BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264M02
Chromosome11 (Build37)
Map Location 56,873,474 - 57,075,053
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGria1
Upstream geneLOC100040816, LOC624168
Downstream geneLOC667878, 1810073G14Rik, Mfap3, Galnt10, Sap30l, Hand1, LOC624605, Larp1, LOC676527, LOC667947, Cnot8, Gemin5, Mrpl22, Irgb10, Igtp, LOC263305, LOC100041816, EG668249
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264M02.bB6Ng01-264M02.g
ACCGA068578GA068579
length1,1661,119
definitionB6Ng01-264M02.b B6Ng01-264M02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,073,888 - 57,075,053)(56,873,474 - 56,874,585)
sequence
gaattccctgccctgatggactgtatccttgaactgtgagccaaaagaaa
cccttttcttcttaagttgctttcatcagagtgttttagcattccatttt
tctcaatgcagttgtatctctttgttgttgacttgctttgtgtactaggc
tggctgtcccaaaagcagtttcagatttttctttctacatcccatctccc
tgaaggagaagaagactgcagaggctcacactgaacttgtagttctaggt
tctggggatttgaactcaggccttcaagcttgcatggcaagagcttttta
cccaataaactgtctacccagcaaccactttagttttgtagataagatct
cactggaaactggattggtcgatttggctcagctggctggctaatgagct
ccagagaggcacttgattctgccttccctggtgtgctaggcttatagaca
ggattcactgtgcctggcttctacatgagtactggggattcaaactcaag
ttctctggtgtgtataataagaacttcattggctgagcccatctcctcag
ccactgagcctggcttgtatgaactgtgaatttatctattatgttacatc
ttgataagatctataagcctaaactcaattgtgtgtcaaagggggacgat
gtgaagaaacattcacccttatgaaaatcttctcttgctcagtatgttat
ctcttaaagctgaacagagttaatgttcatcaggtggaaaacaagcaaag
tttaaaaaacaaaaacaaagccctaatactctaaactatgatgtaggatc
tatactaagaaaatgagtttctggattggatcgatggctcagtggctcac
gcacgtacttccctttcagaggaactgagtttggttcccagaattcacaa
tgggcagctcaaaactgtctgtaagtccaggcacagggggtacaatatcc
tctcccagcctctgttggcacctgcagcatgagcatgtacagacacatat
gtgcacaccaatttaaaaataacatgtttttaaaaatacatacttatctt
gataacctgtaagatttcttgaggtaccctggtgctttgtgaagagaata
caggctgtcttggggagggagtatgtctacttctgttatatactgaagca
attcctgtccctctat
gaattcagtggggcttctgggagttctcggatgcctgttctctaaccaaa
atcaggagacttctctctcccttggcaaccatgagatccagagcttgcaa
cacaagtggctcaccttgagcctgtgaacagctgagcttgcagactagta
tttgacaggtatttactctccaggccacacagccagctaggcaggtagct
gtccacacactggtcagcagaaacactattccctgccagattgaggcctt
tgcattgatgcagagtggggagcagaggtttacaagtcaggagacgtggt
gtacatctcctgttattctttatcagtcatcccttttcttcttttgctga
accctacattttttaatgtgtagatatgagtacaaaaaccttttacctct
gaagccctaaccatggccctctccctccctaggacccagcttcacattca
tcttgcaattatccaacctttgcacacatctggtgtgcccctcaaagact
tcactcctggccatctcaactgcagtctcacctctttgcttcctctctgt
ctgggctctgccaagctgcttatgcctgagagccttattcagtgggccat
ctcctctagaacattcttcctctgactctttctgctctgatcttgccagc
tcccctcccctcttgcactttcttgtaccagtttctctttcccttacttt
attgctcagtttagattctcgcttatatcccttagtaagcattctggaat
catacagaaggttcacttggtaaagtgctcactacacaaggataaggaca
tgagttcaatatccagagatcatctaaaaagccaggcttgtggtctccat
actggcaagtcagagacaggaggatctcttggggttgccagtcaggctag
cagaatggacaagctcccggccaggaagagactgtgtctgtaaaaccaag
gtggacagtcaatgcctgaggtcatcctctagtgttccaatattcacatc
catacatgtgaacatgtatgtgcatgcatgcacacattacacacacatac
acacatctctacttcaatcacaactaatgccacagattgtttcttaagag
cagcgaatgctgaatggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_57073888_57075053
seq2: B6Ng01-264M02.b_44_1209 (reverse)

seq1  ATAGAGGGGAAACAAGGAAATGCTTCAGTATATAACAGAAGTAGAACCAT  50
      ||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  ATAGAGGG---AC-AGGAATTGCTTCAGTATATAACAGAAGTAGA--CAT  44

seq1  ACTCCCTCCCCAAGACAGCCTGTA-TCTC-TCACAAAGCA-CAGGGTACC  97
      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||
seq2  ACTCCCTCCCCAAGACAGCCTGTATTCTCTTCACAAAGCACCAGGGTACC  94

seq1  TCAAGAAATCCTACAGG-TATCAAGATAAGTATGTATTTTTAAAACATTG  146
      |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  TCAAGAAATCTTACAGGTTATCAAGATAAGTATGTATTTTTAAAAACATG  144

seq1  TTA-TTTTAAATT-GTGTGCACATATGTGTCTGTACATGCTCATGCTGCA  194
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTAAATTGGTGTGCACATATGTGTCTGTACATGCTCATGCTGCA  194

seq1  GGTGCCAACAGAGGCTGGGAGAGGATATTGTACCCCCTGTGCCTGGACTT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCAACAGAGGCTGGGAGAGGATATTGTACCCCCTGTGCCTGGACTT  244

seq1  ACAGACAGTTTTGAGCTGCCCATTGTGAATTCTGGGAACCAAACTCAGTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGTTTTGAGCTGCCCATTGTGAATTCTGGGAACCAAACTCAGTT  294

seq1  CCTCTGAAAGGGAAGTACGTGCGTGAGCCACTGAGCCATCGATCCAATCC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAAAGGGAAGTACGTGCGTGAGCCACTGAGCCATCGATCCAATCC  344

seq1  AGAAACTCATTTTCTTAGTATAGATCCTACATCATAGTTTAGAGTATTAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTCATTTTCTTAGTATAGATCCTACATCATAGTTTAGAGTATTAG  394

seq1  GGCTTTGTTTTTGTTTTTTAAACTTTGCTTGTTTTCCACCTGATGAACAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGTTTTTGTTTTTTAAACTTTGCTTGTTTTCCACCTGATGAACAT  444

seq1  TAACTCTGTTCAGCTTTAAGAGATAACATACTGAGCAAGAGAAGATTTTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCTGTTCAGCTTTAAGAGATAACATACTGAGCAAGAGAAGATTTTC  494

seq1  ATAAGGGTGAATGTTTCTTCACATCGTCCCCCTTTGACACACAATTGAGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGGTGAATGTTTCTTCACATCGTCCCCCTTTGACACACAATTGAGT  544

seq1  TTAGGCTTATAGATCTTATCAAGATGTAACATAATAGATAAATTCACAGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCTTATAGATCTTATCAAGATGTAACATAATAGATAAATTCACAGT  594

seq1  TCATACAAGCCAGGCTCAGTGGCTGAGGAGATGGGCTCAGCCAATGAAGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACAAGCCAGGCTCAGTGGCTGAGGAGATGGGCTCAGCCAATGAAGT  644

seq1  TCTTATTATACACACCAGAGAACTTGAGTTTGAATCCCCAGTACTCATGT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTATACACACCAGAGAACTTGAGTTTGAATCCCCAGTACTCATGT  694

seq1  AGAAGCCAGGCACAGTGAATCCTGTCTATAAGCCTAGCACACCAGGGAAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCAGGCACAGTGAATCCTGTCTATAAGCCTAGCACACCAGGGAAG  744

seq1  GCAGAATCAAGTGCCTCTCTGGAGCTCATTAGCCAGCCAGCTGAGCCAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAATCAAGTGCCTCTCTGGAGCTCATTAGCCAGCCAGCTGAGCCAAA  794

seq1  TCGACCAATCCAGTTTCCAGTGAGATCTTATCTACAAAACTAAAGTGGTT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGACCAATCCAGTTTCCAGTGAGATCTTATCTACAAAACTAAAGTGGTT  844

seq1  GCTGGGTAGACAGTTTATTGGGTAAAAAGCTCTTGCCATGCAAGCTTGAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTAGACAGTTTATTGGGTAAAAAGCTCTTGCCATGCAAGCTTGAA  894

seq1  GGCCTGAGTTCAAATCCCCAGAACCTAGAACTACAAGTTCAGTGTGAGCC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGAGTTCAAATCCCCAGAACCTAGAACTACAAGTTCAGTGTGAGCC  944

seq1  TCTGCAGTCTTCTTCTCCTTCAGGGAGATGGGATGTAGAAAGAAAAATCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGTCTTCTTCTCCTTCAGGGAGATGGGATGTAGAAAGAAAAATCT  994

seq1  GAAACTGCTTTTGGGACAGCCAGCCTAGTACACAAAGCAAGTCAACAACA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGCTTTTGGGACAGCCAGCCTAGTACACAAAGCAAGTCAACAACA  1044

seq1  AAGAGATACAACTGCATTGAGAAAAATGGAATGCTAAAACACTCTGATGA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATACAACTGCATTGAGAAAAATGGAATGCTAAAACACTCTGATGA  1094

seq1  AAGCAACTTAAGAAGAAAAGGGTTTCTTTTGGCTCACAGTTCAAGGATAC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAACTTAAGAAGAAAAGGGTTTCTTTTGGCTCACAGTTCAAGGATAC  1144

seq1  AGTCCATCAGGGCAGGGAATTC  1166
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATCAGGGCAGGGAATTC  1166

seq1: chr11_56873474_56874585
seq2: B6Ng01-264M02.g_69_1187

seq1  GAATTCAGTGGGGCTTCTGGGAGTTCTCGGATGCCTGTTCTCTAACCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGGGGCTTCTGGGAGTTCTCGGATGCCTGTTCTCTAACCAAA  50

seq1  ATCAGGAGACTTCTCTCTCCCTTGGCAACCATGAGATCCAGAGCTTGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAGACTTCTCTCTCCCTTGGCAACCATGAGATCCAGAGCTTGCAA  100

seq1  CACAAGTGGCTCACCTTGAGCCTGTGAACAGCTGAGCTTGCAGACTAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGTGGCTCACCTTGAGCCTGTGAACAGCTGAGCTTGCAGACTAGTA  150

seq1  TTTGACAGGTATTTACTCTCCAGGCCACACAGCCAGCTAGGCAGGTAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAGGTATTTACTCTCCAGGCCACACAGCCAGCTAGGCAGGTAGCT  200

seq1  GTCCACACACTGGTCAGCAGAAACACTATTCCCTGCCAGATTGAGGCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACACACTGGTCAGCAGAAACACTATTCCCTGCCAGATTGAGGCCTT  250

seq1  TGCATTGATGCAGAGTGGGGAGCAGAGGTTTACAAGTCAGGAGACGTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTGATGCAGAGTGGGGAGCAGAGGTTTACAAGTCAGGAGACGTGGT  300

seq1  GTACATCTCCTGTTATTCTTTATCAGTCATCCCTTTTCTTCTTTTGCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATCTCCTGTTATTCTTTATCAGTCATCCCTTTTCTTCTTTTGCTGA  350

seq1  ACCCTACATTTTTTAATGTGTAGATATGAGTACAAAAACCTTTTACCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTACATTTTTTAATGTGTAGATATGAGTACAAAAACCTTTTACCTCT  400

seq1  GAAGCCCTAACCATGGCCCTCTCCCTCCCTAGGACCCAGCTTCACATTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCCTAACCATGGCCCTCTCCCTCCCTAGGACCCAGCTTCACATTCA  450

seq1  TCTTGCAATTATCCAACCTTTGCACACATCTGGTGTGCCCCTCAAAGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAATTATCCAACCTTTGCACACATCTGGTGTGCCCCTCAAAGACT  500

seq1  TCACTCCTGGCCATCTCAACTGCAGTCTCACCTCTTTGCTTCCTCTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCCTGGCCATCTCAACTGCAGTCTCACCTCTTTGCTTCCTCTCTGT  550

seq1  CTGGGCTCTGCCAAGCTGCTTATGCCTGAGAGCCTTATTCAGTGGGCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTCTGCCAAGCTGCTTATGCCTGAGAGCCTTATTCAGTGGGCCAT  600

seq1  CTCCTCTAGAACATTCTTCCTCTGACTCTTTCTGCTCTGATCTTGCCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTAGAACATTCTTCCTCTGACTCTTTCTGCTCTGATCTTGCCAGC  650

seq1  TCCCCTCCCCTCTTGCACTTTCTTGTACCAGTTTCTCTTTCCCTTACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCCCTCTTGCACTTTCTTGTACCAGTTTCTCTTTCCCTTACTTT  700

seq1  ATTGCTCAGTTTAGATTCTCGCTTATATCCCTTAGTAAGCATTCTGGAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTCAGTTTAGATTCTCGCTTATATCCCTTAGTAAGCATTCTGGAAT  750

seq1  CATACAGAAGGTTCACTTGGTAAAGTGCTCACTACACAAGGATAAGGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGAAGGTTCACTTGGTAAAGTGCTCACTACACAAGGATAAGGACA  800

seq1  TGAGTTCAATATCCAGAGATCATCTAAAAAGCCAGGCTTGTGGTCTCCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCAATATCCAGAGATCATCTAAAAAGCCAGGCTTGTGGTCTCCAT  850

seq1  ACTGGCAAGTCAGAGACAGGAGGATCTCTTGGGGTTGCCAGTCAGGCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCAAGTCAGAGACAGGAGGATCTCTTGGGGTTGCCAGTCAGGCTAG  900

seq1  CAGAATGGACAAGCTCCCGGCCAGGAAGAGACTGTGTCTGTAAAACCAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGGACAAGCTCCCGGCCAGGAAGAGACTGTGTCTGTAAAACCAAG  950

seq1  GTGGACAGTCAATGCCTGAGGTCATCCTCTAGTGT--CCATATTCACATC  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||
seq2  GTGGACAGTCAATGCCTGAGGTCATCCTCTAGTGTTCCAATATTCACATC  1000

seq1  CATACATGTGAACATGTATGTGCATGCATGCACACA-TACACACACACAC  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  CATACATGTGAACATGTATGTGCATGCATGCACACATTACACACACATAC  1050

seq1  ACACA-CAC-AC-ACACACACACACAATGCCCACAGATTGTTTCTTAAGA  1094
      ||||| | | ||  ||  ||||   |||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACACATCTCTACTTCAATCACAACTAATG-CCACAGATTGTTTCTTAAGA  1099

seq1  GCAGCG-ATGCTG-ATGGGA  1112
      |||||| |||||| ||||||
seq2  GCAGCGAATGCTGAATGGGA  1119