTGGCAAGGTCATGGGATGTAG-AAAACATAATGCTGTGACTT  1092
      || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CT-GCA--GTCAT-GGATGTAGAAAAACATAATGCTGTGACTT  1082