BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-251G23
Chromosome11 (Build37)
Map Location 6,889,065 - 7,024,272
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdcy1
Upstream geneCamk2b, LOC100042156, Nudcd3, LOC100042173, Npc1l1, LOC100041242, LOC665250, Ddx56, Tmed4, Ogdh, LOC100042227, Zmiz2, Ppia, H2afv, LOC665277, LOC665283, LOC626342, Purb, Myo1g, LOC100041286, Ccm2, LOC665327, AB182283, Tbrg4, Wap, LOC100041311, Ramp3, LOC665314, LOC626419, LOC665339, LOC665343, LOC100041332
Downstream geneLOC100041347, Igfbp1, Igfbp3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-251G23.bB6Ng01-251G23.g
ACCGA058697GA058698
length1,0881,119
definitionB6Ng01-251G23.b B6Ng01-251G23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(6,889,065 - 6,890,151)(7,023,139 - 7,024,272)
sequence
gaattcctcaaggggtgaaatgcatttcgaagatagtcacggcaagcgcc
ataacaattacccacttgagccggagcttccttttctgctcataattaat
gttgctcttctgaagagcagccgtgacacttaaggggataaatatttctt
cagtgatttcttttgtgaagccaagtccctttaagcactggaatggctca
gttctgccatttgctcctttgccagtccgcataatcctattgctaagggg
atattagaaaccccaaatacacagcctttggtctgtaaattattcatgaa
gtcaacaggaaatttggggacctttttcttcagtgctcaaatgaatggaa
gcttctttcaagtgaatttgtaaaactgagggattttgaatgtaagtgaa
caaattgagaggagttggacactgcccagaaagtcactggagtcctttga
acagaataaatattgaagctggagaacaattttatgtcaatttctttgat
gtcaatagaaagaacaccagatgctgtcagagtgctttatgcagaacaag
ggcagggcacccaccctgtcctcagagagccacgtattattccactttga
gtaaacattgtcctcccagctgactcaggggtccgctaaccctggcttta
gcatcatccccacaaaaaaactttgcattgtttttcttaattgccaagtc
tacaagagagtctctgccagatagcttcttcttcttcctcttcttcttct
tcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttcttc
ttcttcttcttcttcttcttaaaaaaatggtgtctgctctagaagagata
gtacctggaattgccagcctcatatgggacaaaaagtgttatgcaaacgc
aggcattgttcccctgcactgtgttccggtgcattttgctcttggtaagg
cagggagagccctgccatcccttgaccgtggacggagggttacatacttt
atgggcaggagactacacttgacaatgtactttgtaatggctgactgaaa
acactccttgacagcaccaaggtcaggacgttcattta
gaattctctctgacgccagctccctacctatctagcacacactccaaccc
agctctccttccaggcgccagatgtttgctccctacataccctgcagcca
cctaattcaacaaattgctggctttcacaattaacttatagaagactctg
ccctgagcacttgtgcttgacaatgcatggaccatgccagtgtgctctaa
caacactactggcatgaatacaactagccagccctttcacttcagccctc
catggctttgaatagcttctttatatttctcaagcagggaaactgaggca
cgaccagttaagttgatatgattgaatgtctgtggctgcatagtgaaccc
tgtctctgagttgaagcccacagaaaggtttcgtgggggcaaaggtcagg
aagggcataagacaatgggtggcagtgagcagattcctgatgctcctgga
ccccaacagacacagttctggttactcacatagattgtgcgagtccttct
ggaaatacccagagttgacacaatactagagaacagtaacttcaatagct
cagaccatattagcttcaactcatagcaactaaagttagtcaaaatggcc
acattgtatcctggagccatgaacctttgtcaccagcatgcatgaatgtc
ttattttgccctaaagcaaagtaaattgacacaagtgaccctaactcagg
ctctggtatcagccaacacattcatctctgcaacgactctcagaagaaag
actggatgggatggaagacttacttgactcagactcacagttctcagccc
agtgttcaccagctctgctgtttgtacactatggtgaagcagagcatcat
ggcagagagggaagggaggtgcactgtcagacaccatcacgctaggaggt
gaaaaacgagacaagggatccaagacatgataccttcttcagggcaggct
tgcagatactgcttcttcaaatacatctcagaaactcccagacagcactg
cgagctgggagcaagccttcaatgcatgagctttagacataggttctcaa
ccagggtctatgacttttcacagaagtcaccttaagaaccactgaaaaca
gcgtttacattacatcata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_6889065_6890151
seq2: B6Ng01-251G23.b_48_1135

seq1  GAATTCCTCAAGGGGTGAAATGCATTTCGAAGATAGTCACGGCAAGCGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAAGGGGTGAAATGCATTTCGAAGATAGTCACGGCAAGCGCC  50

seq1  ATAACAATTACCCACTTGAGCCGGAGCTTCCTTTTCTGCTCATAATTAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAATTACCCACTTGAGCCGGAGCTTCCTTTTCTGCTCATAATTAAT  100

seq1  GTTGCTCTTCTGAAGAGCAGCCGTGACACTTAAGGGGATAAATATTTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTCTTCTGAAGAGCAGCCGTGACACTTAAGGGGATAAATATTTCTT  150

seq1  CAGTGATTTCTTTTGTGAAGCCAAGTCCCTTTAAGCACTGGAATGGCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGATTTCTTTTGTGAAGCCAAGTCCCTTTAAGCACTGGAATGGCTCA  200

seq1  GTTCTGCCATTTGCTCCTTTGCCAGTCCGCATAATCCTATTGCTAAGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGCCATTTGCTCCTTTGCCAGTCCGCATAATCCTATTGCTAAGGGG  250

seq1  ATATTAGAAACCCCAAATACACAGCCTTTGGTCTGTAAATTATTCATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAGAAACCCCAAATACACAGCCTTTGGTCTGTAAATTATTCATGAA  300

seq1  GTCAACAGGAAATTTGGGGACCTTTTTCTTCAGTGCTCAAATGAATGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACAGGAAATTTGGGGACCTTTTTCTTCAGTGCTCAAATGAATGGAA  350

seq1  GCTTCTTTCAAGTGAATTTGTAAAACTGAGGGATTTTGAATGTAAGTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTTCAAGTGAATTTGTAAAACTGAGGGATTTTGAATGTAAGTGAA  400

seq1  CAAATTGAGAGGAGTTGGACACTGCCCAGAAAGTCACTGGAGTCCTTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTGAGAGGAGTTGGACACTGCCCAGAAAGTCACTGGAGTCCTTTGA  450

seq1  ACAGAATAAATATTGAAGCTGGAGAACAATTTTATGTCAATTTCTTTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATAAATATTGAAGCTGGAGAACAATTTTATGTCAATTTCTTTGAT  500

seq1  GTCAATAGAAAGAACACCAGATGCTGTCAGAGTGCTTTATGCAGAACAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATAGAAAGAACACCAGATGCTGTCAGAGTGCTTTATGCAGAACAAG  550

seq1  GGCAGGGCACCCACCCTGTCCTCAGAGAGCCACGTATTATTCCACTTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGGCACCCACCCTGTCCTCAGAGAGCCACGTATTATTCCACTTTGA  600

seq1  GTAAACATTGTCCTCCCAGCTGACTCAGGGGTCCGCTAACCCTGGCTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACATTGTCCTCCCAGCTGACTCAGGGGTCCGCTAACCCTGGCTTTA  650

seq1  GCATCATCCCCACAAAAAAACTTTGCATTGTTTTTCTTAATTGCCAAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCATCCCCACAAAAAAACTTTGCATTGTTTTTCTTAATTGCCAAGTC  700

seq1  TACAAGAGAGTCTCTGCCAGATAGCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAGAGTCTCTGCCAGATAGCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCT  750

seq1  TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC  800

seq1  TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTAAAAAAATGGTGTCTGCTCTAGAAGAGATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTAAAAAAATGGTGTCTGCTCTAGAAGAGATA  850

seq1  GTACCTGGAATTGCCAGCCTCATATGGGACAAAAAGTGTTATGCAAACGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTGGAATTGCCAGCCTCATATGGGACAAAAAGTGTTATGCAAACGC  900

seq1  AGGGCATTGTTCCCCTGCACTGTGTTCCGGTGCATTTTGCTCTTGGTAAG  950
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGCATTGTTCCCCTGCACTGTGTTCCGGTGCATTTTGCTCTTGGTAAG  949

seq1  GCAGGGAGAGCCCTGCCATCCCTTGACCGTGGACGGAGGGTTACATACTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGAGAGCCCTGCCATCCCTTGACCGTGGACGGAGGGTTACATACTT  999

seq1  AAT-GGCAGGAGACTTACACTTGACAATGTAC-TTGTAATGGCTGAACTG  1048
       || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  TATGGGCAGGAGAC-TACACTTGACAATGTACTTTGTAATGGCTG-ACTG  1047

seq1  AAAACACT-CTTGACAGCACC-AGGTCAAGACAGTCATTTA  1087
      |||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||
seq2  AAAACACTCCTTGACAGCACCAAGGTCAGGACGTTCATTTA  1088

seq1: chr11_7023139_7024272
seq2: B6Ng01-251G23.g_66_1184 (reverse)

seq1  TATGAATTGTAATGTAAACGCCTGTGTTTTCCAGTGG-TCTT-AGGTGAC  48
      |||||  ||||||||||||||   |||||| |||||| |||| |||||||
seq2  TATGA--TGTAATGTAAACGC---TGTTTT-CAGTGGTTCTTAAGGTGAC  44

seq1  CTCTGTGAAAAAGTCATAAGACCCTTGGGTTGAGAACTATTGTTCTAAAG  98
       |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||   || |||||| 
seq2  TTCTGTG-AAAAGTCAT-AGACCCT--GGTTGAGAACCTATG-TCTAAA-  88

seq1  GCTCATGCATTGAAGGCTTGGCTCCCAGCTCGCAGTGCTGTCTTGGGAGT  148
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCTCATGCATTGAAGGCTT-GCTCCCAGCTCGCAGTGCTGTC-TGGGAGT  136

seq1  TTCTTGAGATGTATTTTGAAGAAGCAGTATCTGCAAGCCTGCCCTTGAAG  198
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTC-TGAGATGTA-TTTGAAGAAGCAGTATCTGCAAGCCTGCCC-TGAAG  183

seq1  AAGGTATCATGTCTTGGATCCCTTGTCTCGTTTTTCACCTCCTAGCGTGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTATCATGTCTTGGATCCCTTGTCTCGTTTTTCACCTCCTAGCGTGA  233

seq1  TGGTGTCTGACAGTGCACCTCCCTTCCCTCTCTGCCATGATGCTCTGCTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCTGACAGTGCACCTCCCTTCCCTCTCTGCCATGATGCTCTGCTT  283

seq1  CACCATAGTGTACAAACAGCAGAGCTGGTGAACACTGGGCTGAGAACTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATAGTGTACAAACAGCAGAGCTGGTGAACACTGGGCTGAGAACTGT  333

seq1  GAGTCTGAGTCAAGTAAGTCTTCCATCCCATCCAGTCTTTCTTCTGAGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGAGTCAAGTAAGTCTTCCATCCCATCCAGTCTTTCTTCTGAGAG  383

seq1  TCGTTGCAGAGATGAATGTGTTGGCTGATACCAGAGCCTGAGTTAGGGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTGCAGAGATGAATGTGTTGGCTGATACCAGAGCCTGAGTTAGGGTC  433

seq1  ACTTGTGTCAATTTACTTTGCTTTAGGGCAAAATAAGACATTCATGCATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGTCAATTTACTTTGCTTTAGGGCAAAATAAGACATTCATGCATG  483

seq1  CTGGTGACAAAGGTTCATGGCTCCAGGATACAATGTGGCCATTTTGACTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGACAAAGGTTCATGGCTCCAGGATACAATGTGGCCATTTTGACTA  533

seq1  ACTTTAGTTGCTATGAGTTGAAGCTAATATGGTCTGAGCTATTGAAGTTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAGTTGCTATGAGTTGAAGCTAATATGGTCTGAGCTATTGAAGTTA  583

seq1  CTGTTCTCTAGTATTGTGTCAACTCTGGGTATTTCCAGAAGGACTCGCAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTCTAGTATTGTGTCAACTCTGGGTATTTCCAGAAGGACTCGCAC  633

seq1  AATCTATGTGAGTAACCAGAACTGTGTCTGTTGGGGTCCAGGAGCATCAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATGTGAGTAACCAGAACTGTGTCTGTTGGGGTCCAGGAGCATCAG  683

seq1  GAATCTGCTCACTGCCACCCATTGTCTTATGCCCTTCCTGACCTTTGCCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTGCTCACTGCCACCCATTGTCTTATGCCCTTCCTGACCTTTGCCC  733

seq1  CCACGAAACCTTTCTGTGGGCTTCAACTCAGAGACAGGGTTCACTATGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGAAACCTTTCTGTGGGCTTCAACTCAGAGACAGGGTTCACTATGCA  783

seq1  GCCACAGACATTCAATCATATCAACTTAACTGGTCGTGCCTCAGTTTCCC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAGACATTCAATCATATCAACTTAACTGGTCGTGCCTCAGTTTCCC  833

seq1  TGCTTGAGAAATATAAAGAAGCTATTCAAAGCCATGGAGGGCTGAAGTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGAGAAATATAAAGAAGCTATTCAAAGCCATGGAGGGCTGAAGTGA  883

seq1  AAGGGCTGGCTAGTTGTATTCATGCCAGTAGTGTTGTTAGAGCACACTGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTGGCTAGTTGTATTCATGCCAGTAGTGTTGTTAGAGCACACTGG  933

seq1  CATGGTCCATGCATTGTCAAGCACAAGTGCTCAGGGCAGAGTCTTCTATA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTCCATGCATTGTCAAGCACAAGTGCTCAGGGCAGAGTCTTCTATA  983

seq1  AGTTAATTGTGAAAGCCAGCAATTTGTTGAATTAGGTGGCTGCAGGGTAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAATTGTGAAAGCCAGCAATTTGTTGAATTAGGTGGCTGCAGGGTAT  1033

seq1  GTAGGGAGCAAACATCTGGCGCCTGGAAGGAGAGCTGGGTTGGAGTGTGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGAGCAAACATCTGGCGCCTGGAAGGAGAGCTGGGTTGGAGTGTGT  1083

seq1  GCTAGATAGGTAGGGAGCTGGCGTCAGAGAGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGATAGGTAGGGAGCTGGCGTCAGAGAGAATTC  1119