BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264P14
Chromosome11 (Build37)
Map Location 117,412,863 - 117,509,644
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneUbe2o, Aanat, Rhbdf2, Cygb, OTTMUSG00000003947, 1810032O08Rik, St6galnac2, LOC634720, BC018473, St6galnac1, Mxra7, Jmjd6, 1110005A03Rik, LOC100043293, Sfrs2, Mfsd11, Mgat5b, LOC100042036, Sec14l1, Sept9, EG667423
Downstream geneTnrc6c, Tmc6, Tmc8, 6030468B19Rik, Syngr2, Tk1, Afmid, Birc5, LOC546519, Tha1, Socs3, Pgs1, Dnahc17, Pscd1, Usp36, Timp2, Ddc8, Lgals3bp, Cant1, C1qtnf1, D230014K01Rik, D11Bwg0517e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264P14.bB6Ng01-264P14.g
ACCGA068744GA068745
length1,1291,110
definitionB6Ng01-264P14.b B6Ng01-264P14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,412,863 - 117,413,987)(117,508,534 - 117,509,644)
sequence
gaattcccaatgtgttcttggccagctgtgtgcactagtcacaagagatt
ccctgggagtgacagtagagaggtcttataggataacagagactaggcca
cccttgatgcttcatcaatgcacggggcctcacacgatctgtgaagaata
cctgttcccacccatcagagagcacacctgcaggggctctcgtgagctca
ggtgtgatcagagtctgttgctgcagcctgagcccgttagtccaggaaag
ccactcccaacctgtcaacacatgtactgtagagtcctacatcgagcagg
tttctgctgattggggtgggggtggcaggttctgggaacagtggggatgc
ccaagagccaggccagacgctatggacatgatttctgaggctcagtgagg
caggaagagggcaacagaaaggaagcctgagtaagggagttgcagagaag
actgaactgggtggcaccaccatttcctcctggctggaccccagggtctg
aagtgcccagggcagccagagcaggccatctcctgcctcccaccaatggt
ttccaggaaaggctcagttgtcatggcaacatccatccaattactccact
tttgcagaaatcacctaccagccaagttggctggaactcaccccttctaa
agaacaagtcctccgcttgaagtttggcctcgctgtggccaagcgtgtga
agcgagaagtggagaggcgggttgggcacatgggccacaagagagatggt
cacagaggcagaggctataaccaagggacaatggctagccttcacaaacc
agagacaggcggagagctggatcctgcaagggtgctaaaggataggcaag
ttaggaaagggattctatgtgaatagctttgctgaggacagggctggtca
ctgagaaggctgaggtgcccgtgaagtcttcctagagggtgcggagttca
gaaggaagtggcttggccaattggtcatttactgaaagtaacaaagttgg
agattggcctgtattgtgattatacacttaggagggttgggcagcccaac
caaggagggcggtgctcctgtgcatggtgtctggagtgacagggtgtcaa
ggtaaagattcgtttgatgagtacagtca
gaattcagattcatcctcagctacacagtgagggcttggccagcctgtgg
gcgatgcgtaaaattgtctcagtaaactaaacacagcgctggacagatgg
ctcagcagttaacagcactagctgctcttccaaaagacccaggactgatc
ccagcatccacatgatggttcacagccatctgtaacttcagctacaaatc
ccatgccttcttctggtctccataggtaccaggacatatgtagtgcacaa
atttccaggcaaaactcgacacacatcatgtaatgaaaggtaaacaaaac
agagtcaaacagagctgctggaagtgaaggggtatgtgtcaggcagcagg
gcaggagcggggtactgggctccgcagggatggcagttcgggtgacaagc
agatttctgaagccgtttgcagaatgagacctgtttgacctcaaacactc
agagcttcagctcttcctggaagcaataggatggctaatgagaggaataa
ggctagaaacctcactggcttgttgcagctgcccaggccctaccttcaag
cagttgatggtctgggaatttggagcaggttaaccaagagcccgtcatca
cactgtgtgccagtcttctgagtgtgtgtgccgcattaccaccaccaggg
acaggtcttgcccttagaccacctatgttcctccctagaatgcagtctta
gggttttactgctgtgaacagacaccatgaccaaggcaactcttataagg
atgataattggggctggcttgcaggtttggaggttcattccattatcatt
aaggcaggaacataatggcctccaggtaggcatggtacaggaggagctga
gagttctacatcttcatctgaaggctgctagcagactactgccttccagg
cagctagaatgagggtcttaaagcccacgcccacagtgacacacccactc
caacaaggcacacttctaatagtgccattccccgtgctgagcacatacaa
acatcacaactgcagtctttgtttttggaacatactggagatctgccttg
caggaaccagtcctcaagtgcagttatccttttgagaagagattgccgat
ttgcctgagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_117412863_117413987
seq2: B6Ng01-264P14.b_48_1176

seq1  GAATTCCCAATGTGTTCTTGGCCAGCTGTGTGCACTAGTCACAAGAGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAATGTGTTCTTGGCCAGCTGTGTGCACTAGTCACAAGAGATT  50

seq1  CCCTGGGAGTGACAGTAGAGAGGTCTTATAGGATAACAGAGACTAGGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGAGTGACAGTAGAGAGGTCTTATAGGATAACAGAGACTAGGCCA  100

seq1  CCCTTGATGCTTCATCAATGCACGGGGCCTCACACGATCTGTGAAGAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGATGCTTCATCAATGCACGGGGCCTCACACGATCTGTGAAGAATA  150

seq1  CCTGTTCCCACCCATCAGAGAGCACACCTGCAGGGGCTCTCGTGAGCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTCCCACCCATCAGAGAGCACACCTGCAGGGGCTCTCGTGAGCTCA  200

seq1  GGTGTGATCAGAGTCTGTTGCTGCAGCCTGAGCCCGTTAGTCCAGGAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGATCAGAGTCTGTTGCTGCAGCCTGAGCCCGTTAGTCCAGGAAAG  250

seq1  CCACTCCCAACCTGTCAACACATGTACTGTAGAGTCCTACATCGAGCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCCAACCTGTCAACACATGTACTGTAGAGTCCTACATCGAGCAGG  300

seq1  TTTCTGCTGATTGGGGTGGGGGTGGCAGGTTCTGGGAACAGTGGGGATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGCTGATTGGGGTGGGGGTGGCAGGTTCTGGGAACAGTGGGGATGC  350

seq1  CCAAGAGCCAGGCCAGACGCTATGGACATGATTTCTGAGGCTCAGTGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGCCAGGCCAGACGCTATGGACATGATTTCTGAGGCTCAGTGAGG  400

seq1  CAGGAAGAGGGCAACAGAAAGGAAGCCTGAGTAAGGGAGTTGCAGAGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGAGGGCAACAGAAAGGAAGCCTGAGTAAGGGAGTTGCAGAGAAG  450

seq1  ACTGAACTGGGTGGCACCACCATTTCCTCCTGGCTGGACCCCAGGGTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACTGGGTGGCACCACCATTTCCTCCTGGCTGGACCCCAGGGTCTG  500

seq1  AAGTGCCCAGGGCAGCCAGAGCAGGCCATCTCCTGCCTCCCACCAATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCCAGGGCAGCCAGAGCAGGCCATCTCCTGCCTCCCACCAATGGT  550

seq1  TTCCAGGAAAGGCTCAGTTGTCATGGCAACATCCATCCAATTACTCCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGAAAGGCTCAGTTGTCATGGCAACATCCATCCAATTACTCCACT  600

seq1  TTTGCAGAAATCACCTACCAGCCAAGTTGGCTGGAACTCACCCCTTCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGAAATCACCTACCAGCCAAGTTGGCTGGAACTCACCCCTTCTAA  650

seq1  AGAACAAGTCCTCCGCTTGAAGTTTGGCCTCGCTGTGGCCAAGCGTGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAGTCCTCCGCTTGAAGTTTGGCCTCGCTGTGGCCAAGCGTGTGA  700

seq1  AGCGAGAAGTGGAGAGGCGGGTTGGGCACATGGGCCACAAGAGAGATGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAGAAGTGGAGAGGCGGGTTGGGCACATGGGCCACAAGAGAGATGGT  750

seq1  CACAGAGGCAGAGGCTATAACCAAGGGACAATGGCTAGCCTTCACAAACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGCAGAGGCTATAACCAAGGGACAATGGCTAGCCTTCACAAACC  800

seq1  AGAGACAGGCGGAGAGCTGGATCCTGCCAAGGTGCTAAAGGATAGGCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGGCGGAGAGCTGGATCCTGCAAGGGTGCTAAAGGATAGGCAAG  850

seq1  TTAGGAAAGGGATTCTATGTGAAATAGCTTTGCTGAGGACAGGGCTGGTC  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAAGGGATTCTATGTG-AATAGCTTTGCTGAGGACAGGGCTGGTC  899

seq1  ACTGAGAAGGCTGAGGTGCCCGTGAAGTCTTCCTAGAGGGTGCGGAGTCC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACTGAGAAGGCTGAGGTGCCCGTGAAGTCTTCCTAGAGGGTGCGGAGTTC  949

seq1  AGAAGGAAGTGGC-TGGCCAATTGGTCATTTACTGAAAGTAACAAAAGTG  999
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  AGAAGGAAGTGGCTTGGCCAATTGGTCATTTACTGAAAGTAACAAAGTTG  999

seq1  GAGAATGG-CTGTATTGTGA-TATACACATAGGAGG--TTGGCAAGCCAA  1045
      |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||  ||||
seq2  GAGATTGGCCTGTATTGTGATTATACACTTAGGAGGGTTGGGCAGCCCAA  1049

seq1  CCAAGGAGGGCGGGTGCT-CTGGGCAGAGGTGTCCTGAGTGACA-GGTGG  1093
      ||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||  |||||||| |||| 
seq2  CCAAGGAGGGC-GGTGCTCCTGTGCA-TGGTGTCTGGAGTGACAGGGTGT  1097

seq1  CCAGTAGAAGA-TCGGTTGATTGAGTACAGTCA  1125
      | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||
seq2  CAAGGTAAAGATTCGTTTGA-TGAGTACAGTCA  1129

seq1: chr11_117508534_117509644
seq2: B6Ng01-264P14.g_68_1177 (reverse)

seq1  CCTCA-GCAAATC-GCCATCTCTTCTCAAAAGGATACTGGCACTTGAGGC  48
      ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||| 
seq2  CCTCAGGCAAATCGGCAATCTCTTCTCAAAAGGATAACTGCACTTGAGGA  50

seq1  CTGGTTCCTGCAGGGCAGATCT-CAGTAATGGTTCCAAAACAAAGACTGC  97
      |||||||||||| ||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||
seq2  CTGGTTCCTGCAAGGCAGATCTCCAGT-ATGTTCCAAAAACAAAGACTGC  99

seq1  AGTTGTGATGGTTTGTATGTGCTCAGCACGGGGAATGGCACTATTAGGAG  147
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || 
seq2  AGTTGTGAT-GTTTGTATGTGCTCAGCACGGGGAATGGCACTATTA-GAA  147

seq1  GTGTGGCCTTGTTGGAGTGGGTGTGTCACTGTGGGCGTGGGCTTTAAGAC  197
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGT-GCCTTGTTGGAGTGGGTGTGTCACTGTGGGCGTGGGCTTTAAGAC  196

seq1  CCTCATTCTAGCTGCCTGGAAGGCAGTAGTCTGCTAGCAGCCTTCAGATG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATTCTAGCTGCCTGGAAGGCAGTAGTCTGCTAGCAGCCTTCAGATG  246

seq1  AAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCTGTACCATGCCTACCTGGAGGCCAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTCCTGTACCATGCCTACCTGGAGGCCAT  296

seq1  TATGTTCCTGCCTTAATGATAATGGAATGAACCTCCAAACCTGCAAGCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTCCTGCCTTAATGATAATGGAATGAACCTCCAAACCTGCAAGCCA  346

seq1  GCCCCAATTATCATCCTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAATTATCATCCTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCA  396

seq1  CAGCAGTAAAACCCTAAGACTGCATTCTAGGGAGGAACATAGGTGGTCTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTAAAACCCTAAGACTGCATTCTAGGGAGGAACATAGGTGGTCTA  446

seq1  AGGGCAAGACCTGTCCCTGGTGGTGGTAATGCGGCACACACACTCAGAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAAGACCTGTCCCTGGTGGTGGTAATGCGGCACACACACTCAGAAG  496

seq1  ACTGGCACACAGTGTGATGACGGGCTCTTGGTTAACCTGCTCCAAATTCC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCACACAGTGTGATGACGGGCTCTTGGTTAACCTGCTCCAAATTCC  546

seq1  CAGACCATCAACTGCTTGAAGGTAGGGCCTGGGCAGCTGCAACAAGCCAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCATCAACTGCTTGAAGGTAGGGCCTGGGCAGCTGCAACAAGCCAG  596

seq1  TGAGGTTTCTAGCCTTATTCCTCTCATTAGCCATCCTATTGCTTCCAGGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTTTCTAGCCTTATTCCTCTCATTAGCCATCCTATTGCTTCCAGGA  646

seq1  AGAGCTGAAGCTCTGAGTGTTTGAGGTCAAACAGGTCTCATTCTGCAAAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGAAGCTCTGAGTGTTTGAGGTCAAACAGGTCTCATTCTGCAAAC  696

seq1  GGCTTCAGAAATCTGCTTGTCACCCGAACTGCCATCCCTGCGGAGCCCAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGAAATCTGCTTGTCACCCGAACTGCCATCCCTGCGGAGCCCAG  746

seq1  TACCCCGCTCCTGCCCTGCTGCCTGACACATACCCCTTCACTTCCAGCAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCGCTCCTGCCCTGCTGCCTGACACATACCCCTTCACTTCCAGCAG  796

seq1  CTCTGTTTGACTCTGTTTTGTTTACCTTTCATTACATGATGTGTGTCGAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTTGACTCTGTTTTGTTTACCTTTCATTACATGATGTGTGTCGAG  846

seq1  TTTTGCCTGGAAATTTGTGCACTACATATGTCCTGGTACCTATGGAGACC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCCTGGAAATTTGTGCACTACATATGTCCTGGTACCTATGGAGACC  896

seq1  AGAAGAAGGCATGGGATTTGTAGCTGAAGTTACAGATGGCTGTGAACCAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAAGGCATGGGATTTGTAGCTGAAGTTACAGATGGCTGTGAACCAT  946

seq1  CATGTGGATGCTGGGATCAGTCCTGGGTCTTTTGGAAGAGCAGCTAGTGC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGATGCTGGGATCAGTCCTGGGTCTTTTGGAAGAGCAGCTAGTGC  996

seq1  TGTTAACTGCTGAGCCATCTGTCCAGCGCTGTGTTTAGTTTACTGAGACA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAACTGCTGAGCCATCTGTCCAGCGCTGTGTTTAGTTTACTGAGACA  1046

seq1  ATTTTACGCATCGCCCACAGGCTGGCCAAGCCCTCACTGTGTAGCTGAGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACGCATCGCCCACAGGCTGGCCAAGCCCTCACTGTGTAGCTGAGG  1096

seq1  ATGAATCTGAATTC  1111
      ||||||||||||||
seq2  ATGAATCTGAATTC  1110