BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267O14
Chromosome11 (Build37)
Map Location 8,038,161 - 8,184,294
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAdcy1, LOC100041347, Igfbp1, Igfbp3
Downstream geneLOC665380, Tns3, LOC638720, Pkd1l1, LOC624800, Hus1, Sunc1, OTTMUSG00000005148, Upp1, LOC626887, LOC100041469, Abca13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267O14.bB6Ng01-267O14.g
ACCGA070910GA070911
length1,0981,132
definitionB6Ng01-267O14.b B6Ng01-267O14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(8,183,208 - 8,184,294)(8,038,161 - 8,039,249)
sequence
gaattcttcccagcgcactttcctccttattttagtcagcttctggaagg
gcacactgctcactgcctattataatgatgatgacaatatgcccgatata
cccgagtacgagagcaaggttgctttagcgcacgcacatttgagacgatc
cagaccatggttcctggttctggtgccttgggctggtgctagtacagtac
cccacagcaggggcatatggcacaaaaggcttgcttgtctcatagtggac
tggaaacagaggcagggagggttcctaatatcacctttagatgaagacac
tctgtggcccaacttcttcctcccagtagttgctcaggctataaatcaag
ttatagagagacctatctaaactgtaaagagtttcccacatgtgtctctc
ctgactcccccttcattcttacaaaaccagcaccaaactctatgttcttc
ccgtttgtttgtttgcttgtttgtttgtttaagacaaccatgtggctgag
aacgttttctgatagacgctaattttctgattatccacctctcccttttc
atgtccaccttctgtgtattgttctaggactctcaccatggagtctttcc
tttgcaggcctcctttgctttgttacatggatgtgattttgctactctca
ctcctttactcgctttctttcatatgtcccttggctgacactgtccccaa
gccagtggctaaggactccttctcacaggacacttctctccacattagtt
cagcctttcttgacttcagtgcctgtctctttctcacagcatacgaatct
ggatctgtcacctaaatttgtcctgggcacacaaagtcaaagcttttatc
tatacatcaatgagtcactagcatgtaccatgacagttccaatgagactc
attacctacgaaagtgtctgtcttggatagacaggctagagttattcaga
aagggggacctcaaattgagaaatgccttccataaaattctggctctaga
gcattttcttggagtagtgattgggtgagggagccccagcccactgtggg
gtgctgcatcccttggaacttggtggttccttgggttcctataagaaa
gaattctcctctcaatcacttgtcttctcttctaagagcatggtttggct
tctttgttattgttgttgttcattttatcttttgttgttgttttgtattt
caacatgagaaggagacctataaattgtctgtggtgaagcgaatgctcag
ctaaccaggtcttactttccaaaacagtgatggtcaaacaccagagggaa
aacaattccatgacgtggaatgttaataaaaccagaaaggtgtctctttg
aggtcatataccagccaaggtcactgtgtccccttgaaccatgactgaaa
ccaaaaaaatgataagcaggaggcttctccttcatgtaaaattctaaaat
gttatggcaacattatgtacaaagaatagggaaccgtgaaaatttctcaa
cagctggcataatccttcccccctattgtctttgtgagaaaatataacat
tgattccatcccagaaatgaccagaggaaggcagctgccagttcaacttg
acaatacatgggtgtgtagcacctggcatgcccttcacagtcgcagagaa
gatagacacgaggaaagctggacggatgcagtctctgggagaccagaggg
atcctaagtatctgggaagttctcagcagtgtctttggttttgctgctga
ctgcttttagacacattaccttttaacaaactttgagtaagttcaacttc
tgagagaagatccagaaacttgcccacaagttttttgcccttctccccaa
cccaggccacaaaatgaaagaaagagaataagttttaaagtgaaaaatac
aacattacagcaagctcacacataaaaatgtaattggtaaattgtcacct
acatattcttttaacctaatgactatcccccagccctcttcttgtctctt
tctctaagagtcctgtctttgaattccctccccctgccttagctcttgcc
caagggaagaagttcccagatatgatgggtaagggtttcccaacctggcc
caacctgggctcatgggcacctatagagcccttgtagaatatcccattgt
tgtatgctttgaacatttgctccagggggcctagtaaagtgtatacctac
tggccatcttgaaaaataccttggtatgatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_8183208_8184294
seq2: B6Ng01-267O14.b_50_1147 (reverse)

seq1  TTTCTTATAGG-ACCCA--GGACCACC-AGT--CCAGGGATGGCAGCA-C  43
      ||||||||||| |||||  | |||||| |||  | |||||| |||||| |
seq2  TTTCTTATAGGAACCCAAGGAACCACCAAGTTCCAAGGGAT-GCAGCACC  49

seq1  CCACAGTGGGCTGGGGCCTCCCTCACCC-ATCACTACT-CAAGAAAATGC  91
      |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  CCACAGTGGGCTGGGG-CTCCCTCACCCAATCACTACTCCAAGAAAATGC  98

seq1  TCTAGAGCCAG-ATTTTATGG-AGGCATTTTCTCAA-TTGAGGTCCCCCT  138
      ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  TCTAGAGCCAGAATTTTATGGAAGGCA-TTTCTCAATTTGAGGTCCCCCT  147

seq1  TTCTG-ATAACTCTAGCCTGTCTATCCAAGACAGACACTTTCGTAGGTAA  187
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAATAACTCTAGCCTGTCTATCCAAGACAGACACTTTCGTAGGTAA  197

seq1  TGAGTCTCATTGGAACTGTCATGGTACATGCTAGTGACTCATTGATGTAT  237
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTCATTGGAACTGTCATGGTACATGCTAGTGACTCATTGATGTAT  247

seq1  AGATAAAAGCTTTGACTTTGTGTGCCCAGGAC-AATTTAGGTGACAGATC  286
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGATAAAAGCTTTGACTTTGTGTGCCCAGGACAAATTTAGGTGACAGATC  297

seq1  CAGATTCGTATGCTGTGAGAAAGAGACAGGCACTGAAGTCAAGAAAGGCT  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCGTATGCTGTGAGAAAGAGACAGGCACTGAAGTCAAGAAAGGCT  347

seq1  GAACTAATGTGGAGAGAAGTGTCCTGTGAGAAGGAGTCCTTAGCCACTGG  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAATGTGGAGAGAAGTGTCCTGTGAGAAGGAGTCCTTAGCCACTGG  397

seq1  CTTGGGGACAGTGTCAGCCAAGGGACATATGAAAGAAAGCGAGTAAAGGA  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGGACAGTGTCAGCCAAGGGACATATGAAAGAAAGCGAGTAAAGGA  447

seq1  GTGAGAGTAGCAAAATCACATCCATGTAACAAAGCAAAGGAGGCCTGCAA  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAGTAGCAAAATCACATCCATGTAACAAAGCAAAGGAGGCCTGCAA  497

seq1  AGGAAAGACTCCATGGTGAGAGTCCTAGAACAATACACAGAAGGTGGACA  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGACTCCATGGTGAGAGTCCTAGAACAATACACAGAAGGTGGACA  547

seq1  TGAAAAGGGAGAGGTGGATAATCAGAAAATTAGCGTCTATCAGAAAACGT  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGGGAGAGGTGGATAATCAGAAAATTAGCGTCTATCAGAAAACGT  597

seq1  TCTCAGCCACATGGTTGTCTTAAACAAACAAACAAGCAAACAAACAAACG  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCCACATGGTTGTCTTAAACAAACAAACAAGCAAACAAACAAACG  647

seq1  GGAAGAACATAGAGTTTGGTGCTGGTTTTGTAAGAATGAAGGGGGAGTCA  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAACATAGAGTTTGGTGCTGGTTTTGTAAGAATGAAGGGGGAGTCA  697

seq1  GGAGAGACACATGTGGGAAACTCTTTACAGTTTAGATAGGTCTCTCTATA  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGACACATGTGGGAAACTCTTTACAGTTTAGATAGGTCTCTCTATA  747

seq1  ACTTGATTTATAGCCTGAGCAACTACTGGGAGGAAGAAGTTGGGCCACAG  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATTTATAGCCTGAGCAACTACTGGGAGGAAGAAGTTGGGCCACAG  797

seq1  AGTGTCTTCATCTAAAGGTGATATTAGGAACCCTCCCTGCCTCTGTTTCC  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTTCATCTAAAGGTGATATTAGGAACCCTCCCTGCCTCTGTTTCC  847

seq1  AGTCCACTATGAGACAAGCAAGCCTTTTGTGCCATATGCCCCTGCTGTGG  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCACTATGAGACAAGCAAGCCTTTTGTGCCATATGCCCCTGCTGTGG  897

seq1  GGTACTGTACTAGCACCAGCCCAAGGCACCAGAACCAGGAACCATGGTCT  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTGTACTAGCACCAGCCCAAGGCACCAGAACCAGGAACCATGGTCT  947

seq1  GGATCGTCTCAAATGTGCGTGCGCTAAAGCAACCTTGCTCTCGTACTCGG  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCGTCTCAAATGTGCGTGCGCTAAAGCAACCTTGCTCTCGTACTCGG  997

seq1  GTATATCGGGCATATTGTCATCATCATTATAATAGGCAGTGAGCAGTGTG  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATCGGGCATATTGTCATCATCATTATAATAGGCAGTGAGCAGTGTG  1047

seq1  CCCTTCCAGAAGCTGACTAAAATAAGGAGGAAAGTGCGCTGGGAAGAATT  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCAGAAGCTGACTAAAATAAGGAGGAAAGTGCGCTGGGAAGAATT  1097

seq1  C  1087
      |
seq2  C  1098

seq1: chr11_8038161_8039249
seq2: B6Ng01-267O14.g_71_1202

seq1  GAATTCTCCTCTCAATCACTTGTCTTCTCTTCTAAGAGCATGGTTTGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTCTCAATCACTTGTCTTCTCTTCTAAGAGCATGGTTTGGCT  50

seq1  TCTTTGTTATTGTTGTTGTTCATTTTATCTTTTGTTGTTGTTTTGTATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTATTGTTGTTGTTCATTTTATCTTTTGTTGTTGTTTTGTATTT  100

seq1  CAACATGAGAAGGAGACCTATAAATTGTCTGTGGTGAAGCGAATGCTCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGAGAAGGAGACCTATAAATTGTCTGTGGTGAAGCGAATGCTCAG  150

seq1  CTAACCAGGTCTTACTTTCCAAAACAGTGATGGTCAAACACCAGAGGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCAGGTCTTACTTTCCAAAACAGTGATGGTCAAACACCAGAGGGAA  200

seq1  AACAATTCCATGACGTGGAATGTTAATAAAACCAGAAAGGTGTCTCTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTCCATGACGTGGAATGTTAATAAAACCAGAAAGGTGTCTCTTTG  250

seq1  AGGTCATATACCAGCCAAGGTCACTGTGTCCCCTTGAACCATGACTGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCATATACCAGCCAAGGTCACTGTGTCCCCTTGAACCATGACTGAAA  300

seq1  CCAAAAAAATGATAAGCAGGAGGCTTCTCCTTCATGTAAAATTCTAAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAAAATGATAAGCAGGAGGCTTCTCCTTCATGTAAAATTCTAAAAT  350

seq1  GTTATGGCAACATTATGTACAAAGAATAGGGAACCGTGAAAATTTCTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGGCAACATTATGTACAAAGAATAGGGAACCGTGAAAATTTCTCAA  400

seq1  CAGCTGGCATAATCCTTCCCCCCTATTGTCTTTGTGAGAAAATATAACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGCATAATCCTTCCCCCCTATTGTCTTTGTGAGAAAATATAACAT  450

seq1  TGATTCCATCCCAGAAATGACCAGAGGAAGGCAGCTGCCAGTTCAACTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCATCCCAGAAATGACCAGAGGAAGGCAGCTGCCAGTTCAACTTG  500

seq1  ACAATACATGGGTGTGTAGCACCTGGCATGCCCTTCACAGTCGCAGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATACATGGGTGTGTAGCACCTGGCATGCCCTTCACAGTCGCAGAGAA  550

seq1  GATAGACACGAGGAAAGCTGGACGGATGCAGTCTCTGGGAGACCAGAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGACACGAGGAAAGCTGGACGGATGCAGTCTCTGGGAGACCAGAGGG  600

seq1  ATCCTAAGTATCTGGGAAGTTCTCAGCAGTGTCTTTGGTTTTGCTGCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAAGTATCTGGGAAGTTCTCAGCAGTGTCTTTGGTTTTGCTGCTGA  650

seq1  CTGCTTTTAGACACATTACCTTTTAACAAACTTTGAGTAAGTTCAACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTTAGACACATTACCTTTTAACAAACTTTGAGTAAGTTCAACTTC  700

seq1  TGAGAGAAGATCCAGAAACTTGCCCACAAGTTTTTTGCCCTTC-CCCCAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGAGAGAAGATCCAGAAACTTGCCCACAAGTTTTTTGCCCTTCTCCCCAA  750

seq1  CCCAGGCCAC-AAATGAAAGAAAGAGAATAAG-TTTAAAGTG-AAAATAC  796
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  CCCAGGCCACAAAATGAAAGAAAGAGAATAAGTTTTAAAGTGAAAAATAC  800

seq1  AACATTACAGCAAGCTCACACAT-AAAATGT-ATTTGTAAATTGTCACCT  844
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||
seq2  AACATTACAGCAAGCTCACACATAAAAATGTAATTGGTAAATTGTCACCT  850

seq1  ACATATTC-TTTAACCTAATGACTAT-CCCCAGCCCTCT--CTGTCTC-T  889
      |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |
seq2  ACATATTCTTTTAACCTAATGACTATCCCCCAGCCCTCTTCTTGTCTCTT  900

seq1  TCTCT-AGAGT-CTGTCTT--GATTCCCT-CCCCTGCC-TAGCTC-TGCC  932
      ||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||||| |||||| ||||
seq2  TCTCTAAGAGTCCTGTCTTTGAATTCCCTCCCCCTGCCTTAGCTCTTGCC  950

seq1  CA--GGAAGAAGTT-CCAGA-ATGAT-GGTAAGG--TTCCCCACCTG--C  973
      ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||  |
seq2  CAAGGGAAGAAGTTCCCAGATATGATGGGTAAGGGTTTCCCAACCTGGCC  1000

seq1  CTACCT-GGCTCAT-GGCA-CTATAGAGCCCTTG-AG-ATAT-CCAT--G  1015
      | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||   
seq2  CAACCTGGGCTCATGGGCACCTATAGAGCCCTTGTAGAATATCCCATTGT  1050

seq1  TGTA-GC-TTGAACATTTGCTCCAGGGTGCTTAGTAAGGTATA---CTAC  1060
      |||| || ||||||||||||||||||| || |||||| || ||   ||||
seq2  TGTATGCTTTGAACATTTGCTCCAGGGGGCCTAGTAAAGTGTATACCTAC  1100

seq1  TGGCCATCT--GAAAATA-CTTTGTATGATGG  1089
      |||||||||   |||||| ||| |||||||||
seq2  TGGCCATCTTGAAAAATACCTTGGTATGATGG  1132