BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-272H13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 43,751,773 - 43,923,516
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAtp10b, EG544767, Pttg1, Slu7, LOC100039392, C1qtnf2, Ccnjl, Fabp6, LOC620562, 4631424J17Rik, Ttc1, Adra1b
Downstream geneIl12b, Ublcp1, 3732413I11Rik, Ebf1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-272H13.bB6Ng01-272H13.g
ACCGA074289GA074290
length8021,128
definitionB6Ng01-272H13.b B6Ng01-272H13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,922,724 - 43,923,516)(43,751,773 - 43,752,901)
sequence
gaattcaaaggtattggaaggaatcagaatgtagagtctgatagtgtcca
agaacagtagattctagaacaacagagttggggcaggagggaagcctcag
gctgggcaaccagaaaactccttgctttgggactctgaagagcaatgacc
atggaaagttccaggcaagttactgacaagctgagatttctctcctgagt
agaaacagcttgtcagaacttagttgccagggcatgttttactgacagat
tgggtgcaatttttccctgctgggggttggggggggggcatacttcaaaa
gcagacaaggaaagggaagctggaagaaggaagggacaacctgctgtcag
cttcttctgtatgacttcaggacagctcctgcagatgtgcccacaacacc
aaaagtcaattccccaagcctggaagcaagtcagcaaatctgagagccat
caagttgtacatgagcaccccaacaggctgcgggacatgcagcttagcca
cagggtgggctcagctctcatgtgacatgagcgctctcctttgtaccaaa
ttaaaccaatttgatcaaaatttgtaatgcagaggagcgtaattaaattg
aagattttaattaggcatggttttgatgaaacttaacaggagcaggcagg
aacagtcttgctgtctattaaacataatcctgtgcagtgaaagagcttgc
tagttgatgatctttaatggttaccccagagctcagcttctttgcatagt
gtcagcttggaggaagggatatagaaaggggacatggggagttaaaggga
gg
gaattcactttgccctgagattttaattcttctctaatacatactaggta
ctctgagaacagagttggatggctcatgtaagttgtatgtgccggatatg
agttttctttttttaagacagggtttctttgtagccttggctattctgga
gctccctttgtagactggccttaacatcacagagatctgcctgcctctgc
ctcccaaatgatgggattaaaggcgtgtgccaccactgctcggttgagtg
taaggttttctagtgtcatagcacaagcaatagaatagagtgctttctta
aaatgccttgttccccattcctagaggtgaccttgtacaatttgtctatc
aggcagtttgtgagcagagagatatcctctctctggctattatgtttgat
ttttctctaagaattcctgccaagatctctatttacaatttatgtgtcta
ggcaagactgtggaattctgccatggcttcacagatgagcctatgagatt
tggacctagcatccatcctgtctgtagtggtaagttggggttaggcatgt
gacctatttctggccaaagaaaactggtttttctccccactgggctgaaa
gtgggaaggattaaggagaaagcacctttcctgacaccatgagaaggaag
aggggtggagtcagcaggtggagcagggtcaggttctgatggacatgaaa
tcatgactgcagttggcactttcacaggatcaggtacaggagccaacaca
cttagtgtgtggtgagacactgggaggagggattttagccacttgccaac
aagtgttcttgacggttacagtatgtgccatgggctatgcctctccatgt
gctgtatgacaatctcacttagctacgtaacacactccaagccacagaga
actgagctcagagctggacctcatttctttcccaagccacacccagaaga
ccttctgctttaagacagaagttggaaaggcatttaaaacggagaaggaa
aggatgatgagaaagaaagaatgacgttgattttatacccttcagttatt
gttcaaagccgcttaaagatcttcattgatttaccacccattcaaaccga
aagtgacagattcatgttggtaatgatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_43922724_43923516
seq2: B6Ng01-272H13.b_49_849 (reverse)

seq1  CTCCC-TTAACT-CCCATGT-CCCTTTCTATATCCC-TCCTCCAAGCTGA  46
      ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTCCCTTTAACTCCCCATGTCCCCTTTCTATATCCCTTCCTCCAAGCTGA  50

seq1  CACTATGC-AAGAAGCTGAGCTCT-GGGTAACCATTAAAGATCATCAACT  94
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGCAAAGAAGCTGAGCTCTGGGGTAACCATTAAAGATCATCAACT  100

seq1  AGCAAGCTC-TTCACTGCACAGGATTATGTTTAATAGACAGCAAGACTGT  143
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCTCTTTCACTGCACAGGATTATGTTTAATAGACAGCAAGACTGT  150

seq1  TCCTGCCTGCTCCTGTTAAGTTTCATCAAAACCATGCCTAATTAAAATCT  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCCTGCTCCTGTTAAGTTTCATCAAAACCATGCCTAATTAAAATCT  200

seq1  TCAATTTAATTACGCTCCTCTGCATTACAAATTTTGATCAAATTGGTTTA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTAATTACGCTCCTCTGCATTACAAATTTTGATCAAATTGGTTTA  250

seq1  ATTTGGTAC-AAGGAGAGCGCTCATGTCACATGAGAGCTGAGCCCACCCT  292
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGTACAAAGGAGAGCGCTCATGTCACATGAGAGCTGAGCCCACCCT  300

seq1  GTGGCTAAGCTGCATGTCCCGCAGCCTGTTGGGGTGCTCATGTACAACTT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTAAGCTGCATGTCCCGCAGCCTGTTGGGGTGCTCATGTACAACTT  350

seq1  GATGGCTCTCAGATTTGCTGACTTGCTTCCAGGCTTGGGGAATTGACTTT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTCTCAGATTTGCTGACTTGCTTCCAGGCTTGGGGAATTGACTTT  400

seq1  TGGTGTTGTGGGCACATCTGCAGGAGCTGTCCTGAAGTCATACAGAAGAA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTGTGGGCACATCTGCAGGAGCTGTCCTGAAGTCATACAGAAGAA  450

seq1  GCTGACAGCAGGTTGTCCCTTCCTTCTTCCAGCTTCCCTTTCCTTGTCTG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACAGCAGGTTGTCCCTTCCTTCTTCCAGCTTCCCTTTCCTTGTCTG  500

seq1  CTTTTGAAGTATGCCCCCCCCCCAACCCCCAGCAGGGAAAAATTGCACCC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGAAGTATGCCCCCCCCCCAACCCCCAGCAGGGAAAAATTGCACCC  550

seq1  AATCTGTCAGTAAAACATGCCCTGGCAACTAAGTTCTGACAAGCTGTTTC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTCAGTAAAACATGCCCTGGCAACTAAGTTCTGACAAGCTGTTTC  600

seq1  TACTCAGGAGAGAAATCTCAGCTTGTCAGTAACTTGCCTGGAACTTTCCA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAGGAGAGAAATCTCAGCTTGTCAGTAACTTGCCTGGAACTTTCCA  650

seq1  TGGTCATTGCTCTTCAGAGTCCCAAAGCAAGGAGTTTTCTGGTTGCCCAG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATTGCTCTTCAGAGTCCCAAAGCAAGGAGTTTTCTGGTTGCCCAG  700

seq1  CCTGAGGCTTCCCTCCTGCCCCAACTCTGTTGTTCTAGAATCTACTGTTC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGCTTCCCTCCTGCCCCAACTCTGTTGTTCTAGAATCTACTGTTC  750

seq1  TTGGACACTATCAGACTCTACATTCTGATTCCTTCCAATACCTTTGAATT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACACTATCAGACTCTACATTCTGATTCCTTCCAATACCTTTGAATT  800

seq1  C  793
      |
seq2  C  801

seq1: chr11_43751773_43752901
seq2: B6Ng01-272H13.g_65_1192

seq1  GAATTCACTTTGCCCTGAGATTTTAATTCTTCTCTAATACATACTAGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTGCCCTGAGATTTTAATTCTTCTCTAATACATACTAGGTA  50

seq1  CTCTGAGAACAGAGTTGGATGGCTCATGTAAGTTGTATGTGCCGGATATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGAACAGAGTTGGATGGCTCATGTAAGTTGTATGTGCCGGATATG  100

seq1  AGTTTTCTTTTTTTAAGACAGGGTTTCTTTGTAGCCTTGGCTATTCTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCTTTTTTTAAGACAGGGTTTCTTTGTAGCCTTGGCTATTCTGGA  150

seq1  GCTCCCTTTGTAGACTGGCCTTAACATCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTTTGTAGACTGGCCTTAACATCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGC  200

seq1  CTCCCAAATGATGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTGCTCGGTTGAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAAATGATGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTGCTCGGTTGAGTG  250

seq1  TAAGGTTTTCTAGTGTCATAGCACAAGCAATAGAATAGAGTGCTTTCTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTTTTCTAGTGTCATAGCACAAGCAATAGAATAGAGTGCTTTCTTA  300

seq1  AAATGCCTTGTTCCCCATTCCTAGAGGTGACCTTGTACAATTTGTCTATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCTTGTTCCCCATTCCTAGAGGTGACCTTGTACAATTTGTCTATC  350

seq1  AGGCAGTTTGTGAGCAGAGAGATATCCTCTCTCTGGCTATTATGTTTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTTTGTGAGCAGAGAGATATCCTCTCTCTGGCTATTATGTTTGAT  400

seq1  TTTTCTCTAAGAATTCCTGCCAAGATCTCTATTTACAATTTATGTGTCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTAAGAATTCCTGCCAAGATCTCTATTTACAATTTATGTGTCTA  450

seq1  GGCAAGACTGTGGAATTCTGCCATGGCTTCACAGATGAGCCTATGAGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGACTGTGGAATTCTGCCATGGCTTCACAGATGAGCCTATGAGATT  500

seq1  TGGACCTAGCATCCATCCTGTCTGTAGTGGTAAGTTGGGGTTAGGCATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCTAGCATCCATCCTGTCTGTAGTGGTAAGTTGGGGTTAGGCATGT  550

seq1  GACCTATTTCTGGCCAAAGAAAACTGGTTTTTCTCCCCACTGGGCTGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTATTTCTGGCCAAAGAAAACTGGTTTTTCTCCCCACTGGGCTGAAA  600

seq1  GTGGGAAGGATTAAGGAGAAAGCACCTTTCCTGACACCATGAGAAGGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAGGATTAAGGAGAAAGCACCTTTCCTGACACCATGAGAAGGAAG  650

seq1  AGGGGTGGAGTCAGCAGGTGGAGCAGGGTCAGGTTCTGATGGACATGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTGGAGTCAGCAGGTGGAGCAGGGTCAGGTTCTGATGGACATGAAA  700

seq1  TCATGACTGCAGTTGGCACTTTCACAGGATCAGGTACAGGAGCCAACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGACTGCAGTTGGCACTTTCACAGGATCAGGTACAGGAGCCAACACA  750

seq1  CTTAGTGTGTGGTGAGACACTGGGAGGAGGGATTTTAGCCACTTGCCAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGTGTGGTGAGACACTGGGAGGAGGGATTTTAGCCACTTGCCAAC  800

seq1  AAGTGTTCTTGACGGTTACAGTATGTGCCATGGGCTATGCCTCTCCATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTCTTGACGGTTACAGTATGTGCCATGGGCTATGCCTCTCCATGT  850

seq1  GCTGTATGACAATCTCACTTAGCTACGTAACACACTCCAAGCCACAGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTATGACAATCTCACTTAGCTACGTAACACACTCCAAGCCACAGAGA  900

seq1  ACTGAGCTCAGAGCTGGACCTCATT--CTTCCCAAG-CACACCCAGAAGA  947
      |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||
seq2  ACTGAGCTCAGAGCTGGACCTCATTTCTTTCCCAAGCCACACCCAGAAGA  950

seq1  CC-TCTGC-TTAAGACAGAAGTGGAAAAGGCAATTAAAAAGGAAGAAGGA  995
      || ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||
seq2  CCTTCTGCTTTAAGACAGAAGTTGGAAAGGCATTTAAAACGG-AGAAGGA  999

seq1  AAGGAAGGAAGGAAGAAAGAAAAGAATGACAGTTGATTTTATAACCTTCC  1045
      ||||| |  | | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| 
seq2  AAGGATG--ATG-AGAAAG-AAAGAATGAC-GTTGATTTTATACCCTTCA  1044

seq1  AGTATTG-TCAAAGCCGCTTTAAAAGATCTCCATTGATATA-CACCCATT  1093
        ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||
seq2  GTTATTGTTCAAAGCCGCTT--AAAGATCTTCATTGATTTACCACCCATT  1092

seq1  TAAACAG-AAGTGACCAGTATCATGTTGTAGATGATG  1129
       |||| | |||||| |||  ||||||||   ||||||
seq2  CAAACCGAAAGTGA-CAGATTCATGTTGGTAATGATG  1128