BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265B22
Chromosome11 (Build37)
Map Location 106,598,931 - 106,720,206
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm885, Polg2, Ddx5, Ccdc45, Smurf2
Upstream geneTanc2, LOC667737, Cyb561, Ace, EG217246, Kcnh6, Wdr68, Ccdc44, Map3k3, Limd2, 2610019A05Rik, 2610204L23Rik, Ddx42, Ftsj3, Psmc5, Smarcd2, Tcam1, Gh, Cd79b, Scn4a, 2310007L24Rik, Icam2, Ern1, LOC100041277, Tex2, Pecam1
Downstream geneLOC666873, Kpna2, 1810010H24Rik, Bptf, LOC100042899, Nol11, LOC671692, Pitpnc1, Psmd12, A830035A12Rik, Helz, Cacng1, Cacng4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265B22.bB6Ng01-265B22.g
ACCGA068854GA068855
length917488
definitionB6Ng01-265B22.b B6Ng01-265B22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(106,719,290 - 106,720,206)(106,598,931 - 106,599,424)
sequence
gaattcattaaagcagttcagcattttgcccatcataagtgcttacttag
taagctagggttagtggcacacacctttaatctcagcagagccagacaga
cttgtgagtttgagaccagcctggtctacttagtgagttccaggacagag
ctacatagtgagaccttgtctcaaaaaaaaaaaccaaaaccaaaatcaag
tacttaataattagctacttttaaaaaatgttgttactattattgttatt
ctcattttacagcaacaaaaatggaaaccaatataaatcatttgcctgaa
gttatttaataagtgggggagctggatcttaaggcctaagccttaattcc
caagcttataaattttatcattattatccactttttatactgtcttatac
tttactgatttttttatttcaaagtatttttaattaacttcaatgaaata
taatttaaattaagttgtacccacttacagtagatgtagttaattgattg
acttttagctcaacctattgtttataattttatcacatttatttgtgtga
atttgtgtgagtttatgtgagctatagcttgttgtgtgtgtatgtggggg
tcagaagacagcttttgtaggttggttctctcttcttaccatatgtaacc
tcggaatcaaatacaagttgttacttgatagcaagtacctttatccactc
agccatcttgctagcctgtcttattttgacataaaattttatatacaagt
tctagtgcttgcatattttgtttaaattttaaaaatcctaaaattgtgct
aagtatagtgacctactcttatcaatctgagcggttgggaggttgaggaa
ggaggatcatgaatttaaggtcacattttaagggattgtgagttcaaaga
taaggtgagttgcattg
ctgacactgaggcaggagaattacccggttttgactgggccacataagga
gttccagtccagtcaggactacagagtgcaagaaagaccctatcttaaaa
caacaaaaaacaggtaggatggctcagtggataaagagtagctgtggcca
agtctgatgacccgagtttgattcctggtacccacatggtggatggtggg
aagaagagacccgacgccagcaagctgtcctgaccacaccagaatgtgtg
ttatgtcatgcatacctctacactgatggacagatagatagacagatgca
cacaggcgcacacatggacacatgttttgttttgtttggttggtttggag
ttttttccaaaaaaaggtttcactgtatagccctggctgtcactctgtag
accaggctggccttgccctgagggaccagcctcaccgatgagatagcata
gaatagagtttatttagggcatggggaggggagttgag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_106719290_106720206
seq2: B6Ng01-265B22.b_47_963 (reverse)

seq1  CAATACAACTCACACTATCTTGGAACTCACAATTCCTTAAATTGTGACCT  50
      |||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2  CAATGCAACTCACCTTATCTTTGAACTCACAATCCCTTAAAATGTGACCT  50

seq1  TAAATTCATGATCCTCCTTCCTCAACCTCCCAACCGCTCAGATTGATAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTCATGATCCTCCTTCCTCAACCTCCCAACCGCTCAGATTGATAAG  100

seq1  AGTAGGTCACTATACTTAGCACAATTTTAGGATTTTTAAAATTTAAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGTCACTATACTTAGCACAATTTTAGGATTTTTAAAATTTAAACAA  150

seq1  AATATGCAAGCACTAGAACTTGTATATAAAATTTTATGTCAAAATAAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCAAGCACTAGAACTTGTATATAAAATTTTATGTCAAAATAAGAC  200

seq1  AGGCTAGCAAGATGGCTGAGTGGATAAAGGTACTTGCTATCAAGTAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAGCAAGATGGCTGAGTGGATAAAGGTACTTGCTATCAAGTAACAA  250

seq1  CTTGTATTTGATTCCGAGGTTACATATGGTAAGAAGAGAGAACCAACCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTATTTGATTCCGAGGTTACATATGGTAAGAAGAGAGAACCAACCTA  300

seq1  CAAAAGCTGTCTTCTGACCCCCACATACACACACAACAAGCTATAGCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGCTGTCTTCTGACCCCCACATACACACACAACAAGCTATAGCTCA  350

seq1  CATAAACTCACACAAATTCACACAAATAAATGTGATAAAATTATAAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAACTCACACAAATTCACACAAATAAATGTGATAAAATTATAAACAA  400

seq1  TAGGTTGAGCTAAAAGTCAATCAATTAACTACATCTACTGTAAGTGGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTGAGCTAAAAGTCAATCAATTAACTACATCTACTGTAAGTGGGTA  450

seq1  CAACTTAATTTAAATTATATTTCATTGAAGTTAATTAAAAATACTTTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTAATTTAAATTATATTTCATTGAAGTTAATTAAAAATACTTTGAA  500

seq1  ATAAAAAAATCAGTAAAGTATAAGACAGTATAAAAAGTGGATAATAATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAAATCAGTAAAGTATAAGACAGTATAAAAAGTGGATAATAATGA  550

seq1  TAAAATTTATAAGCTTGGGAATTAAGGCTTAGGCCTTAAGATCCAGCTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTTATAAGCTTGGGAATTAAGGCTTAGGCCTTAAGATCCAGCTCC  600

seq1  CCCACTTATTAAATAACTTCAGGCAAATGATTTATATTGGTTTCCATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTTATTAAATAACTTCAGGCAAATGATTTATATTGGTTTCCATTTT  650

seq1  TGTTGCTGTAAAATGAGAATAACAATAATAGTAACAACATTTTTTAAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTGTAAAATGAGAATAACAATAATAGTAACAACATTTTTTAAAAG  700

seq1  TAGCTAATTATTAAGTACTTGATTTTGGTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAATTATTAAGTACTTGATTTTGGTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGAC  750

seq1  AAGGTCTCACTATGTAGCTCTGTCCTGGAACTCACTAAGTAGACCAGGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTCACTATGTAGCTCTGTCCTGGAACTCACTAAGTAGACCAGGCT  800

seq1  GGTCTCAAACTCACAAGTCTGTCTGGCTCTGCTGAGATTAAAGGTGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCAAACTCACAAGTCTGTCTGGCTCTGCTGAGATTAAAGGTGTGTG  850

seq1  CCACTAACCCTAGCTTACTAAGTAAGCACTTATGATGGGCAAAATGCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAACCCTAGCTTACTAAGTAAGCACTTATGATGGGCAAAATGCTGA  900

seq1  ACTGCTTTAATGAATTC  917
      |||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTAATGAATTC  917

seq1: chr11_106598931_106599424
seq2: B6Ng01-265B22.g_66_559

seq1  GAATTCCTGACACTGAGGCAGGAGAATTACCCGGTTTTGACTGGGCCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGACACTGAGGCAGGAGAATTACCCGGTTTTGACTGGGCCACA  50

seq1  TAAGGAGTTCCAGTCCAGTCAGGACTACAGAGTGCAAGAAAGACCCTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAGTTCCAGTCCAGTCAGGACTACAGAGTGCAAGAAAGACCCTATC  100

seq1  TTAAAACAACAAAAAACAGGTAGGATGGCTCAGTGGATAAAGAGTAGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACAACAAAAAACAGGTAGGATGGCTCAGTGGATAAAGAGTAGCTG  150

seq1  TGGCCAAGTCTGATGACCCGAGTTTGATTCCTGGTACCCACATGGTGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAAGTCTGATGACCCGAGTTTGATTCCTGGTACCCACATGGTGGAT  200

seq1  GGTGGGAAGAAGAGACCCGACGCCAGCAAGCTGTCCTGACCACACCAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGAAGAAGAGACCCGACGCCAGCAAGCTGTCCTGACCACACCAGAA  250

seq1  TGTGTGTTATGTCATGCATACCTCTACACTGATGGACAGATAGATAGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTTATGTCATGCATACCTCTACACTGATGGACAGATAGATAGACA  300

seq1  GATGCACACAGGCGCACACATGGACACATGTTTTGTTTTGTTTGGTTGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCACACAGGCGCACACATGGACACATGTTTTGTTTTGTTTGGTTGGT  350

seq1  TTGGAGTTTTTTCCAAAAAAAGGTTTCACTGTATAGCCCTGGCTGTCACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGTTTTTTCCAAAAAAAGGTTTCACTGTATAGCCCTGGCTGTCACT  400

seq1  CTGTAGACCAGGCTGGCCTTGCCCTGAGGGACCAGCCTCACCGATGAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGACCAGGCTGGCCTTGCCCTGAGGGACCAGCCTCACCGATGAGAT  450

seq1  AGCATAGAATAGAGTTTATTTAGGGCATGGGGAGGGGAGTTGAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGAATAGAGTTTATTTAGGGCATGGGGAGGGGAGTTGAG  494