BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-276K21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 12,167,337 - 12,300,301
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCobl
Upstream geneVwc2, Zpbp, LOC625132, EG432534, 4930415F15Rik, Ikzf1, Fignl1, Ddc, Grb10
Downstream geneLOC627244
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-276K21.bB6Ng01-276K21.g
ACCGA077401GA077402
length1,1351,069
definitionB6Ng01-276K21.b B6Ng01-276K21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,299,181 - 12,300,301)(12,167,337 - 12,168,379)
sequence
gaattcacagatgaagagggttcatggccattggtctagaactaggctta
cagatgggttttcaaatggtagagggttgtggtaaggacagggagagaaa
gaagttacttacccagaaaaagtggatagtgcctagagaggtttcacagg
ctgcagggtttggaactgatttaaaagaaatgaacagccaggaaggagtg
ggagttgctggaaggaaactttaaagacaggaacactccataggcttacg
aagatgaggatatgagtctggatggagccttagcccaggggacaaaatgt
gtcagtttccagtatggctctggtccaccactatgtgagactgtgctgtg
cacacactttgccaagagcatccatgtaccagatgtcaggatcggttact
ctatatatctcaccgttcacctgggcagtaggagttttggttcctgtttg
tagtaggtaagaactcttgagttgcaggaagccagctggcaggtagcaga
tgtaaaatttctatacaaatagctcttactcaaactccccccaacctccc
caagtctttcccatagtactgtccagaatgtgagtgtgcatcaaagaaag
gacttgagtatggatctcacctgtcttggcactaaataagagagggtcta
ggccagtaggttctcaaccttcttaatgctaagacccttttatacagctc
ctcaggttgtggtggccccatcataaaattattttcagtgctactttaca
aacataaatttgctactgttatgaactgtagtatacaaatctgatatgaa
gatggtcttaggcgacctctgtgaaaggttcatttgacaccccccagggg
gatgaaaaccacatgttgagaacctctggtctagactgccaatcataaag
gtgatttgttcaggagatccttcccttgagttcttcatggctttgttgac
caggagaagaatgaacccttgtagttgagcccactatatccctctctcta
tgtttaaaacctactcttcccagagcagctctcttctcagtcttggaatc
tgttcctctggtcactcctccaggtttctatttctcctgtttccagcctt
ctttaggtgtccagcagacgtgtaatgttcctctc
gaattcaaactatcccatgaaaacctggacacttgattggttagtctttt
gtctatctttgtggtgccgaggatttaactagatcattgtacaatctagg
aaagggctccaccaaggagctacatcttcaaacccttaattaacccttta
aacatgcatcctctaggcaactgtggtggttaaatattcaaactagtgat
aataaagacaattttttgtagtctgactcctgacttaaaatgactgcata
tatacacatacacgtatatatataacaacaagtaatgaaaatgggtccat
gaactttaaaaagagcaaggagggatatataaaagggtttggggggaggg
aaggaaaaacaaattacaatttcaaaaacaacagcaataataaaaatgag
tttcttaaacaaacaagcaaacaaaaacatgacgaatgaacagaaacaga
ccattctggtatggaaccttctgaccagcaaccttatagaataatgttgg
aaatgtggtctacatgctaatgacattcttcctcaacatttggacctgtc
ttaattttaatactttaggaaatgtaagtttttgtgtgagtaagagatga
gcctggaagggaaggtaaaattaaaaagtatcagaacccaagaaccagta
gttaatgtccttaagcattaggtaaaagcacacagggagatggtgggcag
agctctgtgtggctttctcctgacattagagtttgtctctattgagacct
gataggaaaaactacagtcatcctgctaactggagacaggttaactagca
attgtgagaggtgaatttattctctttccagggtgtcagaaagctgtaga
gctgtagtttgaagggatataagtctataaattagtctctagagtttcaa
gttgagtcagtagacaatgggagtttttctggatcttaaaatttgaggct
agaaaccatggtacctgtggttcccaaactttgctcctccttccccataa
acagccccctggggcttggttattatgattggtaagccctcacataatgt
ggccaatgtgtatgcaact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_12299181_12300301
seq2: B6Ng01-276K21.b_47_1181 (reverse)

seq1  GAGAG--ACATT-CACGTCTGCTGGACACC-AAAGA--GCTG--AACA-G  41
      |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||| |
seq2  GAGAGGAACATTACACGTCTGCTGGACACCTAAAGAAGGCTGGAAACAGG  50

seq1  AG-AATAGAAA-CTGGAGGAGTGACCAGA-GAACAGATT-CAAGACTGAG  87
      || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  AGAAATAGAAACCTGGAGGAGTGACCAGAGGAACAGATTCCAAGACTGAG  100

seq1  AAGAGGAGCTGCCTCTGGGAAGAGTAGGTTTTAAACAATAGAGAGAGGGA  137
      |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAGA-GAGCTG-CTCTGGGAAGAGTAGGTTTTAAAC-ATAGAGAGAGGGA  147

seq1  TATAGTGGGCTCAACTACAA-GGTTCATTC-TCTCCTGGTCAACAAAGCC  185
      |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TATAGTGGGCTCAACTACAAGGGTTCATTCTTCTCCTGGTCAACAAAGCC  197

seq1  ATGAAGAACTCAA-GGAAGGATCTCCTGAACAAATCACC-TTATGATTGG  233
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ATGAAGAACTCAAGGGAAGGATCTCCTGAACAAATCACCTTTATGATTGG  247

seq1  CAGTCTAGACCAGAGGTTCTCAACATGTGGTTTTCATCCCCCTGGGGGGT  283
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAGACCAGAGGTTCTCAACATGTGGTTTTCATCCCCCTGGGGGGT  297

seq1  GTCAAATGAACCTTTCACAGAGGTCGCCTAAGACCATCTTCATATCAGAT  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAATGAACCTTTCACAGAGGTCGCCTAAGACCATCTTCATATCAGAT  347

seq1  TTGTATACTACAGTTCATAACAGTAGCAAATTTATGTTTGTAAAGTAGCA  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATACTACAGTTCATAACAGTAGCAAATTTATGTTTGTAAAGTAGCA  397

seq1  CTGAAAATAATTTTATGATGGGGCCACCACAACCTGAGGAGCTGTATAAA  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAATAATTTTATGATGGGGCCACCACAACCTGAGGAGCTGTATAAA  447

seq1  AGGGTCTTAGCATTAAGAAGGTTGAGAACCTACTGGCCTAGACCCTCTCT  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCTTAGCATTAAGAAGGTTGAGAACCTACTGGCCTAGACCCTCTCT  497

seq1  TATTTAGTGCCAAGACAGGTGAGATCCATACTCAAGTCCTTTCTTTGATG  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGTGCCAAGACAGGTGAGATCCATACTCAAGTCCTTTCTTTGATG  547

seq1  CACACTCACATTCTGGACAGTACTATGGGAAAGACTTGGGGAGGTTGGGG  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCACATTCTGGACAGTACTATGGGAAAGACTTGGGGAGGTTGGGG  597

seq1  GGAGTTTGAGTAAGAGCTATTTGTATAGAAATTTTACATCTGCTACCTGC  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTTGAGTAAGAGCTATTTGTATAGAAATTTTACATCTGCTACCTGC  647

seq1  CAGCTGGCTTCCTGCAACTCAAGAGTTCTTACCTACTACAAACAGGAACC  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGCTTCCTGCAACTCAAGAGTTCTTACCTACTACAAACAGGAACC  697

seq1  AAAACTCCTACTGCCCAGGTGAACGGTGAGATATATAGAGTAACCGATCC  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCCTACTGCCCAGGTGAACGGTGAGATATATAGAGTAACCGATCC  747

seq1  TGACATCTGGTACATGGATGCTCTTGGCAAAGTGTGTGCACAGCACAGTC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATCTGGTACATGGATGCTCTTGGCAAAGTGTGTGCACAGCACAGTC  797

seq1  TCACATAGTGGTGGACCAGAGCCATACTGGAAACTGACACATTTTGTCCC  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATAGTGGTGGACCAGAGCCATACTGGAAACTGACACATTTTGTCCC  847

seq1  CTGGGCTAAGGCTCCATCCAGACTCATATCCTCATCTTCGTAAGCCTATG  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTAAGGCTCCATCCAGACTCATATCCTCATCTTCGTAAGCCTATG  897

seq1  GAGTGTTCCTGTCTTTAAAGTTTCCTTCCAGCAACTCCCACTCCTTCCTG  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTTCCTGTCTTTAAAGTTTCCTTCCAGCAACTCCCACTCCTTCCTG  947

seq1  GCTGTTCATTTCTTTTAAATCAGTTCCAAACCCTGCAGCCTGTGAAACCT  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTCATTTCTTTTAAATCAGTTCCAAACCCTGCAGCCTGTGAAACCT  997

seq1  CTCTAGGCACTATCCACTTTTTCTGGGTAAGTAACTTCTTTCTCTCCCTG  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGGCACTATCCACTTTTTCTGGGTAAGTAACTTCTTTCTCTCCCTG  1047

seq1  TCCTTACCACAACCCTCTACCATTTGAAAACCCATCTGTAAGCCTAGTTC  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTACCACAACCCTCTACCATTTGAAAACCCATCTGTAAGCCTAGTTC  1097

seq1  TAGACCAATGGCCATGAACCCTCTTCATCTGTGAATTC  1121
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCAATGGCCATGAACCCTCTTCATCTGTGAATTC  1135

seq1: chr11_12167337_12168379
seq2: B6Ng01-276K21.g_66_1134

seq1  GAATTCAAACTATCCCATGAAAACCTGGACACTTGATTGGTTAGTCTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACTATCCCATGAAAACCTGGACACTTGATTGGTTAGTCTTTT  50

seq1  GTCTATCTTTGTGGTGCCGAGGATTTAACTAGATCATTGTACAATCTAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATCTTTGTGGTGCCGAGGATTTAACTAGATCATTGTACAATCTAGG  100

seq1  AAAGGGCTCCACCAAGGAGCTACATCTTCAAACCCTTAATTAACCCTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGCTCCACCAAGGAGCTACATCTTCAAACCCTTAATTAACCCTTTA  150

seq1  AACATGCATCCTCTAGGCAACTGTGGTGGTTAAATATTCAAACTAGTGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGCATCCTCTAGGCAACTGTGGTGGTTAAATATTCAAACTAGTGAT  200

seq1  AATAAAGACAATTTTTTGTAGTCTGACTCCTGACTTAAAATGACTGCATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGACAATTTTTTGTAGTCTGACTCCTGACTTAAAATGACTGCATA  250

seq1  TATACACATACACGTATATATATAACAACAAGTAATGAAAATGGGTCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACACATACACGTATATATATAACAACAAGTAATGAAAATGGGTCCAT  300

seq1  GAACTTTAAAAAGAGCAAGGAGGGATATATAAAAGGGTTTGGGGGGAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTTAAAAAGAGCAAGGAGGGATATATAAAAGGGTTTGGGGGGAGGG  350

seq1  AAGGAAAAACAAATTACAATTTCAAAAACAACAGCAATAATAAAAATGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAAAACAAATTACAATTTCAAAAACAACAGCAATAATAAAAATGAG  400

seq1  TTTCTTAAACAAACAAGCAAACAAAAACATGACGAATGAACAGAAACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTAAACAAACAAGCAAACAAAAACATGACGAATGAACAGAAACAGA  450

seq1  CCATTCTGGTATGGAACCTTCTGACCAGCAACCTTATAGAATAATGTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCTGGTATGGAACCTTCTGACCAGCAACCTTATAGAATAATGTTGG  500

seq1  AAATGTGGTCTACATGCTAATGACATTCTTCCTCAACATTTGGACCTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGGTCTACATGCTAATGACATTCTTCCTCAACATTTGGACCTGTC  550

seq1  TTAATTTTAATACTTTAGGAAATGTAAGTTTTTGTGTGAGTAAGAGATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTTAATACTTTAGGAAATGTAAGTTTTTGTGTGAGTAAGAGATGA  600

seq1  GCCTGGAAGGGAAGGTAAAATTAAAAAGTATCAGAACCCAAGAACCAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGAAGGGAAGGTAAAATTAAAAAGTATCAGAACCCAAGAACCAGTA  650

seq1  GTTAATGTCCTTAAGCATTAGGTAAAAGCACACAGGGAGATGGTGGGCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTCCTTAAGCATTAGGTAAAAGCACACAGGGAGATGGTGGGCAG  700

seq1  AGCTCTGTGTGGCTTTCTCCTGACATTAGAGTTTGTCTCTATTGAGACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGTGTGGCTTTCTCCTGACATTAGAGTTTGTCTCTATTGAGACCT  750

seq1  GATAGGAAAAACTACAGTCATCCTGCTAACTGGAGACAGGTTAACTAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGAAAAACTACAGTCATCCTGCTAACTGGAGACAGGTTAACTAGCA  800

seq1  ATTGTGAGAGGTGAATTTATTCTC-TTCCAGGGTGTCAGAAAGCTGTAGA  849
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGAGAGGTGAATTTATTCTCTTTCCAGGGTGTCAGAAAGCTGTAGA  850

seq1  GCTGTAGTTTGAA-GGATATAAGTCTATAAA-TAGTCTCTAGAGTTTC-A  896
      ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  GCTGTAGTTTGAAGGGATATAAGTCTATAAATTAGTCTCTAGAGTTTCAA  900

seq1  GTTGAGTCAGTAGACA--TGGAG-TTTTCT-GATCTTAAAATTTGAGGCT  942
      ||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGTCAGTAGACAATGGGAGTTTTTCTGGATCTTAAAATTTGAGGCT  950

seq1  AG-AACCAT-GTA-CTGTG--TTCCAAAC-TTGCT-CTCCTT-CCCATAA  984
      || |||||| ||| |||||  | |||||| ||||| |||||| |||||||
seq2  AGAAACCATGGTACCTGTGGTTCCCAAACTTTGCTCCTCCTTCCCCATAA  1000

seq1  ACAGCCCC--TGGGCTT-GTTA-TATGATTG--TAGGCCTCACAT-ATGT  1027
      ||||||||   |||||| |||| ||||||||   || |||||||| ||||
seq2  ACAGCCCCCTGGGGCTTGGTTATTATGATTGGTAAGCCCTCACATAATGT  1050

seq1  G--CAA-ATGTATGCAACT  1043
      |  |||  |||||||||||
seq2  GGCCAATGTGTATGCAACT  1069