BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-258F01
Chromosome11 (Build37)
Map Location 73,506,241 - 73,629,889
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700012C15Rik, Olfr388-ps1, Olfr389, Olfr390, Olfr391-ps1, Olfr392
Upstream geneAnkfy1, Cyb5d2, Zzef1, LOC627119, Atp2a3, P2rx1, LOC100043309, Camkk1, 1200014J11Rik, Itgae, Gsg2, P2rx5, Tmem93, Tax1bp3, Ctns, Carkl, Trpv1, Trpv3, Aspa, Spata22, Olfr20, Olfr376, Olfr377-ps1, Olfr1, Olfr75-ps1, Olfr378, Olfr379-ps1, Olfr380, Olfr381, Olfr382, Olfr383-ps1, Olfr385, Olfr386, Olfr387-ps1
Downstream geneOlfr393, Olfr394, Olfr395, Olfr396-ps1, Olfr23, Olfr22-ps1, Olfr397, Olfr398, Olfr139, Olfr399, OTTMUSG00000006163, LOC668567, Olfr400-ps1, Olfr401, Olfr402, Olfr403, Olfr43, Olfr404-ps1, Olfr405-ps1, Olfr406, Olfr407-ps1, Olfr59, Olfr408-ps1, Olfr409-ps1, LOC193079, Olfr410, Olfr411, Olfr412, Garnl4, E130309D14Rik, 1300001I01Rik, Pafah1b1, Mett10d
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-258F01.bB6Ng01-258F01.g
ACCGA063786GA063787
length1,1031,163
definitionB6Ng01-258F01.b B6Ng01-258F01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,628,783 - 73,629,889)(73,506,241 - 73,507,433)
sequence
gaattccatgtgatttgcatgtatattaactgtagaactagttttatgtg
acagtcttatctgctattgaggtaaaaattatgagtttgaccactgaaga
agtaaagtccattaggtcagcagtagcaaacatcacaagtgatctttgct
ttgtagtctcttcatgtgtgactacataaaacatgggcctcattcactca
tagaatacaaataattctgagaagctaggtgcacaatttctcttatattt
ttgtagttctttttttctattaactgcttacatgaggtttgtcacattat
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aagtaaatataaaacaatatttctatttgctttaccataactaacatttt
ttattatttgtcaaaaatcttgcctctttttctgtattgatcttttgcct
gctcccagtttagaaacacttcccctttcctattttatattgtttttatt
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cacacatgtacacagtcacacataacacatatgatcatactcataaacac
acatacacacatgtaggtacctcaagtaaaatcaaaggaaaaaggaaaga
aaggctttcaacttgagaagtgttgcgtccacctcagctggcaaggaaga
cacaacacagttggattcttctcaacagcctttattgcagaacgcctcaa
tgctgctacggaacctcggaaccaggaagtctgcttatatactctcagcc
ccatcactcacggcagcatgcacctcacagcacacagcttagccatcagc
gcagggcatgtctcacaattgactgtttacactgccagcatcatagtgca
cctgtgcagtctccaatggtcttggctattcaggtatgaggaagttcagg
tgcaagttcatta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_73628783_73629889
seq2: B6Ng01-258F01.b_45_1147 (reverse)

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      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||
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      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACACACATAGTGTA-TGTATACTCTACAGTAATTAATCTTACTCT  144

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      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAGTTATTCATCTTCAATTTTCTCAGACTATGAACTCACCTTTTCATATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTATTCATCTTCAATTTTCTCAGACTATGAACTCACCTTTTCATATG  394

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGTAAATATTCCCTGATTAACTGCACAGATATAATTTTGTATTTA  444

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACATATTCAGGTATGCAAAATAGAATGCTCTTTTAAATAATACTAA  494

seq1  TGACGATTTTTTTATTTTTCATATGATTTCACTATATTCATATCCATATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACGATTTTTTTATTTTTCATATGATTTCACTATATTCATATCCATATT  544

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATGCCATTGATAATGATGTAGGAAAATAAATACAGTAAATGGTTTT  594

seq1  TAAAGTATCAGTAAATTTTAATCCCTCCCTTGATTGCATGTTCAGACATC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTATCAGTAAATTTTAATCCCTCCCTTGATTGCATGTTCAGACATC  644

seq1  CATAACTAGAAAGACAGTTTATATAGGGACTGGTCTAGGTCTTAAAAGAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTAGAAAGACAGTTTATATAGGGACTGGTCTAGGTCTTAAAAGAA  694

seq1  AATTTGGTCAAATTACAGTTGTAAGTATGTCAATGAAGATGTTTTACCAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGGTCAAATTACAGTTGTAAGTATGTCAATGAAGATGTTTTACCAT  744

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATTTTATAATGTGACAAACCTCATGTAAGCAGTTAATAGAAAAAAA  844

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGACTACAAAGCAAAGATCACTTGTGATGTTTGCTACTGCTGACCTAATG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTACAAAGCAAAGATCACTTGTGATGTTTGCTACTGCTGACCTAATG  994

seq1  GACTTTACTTCTTCAGTGGTCAAACTCATAATTTTTACCTCAATAGCAGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTACTTCTTCAGTGGTCAAACTCATAATTTTTACCTCAATAGCAGA  1044

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACTGTCACATAAAACTAGTTCTACAGTTAATATACATGCAAATCAC  1094

seq1  ATGGAATTC  1107
      |||||||||
seq2  ATGGAATTC  1103

seq1: chr11_73506241_73507433
seq2: B6Ng01-258F01.g_65_1227

seq1  GAATTCTGCATGGAGAGAAGCTCAAAGCAATTCCTCTTAAATCATGAGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCATGGAGAGAAGCTCAAAGCAATTCCTCTTAAATCATGAGCA  50

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAGGTTGTTCATTTTCTCCATAGATATTCAATATATATTTTTGAAA  100

seq1  TAATATCTAGAGCAATAAGACATTTAATGAGCTTTAGAGGATATGCATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATCTAGAGCAATAAGACATTTAATGAGCTTTAGAGGATATGCATAA  150

seq1  ATAGATACTATAAAAGTATCCTTATTATTTTGATAATAAATATATATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATACTATAAAAGTATCCTTATTATTTTGATAATAAATATATATATA  200

seq1  AAATTTGACAGGATGTTTCTCACATTTATAGTCAGGTTCCTTTAAAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGACAGGATGTTTCTCACATTTATAGTCAGGTTCCTTTAAAAAGC  250

seq1  ATTTTCATCTATAGGGATGTAAAACAAACAAACAATATATATATATATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCATCTATAGGGATGTAAAACAAACAAACAATATATATATATATAT  300

seq1  ACATATATATATATATATATATACCTTATAAGGTATATAAAATCAACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATATATATATATATATACCTTATAAGGTATATAAAATCAACACA  350

seq1  TATTATACATATCATATAAATATATACACATATGTATTTTGTATAATCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATACATATCATATAAATATATACACATATGTATTTTGTATAATCGT  400

seq1  AAGTAAATATAAAACAATATTTCTATTTGCTTTACCATAACTAACATTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAATATAAAACAATATTTCTATTTGCTTTACCATAACTAACATTTT  450

seq1  TTATTATTTGTCAAAAATCTTGCCTCTTTTTCTGTATTGATCTTTTGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATTTGTCAAAAATCTTGCCTCTTTTTCTGTATTGATCTTTTGCCT  500

seq1  GCTCCCAGTTTAGAAACACTTCCCCTTTCCTATTTTATATTGTTTTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCAGTTTAGAAACACTTCCCCTTTCCTATTTTATATTGTTTTTATT  550

seq1  TTTCCCCATAACTATCCATATAATTCTCATAAACTAATGAGGTTTATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCATAACTATCCATATAATTCTCATAAACTAATGAGGTTTATGAA  600

seq1  AATCAGCATTAGTTTCCCACTACATATGATCAGTATTATGGGTTTCCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGCATTAGTTTCCCACTACATATGATCAGTATTATGGGTTTCCCAA  650

seq1  TGCAGAGCATTCATTGCTTAAACAATAAATAATCACAAACAACAAATTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGCATTCATTGCTTAAACAATAAATAATCACAAACAACAAATTCC  700

seq1  ACTCACAGAGATGCTTTTATGTAATATTAGAAACACCTAGCTAACAGATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACAGAGATGCTTTTATGTAATATTAGAAACACCTAGCTAACAGATA  750

seq1  CACACATGTACACAGTCACACATAACACATATGATCATACTCATAAACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGTACACAGTCACACATAACACATATGATCATACTCATAAACAC  800

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACACACATGTAGGTACCTCAAGTAAAATCAAAGGAAAAAGGAAAGA  850

seq1  AAGGCTTTCAACTTGAGAAGTGTTGCGTCCACCTCAGCTGGCAAGGAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTTTCAACTTGAGAAGTGTTGCGTCCACCTCAGCTGGCAAGGAAGA  900

seq1  CACAACACAGTTGGATTCTTCTCAACAGCCTTTATTGCAGGAACGCCTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACAACACAGTTGGATTCTTCTCAACAGCCTTTATTGCA-GAACGCCTCA  949

seq1  ATGCTGCTACGGGAACCCCGGGAACCCAGGAAGGTTCTGCTTATATACTC  1000
      |||||||||| |||||| |||  | ||||||||  |||||||||||||||
seq2  ATGCTGCTAC-GGAACCTCGG--AACCAGGAAG--TCTGCTTATATACTC  994

seq1  TCAGCCCCCATCCACTCACGGCAGGCCATGCCACCTCACCAGGCACACAG  1050
      |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||
seq2  TCAG-CCCCAT-CACTCACGGCAG--CATG-CACCTCAC--AGCACACAG  1037

seq1  CTTTAGCCAATCAGGGCGGCAGGGGCATGTCTCCACCAAATATGGACTTG  1100
      | |||||| ||||| ||     |||||||||||     |  || ||| ||
seq2  C-TTAGCC-ATCAGCGC----AGGGCATGTCTC-----ACAATTGAC-TG  1075

seq1  TTTACACTGCCAGCATCATAGTGCACCTGTGCAGTTCTCACAATGGTCGT  1150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
seq2  TTTACACTGCCAGCATCATAGTGCACCTGTGCAG-TCTC-CAATGGTCTT  1123

seq1  GGCTTATTTTCAGGTGTATGAGGAAG-TCAGGTGCAAG-TCATTA  1193
      |||   | |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  GGC---TATTCAG--GTATGAGGAAGTTCAGGTGCAAGTTCATTA  1163